谷世江,侯瑞卿,高盛果,孫哲,李向東,翟路峰,金云云,朱巧艷,廖永洪,*,田克恭,b,*
a National Research Center for Veterinary Medicine, Luoyang 471000, China
b College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China
人蒼白桿菌(O. anthropi)是一種在環(huán)境中廣泛存在的革蘭氏陰性桿菌。它最先被歸類(lèi)于CDC Vd群[1],屬于布魯氏菌科[2]。O. anthropi曾被認(rèn)為是一種人類(lèi)條件致病菌,主要感染免疫功能低下的患者[1,3,4]。然而,一些報(bào)道表明O. anthropi也可以引起健康人的感染[5-7]。O. anthropi感染的表現(xiàn)包含眼內(nèi)炎[6]、心內(nèi)膜炎、腦膜炎、骨軟骨炎、骨髓炎、胰腺膿腫、穿刺傷口、骨盆膿腫和尿路感染[8-14]。據(jù)報(bào)道,除感染人類(lèi)以外,O. anthropi還可以感染其他哺乳動(dòng)物。Franci等[15]首次報(bào)道了健康犬被O. anthropi感染的報(bào)告,該犬在常規(guī)牙齒清潔后被感染,原因是麻醉液被O. anthropi污染。ElAdawy等[16]從火雞的盲腸中分離出O. anthropi。迄今為止,尚未有從其他物種中分離到O. anthropi的報(bào)道。在本研究中,我們首次從豬體內(nèi)分離并鑒定了一株O. anthropi。
豬腦樣本來(lái)自于中國(guó)江西省的一家商業(yè)化的養(yǎng)豬場(chǎng)。該豬有神經(jīng)癥狀,剖檢觀(guān)察顯示有腦膜炎。對(duì)該豬腦樣本進(jìn)行組織病理學(xué)檢查和細(xì)菌分離。在無(wú)菌條件下用棉拭子從腦樣本中取樣以避免污染。將分離物在含有10%新生牛血清(浙江天杭生物技術(shù)有限公司,中國(guó))的胰蛋白胨大豆瓊脂(TSA; BD DifcoTM,美國(guó)BD公司)上于37 ℃培養(yǎng)24 h。革蘭氏染色根據(jù)Gerhardt等[17]描述的方法進(jìn)行。使用API 20 NE(法國(guó)生物梅里埃公司)對(duì)分離菌進(jìn)行生化鑒定,方法參照廠(chǎng)家的說(shuō)明書(shū)。
使用金唯智公司(中國(guó))的細(xì)菌基因組DNA試劑盒,對(duì)24 h的細(xì)菌培養(yǎng)物進(jìn)行DNA模板提取,方法參照廠(chǎng)家的說(shuō)明書(shū)。
參 照Scholz等[18]描 述 的 方 法 對(duì) 細(xì) 菌16S rRNA基因和recA基因進(jìn)行擴(kuò)增。正向引物27f(5′-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3′) 和反向引 物1492r(5′-AAGTCGTAACAAGGT ARCCG-3′)用于擴(kuò)增16S rRNA基因,擴(kuò)增的目的片段大小約1400 bp。聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)程序如下:94 ℃ 5min;隨后94 ℃60 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 90 s,30個(gè) 循 環(huán); 最 后72 ℃10 min。PCR產(chǎn)物使用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析。recA基因擴(kuò)增引物為recA-f(5′-ATGTCTCAAAAAAA TTCATTGCGAC-3′)和recA-r(5′-AGCATCTTCTTCCG GTCCGC-3′);擴(kuò)增recA基因條帶大小為1065 bp。PCR程 序 如 下:94 ℃ 5 min;隨 后94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,30個(gè)循環(huán);最后72 ℃ 10 min。PCR產(chǎn)物使用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析。
將PCR產(chǎn)物送至金唯智公司進(jìn)行測(cè)序。序列在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)數(shù)據(jù)庫(kù)中使用BLASTnx進(jìn)行了BLASTed處理(其中,BLAST為基本局部比對(duì)搜索工具)。使用CLUSTAL X [19]來(lái)比對(duì)序列。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)基于16S rRNA基因(rrs)和recA基因,使用軟件MEGA版本5 [21,22]采用Kimura的雙參數(shù)模型進(jìn)行分析[20]。進(jìn)化樹(shù)枝干上的數(shù)字表示bootstrap test重復(fù)測(cè)試(1000次重復(fù))時(shí)相關(guān)物種成簇的樹(shù)的比例[23]。
基因組序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中通過(guò)基因組BLAST工具進(jìn)行BLAST分析。蒼白桿菌屬(Ochrobactrumsp.)和布魯氏菌屬(Brucellasp.)的recA、16S rRNA基因的部分序列的GenBank登錄號(hào),以及部分蒼白桿菌(Ochrobactrum)的全基因組序列的GenBank登錄號(hào)見(jiàn)Appendix A中的Table S1。
參照Bauer等[24]描述的紙片擴(kuò)散法對(duì)分離株進(jìn)行抗生素敏感性試驗(yàn)。將分離菌株接種于含10%新生牛血清的TSA平板,37 ℃培養(yǎng)24 h。將培養(yǎng)物用磷酸鹽緩沖液(PBS, 0.01 mol·L-1, pH 7.2)制備成菌懸液,濃度為1× 108CFU·mL-1(其中,CFU代表菌落形成單位)。用無(wú)菌棉簽沾取菌懸液涂布于含有10%新生牛血清的TSA平板上,隨后將藥敏紙片(杭州微生物試劑有限公司)放在接種后的瓊脂表面上。將平板底部朝上置于35 ℃孵育24 h,測(cè)量抑菌圈直徑。參照動(dòng)物細(xì)菌紙片和稀釋法藥敏試驗(yàn)判定標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布的參數(shù)進(jìn)行結(jié)果判定[25]。
將分離株接種含有10%新生牛血清的TSA平板,37 ℃下培養(yǎng)24 h,用PBS(0.01 mol·L-1, pH 7.2)制成活菌含量為5×109~2×1010CFU·mL-1的系列菌懸液。通過(guò)腹腔注射感染BALB/c小鼠,每只小鼠注射菌液0.2 mL,劑量為每只小鼠1×109~4×109CFU。對(duì)死亡小鼠腦組織樣本進(jìn)行組織病理學(xué)觀(guān)察。該動(dòng)物試驗(yàn)參照國(guó)家獸用藥品工程技術(shù)研究中心動(dòng)物保健和倫理委員會(huì)批準(zhǔn)的規(guī)定進(jìn)行。
將腦樣品用10%福爾馬林溶液固定過(guò)夜,然后包埋在石蠟中。將腦組織切片并用蘇木精和伊紅染色以進(jìn)行組織病理學(xué)評(píng)估。
豬腦樣本的組織病理學(xué)結(jié)果顯示腦白質(zhì)有壞死性結(jié)節(jié)、灰質(zhì)神經(jīng)元壞死和大量中性粒細(xì)胞浸潤(rùn),如圖1所示。將腦樣本劃線(xiàn)TSA平板分離到純的光滑小菌落。革蘭氏染色為陰性桿菌(圖2)。
該分離株為氧化酶和過(guò)氧化氫酶陽(yáng)性,API 20 NE生化鑒定為人蒼白桿菌(O. anthropi)(概率為99.9%)(表 1)。命名為JXLH03B。
JXLH03B株16S rRNA基因的序列與蒼白桿菌屬(Ochrobactrumsp.,GenBank登錄號(hào):MH201346.1)、O. anthropi(GenBank登錄號(hào):LT671861.1)和羽扇豆蒼白桿菌(O. lupini, GenBank登錄號(hào):KU217325.1)的序列完全相同。recA基因經(jīng)BLAST分析,結(jié)果顯示與O. anthropi(GenBank登錄號(hào):LT671861.1)序列完全相同。
圖1. 豬腦樣品的組織病理學(xué)觀(guān)察(H&E,20×)。(a)腦白質(zhì)中的壞死性結(jié)節(jié)(如箭頭所示);(b)灰質(zhì)神經(jīng)元壞死(如三角形所示)和中性粒細(xì)胞浸潤(rùn)(如箭頭所示)。
圖2. 分離物的菌落形態(tài)和細(xì)胞形態(tài)。(a)分離物的菌落形態(tài);(b)革蘭氏染色后顯微鏡觀(guān)察的細(xì)胞形態(tài)(100×)。
表1 JXLH03B分離株的API 20 NE鑒定結(jié)果
(續(xù)表)
基于16S rRNA基因進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析。如圖3所示,JXLH03B株與O. anthropiLMG7991、O. anthropiOAB、O. anthropiLMG5140、O. anthropiLMG3333、O.anthropiLMG3333T、O. anthropiDSM14396、O. anthropiATCC49188、O. anthropi7b2C和O. lupiniLMG1821處于一個(gè)分支。另外,基于recA基因,JXLH03B株與O.anthropiDSM14396、O. anthropiLMG3333和O. anthropi10CS0094處于一個(gè)分支(圖4)。
分離菌株基因組測(cè)序結(jié)果為有兩個(gè)序列,總長(zhǎng)度為4 725 913 bp。G + C含量為56.01%。序列1和序列2的長(zhǎng)度分別為2 641 072 bp和2 088 481 bp。BLAST結(jié)果表明,分離株的基因組序列與已發(fā)表的兩株O. anthropi基因組序列之間的相似度為97.54%~98.08%(表2)。
JXLH03B株感染BALB/c小鼠的劑量為每只小鼠1×109~4×109CFU。小鼠死亡率為0/5~5/5(表3)。對(duì)所有死亡小鼠的大腦取樣進(jìn)行組織病理學(xué)檢查。所有感染后死亡小鼠的腦組織都有炎癥。組織病理學(xué)結(jié)果顯示大腦中有多個(gè)壞死灶。腦實(shí)質(zhì)液化,大量嗜中性粒細(xì)胞壞死聚集形成結(jié)節(jié)(如圖5中箭頭所示)。一些神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞崩解(圖5)。
藥敏試驗(yàn)根據(jù)動(dòng)物細(xì)菌紙片和稀釋法藥敏試驗(yàn)判定標(biāo)準(zhǔn)的指導(dǎo)原則,使用紙片擴(kuò)散試驗(yàn)進(jìn)行[25]。JXLH03B株對(duì)硫酸慶大霉素、丁胺卡那霉素、恩諾沙星、環(huán)丙沙星、多西環(huán)素和氟苯尼考敏感,但對(duì)青霉素鈉、頭孢噻呋、卡那霉素硫酸鹽、林可霉素和泰樂(lè)菌素耐藥(表4)。
O. anthropi是一種需氧、非發(fā)酵、運(yùn)動(dòng)、氧化酶陽(yáng)性、脲酶陽(yáng)性的革蘭氏陰性桿菌,曾被稱(chēng)為“無(wú)色桿菌Vd群”[1]。生化反應(yīng)圖譜(API 20 NE)將JXLH03B株鑒定為O. anthropi。Ochrobactrum屬屬于布魯氏菌科,與布魯氏菌有著較近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[26]。Ochrobactrum屬包含約16個(gè)種[27]。16S rRNA基因分析用于鑒定和區(qū)分O. anthropi和布魯氏菌屬[2,26,27]。但是,這種方法(尤其是部分測(cè)序)由于其高度的序列相似性而容易誤判這些病原體[27]。同時(shí),recA基因分析提供了更準(zhǔn)確的識(shí)別和區(qū)分[18,27]。我們對(duì)JXLH03B分離株進(jìn)行16S RNA基因測(cè)序比對(duì),16S RNA基因比對(duì)結(jié)果不能完全將該菌株鑒定為O.anthropi,結(jié)合recA基因測(cè)序比對(duì)的結(jié)果將分離株鑒定為O. anthropi。
對(duì)小鼠感染試驗(yàn)表明,該菌株具有一定的致病性,可導(dǎo)致小鼠腦部病變。為了測(cè)試JXLH03B株對(duì)豬的致病性,分別對(duì)9頭80日齡的健康豬進(jìn)行攻毒,分別以每頭 豬1.2×109CFU、1.2×1010CFU和1.2×1011CFU的劑量,通過(guò)氣管注射攻毒。但是,攻毒后沒(méi)有豬只表現(xiàn)出臨床癥狀,并且攻毒豬的腦樣本的組織病理學(xué)檢查未發(fā)現(xiàn)異常(數(shù)據(jù)未顯示)。因此,未能建立O. anthropiJXLH03B株對(duì)健康豬的感染模型。在人類(lèi)中,O. anthropi主要感染免疫功能低下的患者[1,3,4]。我們懷疑感染O. anthropi的豬可能是因其他病原感染導(dǎo)致免疫功能受損引起的,因在患病的豬中檢測(cè)到豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)(數(shù)據(jù)未顯示),而PRRSV會(huì)引起免疫抑制性呼吸系統(tǒng)疾病[28]。O. anthropi廣泛分布于土壤和水中[2],因此,我們懷疑這只豬由于免疫力低下而通過(guò)以上途徑感染了人蒼白桿菌。
人蒼白桿菌對(duì)除碳青霉烯類(lèi)以外的幾乎所有β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素耐藥,原因是其能產(chǎn)生AmpCβ-內(nèi)酰胺酶[29]。我們的研究結(jié)果表明,分離株對(duì)青霉素和頭孢噻呋具有抗性,與文獻(xiàn)報(bào)道一致[30]。
圖3. 基于16S rRNA基因使用CLUSTREE鄰接法進(jìn)行的系統(tǒng)發(fā)育分析。比例尺:每個(gè)位點(diǎn)0.002個(gè)不同的殘基。每個(gè)分枝的顯著性用1000次檢驗(yàn)的bootstrap值來(lái)表示。
在本研究中,我們首次從豬體內(nèi)分離并鑒定了人蒼白桿菌(O. anthropi)。這種細(xì)菌能夠通過(guò)試驗(yàn)感染小鼠并導(dǎo)致典型的腦膜炎,這表明O. anthropi可能具有更廣泛的宿主感染譜。
圖4. 基于recA基因使用CLUSTREE鄰接法進(jìn)行的系統(tǒng)發(fā)育分析。比例尺:每個(gè)位點(diǎn)0.01個(gè)不同的殘基。每個(gè)分枝的顯著性用1000次檢驗(yàn)的bootstrap值來(lái)表示。
表2 JXLH03B株與另外兩株O. anthropi基因組序列的相似性
表3 JXLH03B株感染小鼠結(jié)果
圖5. 小鼠腦樣品的組織病理學(xué)觀(guān)察(H&E,20×)。腦中出現(xiàn)壞死灶,中性粒細(xì)胞壞死聚集形成結(jié)節(jié)(如箭頭所示)。
表4 JXLH03B分離株紙片擴(kuò)散法藥敏結(jié)果和判定
致謝
本工作得到了國(guó)家“萬(wàn)人計(jì)劃”青年拔尖人才(李向東)和洛陽(yáng)市“河洛英才計(jì)劃”(新型獸用生物制品研發(fā)及產(chǎn)業(yè)化)(田克恭)的資助。
Compliance with ethics guidelines
Shijiang Gu, Ruiqing Hou, Shengguo Gao, Zhe Sun,Xiangdong Li, Lufeng Zhai, Yunyun Jin, Qiaoyan Zhu,Yonghong Liao, and Kegong Tian declare that they have no conf l ict of interest or fi nacial conf l icts to disclose.
Appendix A. Supplementary data
Supplementary data to this article can be found online at https://doi.org/10.1016/j.eng.2019.08.014.