国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

內(nèi)蒙古鄂爾多斯市野生羊肚菌ITS初步鑒定

2020-05-23 06:40康立茹于傳宗王海燕李亞嬌孫國琴
北方農(nóng)業(yè)學(xué)報 2020年1期
關(guān)鍵詞:學(xué)名菌類羊肚

龐 杰,劉 海,康立茹,于傳宗,王海燕,李亞嬌,孫國琴

(1.內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010031;2.食用菌內(nèi)蒙古自治區(qū)工程研究中心,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010031;3.鄂托克旗草原工作站,內(nèi)蒙古 烏蘭鎮(zhèn) 016100)

羊肚菌(Morchella esculenta)隸屬于子囊菌門(Ascomycota) 盤 菌 綱(Pezizomycetes) 盤 菌 目(Pezizales) 羊肚菌科(Morchellaceae)羊肚菌屬(Morchella),是世界公認(rèn)的一類珍貴、稀有食(藥)用真菌,在歐洲被認(rèn)為是僅次于塊菌的美味食用菌[1]。在北美洲、亞洲(中國、日本、印度、朝鮮)和歐洲均有分布,在我國的分布范圍比較廣泛,主要分布在西南、中原、華中、華東區(qū)域。目前,關(guān)于內(nèi)蒙古地區(qū)野生羊肚菌研究尚屬空白。

羊肚菌屬根據(jù)形態(tài)特征被劃分為四大類群:黑色羊肚菌類、黃色羊肚菌類、半開羊肚菌類和變紅羊肚菌類[2-4]?,F(xiàn)代分子系統(tǒng)發(fā)育分析認(rèn)為,羊肚菌屬由黃色羊肚菌(Esculenta)支系、黑色羊肚菌(Elata)支系和變紅羊肚菌(Rufobrunnea)支系構(gòu)成,半開羊肚菌類被劃分到黑色羊肚菌支系中[5-6]。杜習(xí)慧等[7]將我國羊肚菌分布劃分為六個區(qū)域,其中歐亞草原亞區(qū)和中亞荒漠亞區(qū)的羊肚菌有待調(diào)查和研究。內(nèi)蒙古地處我國北疆,生態(tài)類型多樣,生物多樣性豐富。筆者在內(nèi)蒙古鄂爾多斯市進(jìn)行野外食用菌資源調(diào)查中發(fā)現(xiàn)了野生羊肚菌的分布,并且鄂爾多斯地區(qū)地處歐亞草原亞區(qū)和中亞荒漠亞區(qū)交匯地區(qū),目前上述地區(qū)羊肚菌鑒定工作尚屬空白。因此,該項研究工作的開展填補(bǔ)了內(nèi)蒙古羊肚菌鑒定的空白。

1 材料和方法

1.1 材料

羊肚菌子實體采集于內(nèi)蒙古鄂爾多斯市獨貴塔拉鎮(zhèn)附近,采集時間為2016年4月,標(biāo)本保藏于內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所(圖1)。

1.2 羊肚菌菌種分離

分離方法和培養(yǎng)基配方參見文獻(xiàn)[8]。

1.3 DNA 提取、ITS 擴(kuò)增及測序

DNA 提取采用CTAB 法[9],PCR 反應(yīng)體系參考王凱[10]所采用的方法。PCR 引物為ITS1/4,由上海生工生物工程有限公司合成;ITS 測序由北京博邁德基因技術(shù)有限公司完成。

1.4 數(shù)據(jù)處理

測序數(shù)據(jù)提交NCBI 數(shù)據(jù)庫和羊肚菌多基因序列模標(biāo)數(shù)據(jù)庫(Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫),獲得比對數(shù)據(jù);采用MEGA v7.0.14 軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及遺傳距離的計算,遺傳距離采用鄰接法(Neighbor-joining methhod)。

2 結(jié)果與分析

2.1 ITS 測序NCBI 數(shù)據(jù)庫比對結(jié)果分析

將培養(yǎng)的菌絲體提取DNA 并經(jīng)過PCR,交測序公司進(jìn)行測序。測定的樣品子實體rDNA ITS 序列長度為1 185 bp,其中CG 為54.43%,測序質(zhì)量優(yōu)良,將測得的序列提交至NCBI 數(shù)據(jù)庫,獲得序列號為MN872380。

將測序獲得的堿基序列提交至NCBI 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(2019年12月27日),共計獲得100 個比對結(jié)果,最大評分范圍為1 884~1 029;同源性范圍為97.97%~88.19%。進(jìn)一步對100 個比對結(jié)果進(jìn)行分析,結(jié)果將目標(biāo)羊肚菌分在8 種類型中(表1),剔除無法獲得準(zhǔn)確名稱的Morchella sp. 和Uncultured Morchella,目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)可能的學(xué)名為M. spongiola、M. esculenta、M. prava、M. dunensis、M. vulgaris、M. crassipes。

表1 ITS 序列在GenBank 中比對結(jié)果(2019-12-27)

進(jìn)一步選用NCBI 數(shù)據(jù)庫51 個有確定拉丁學(xué)名的DNA 序列結(jié)果,采用遺傳距離的計算(鄰接法,Neighbor-joining methhod)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及遺傳距離的計算。結(jié)果表明,目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)單獨成一類,與其他相關(guān)的DNA 序列結(jié)果都不接近(圖2)。

2.2 Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫比對結(jié)果分析

為了進(jìn)一步確定目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380),將ITS 測序結(jié)果提交至Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫[7]進(jìn)行比對,獲得50 個比對結(jié)果,評分范圍為1 586.55~1 228.35,相似性范圍為98.03~94.20,重疊百分比范圍為90.13%~73.92%。進(jìn)一步對50 個比對結(jié)果進(jìn)行分析,結(jié)果將目標(biāo)羊肚菌分在4 種類型中(表2),剔除無法獲得準(zhǔn)確名稱的Morchella sp.,目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)可能的學(xué)名為M. spongiola、M. prava、M. esculenta。

進(jìn)一步選用Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫27 個有確定拉丁名的DNA 序列結(jié)果,采用MEGA v7.0.14 軟件對其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及遺傳距離的計算(鄰接法)。結(jié)果表明,目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)與KM485935、JQ691480、EU834822 和EU834821 分在一類(圖3)。

表2 ITS 序列在Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫中比對結(jié)果(2019-12-27)

3 結(jié)論與討論

羊肚菌屬由黃色羊肚菌(Esculenta)支系、黑色羊肚菌(Elata)支系和變紅羊肚菌(Rufobrunnea)支系構(gòu)成[5-6]。WIPF 等[11]對黃色羊肚菌和黑色羊肚菌的ITS 序列進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)黑色羊肚菌的ITS 序列長度為740~750 bp,黃色羊肚菌的ITS 序列長度為1 150~1 220 bp,本次采集的羊肚菌ITS 序列長度為1 185 bp,因此推斷為黃色羊肚菌支系。

進(jìn)一步對兩個數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,雖然通過Morchella MLST 數(shù)據(jù)庫比對結(jié)構(gòu)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹中將目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)與KM485935、JQ691480、EU834822 和EU834821 分 在 一 類,但是,有同一類拉丁學(xué)名并不統(tǒng)一,相同拉丁學(xué)名也在不同類別當(dāng)中出現(xiàn)的問題。并且在NCBI 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)一步檢索KM485935、JQ691480、EU834822和EU834821 的相關(guān)信息,無法獲取準(zhǔn)確地采集地等信息。綜上所述,鄂爾多斯地區(qū)分布有黃色羊肚菌類(yellow morels),但其拉丁學(xué)名尚不能通過單一的ITS 確認(rèn),目標(biāo)測序結(jié)果(MN872380)的拉丁學(xué)名確定,仍需要進(jìn)一步采取LSU、EFla、RPB1 和RPB2 等多基因聯(lián)合分析才能完成[12]。

猜你喜歡
學(xué)名菌類羊肚
什么是植物的拉丁學(xué)名
草莓主要害蟲名錄
小小羊肚菌 拓寬致富路
潤楠[Machilus nanmu(Oliver)Hemsley]學(xué)名訂正過程及四川所產(chǎn)形態(tài)特征
菌類蔬菜交叉種植一地雙收
《羊肚菌“喝水”有學(xué)問》
羊肚菌藥膳之“揚眉吐氣”
在雨后,與菌有約嗎?
葡萄園套種“羊肚菌” 增收增效又環(huán)保
豬苓的稱謂及學(xué)名更替