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與人類過招的病毒是從哪里來的

2020-05-19 15:14:57唐騁
風流一代·經(jīng)典文摘 2020年5期
關鍵詞:轉座子宿主細菌

唐騁

日前,世界衛(wèi)生組織(WHO)給新型冠狀病毒所致疾病確定下了正式名稱:COVID-19,而國際病毒分類委員會(ICTV)則宣布新型冠狀病毒的正式名稱為“嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2型”(SARS-CoV-2)。

雖然對于這種未知病毒的命名還存在不少爭議,但已有研究紛紛把“破案”線索指向了野生動物。為何致命病毒總是來自野生動物?又是怎樣的進化邏輯讓病毒如此狡猾,擁有與人類相較量的智慧和力量?要回答這些問題,就得先了解病毒這種古老生命體的起源與演化。

假說一,

遠古分子生命的復仇之魂

病毒的故事或許還要從遠古說起。幾十億年前,在那個了無生機的地球上,某些機緣巧合之下,海水中產(chǎn)生了史上第一批有機大分子,從而點燃了生命的星星之火。

慢慢地,有些大分子,比如RNA、DNA和蛋白質(zhì),開始或獨立、或彼此協(xié)作地復制自身,這個階段可以稱為“分子生命”。然而,在一片祥和的分子生命中,它們發(fā)展出了一個改變生命法則的結構,那就是細胞——擁有膜結構的細胞可以更好地保護其中嬌弱的RNA和蛋白質(zhì)等核心大分子,極大增強了這些生物的適應力。

有一種假說認為,病毒正是原始分子生命世界的遺民,它們在最后一刻創(chuàng)造出了寄生的生活方式,反過來利用了別人的細胞結構,宛如一群遠古的復仇之魂,對于奪取它家園的族裔進行著永恒的抗爭。

這個假說一度十分盛行,畢竟病毒的構造是如此簡單,甚至簡陋,它們與細胞生命的差異又是如此巨大。比如,引起這次疫情的冠狀病毒,以及每年冬天都會來報到的流感病毒,它們的遺傳物質(zhì)都是RNA,而不像細胞生物那樣利用DNA來承載自己的遺傳信息。

更實錘的證據(jù)來自于“擬病毒”,它就是一個RNA分子。擬病毒沒辦法直接感染細胞,但是它可以感染病毒。確切地說,擬病毒是在某些病毒感染細胞的時候,通過“搭便車”來順便復制自己、擴散自己,從而引發(fā)一些諸如人類丁型肝炎之類的疾病。

假說二,

劫持細菌老板的叛逃基因

在這個假說里,基因為了讓自己流傳下去,什么事情都做得出來。

細菌中廣泛存在一種名叫“質(zhì)粒”的小片段環(huán)狀DNA,它們基本上就是一群打工仔、臨時工,細菌隨時可以從環(huán)境中吸收它們?yōu)榧核茫材茈S時趕走它們。

“我們不要一輩子打工!”于是,在漫長的演化中,有些質(zhì)粒開始嘗試一件事:它們走上了“叛變”之路,反過來把它們的細菌老板給“劫持”了,奪走細菌所有的營養(yǎng)來復制自身。隨著時間推移,它們中的一部分就演化成了病毒。

人類以及所有動植物的細胞跟細菌很不一樣,我們都屬于真核生物,細胞中并沒有細菌那樣的質(zhì)粒。但在真核生物細胞里,還是有那么一些基因會蠢蠢欲動,它們不肯在染色體上好好待著,而是在細胞核里的染色體上左右橫跳,跑來跑去。不過這幫調(diào)皮搗蛋的基因倒是有一個仙風道骨的名字——轉座子。

根據(jù)分子生物學檢測,很多轉座子都擁有與病毒非常相似的基因序列,兩者將自己整合進宿主細胞染色體的機制也高度相似。尤其是病毒樣逆轉錄轉座子,與某些病毒簡直一模一樣。唯一不同的,只是這些轉座子還不能像病毒一樣,在細胞之間遷移。

然而,病毒的身世到這里依舊撲朔迷離,因為它們根本就不遵循一般生物的演化模式。

病毒感染的一般流程是:把自己的基因注入宿主細胞中,然后利用宿主細胞復制自己的基因,并且制造構建病毒顆粒所需的各種材料,最后操控細胞將病毒顆粒的各個零件連同病毒的基因一起包裝成新的病毒顆粒,釋放出去感染別的細胞。但在這個過程中,病毒每時每刻都在和各種生物交換基因。比如,病毒在指揮宿主細胞包裝病毒顆粒時,有時候會把一些宿主細胞的DNA一塊兒包進去,或者不小心在宿主細胞中留一點點自己的基因。

哺乳動物的基因中,ERVW-1基因可以阻止母體免疫系統(tǒng)攻擊胎兒,這就是某個病毒在一億多年前,不小心落在我們祖先細胞中的。病毒在跨物種傳播時,經(jīng)常導致基因從一個物種轉移到另一個物種,這也成為大自然中“轉基因”的一條途徑。

正因為病毒的“轉基因”如此之頻繁,讓人不得不重新思考:病毒真是叛逃的基因嗎?還是那些轉座子其實是病毒偶然留在細胞中的基因“禮物”呢?

假說三,

病毒或為沉淪的細胞生物

2003年,科學家發(fā)現(xiàn)了一種非常不講道理的病毒——“擬菌病毒”。這個病毒的體型達到了0.4至0.5微米,在顯微鏡下看,個頭和細菌差不多。引發(fā)此次疫情的冠狀病毒也被認為是比較大的一類病毒,但其體型還不到0.1微米。

2008年,科學家發(fā)現(xiàn)了第二種大病毒,將其命名為 “媽媽病毒”。此后,一種又一種“大病毒”開始接二連三地出現(xiàn)在人類視野中,2013年發(fā)現(xiàn)的“潘多拉病毒”更是把最大病毒的體型刷新到了1微米以上。

從此,病毒與某些單細胞生物的界限開始變得模糊。比如,擬菌病毒的結構與基因和一類叫作“古菌”的單細胞生物非常相似。唯一不同的是,擬菌病毒丟失了一部分自主完成細胞分裂的關鍵基因,所以不得不寄生在其他生物的細胞中,利用宿主細胞來生長繁殖。

于是,這就引發(fā)了病毒起源的第三種假說,認為病毒本質(zhì)上是墮落的細胞生物——有些單細胞生物在長期寄生生活中,逐漸退化掉絕大部分細胞結構,最終變成了病毒這種“活死人”般的樣子。而像擬菌病毒這樣的生物,可能就是剛剛開始墮落的古菌。

進化推手,

在生物演化史上烙下深印

那么,病毒究竟應是遠古的復仇之魂,還是叛逃的基因,抑或是墮落的細胞生物呢?這三種假說都有合理之處,同時也都存在著不能解釋的問題。也許,病毒起源的故事遠比這一切假說都更加復雜,甚至它的起源也未必是唯一的。

這也給科學家的研究帶來了數(shù)不清的煩惱,因為很難將病毒像細胞生物那樣根據(jù)親緣關系來分類,所以大部分病毒還是以它們的形態(tài)和引發(fā)的癥狀來粗糙歸類,比如說冠狀病毒就是因為在電子顯微鏡下看起來有很多凸起,樣子像皇冠一樣而得名。

盡管我們還沒弄明白病毒從何而來,但是病毒卻真真切切地在生物的演化中留下了深深的烙印。

病毒與生物之間的斗爭,也一直是演化的最強推手之一。由于病毒無比強大的變異能力,我們可能無法預測下一個對我們有致命威脅的病毒會在何時何地出現(xiàn)。這最終逼得很多生物不得不采取一些獲得更多基因變異后代的手段。比如,有性生殖就可以讓一個生物的后代有著不同的基因組合,它所帶來的基因多樣性,盡可能保障了所有后代不至于被一種病毒“全殲”。

同時,病毒還打破了生殖隔離的壁障,讓基因得以在不同物種之間流動。所以,病毒雖不屬于生命演化之樹上的任何一個枝丫,但它們宛若圍繞在演化之樹上的流螢,在這棵樹上處處都留下它們的痕跡。

(作者系中國科學院腦科學與智能技術卓越創(chuàng)新中心博士研究生)

(張迪摘自2020年2月23日《文匯報》)

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