陳東榮,肖 凱,段林偉,張 明
(廣西大學(xué) 亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動(dòng)物繁殖研究所,南寧 530004)
NLRP5[pyrin domain(PYD)containing proteins 5]基因是胚胎需要的母體抗原,也稱為Mater(maternal antigen that embryos require),是在哺乳動(dòng)物中最早被鑒定的母源效應(yīng)基因之一[1]。NLRP5屬于NLRP(nucleotide-binding oligomerization domain,leucine rich repeat and pyrin domain containing proteins)蛋白家族。人類有14 種NLRP成員,分別為NLRP1~NLRP14,在小鼠中已報(bào)道有20個(gè)NLRP成員蛋白[2-3]。NLRP家族成員包括三個(gè)結(jié)構(gòu)域定義,分別是PYD、NACHT、LRR結(jié)構(gòu)域。N末端區(qū)域?yàn)镻YD結(jié)構(gòu)域,主要參與炎癥和細(xì)胞凋亡;LRR結(jié)構(gòu)域調(diào)節(jié)不同細(xì)胞功能的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用;猜測(cè)NACHT結(jié)構(gòu)域可與ATP/鳥(niǎo)苷三磷酸結(jié)合[2]。NLRP家族基因可以分為免疫相關(guān)基因和生殖相關(guān)基因,免疫相關(guān)基因包括NLRP1、NLRP3、NLRP6、NLRP10 和NLRP12,其他的NLRP是生殖相關(guān)基因[3]。敲除Nlrp5基因后,小鼠的早期胚胎阻滯在2細(xì)胞期,表明Nlrp5在早期胚胎發(fā)育過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用[1]。在豬卵母細(xì)胞中顯微注射dsRNA干擾NLRP5,胚胎停滯在2~8細(xì)胞階段[4];沉默獼猴的NLRP5基因,早期胚胎也阻滯在8~16細(xì)胞期[5-6]。此外,NLRP5、FILIA、OOEP(FLOPED)、PADI6和TLE6被確認(rèn)為皮質(zhì)下母源效應(yīng)復(fù)合物(SCMC),是位于卵母細(xì)胞和胚胎皮層下的一種多蛋白復(fù)合物,對(duì)胚胎發(fā)生至關(guān)重要[7-8]。與NLRP5蛋白同家族的NLRP2和NLRP7有可能是皮質(zhì)下母源效應(yīng)復(fù)合物的成員[9-10]。上述研究表明NLRP5是動(dòng)物卵母細(xì)胞和早期胚胎發(fā)育的相關(guān)基因。
關(guān)于水牛NLRP5基因的研究較少,此外,生物制品市場(chǎng)上缺乏水牛母源基因抗體商品,難以對(duì)它們的功能和定位等機(jī)制進(jìn)行深入研究。本試驗(yàn)以水牛為研究對(duì)象,克隆水牛NLRP5基因序列,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并通過(guò)構(gòu)建水牛NLRP5原核表達(dá)載體對(duì)NLRP5蛋白的表達(dá)條件進(jìn)行優(yōu)化,然后進(jìn)行純化,制備多克隆抗體,用Western blot分析該基因在水牛各組織的表達(dá)特性,為研究水牛NLRP5在水牛生殖過(guò)程中的功能奠定基礎(chǔ)。
水牛卵巢、心臟和肝臟等組織,取自南寧市肉聯(lián)廠屠宰分廠。原核表達(dá)載體pET-32a(+)質(zhì)粒,廣西大學(xué)亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存并提供。感受態(tài)細(xì)胞5α和BL21(DE3),購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司。4周齡昆明小白鼠,購(gòu)自廣西醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。
2×Rapid Taq Master Mix、2×Phanta Max Master Mix和膠回收試劑盒,購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒、pMD18-T載體、限制性內(nèi)切酶和T4 DNA連接酶,購(gòu)自寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司;堿磷酶馬抗小鼠標(biāo)記IgG,購(gòu)自北京中杉金橋有限公司;預(yù)染蛋白Marker,購(gòu)自賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司和生工生物工程(上海)股份有限公司。
1.3.1 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)NCBI公布的水牛NLRP5基因預(yù)測(cè)序列(XM_006041797.2),用Oligo7.0軟件設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物。所有引物(見(jiàn)表1)由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
表1 NLRP5基因克隆引物序列
1.3.2 總RNA的提取與cDNA的合成 收集GV期的水牛卵母細(xì)胞,直接用微量提取試劑盒提取卵母細(xì)胞總RNA。取高溫滅菌的研缽置于無(wú)菌超凈臺(tái)中,先倒入液氮預(yù)冷研缽,待液氮揮發(fā)完將水牛各組織樣品放研缽中用剪刀剪碎,再加入液氮淹沒(méi)組織;液氮快揮發(fā)完時(shí)用研磨棒研磨組織,組織會(huì)越來(lái)越細(xì),再加入液氮繼續(xù)研磨。整個(gè)過(guò)程需添加4~5次液氮研磨,最后將組織研磨成粉末,再盛于預(yù)冷的滅菌EP管中。采用TRIzol法提取總RNA,通過(guò)分光光度計(jì)檢測(cè)總RNA的濃度和純度。利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒將細(xì)胞和各組織的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA樣品,-80℃保存。
1.3.3 PCR擴(kuò)增 以反轉(zhuǎn)錄后的cDNA為模板,用基因特異性引物進(jìn)行PCR。反應(yīng)體系:2×Phanta Max Master Mix 12.5μL,上下游稀釋引物各1μL,DNA模板2μL,RNase-FreeH2O8.5μL。PCR擴(kuò)增程序:第一步預(yù)變性95℃5 min;第二步95℃15 s,60℃15 s,72℃30 s,34個(gè)循環(huán);第三步72℃5 min。PCR結(jié)束后將產(chǎn)物用2×Rapid Taq Master Mix進(jìn)行72℃20 min加A尾。
擴(kuò)增且添加A尾的產(chǎn)物進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,確定目的片段大小。利用膠回收試劑盒回收目的片段,將膠回收產(chǎn)物連接pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化5α感受態(tài)細(xì)胞,涂于氨芐青霉素LB培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng)過(guò)夜。挑取單菌落進(jìn)行PCR擴(kuò)增鑒定,取陽(yáng)性菌落送生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。
1.3.4 水牛NLRP5基因序列的生物信息學(xué)分析用DNAStar軟件的SeqMan將測(cè)序的4段序列拼接成完整的CDS序列。用Megalign軟件將克隆出來(lái)的序列與預(yù)測(cè)序列進(jìn)行同源性比對(duì),在NCBI上下載其他物種的NLRP5基因進(jìn)行同源性比對(duì)。
1.3.5 原核表達(dá)載體的構(gòu)建 根據(jù)克隆出來(lái)NLRP5序列,對(duì)NLRP5多肽的親水性、疏水性和線性表位等指標(biāo)進(jìn)行分析,選取親水性和免疫原性較好的480 bp片段進(jìn)行原核表達(dá)。再根據(jù)pET-32a(+)載體圖譜,設(shè)計(jì)分別含有限制性內(nèi)切酶HindⅢ和EcoRⅠ酶切位點(diǎn)的上、下游引物。引物序列:PET32a-NLRP5,F(xiàn)5′-GGCAAGGGAC-3′,R5′-ATTTaagcttgCGGGACCGGGGCGTCCGGCCACTC-3′。以卵母細(xì)胞的cDNA為模板,用帶有酶切位點(diǎn)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲取原核表達(dá)目的片段。連接pMD18-T載體,獲得重組質(zhì)粒pMD18-T-NLRP5,將其雙酶切后亞克隆至原核表達(dá)載體pET-32 a(+),PCR鑒定和酶切鑒定后進(jìn)行測(cè)序。
1.3.6 重組蛋白的表達(dá)及純化 將pET-32a-NLRP5重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,37℃220 r/min培養(yǎng)至菌液光密度值(OD600)達(dá)0.6左右,加入終濃度分別為0,0.05,0.1,0.2,0.3,0.4,0.5 mmol/L的IPTG,30℃誘導(dǎo)6 h。取誘導(dǎo)表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析,以確定目的蛋白所需IPTG最佳濃度誘導(dǎo)。在最佳濃度及30℃條件下分別誘導(dǎo)0,2,4,6,8,10 h,確定目的蛋白最佳誘導(dǎo)時(shí)間。用液氮反復(fù)凍融法裂解菌體,離心后分別收集上清液與菌體沉淀,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析,鑒定重組蛋白的表達(dá)形式。然后用鎳柱純化包涵體蛋白,將純化后的重組蛋白復(fù)性透析,再用His標(biāo)簽抗體鑒定。
1.3.7 免疫程序及多克隆抗體制備 1)首次免疫:將等體積的重組蛋白與弗氏完全佐劑混合,完全乳化后用注射器注射到小鼠背部皮下,采用多點(diǎn)注射。
2)第14,21,35天用重組蛋白與弗氏不完全佐劑等體積混合乳化,背部多點(diǎn)注射加強(qiáng)免疫。
3)第42天,采集小鼠血液,4℃靜置2 h,4℃12 000 r/min離心10 min,分裝,析出血清,-80℃保存,備用。
1.3.8 鼠抗NLRP5多克隆抗體的鑒定 先用制備的多克隆抗體與重組蛋白進(jìn)行Western blot,檢驗(yàn)抗體效價(jià),再用抗體血清檢測(cè)水牛NLRP5蛋白在卵母細(xì)胞及顆粒細(xì)胞的特異性表達(dá)情況。取200個(gè)GV期的卵母細(xì)胞和收集的顆粒細(xì)胞進(jìn)行SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)PVDF膜和脫脂牛奶封閉后,NLRP5抗體37℃孵育2 h,二抗37℃孵育1 h,最后堿性磷酸酯酶顯色,Bio-Rad成像儀曝光分析。
對(duì)以卵母細(xì)胞的cDNA為模板設(shè)計(jì)的4段特異性引物進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,電泳檢測(cè)條帶分別為866,942,764,1 002 bp,與預(yù)期片段大小相符,見(jiàn)圖1。用DNAStar的SeqMam軟件將4段序列拼接成完整的CDS序列,共3 297 bp。首次克隆得到水牛NLRP5基因CDS全長(zhǎng)序列,由1 098個(gè)氨基酸編碼。通過(guò)ExPasy在線軟件預(yù)測(cè)出NLRP5蛋白分子質(zhì)量為121.17 kD,預(yù)測(cè)等電點(diǎn)為6.78。
選擇水牛NLRP5(XM_006041797.2)及NCBI上公布的綿羊(XM_027978862.1)、山羊(XM_018063503.1)、牛(XM_012537380.1)、野豬(XM_005664875.3)、小鼠(NM_011860.3)、獼猴(NM_001127631.1)、倭黑猩猩(XM_003809864.2)和智人(NM_153447.4)等物種的NLRP5基因序列,應(yīng)用DNAStar MegAlign構(gòu)建NLRP5序列同源性比對(duì),結(jié)果見(jiàn)圖2。由結(jié)果可見(jiàn)水牛與牛和山羊的基因同源性分別為96.3%和93.9%,最低的同源性也有58.1%,說(shuō)明物種間具有一定的保守性。
PCR擴(kuò)增后瓊脂糖凝膠電泳得到500 bp的目的條帶,與預(yù)期大小(480 bp)相符,見(jiàn)圖3。用限制性內(nèi)切酶HindⅢ和EcoRⅠ對(duì)重組質(zhì)粒和pET-32a(+)質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,回收酶切后的NLRP5目的基因和pET-32a(+),用T4連接酶16℃連接過(guò)夜,獲得重組質(zhì)粒pET-NLRP5。再用HindⅢ和EcoRⅠ酶切重組質(zhì)粒pET-NLRP5也得到預(yù)期的目的條帶,結(jié)果見(jiàn)圖4。測(cè)序結(jié)果與NCBI預(yù)測(cè)的NLRP5基因序列一致,表明成功構(gòu)建了NLRP5原核表達(dá)載體pET-NLRP5。
電泳結(jié)果表明,pET-NLRP5重組蛋白在IPTG終濃度為0.5 mmol/L時(shí)表達(dá)量最高,表達(dá)的融合蛋白為36 kD,見(jiàn)圖5。在IPTG誘導(dǎo)濃度為0.5 mmol/L時(shí),在30℃分別誘導(dǎo)0,2,4,6,8,10 h,每管取菌液1 mL進(jìn)行聲波破碎裂解,分別收集上清液和沉淀進(jìn)行SDS-PAGE電泳。結(jié)果表明,pET-NLRP5重組蛋白IPTG誘導(dǎo)在10 h的重組蛋白表達(dá)量最高,以包涵體形式表達(dá),見(jiàn)圖6。
通過(guò)用Ni柱純化,分別收集洗脫液和純化的NLRP5重組蛋白,結(jié)果見(jiàn)圖7。通過(guò)電泳結(jié)果可以看到純化后的蛋白條帶比未純化的蛋白雜帶少,說(shuō)明NLRP5重組蛋白純化效果較好,見(jiàn)圖8。用Western blot檢驗(yàn)包涵體NLRP5重組蛋白的His標(biāo)簽,結(jié)果獲得36 kD特異性目的條帶,見(jiàn)圖9。說(shuō)明成功純化獲得了NLRP5重組蛋白。
透析復(fù)性的NLRP5重組蛋白在檢測(cè)純度和濃度均達(dá)到免疫準(zhǔn)則后,將NLRP5重組蛋白液體與等量弗氏佐劑乳化免疫昆明小鼠,抗原免疫結(jié)束后通過(guò)對(duì)小鼠進(jìn)行眼球采血,獲取抗體血清。按比例稀釋NLRP5抗體血清作為一抗與NLRP5重組蛋白反應(yīng),用Western blot檢測(cè)NLRP5抗體效價(jià)。結(jié)果表明,在約36 kD處檢測(cè)到特異性的目的條帶,說(shuō)明成功制備水牛NLRP5多克隆抗體,抗體效價(jià)高達(dá)1∶64 000,見(jiàn)圖10。
以收集的抗水牛NLRP5多克隆抗體血清1∶4 000稀釋作為一抗進(jìn)行Western blot,檢測(cè)了NLRP5在水牛不同組織的蛋白質(zhì)表達(dá)情況。結(jié)果表明,NLRP5在大腦、心臟、腎臟、肌肉、瘤胃、睪丸、子宮、卵巢和顆粒細(xì)胞中均不表達(dá),僅在水牛卵母細(xì)胞中表達(dá),蛋白質(zhì)大小為121 kD,見(jiàn)圖11、圖12。表明抗水牛NLRP5多克隆抗體制備成功,水牛的NLRP5蛋白特異性良好。
NLRP5基因是NLRP超大蛋白家族中的一種母源效應(yīng)基因,對(duì)該基因的研究主要集中在人類、小鼠、豬和獼猴的卵母細(xì)胞和早期胚胎中,其中獼猴的卵巢和睪丸都有NLRP5表達(dá)[5-6]。牛的NLRP5蛋白被定位在細(xì)胞質(zhì)中[11],而小鼠NLRP5位于卵母細(xì)胞的線粒體和核仁及緊密的核孔中[12]。
本試驗(yàn)成功克隆得到水牛NLRP5基因CDS的3 297 bp完整序列,水牛與牛、山羊、綿羊和野豬的同 源性 分別 為96.3%、93.9%、89.1% 和75.5%,其中與牛、山羊具有較高的同源性,說(shuō)明NLRP5蛋白在不同物種間的進(jìn)化具有一定保守性。然而,由于生物制品市場(chǎng)上缺乏水牛母源基因抗體商品,難以對(duì)它們的功能和定位等機(jī)制進(jìn)行深入研究。因此,本試驗(yàn)選取NLRP5基因序列親水性和免疫原性較好的480 bp作為原核表達(dá)的目的片段,采用pET-32a(+)載體作為原核表達(dá)載體,該載體還攜帶有6×His-tag序列,便于純化目的蛋白且容易鑒定是否成功表達(dá),可以提高重組蛋白的產(chǎn)量。本試驗(yàn)用His標(biāo)簽鑒定重組蛋白正確表達(dá),并制備了鼠抗NLRP5多克隆抗體,Western blot測(cè)出該抗體與重組NLRP5蛋白反應(yīng)效價(jià)高達(dá)1∶64 000,且驗(yàn)證了NLRP5蛋白僅在水牛卵母細(xì)胞中表達(dá)而不在其他組織中表達(dá)的特異性。這些結(jié)果將為進(jìn)一步研究母源NLRP5基因在水牛卵母細(xì)胞和早期胚胎發(fā)育中的功能奠定基礎(chǔ)。
本試驗(yàn)成功克隆了水牛NLRP5基因,構(gòu)建了pET-NLRP5表達(dá)載體,成功制備了鼠抗NLRP5多克隆抗體,且與NLRP5重組蛋白具有良好反應(yīng),并驗(yàn)證了該蛋白僅在水牛卵母細(xì)胞中特異性表達(dá)。