李澤華,杜 娟,賀學(xué)嬌,趙樹堂,劉穎麗,盧孟柱*
(1. 林木遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所,北京 100091;2. 浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,浙江 杭州 310029)
油菜素內(nèi)酯(BRs)作為一種重要的植物激素,存在于植物的各個器官中[1]參與植物幼苗生長、細(xì)胞伸長、細(xì)胞壁形成等許多生長發(fā)育過程[2-3],并且參與了植物對干旱、低溫、高鹽等逆境脅迫的響應(yīng)[4]。
目前,關(guān)于BRs的生物合成途徑已研究的較為清楚。Fujioka等人通過懸浮培養(yǎng)的長春花(Catharanthus roseue(Linn.) G.Don)細(xì)胞系統(tǒng),以油菜甾醇(CR)作為BRs合成的起始物闡明了BRs合成的基本途徑[5-6]。通過對擬南芥突變體的研究表明,在BRs的合成過程中有幾個比較重要的基因參與。DET2(DEETIOLATED2)基因表達(dá)合成一個5α-還原酶(5α-reductase),可以將油菜甾醇((24R)-24-methylcholest-4-En-3-one)轉(zhuǎn)變?yōu)橛筒绥尥榇迹ǎ?4R)-24-methyl-5alpha-cholestan-3-one)[7-8]。擬南芥DET2基因功能缺失突變體det2-1中,植物無法合成BRs,表現(xiàn)出植株矮小、葉色深綠、根明顯縮短等表型[9]。DWF4(DWARF4)基因和BR6ox(BR-6-oxidase1)基因也被認(rèn)為是BRs合成的關(guān)鍵基因,在擬南芥突變體中具有和det2-1相似的表型[10-11]。
楊樹作為研究木本植株生長發(fā)育的模式樹種,研究BRs在楊樹生長發(fā)育中的作用和機(jī)制對于BRs的研究和分子育種都有重要的理論指導(dǎo)意義。目前,在楊樹中過量表達(dá)BR6ox基因和DWF4基因已有報(bào)道,均有引起楊樹增高增粗等表型[12-13]。關(guān)于楊樹DET2基因功能的研究,此前已有一些報(bào)導(dǎo)。鄧偉等人、譚玉朋、嚴(yán)飛通過在楊樹中異源表達(dá)棉花GhDET2基因,分析了對楊樹生長發(fā)育的影響[14-16]。目前,關(guān)于在楊樹中過量表達(dá)其自身DET2基因的研究還未見報(bào)導(dǎo),關(guān)于過量DET2基因是否可以提高植物內(nèi)源油菜素內(nèi)酯的研究也未見報(bào)導(dǎo)。本研究從銀腺楊 84K(Populus alba×P.glandulosa,‘84K’)中分離出擬南芥AtDET2同源基因PagDET2,構(gòu)建PagDET2過量表達(dá)載體,并通過遺傳轉(zhuǎn)化獲得過量表達(dá)PagDET2的轉(zhuǎn)基因楊樹,對其生長、發(fā)育進(jìn)行分析,為研究DET2在楊樹生長發(fā)育中的功能奠定基礎(chǔ)。
本研究使用的楊樹材料均為銀腺楊84K,為中國林業(yè)科學(xué)研究院林木遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。實(shí)驗(yàn)所用楊樹均由組培苗擴(kuò)繁而來,并由組培苗移栽至營養(yǎng)土中繼續(xù)培養(yǎng)。將帶有頂端的組培苗嫩莖(約2.5 cm)扦插到生根培養(yǎng)基(1/2MS基礎(chǔ)培養(yǎng)基,0.05 mg·L-1IBA 和 0.02 mg·L-1NAA,0.5%瓊脂粉,pH 5.8~6.0),培養(yǎng)于人工氣候室(溫度為23~25 ℃,光周期為14 h/10 h光照/黑暗,光照強(qiáng)度為 50 μmol·m-2·s-1)。生長 20 天后,將其移栽到營養(yǎng)土中,在22 ℃長日照(14 h/10 h光照/黑暗)培養(yǎng)室中繼續(xù)培養(yǎng)。
本研究所使用的Gateway入門載體pDNOR207、過表達(dá)載體pMDC32、GUS組織表達(dá)分析載體pMDC164、大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α 及農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101菌種均由本實(shí)驗(yàn)室保存。PCR引物合成和序列測序由Invitrogen公司完成。PCR反應(yīng)用的2倍濃度的Premix高保真酶Primer STAR HS、普通擴(kuò)增酶PCRMix、DNA marker、膠回收試劑盒(TaKaRaAgarose Gel DNA Purification Kit)均為Takara公司產(chǎn)品。
1.2.1 RNA提取和cDNA合成及RT-qPCR分析采用QIAGEN公司RNA提取試劑盒(RNeasy mini kit),并按照說明書提取RNA。RNA濃度和質(zhì)量分別用 Nanodrop8000(Thermo Fisher Scientific)和瓊脂糖凝膠電泳檢測。使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScriptTMRT reagent Kit(TaKaRa)并按照說明書操作,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA。
在Roche 480定量儀器,使用SYBR Premix ExTaqTMⅡ試劑盒(TaKaRa)上進(jìn)行RT-qPCR分析,ACTIN基因作為內(nèi)參,每個樣品進(jìn)行4個技術(shù)重復(fù)。
1.2.2PagDET2基因的克隆 以擬南芥AtDET2基因?yàn)槟康幕?,在毛果楊(Populus trichocarpa)基因組數(shù)據(jù)庫(http://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)中 Blast獲取AtDET2同源基因PtDET2(Potri.016G110600)序列。使用引物設(shè)計(jì)軟件Primer設(shè)計(jì)PtDET2基因蛋白質(zhì)編碼區(qū)(CDS區(qū))特異引物(PagDET2-F和PagDET2-R)(表1),以84K楊cDNA為模板,利用高保真聚合酶Prime STAR進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到目的基因PagDET2,并進(jìn)行測序驗(yàn)證。
1.2.3 生物信息學(xué)分析 使用ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)在線分析84K楊DET2蛋白的基本理化性質(zhì)。利用NCBI蛋白結(jié)構(gòu)分析網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)分析PagDET2蛋白結(jié)構(gòu)和功能。利用NCBI網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)和植物基因組網(wǎng)站(https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)查找獲取不同物種中DET2氨基酸序列。使用DNAMAN軟件比對不同物種中DET2蛋白氨基酸序列,并分析保守結(jié)構(gòu)域[17]。使用軟件MEGA 6利用N-J法構(gòu)建不同物種的DET2蛋白序列系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。
五六年級的孩子已開始步入青春期,開始對異性有一些朦朦朧朧的感覺。這說明孩子長大了,對自己的性別有了認(rèn)同,對異性也產(chǎn)生了認(rèn)識欲望,這是很正常的事。但我認(rèn)為“談戀愛”三個字用在他們身上還不合適,頂多就是對異性的一種好感,一種認(rèn)同。該如何疏導(dǎo)呢?說重了,怕給他們造成心理陰影,說輕了,反而使他們對異性更加好奇,說不定,還會影響其他孩子。思前想后,我決定從小雨身上找突破口。
表 1 PCR擴(kuò)增所用引物序列Table 1 Primer sequences used for PCR
1.2.4 基因表達(dá)組織特異性分析 利用半定量PCR方法對DET2在84K楊各組織中的表達(dá)情況進(jìn)行分析。以84K楊各組織的cDNA為模板,用特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳。根據(jù)條帶亮度判斷DET2基因在各組織中的表達(dá)情況。
1.2.5 載體構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化 利用Gateway技術(shù),將PagDET2基因連接至入門載體pDNOR207上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌并測序驗(yàn)證后,重組至過表達(dá)載體pMDC32中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌并測序驗(yàn)證。
將構(gòu)建好的過表達(dá)載體pMDC32-DET2電擊轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化84K楊。具體遺傳轉(zhuǎn)化方法見文獻(xiàn)[18]。得到的轉(zhuǎn)基因株系進(jìn)行PCR檢測,并提取RNA對PagDET2基因進(jìn)行RT-qPCR定量分析。選擇表達(dá)量較高的3個過表達(dá)轉(zhuǎn)基因株系進(jìn)行試驗(yàn)。
1.2.6 植物體內(nèi)油菜素內(nèi)酯濃度測定 每個株系各選3株在營養(yǎng)土中生長2月的楊樹苗,取其1至3節(jié)間,迅速放入液氮凍存,冷凍研磨后按比例加入PBS(磷酸緩沖液,pH 7.4)。使用植物(Plant)油菜素內(nèi)酯(BR)ELISA檢測試劑盒(綠源伯德生物公司,北京)測定油菜素內(nèi)酯含量,每個樣本進(jìn)行3次技術(shù)重復(fù),并按照說明操作[13]。
1.2.7 植物生長量及耐鹽性、抗旱性研究 在不同年份不同批次分別選取野生型84K楊和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊#1各9株,在營養(yǎng)土中培養(yǎng)75天,測量株高,并重復(fù)3次。
選取野生型84K楊和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊#1各10株,在營養(yǎng)土中培養(yǎng)2個月用于耐鹽性和抗旱性分析,其中高鹽實(shí)驗(yàn)各使用5株,干旱實(shí)驗(yàn)各使用5株,并重復(fù)3次。在耐鹽實(shí)驗(yàn)中,以300 mmol·L-1的NaCl水溶液處理植物,連續(xù)處理10天,持續(xù)觀察;在抗旱實(shí)驗(yàn)中,首先給予充足水分,隨后進(jìn)行持續(xù)干旱處理6天,持續(xù)觀察。以正常澆水的植株作為對照組。過氧化氫檢測使用過氧化氫檢測試劑盒(碧云天,上海),并按照說明書操作。
1.2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 使用SPSS Statistics 24軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,并用t檢驗(yàn)法檢驗(yàn)差異顯著水平。
以84K楊cDNA為模板,使用特異引物PagDET2-F和PagDET2-R通過PCR擴(kuò)增獲得84K楊DET2基因編碼區(qū)序列,并命名為PagDET2基因。序列分析表明,PagDET2基因與毛果楊PtDET2核酸序列相似度達(dá)97.93%,蛋白序列相似度達(dá)96.89%。PagDET2基因編碼區(qū)全長774 bp,編碼一個長度為257個氨基酸的蛋白質(zhì),蛋白分子量約為29.84 kDa,理論等電點(diǎn)(pI)為9.49。PagDET2蛋白序列中含有兩個5α-還原酶(5α-reductase)必需的谷氨酸[19],分別為Glu(56)和Glu(199)[20-21](圖1),利用NCBI進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)分析表明為一種固醇類還原酶DET2(steroid reductase DET2)。
構(gòu)建基于84K楊、毛果楊、擬南芥、水稻等植物DET2蛋白氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖2)。結(jié)果顯示,DET2蛋白的進(jìn)化在高等植物中主要分為單子葉植物和雙子葉植物兩個類群。84K楊DET2與毛果楊、擬南芥等雙子葉植物DET2同屬于一個系統(tǒng)發(fā)育分支,親緣關(guān)系較近,而與水稻、玉米等單子葉植物DET2親緣關(guān)系較遠(yuǎn),這與形態(tài)學(xué)分類相一致。
為了研究PagDET2基因的組織表達(dá)情況,分別取84K楊根、未完全展開的嫩葉、成熟葉、中間節(jié)間和正在伸長的1至3節(jié)間提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行半定量PCR檢測。結(jié)果表明,PagDET2基因在84K楊各個組織中均有表達(dá),且在1至3節(jié)間(In1-3)、中間節(jié)間(S)和嫩葉(YL)表達(dá)量較高,在根(R)和成熟葉片(ML)中表達(dá)量較低。PagDET2基因作為油菜素內(nèi)酯合成的必須基因,參與了植物頂端生長、葉片成熟、木材形成等生長發(fā)育過程(圖3)。
圖 1 基于不同物種中DET2同源蛋白序列的比對分析Fig. 1 Multiple sequence alignment of DET2 amino acid sequence in different plants
圖 2 基于不同物種中DET2同源蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig. 2 Phylogenetic tree constructed on the basis of DET2 amino acid sequence
圖 3 楊樹中PagDET2基因在各組織中的表達(dá)情況(YL:嫩葉,ML:成熟葉,S:中間節(jié)間,In1-3:1至3節(jié)間,R:根)Fig. 3 Expression patterns of PagDET2 in poplar(YL,young leaves; ML, mature leaves; S, middle internode;In1-3, internode 1st to 3rd; R, root)
為了進(jìn)一步研究PagDET2基因在楊樹生長發(fā)育中的作用,構(gòu)建了由CaMV 35S啟動子驅(qū)動的PagDET2過表達(dá)載體PagDET2-OE Vector,采用農(nóng)桿菌侵染葉盤法,獲得了過量表達(dá)PagDET2基因的轉(zhuǎn)基因株系PagDET2-OE。通過PCR克隆和RT-qPCR檢測后,選取3個表達(dá)量較高(圖4)的株系(命名為#1、#2、#3)進(jìn)行試驗(yàn)。
圖 4 PagDET2基因在PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因植株中的表達(dá)情況Fig. 4 The expression levels of PagDET2 in PagDET2-OE lines
DET2基因作為油菜素內(nèi)酯合成過程中的關(guān)鍵限速基因,為了研究DET2基因在楊樹中的過量表達(dá)后對植物體內(nèi)油菜素內(nèi)酯含量的影響,通過RT-qPCR檢測了油菜素內(nèi)酯信號通路關(guān)鍵基因PtPP2A基因在PagDET2-OE株系中的表達(dá)量。結(jié)果顯示:PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊中的PtPP2A基因顯著高于野生型84K(圖5)。
圖 5 PtPP2A基因在PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因植株中的表達(dá)情況Fig. 5 The expression levels of PtEXPA8 in PagDET2-OE lines
進(jìn)一步通過ELISA檢測楊樹體內(nèi)油菜素內(nèi)酯的含量,結(jié)果顯示:與野生型84K楊對比,PagDET2-OE株系中油菜素內(nèi)酯含量顯著升高(圖6)。
在人工氣候室培養(yǎng)室同時(shí)培養(yǎng)野生型84K楊和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊,生長75天的PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊高生長明顯高于野生型84K楊(圖7)。
圖 6 PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因植株中的油菜素內(nèi)酯含量Fig. 6 The content of BRs in PagDET2-OE lines
為了研究PagDET2基因?qū)τ谥参锟果}、耐旱的影響,對野生型84K和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊進(jìn)行干旱和鹽脅迫。結(jié)果顯示:在未脅迫的情況之下,轉(zhuǎn)基因楊樹和野生型84K楊都能正常生長;在干旱脅迫6天后,野生型84K楊和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊都出現(xiàn)了萎蔫、葉片卷曲、枯黃的現(xiàn)象,無明顯差別;在鹽處理8天后,野生型84K楊還能正常生長,但是PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊出現(xiàn)了蔫蔫、葉片卷曲、枯黃的現(xiàn)象(圖8)。對野生型84K楊和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊進(jìn)行過氧化氫含量檢測,取正常生長、干旱處理3天和鹽處理4天后的葉片,液氮研磨后使用過氧化氫檢測試劑盒檢測其過氧化氫含量,結(jié)果顯示:未處理時(shí),過氧化氫含量基本相同,干旱處理和鹽處理均會導(dǎo)致過氧化氫含量升高,但是干旱處理3天后兩者沒有明顯差別,鹽處理4天后,PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊的葉片過氧化氫含量顯著高于相同處理的野生型84K楊。
圖 7 野生型84K(WT)和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因植株75天生長情況Fig. 7 75-day-old wide type(WT)and PagDET2-OE transgenic poplars
圖 8 野生型84K和PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因植株高鹽處理8天后的生長情況Fig. 8 Wide type(WT)and PagDET2-OE transgenic poplars were treated with 300 mMNaCl for 8 days
植物激素在調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育方面具有不可替代的作用,DET2基因作為BRs合成過程中的關(guān)鍵限速基因,對于BRs的合成有重要作用,改變其在植物體內(nèi)的表達(dá),對于研究BRs對于植物的功能和機(jī)制有重要意義。
基因表達(dá)模式的組織分析表明,正在伸長生長的莖和已經(jīng)完成伸長生長的莖中DET2基因均有較高的表達(dá),說明DET2可能影響莖的生長發(fā)育。過量表達(dá)楊樹DET2有增高表型,這一結(jié)果與在楊樹中異源表達(dá)棉花GhDET2基因的結(jié)果相似[14-16]。PtPP2A是AtPP2A基因的同源基因,有研究表明AtPP2A調(diào)控著BRZ1的磷酸化,BZR1是油菜素內(nèi)酯信號通路的核心,所以AtPP2A被認(rèn)為是油菜素內(nèi)酯信號通路的開關(guān),在油菜素內(nèi)酯信號傳導(dǎo)中有重要的積極作用[1,22]。PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊中的PtPP2A基因顯著高于野生型84K,說明轉(zhuǎn)基因楊中油菜素內(nèi)酯下游信號通路可能得到了加強(qiáng)。
通過ELISA檢測植物體內(nèi)BRs的含量表明,PagDET2-OE植株中的BRs含量明顯高于野生型。且前人研究表明擬南芥DET2基因功能缺失突變體det2-1中,植物無法合成BRs[9],說明改變DET2基因的表達(dá)量可以改變植物內(nèi)源BRs的含量,這對于進(jìn)一步研究油菜素內(nèi)酯在植物生長發(fā)育中的調(diào)控機(jī)制有重要意義。DET2過量表達(dá)對于莖生長發(fā)育和油菜素內(nèi)酯信號通路基因表達(dá)量的影響可能是通過改變油菜素內(nèi)酯含量實(shí)現(xiàn)的。這一功能與BRs合成的另一關(guān)鍵基因DWF4相似,在楊樹中過量表達(dá)DWF4基因,可以促進(jìn)楊樹增高,提高BRs含量[13]。關(guān)于DET2等BRs合成中的關(guān)鍵基因的研究對利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)增加楊樹生物量,從而進(jìn)行定向分子育種有潛在應(yīng)用價(jià)值。
楊樹中過量表達(dá)PagDET2基因可使植株對高鹽的耐受性明顯下降。鹽處理4天后,PagDET2-OE轉(zhuǎn)基因楊的葉片過氧化氫含量顯著高于相同處理的野生型84K楊,這從生理上明確了高表達(dá)轉(zhuǎn)基因楊樹抗性降低的機(jī)制。雷雨婷等研究了過量表達(dá)楊樹PtDET2基因?qū)煵菰诟珊?、高鹽等處理下的影響[23],通過在煙草中過量表達(dá)PtDET2基因,可以提高煙草抗旱、耐鹽能力。這與本研究結(jié)果有些不同,可能是由于煙草和楊樹的生長特性不同導(dǎo)致的。84K楊作為木本植物速生樹種,對分水需求很大,對高鹽和干旱更敏感。本研究觀察到的高生長轉(zhuǎn)基因植株的抗逆性降低,預(yù)示著培育速生林木品種需要精細(xì)的管理,盡量避免其處于脅迫狀態(tài)。
本研究通過轉(zhuǎn)基因技術(shù),分析了DET2基因作為BRs合成的關(guān)鍵基因在楊樹生長中的作用。結(jié)果表明,過量表達(dá)可以顯著提高內(nèi)源BRs含量,促進(jìn)植株增高,對速生品種的定向培育提供了基礎(chǔ)。但高生長植株對高鹽脅迫更具有敏感性,在林木培育中應(yīng)盡量避免逆境脅迫。