李正堃 李慧瑾
摘 要
目的:構(gòu)建 HIF1α-shRNA表達(dá)載體并鑒定,為進(jìn)一步研究其在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用奠定基礎(chǔ)。方法:設(shè)計(jì)合成兩條互補(bǔ)的編碼HIF1α-shRNA的DNA寡核苷酸單鏈,退火形成互補(bǔ)雙鏈,后將退火產(chǎn)物與酶切線性化的表達(dá)載體pG1.1連接后,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞DH5α中,提取重組質(zhì)粒并酶切鑒定,挑取克隆正確的重組質(zhì)粒去測序鑒定插入序列。結(jié)果:重組質(zhì)粒酶切結(jié)果顯示退火片段連接到pG1.1載體里,經(jīng)測序分析重組質(zhì)粒插入序列與合成的寡核苷酸序列一致。結(jié)論:HIF1α-shRNA表達(dá)載體構(gòu)建成功,為后續(xù)研究提供基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞
HIF1α;shRNA;載體構(gòu)建
中圖分類號: Q78;R378.11 ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識碼: A
DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2020.07.062
缺氧誘導(dǎo)因子-1(hypoxia-inducible factor-1, HIF-1)最初是從缺氧誘導(dǎo)的肝癌細(xì)胞Hep3B的細(xì)胞核中發(fā)現(xiàn)的一個轉(zhuǎn)錄因子,由氧敏感的α 亞基(HIF-1α)和持續(xù)穩(wěn)定表達(dá)的β亞基(HIF-1β)以異源二聚體的形式組成,HIF-1α是調(diào)節(jié)亞單位,決定HIF-1的活性,HIF-1β則與穩(wěn)定HIF-1及其二聚化有關(guān)[1]。已經(jīng)證實(shí),HIF-1可介導(dǎo)腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生一系列的缺氧適應(yīng)反應(yīng),與腫瘤細(xì)胞的糖酵解途徑密切相關(guān),使腫瘤細(xì)胞在相對缺氧的狀態(tài)下獲得更多的能量供應(yīng),以維持存活、生長和分裂[2]。本研究將構(gòu)建HIF1α-shRNA表達(dá)載體,為進(jìn)一步研究其在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用提供生物學(xué)基礎(chǔ)。
1 材料和方法
1.1 材料
表達(dá)載體pG1.1(武漢巴菲爾),限制性內(nèi)切酶BsaI、SacI (美國NEB),T4 DNA連接酶、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、感受態(tài)細(xì)胞DH5α(北京天根),DNA寡核苷酸由上海生工合成。
1.2 方法
1.2.1 序列設(shè)計(jì)合成
已驗(yàn)證有效干擾HIF1α表達(dá)的siRNA正義鏈序列為5'-GCCTCTTTGACAA
ACTTAA-3',依據(jù)pG1.1載體的插入位點(diǎn)和接頭結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)合成兩條互補(bǔ)的編碼HIF1α-shRNA的DNA寡核苷酸單鏈,結(jié)構(gòu)為BsaI +Sense+Loop+Antisensecomplement+終止信號+SacI+BsaI,具體序列見表1。
1.2.2 載體酶切回收
用BSAI完全酶切pG1.1載體,1%瓊脂糖凝膠電泳回收大片段,即為線性化載體。酶切體系如下:pG1.1 2μg,BsaI 2μl,10×buffer 4μl,100×BSA 0.4μl,H2O補(bǔ)足40μl,37℃水浴酶切過夜,酶切結(jié)果見圖1。
1.2.3 退火形成雙鏈
分別用30μl annealing buffer溶解2OD兩條互補(bǔ)DNA寡核苷酸單鏈,各取2μl,加16μl annealing buffer混勻,94℃退火自然冷卻至室溫,各取1μl退火產(chǎn)物加99μl H2O做100倍稀釋。
1.2.4 載體連接轉(zhuǎn)化
連接反應(yīng)體系如下:稀釋退火片段1μl,線性化載體1μl,5×Ligase Buffer 2μl,T4 DNA Ligase 1μl,H2O 5μl,4℃反應(yīng)過夜。取10μl連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,涂布于含Kana抗性(終濃度為30ug/ml)的LB平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜。從每個培養(yǎng)皿上挑取數(shù)個單克隆菌落接種于5ml含Kana抗性(終濃度為30ug/ml)的LB培養(yǎng)液中,37℃恒溫?fù)u床培養(yǎng)過夜。
1.2.5 載體鑒定
提取重組質(zhì)粒并分別用SacI做酶切鑒定,酶切體系如下:DNA 8.5μl,10 ×Buffer 1μl,SacI 0.5μl,37℃水浴反應(yīng)2h,1%瓊脂糖凝膠電泳,挑取克隆正確的重組質(zhì)粒去測序鑒定插入序列。
2 結(jié)果
因?yàn)檩d體pG1.1里面本來只有一個SacI的酶切位點(diǎn),但是重組質(zhì)粒能夠被SacI酶切出一條約900bp DNA條帶,說明退火片段連接到pG1.1載體里,酶切結(jié)果見圖2。經(jīng)測序分析重組質(zhì)粒插入序列與合成的寡核苷酸序列一致,HIF1α-shRNA表達(dá)載體構(gòu)建成功,測序比對結(jié)果見圖3。
3 討論
研究證明絕大多數(shù)實(shí)體腫瘤組織中存在缺氧微環(huán)境,這一刺激因素能增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞抗凋亡能力、促進(jìn)腫瘤血管生長、增加腫瘤對化療藥物耐受性,從多方面加速腫瘤的惡性進(jìn)展,尤為重要的是缺氧能誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),并在腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用[3]。腫瘤細(xì)胞對缺氧刺激的反應(yīng)體現(xiàn)在下游靶基因的表達(dá)變化而影響細(xì)胞的生物學(xué)功能,而調(diào)控這些差異表達(dá)基因的最為重要的轉(zhuǎn)錄因子就是HIF[4]。
HIF轉(zhuǎn)錄因子包括HIF1、HIF2和HIF3,它們在缺氧環(huán)境中發(fā)揮各自不同的功能,其中HIF1已被證實(shí)參與調(diào)控腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移、血管形成、糖酵解等過程,并與卵巢癌、宮頸癌、肺癌、乳腺癌等多種腫瘤不良預(yù)后密切相關(guān)[5]。HIF1由α及β兩個亞基聚合活化后才能入核調(diào)控下游靶基因的表達(dá)。HIF1α蛋白的氧依賴性降解區(qū)(oxygen-dependent degradation domain,ODD)脯氨酸在常氧條件下會被羥基化,使得HIF1α蛋白進(jìn)入E3泛素連接酶VHL(Von Hippel Lindau)介導(dǎo)的泛素化降解途徑,而β亞基(也被稱為芳香烴受體核轉(zhuǎn)位蛋白,aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator,ARNT)為組成性表達(dá),可穩(wěn)定存在。在缺氧條件下,穩(wěn)定的HIF1α與β亞基結(jié)合形成二聚體后入核,HIF1蛋白可作為轉(zhuǎn)錄因子募集CBP和p300結(jié)合到下游靶基因啟動子或增強(qiáng)子中的HRE上,激活靶基因的轉(zhuǎn)錄[6]。因此,HIF1α的穩(wěn)定性決定了HIF1的生物學(xué)功能的發(fā)揮。
本研究構(gòu)建了HIF-1α-shRNA表達(dá)載體,經(jīng)酶切和測序鑒定證實(shí)構(gòu)建成功。該表達(dá)載體在細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄生成shRNA后,通過Dicer酶剪切生成siRNA,從而干涉HIF-1α表達(dá)。該表達(dá)載體為后續(xù)研究HIF-1α的功能提供基礎(chǔ),可以瞬時干涉HIF-1α進(jìn)一步篩選后得到穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞株,觀察缺氧環(huán)境下腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲、遷移等改變,從而更深入認(rèn)識HIF-1α對腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)作用。
參考文獻(xiàn)
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