任建軍 牛東澤 湯姚 張晉 田英申 李春雨
關(guān)鍵詞:特丁噻草隆;降解菌;生物降解
中圖分類號(hào):S482.4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1000-4440(2020)02-0526-03
Key words:tebuthiuron;degrading bacteria;biodegradation
隨著現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的不斷發(fā)展,農(nóng)藥被廣泛應(yīng)用于病蟲害的防治中,這極大地提高了糧食產(chǎn)量。但是,農(nóng)藥的頻繁使用和超劑量施用會(huì)導(dǎo)致土壤中農(nóng)藥殘留量超標(biāo),特別是新型農(nóng)藥具有熱穩(wěn)定性強(qiáng)、不易光解等特點(diǎn),很難在自然條件下快速降解[1-2]。土壤中的農(nóng)藥殘留不僅影響食品安全,也給人畜的生活環(huán)境和健康帶來了巨大威脅[3]。因此,有效解決土壤中農(nóng)藥殘留帶來的污染問題已迫在眉睫。
目前,常用的土壤農(nóng)藥殘留修復(fù)技術(shù)包括物理修復(fù)技術(shù)、化學(xué)修復(fù)技術(shù)和生物修復(fù)技術(shù)。但是,物理修復(fù)技術(shù)和化學(xué)修復(fù)技術(shù)主要用于修復(fù)工業(yè)污染農(nóng)田的土壤[4],因其存在設(shè)備昂貴,處理成本高,可能產(chǎn)生二次污染等問題,所以很少用于修復(fù)農(nóng)藥污染的農(nóng)田土壤[5]。生物修復(fù)技術(shù)具有成本低,無二次污染,可以改善土壤結(jié)構(gòu)等優(yōu)點(diǎn),能夠降解農(nóng)藥等大多數(shù)有機(jī)污染物,可將污染物徹底分解為二氧化碳、水、無機(jī)化合物等對(duì)環(huán)境和人畜無害的物質(zhì)[6-7]。
特丁噻草隆是一種滅生性的雜環(huán)取代脲類除草劑[8],因其具有藥效高、毒性小等特點(diǎn)而被用于控制多種農(nóng)林作物的雜草,并且因其在土壤和水體中的高溶解度、低生物降解性及潛在的可致癌性,受到學(xué)者的廣泛關(guān)注[9]。但是,目前關(guān)于特丁噻草隆微生物降解的研究較少。因此,本研究擬篩選特丁噻草隆的高效降解菌,并研究其對(duì)特丁噻草隆的降解特性,以期為特丁噻草隆污染的修復(fù)提供方法和理論依據(jù)。
1材料與方法
1.1供試儀器及試驗(yàn)材料
特丁噻草隆純品及主要化學(xué)試劑(分析純)購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司,分子生物試劑購自寶生物工程(大連)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購自于南京奧青生物技術(shù)有限公司。土壤樣品由河北慈心環(huán)??萍加邢薰咎峁?,采集于長期施用特丁噻草隆的農(nóng)田以及特丁噻草隆生產(chǎn)工廠排污口的污泥。試驗(yàn)主要器材包括:恒溫?fù)u床、電泳儀、自動(dòng)凝膠圖像分析儀、恒溫培養(yǎng)箱、高速離心機(jī)、高壓滅菌鍋、通風(fēng)干燥箱、超純水儀、紫外分光光度計(jì)、高效液相色譜儀、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀。
基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基:KH2PO4 0.5 g、K2HPO4 1.5 g、NaCl 1.0 g、(NH4)2SO4 2.0 g、MgCl2 0.1 g、去離子水1 000 ml、pH 7.0,以特丁噻草隆為碳源,根據(jù)需要調(diào)整特丁噻草隆的濃度,基礎(chǔ)鹽固體培養(yǎng)基為基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基中再添加1.5%的瓊脂。Luria-bertani(LB)培養(yǎng)基:酵母粉5.0 g、氯化鈉10.0 g、胰蛋白胨10.0 g、去離子水1 000 ml,LB固體培養(yǎng)基為LB培養(yǎng)基中再添加1.5%的瓊脂。
1.2試驗(yàn)方法
1.2.1富集與分離
取5 g特丁噻草隆污染土樣,加入特丁噻草隆質(zhì)量濃度為100 mg/L的基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基中,置于37 ℃、180 r/min條件下培養(yǎng)7 d,以3%的接種量將其接入相同的培養(yǎng)基中,傳代3次。取1 ml富集培養(yǎng)物分別進(jìn)行梯度(1×10-5、1×10-6、1×10-7)稀釋,用移液槍吸取100 μl,分別涂布于特丁噻草隆質(zhì)量濃度為100 mg/L的基礎(chǔ)鹽固體培養(yǎng)基上,置于37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)35 d,選擇有透明光圈的菌落在LB固體培養(yǎng)基上劃線培養(yǎng),挑取單菌落,通過培養(yǎng)得到純化菌株。
1.2.2菌株鑒定
通過16S rRNA基因序列鑒定純化菌株的種屬[10]。以降解菌的基因組DNA為模板,擴(kuò)增16S rRNA基因,用16S通用引物,即27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′和1492R:5′-TACCTTGTTACGACTT-3′。25.00 μl擴(kuò)增體系為:10×Buffer 2.50 μl,脫氧核糖核苷三磷酸(2.5 mmol/μl) 2.00 μl,引物(25.0 mmol/μl)各0.75 μl,MgCl2(25.0 mmol/μl) 2.50 μl,模板DNA 0.25 μl,rTaq DNA聚合酶(5 U/μl) 0.20 μl,用雙蒸水(ddH2O)補(bǔ)齊至25.00 μl。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)條件為:95 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,53 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,循環(huán)35次,72 ℃延伸10 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司完成測序,基因序列在NCBI上進(jìn)行Blast比對(duì)分析,并與GenBank中其他菌株的16S rRNA基因序列進(jìn)行同源性比較,利用Mega 6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.2.3特丁噻草隆質(zhì)量濃度的測定
發(fā)酵樣品過濾后,用高效液相色譜法(HPLC)進(jìn)行檢測[8],條件為:C18(250.0 mm×4.6 mm,長度×內(nèi)徑)不銹鋼柱,流動(dòng)相是甲醇+0.1%甲酸/超純水(75/25,體積比),流速為1.0 ml/min,進(jìn)樣體積為10 μl,柱溫為25 ℃,保留時(shí)間為5 min,檢測波長為255 nm。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線方程Y=0.971 8x-2.746 6(R2=0.998 7)計(jì)算特丁噻草隆的質(zhì)量濃度。
1.2.4降解菌生長狀況和降解性能的測定
將篩選出的降解菌及其混合菌(等量混合)分別按0.5%接種于含400 mg/L特丁噻草隆的基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基中,置于37 ℃、180 r/min恒溫?fù)u床中培養(yǎng)7 d,測定特丁噻草隆的質(zhì)量濃度和OD600的吸光值。
1.2.5吐溫-80對(duì)特丁噻草隆降解率的影響
將篩選出的降解菌及其混合菌分別按0.5%接種于含400 mg/L特丁噻草隆和0.5%吐溫-80的基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基中,置于37 ℃、180 r/min恒溫?fù)u床中培養(yǎng)7 d,測定特丁噻草隆的質(zhì)量濃度,并計(jì)算降解率。
1.2.6數(shù)據(jù)處理
利用DPS軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并用ANOVA方法進(jìn)行多重比較,采用Duncans方法檢驗(yàn)差異顯著性。
2結(jié)果與分析
2.1特丁噻草隆降解菌的篩選與鑒定
本試驗(yàn)從受污染的土樣中篩選出15種菌株,對(duì)其進(jìn)行富集馴化、分離純化、初篩和復(fù)篩,最終選出了4株能在以特丁噻草隆作為唯一碳源的選擇性培養(yǎng)基上生長的菌株,并將其分別命名為T2-1、T2-2、T2-3和T2-4。以菌株的總DNA為模板,擴(kuò)增16S rRNA基因片段1.5 kb左右。將測序結(jié)果提交至NCBI在線Blast上,并用16S rRNA基因序列構(gòu)建進(jìn)化樹,結(jié)果表明,T2-1為殺香魚假單胞菌(Pseudomonas plecoglossicida),T2-2為臺(tái)灣銅綠假單胞菌(Cupriavidus Taiwanensis),T2-3為惡臭假單胞菌(Pseudomonas putida),T2-4為施氏假單胞菌(Pseudomonas stutzeri)。
2.2降解菌的生長和降解性能
不同降解菌對(duì)特丁噻草隆降解性能的研究結(jié)果表明,降解菌T2-1、T2-2、T2-3、T2-4和混合菌對(duì)特丁噻草隆的降解量分別為11.39 mg/L、11.53 mg/L、10.95 mg/L、7.38 mg/L和15.27 mg/L,對(duì)應(yīng)的降解率分別為0.028 5、0.028 8、0.027 4、0.018 5和0.038 2。由此可知,混合菌的降解效果最好,在單菌降解中,T2-1和T2-2的降解效果較好。不同降解菌在降解培養(yǎng)基中的生長情況表明,降解菌T2-1、T2-2和T2-4的菌體生物量增長明顯,而T2-3和混合菌的菌體生物量幾乎沒有變化。
2.3 ?吐溫-80對(duì)降解菌降解特丁噻草隆效果的影響
結(jié)果表明,降解菌T2-1、T2-2、T2-3、T2-4和混合菌在添加0.5%吐溫-80的基礎(chǔ)鹽培養(yǎng)基中,降解量分別為20.12 mg/L、27.37 mg/L、23.89 mg/L、23.20 mg/L和32.43 mg/L,對(duì)應(yīng)的特丁噻草隆降解率分別為0.050 3、0.068 4、0.059 7、0.058 0和0.081 1。由此可知,吐溫-80能夠明顯提高降解菌對(duì)特丁噻草隆的降解率。
3討論
用于農(nóng)藥殘留生物修復(fù)的微生物包括芽孢桿菌屬、假單胞菌屬、克雷伯氏菌屬、黃單胞菌屬等[10-11]。假單胞菌是重要的生物降解資源[11-13]。本研究篩選出4株降解菌,包括殺香魚假單胞菌、臺(tái)灣銅綠假單胞菌、惡臭假單胞菌和施氏假單胞菌,均可用于降解環(huán)境中的特丁噻草隆等有機(jī)污染物。除此以外,假單胞菌還可以用于生物防治,是具有潛力的生物防治菌種資源[9,14]。微生物降解農(nóng)藥等有機(jī)污染物的本質(zhì)是一系列酶促反應(yīng),單一微生物往往不具備降解有機(jī)物所需要的全部酶,因此,多種微生物協(xié)同作用能夠加快有機(jī)污染物的降解。有研究結(jié)果表明,紅球菌屬和假單胞菌屬混合培養(yǎng)可以明顯提高氯氰菊酯的降解率[15-16]。本研究發(fā)現(xiàn),殺香魚假單胞菌、臺(tái)灣銅綠假單胞菌、惡臭假單胞菌和施氏假單胞菌混合后對(duì)特丁噻草隆的降解率更高。表面活性劑充分保證了底物與微生物的接觸,有利于微生物的降解作用[17]。本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),吐溫-80能提高假單胞菌對(duì)特丁噻草隆的降解率。
盡管本研究對(duì)分離菌株的降解率進(jìn)行了研究,但特丁噻草隆的生物降解途徑和代謝產(chǎn)物尚不明確。在今后的研究中,可以改進(jìn)代謝產(chǎn)物的提取方法,優(yōu)化檢測系統(tǒng),進(jìn)一步探索其降解機(jī)理,同時(shí)優(yōu)化降解條件,更好地促進(jìn)其在特丁噻草隆污染修復(fù)中的應(yīng)用。
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(責(zé)任編輯:王妮)