曾 圣, 劉 偉, 杜 強, 王艷艷, 周 洲, 胡世然
(1.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 水產(chǎn)研究所, 貴州 貴陽 550025; 2.貴州省特種水產(chǎn)工程技術(shù)中心, 貴州 貴陽 550025; 3.黔東南州農(nóng)業(yè)科學(xué)院 水產(chǎn)研究所, 貴州 凱里 556000)
鯉(Cyprinuscarpio)屬硬骨魚綱、鯉形目、鯉科、鯉亞科、鯉屬,在我國除西部高原外,各地淡水中均有分布,是養(yǎng)殖歷史悠久(2 400余年)的重要養(yǎng)殖魚類。我國幅員遼闊、水資源豐富,有多個地方鯉魚種群,如黃河鯉、鏡鯉、興國紅鯉等,因而我國是巨大的鯉魚種質(zhì)資源庫。近年來,通過雜交育種形成的福瑞鯉、松浦鏡鯉等高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)新品種取得了巨大的經(jīng)濟效益和社會效益[1-3]。
清水江鯉是貴州省黔東南州、黔南州等地稻田主要養(yǎng)殖的魚類品種,具有較高的經(jīng)濟價值。由于梯級電站開發(fā)、增殖放流及人工養(yǎng)殖新品種的引入,野生清水江鯉的數(shù)量日趨減少,其種質(zhì)資源遺傳多樣性也受到了一定程度的破壞。
目前,對清水江鯉的研究相對較少,董在杰等[4]通過微衛(wèi)星標記和形態(tài)指標對清水江鯉的種質(zhì)資源現(xiàn)狀的研究結(jié)果表明,清水江鯉群體表現(xiàn)出較高的遺傳多樣性水平,且群體內(nèi)存在顯著遺傳分化。周洲等[5]通過測定清水江鯉8個形態(tài)學(xué)指標,研究清水江鯉外部形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響表明,體長、體高、體厚、尾柄高、尾柄長是影響清水江鯉體質(zhì)量的主要性狀。胡世然等[6]研究了清水江鯉在池塘養(yǎng)殖條件下的適應(yīng)溫度范圍、最適攝食生長溫度、溶氧需求及pH適應(yīng)范圍等的結(jié)果表明,野生清水江鯉可經(jīng)人工馴化為淡水名優(yōu)養(yǎng)殖魚類。胡世然等[7]將清水江鯉與江西興國紅鯉進行雜交改良,清水江鯉雜交改良子一代稻田飼養(yǎng)增產(chǎn)效果顯著。
人工選育是開發(fā)和保護清水江鯉種質(zhì)資源的重要手段之一,為了解清水江鯉早期性腺發(fā)育及性腺發(fā)育過程中相關(guān)基因的表達,通過組織學(xué)切片觀察不同時期清水江鯉性腺,并通過RACE及RT-PCR克隆清水江鯉Foxl2基因,并分析Foxl2的功能,以期為清水江鯉的人工選育提供理論基礎(chǔ)。
清水江鯉苗種及成魚由凱里市福瑞水產(chǎn)養(yǎng)殖場提供。
1.2.1 性腺樣品采集及觀察 選取孵化后50 d、70 d、90 d、120 d、150 d和240 d清水江鯉性腺進行組織學(xué)切片觀察,以了解清水江鯉的性腺發(fā)育情況。清水江鯉性腺用波恩氏液固定過夜,70%酒精洗滌后,參照劉凱等[8]方法采用常規(guī)乙醇梯度脫水、二甲苯透明及石蠟包埋,運用浙江科迪KD2508輪轉(zhuǎn)式切片機進行連續(xù)切片,切片厚度為6 μm,H.E染色,中性樹膠封片,NIKON E50i顯微鏡下觀察并拍照,應(yīng)用Photoshop CS 6.0編輯圖片。
1.2.2 免疫組化 為觀察清水鯉早期生殖細胞分化情況,運用上述孵化后50 d及90 d切片進行免疫組化染色,抗體選用Vasa兔多克隆抗體(生殖細胞特異性抗體)。免疫組化主要參考DONG等[9]的方法。用0.01 M PBS洗滌3次,每次洗滌10 min后,將切片浸入含有0.1%吐溫20的0.01 M檸檬酸緩沖液(pH6.0)中煮5 min。用Vasa兔多克隆抗體(1∶1 000)在4℃下孵育過夜,用0.01 M PBS沖洗3次,每次沖洗5 min。隨后,將組織切片與二抗(羊抗兔IgG)和辣根過氧化物酶以1∶2 000比例孵育30 min,然后用PBS沖洗3次,每次沖洗5 min。以二氨基聯(lián)苯胺為底物,觀察免疫反應(yīng)信號。切片用蘇木精復(fù)染。
1.2.3Foxl2基因序列獲取 通過對項目組前期開展的清水江鯉成魚雌雄性腺轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)(未發(fā)表)進行分析,獲取清水江鯉Foxl2基因中間序列,并通過5′-和3′-RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)及與鯉魚基因組序列比對獲取Foxl2基因全序列。
1.2.4 系統(tǒng)發(fā)生 進化樹包括人類(NP_075555.1)、小鼠(NP_036150.1)、雞(AEE80502.1)、斑胸草雀(XP_002187454.1)、非洲爪蛙(BAH22852.1)、施氏鱘(BAZ96608.1)、許氏平鲉(AEX58659.1)、牙鲆(BAF69017.1)、青鳉(NP_001098358.1)、尼羅羅非魚(NP_001266707.1)、紅鰭東方魨(XP_003968794.2)、半滑舌鰨(NP_001281128.1)、金錢魚(AGH32772.1)、尖吻鱸(XP_018539633)、斑馬魚(NP_001038717.1,NP_001304690.1)、稀有鮈鯽(ADN38241.1)、大口鲇(ABK76309.1)、斑點叉尾鮰(XP_017350481.1)、金魚(XP_026092361.1、XP_026055792.1和XP_026138658.1)、七彩神仙魚(AVP26899.1)、虹鱒(NP_001117956.1和NP_001117957.1)、大西洋鮭(XP_013992219.1)、日本鰻鱺(AXM42349.1和AXM42348.1)、黃鱔(AGM34484.1)、四川裂腹魚(ASU44863.1)、克氏原螯蝦(ALD48735.1)和居蟹皮海綿(CAE51212.1)的Foxl2氨基酸序列。
進化樹以NJ法采用MEGA 6.0[10-12]構(gòu)建。人類Foxl1(NP_005241.1)作為外類群。數(shù)值表示1 000次試驗所得到的步展值,代表每一分支的可信度。除清水江鯉Foxl2a與Foxl2b為試驗克隆外,其余Foxl2蛋白序列來源于NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫。
1.2.5Foxl2在清水江鯉成體組織中的表達 成體(24個月)清水江鯉麻醉后按性別解剖取其腦、垂體、鰓、心臟、脾臟、肝臟、腸、卵巢、精巢及腎臟液氮速凍,組織勻漿后按RNAiso Plus操作說明提取總RNA,提取的總RNA(約5.0 μg)用DNase I處理,以減少或避免基因組DNA的污染。取總RNA(約2.0 μg)逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,用基因特異引物進行擴增,檢驗Foxl2a和Foxl2b在各個組織中的分布情況。同時以鯉魚β-Actin引物擴增為內(nèi)參以驗證PCR過程中cDNA的質(zhì)量。PCR擴增參數(shù):94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s,60℃30 s,72℃60 s,循環(huán)28圈;72℃最終延伸10 min,4℃保存。所有PCR產(chǎn)物最后在1.5%瓊脂糖凝膠中電泳,并用SYBR Green I染色后在凝膠成像系統(tǒng)中拍照記錄結(jié)果。
通過組織學(xué)切片觀察發(fā)現(xiàn),清水江鯉發(fā)育在孵化后50~90 d不能分辨性別(封2圖1a~c),但能明顯分辨出生殖細胞,免疫組化(以Vasa為抗體)染色顯示生殖細胞為橢圓形,細胞核偏大(封2圖1a和c);孵化后120 d的性腺出現(xiàn)初級精母細胞,初級精母細胞呈圓形小顆粒狀,胞質(zhì)弱嗜酸性(封2圖1d);孵化后150 d的性腺出現(xiàn)初級卵母細胞,初級卵母細胞呈圓形,核膜的內(nèi)壁有核仁(封2圖1e);孵化后240 d出現(xiàn)精細胞(封2圖1f)。
基于RT-PCR、RACE和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),清水江鯉含有2個同源基因(Foxl2a和Foxl2b), cDNA全長分別為1 057 bp和1 297 bp,完整ORF分別編碼307個和263個氨基酸。
通過對NCBI數(shù)據(jù)庫的搜索及比對,目前僅發(fā)現(xiàn)在硬骨魚類的斑馬魚、虹鱒、日本鰻鱺、金魚、斑點叉尾鮰、大西洋鮭及七彩神仙魚中存在Foxl2b,其中金魚存在2個Foxl2b(圖2)。
序列比對發(fā)現(xiàn),清水江鯉Foxl2a與Foxl2b核苷酸序列相似性為50.16%,氨基酸序列相似性為44.01%。
通過氨基酸序列的比對,F(xiàn)oxl2a在硬骨魚類間有高度相似性,特別是中間區(qū)域Foxl家族含有的1個高度保守的約110個氨基酸的DNA-binding domain(DBD)(圖3),氨基酸序列間的相似性為75.88%~99.02%。Foxl2b氨基酸序列僅在DBD區(qū)域相對保守(圖4),其余區(qū)域相對不保守,氨基酸序列之間相似性為30.72%~90.08%。
從圖5看出,清水江鯉Foxl2a僅在成體卵巢、腎臟及脾臟中表達,且在卵巢中的表達量高于脾臟和腎臟;Foxl2b僅在成體卵巢中表達。
注:B為腦,P為垂體,G為腮,H為心臟,S為脾臟,I為腸,L為肝臟,K為腎臟,T為精巢,O為卵巢,HK為頭腎。β-Actin為內(nèi)參。
Note: B, brain; P, pituitary; G, gill; H, heart; S, spleen; I, intestines; L, liver; K, kidney; T, testis; O, ovary; HK, head kidney.β-Actin, internal reference.
圖5清水江鯉成體組織中Foxl2a和Foxl2b的表達模式
Fig.5 Expression pattern ofFoxl2aandFoxl2bin adult tissues of QingshuijiangC.carpio
清水江鯉性腺發(fā)育至孵化后90 d時,通過免疫組化(以生殖細胞特異性表達的Vasa為抗體)可以看到性腺中存在大量生殖細胞,但通過HE染色仍不能明顯分辨性別,而黃河鯉在80 d時性腺已出現(xiàn)組織學(xué)上明顯的分化[13]。清水江鯉性腺發(fā)育明顯晚于黃河鯉性腺發(fā)育,可能是由于清水江鯉主要分布于貴州省黔東南州、黔南州等地區(qū),海拔相對較高、氣溫相對較低所致。此結(jié)論將為清水江鯉人工繁殖及選育提供理論基礎(chǔ)。
研究獲得清水江鯉2個Foxl2的同源基因Foxl2a和Foxl2b,并通過系統(tǒng)發(fā)生驗證。
目前僅在硬骨魚類的斑馬魚、日本鰻鱺、金魚、虹鱒及鯉中發(fā)現(xiàn)2個(或以上)Foxl2旁系同源基因,其中金魚存在2個Foxl2b旁系同源基因,而在人類、小鼠、雞、斑胸草雀、非洲爪蛙等四足類中未發(fā)現(xiàn)2個(或以上)Foxl2旁系同源基因,表明,魚類基因組中存在的2個Foxl2旁系同源基因可能是由發(fā)生在輻鰭魚出現(xiàn)早期的額外的基因組復(fù)制(魚類特有的基因組復(fù)制,3R)產(chǎn)生[14-15]。金魚中存在2個Foxl2b基因可能與金魚與鯽魚共同祖先發(fā)生的特有基因組復(fù)制(4R)相關(guān)[16]。其他魚類僅存在1個Foxl2旁系同源基因可能是由于大部分魚類基因組測序尚未完成,還未發(fā)現(xiàn)其他的Foxl2旁系同源,也有可能是進化過程中全基因組復(fù)制往往伴隨著快速的基因丟失[17]所致。
氨基酸序列分析表明,硬骨魚類Foxl2a氨基酸序列相對保守,特別在中間及C末端區(qū),其在不同物種中的功能也較相似;而Foxl2b相對不保守,其在不同物種中的功能可能會有所不同。
對哺乳動物的研究表明,F(xiàn)oxl2(與硬骨魚類Foxl2a同源)幾乎參與了卵巢發(fā)育和功能的所有階段及顆粒細胞相關(guān)的病理學(xué)。Foxl2通過與細胞DNA結(jié)合來打開或關(guān)閉某些基因,幫助顆粒細胞發(fā)育和功能[18-19]。在斑馬魚中的研究表明,F(xiàn)oxl2a和foxl2b協(xié)同調(diào)節(jié)斑馬魚卵巢的分化和維持,F(xiàn)oxl2b在阻止卵巢分化為睪丸方面起主導(dǎo)作用[20]。與其他脊椎動物(包括硬骨魚類)不同,三斑海豬魚Foxl2在自然改變性別的魚類中可能有不同的作用[21]。BARON等[22]發(fā)現(xiàn),虹鱒Foxl2a和Foxl2b在卵巢中有特異表達,但表達的時間模式不同。Foxl2a的表達與芳香化酶的水平相關(guān),雌激素處理遺傳雄性個體則會使Foxl2a與Foxl2b的表達上調(diào)。通過RT-PCR發(fā)現(xiàn),清水江鯉Foxl2a和Foxl2b均在卵巢有較高表達,而在精巢沒有表達,這與Foxl2a和Foxl2b在虹鱒中的情況相似,表明Foxl2a與Foxl2b能在清水江鯉雌性性腺發(fā)育過程中起重要作用。清水江鯉Foxl2a和Foxl2b的具體功能,還有待進一步研究。