何 沛,蘇代發(fā),楊俊譽(yù),肖 煒,劉志華*,崔曉龍*

(1.云南中煙工業(yè)有限責(zé)任公司技術(shù)中心,中國(guó)云南昆明650231；2.云南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,中國(guó)云南昆明650091)

核苷酸序列測(cè)定作為最重要的分子生物學(xué)分析方法之一,不僅能為遺傳信息的揭示和基因表達(dá)調(diào)控等基礎(chǔ)生物學(xué)研究提供重要數(shù)據(jù),而且在基因診斷和基因治療等應(yīng)用研究中也發(fā)揮著重要的作用。為了進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的基因測(cè)序,Sanger等[1]于1977年提出了快速測(cè)定DNA序列的鏈終止法,此后的四十多年時(shí)間里,測(cè)序技術(shù)取得了相當(dāng)大的發(fā)展,出現(xiàn)了新的測(cè)序技術(shù)(包括二代測(cè)序技術(shù)等)[2]。然而,隨著遺傳信息的不斷揭示,第一代測(cè)序技術(shù)已經(jīng)不能滿足科學(xué)研究的需要,因此2005年第二代測(cè)序技術(shù)(next-generation sequencing,NGS)應(yīng)運(yùn)而生[3]。第二代測(cè)序技術(shù)克服了第一代測(cè)序技術(shù)的缺點(diǎn),凸顯出其快速、高通量和低成本的巨大優(yōu)勢(shì),這一細(xì)致、全面的測(cè)序方法為基因組和轉(zhuǎn)錄組的深入研究提供了可能[4]。

與Sanger測(cè)序技術(shù)相比,NGS是一種一次能對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)的核酸分子進(jìn)行測(cè)序的高通量測(cè)序技術(shù),這種高通量測(cè)序使得人們對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致、全貌的分析成為可能。目前,NGS在生物學(xué)中的應(yīng)用包括:全基因組測(cè)序,主要目的在于測(cè)得某一物種的全部基因組,如擬南芥[5]、大腸桿菌[6]等；宏基因組測(cè)序,其主要目的在于解讀微生物群體的多樣性與豐度,探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系,發(fā)掘和研究新的、具有特定功能的基因,目前廣泛應(yīng)用于海洋生物、植物、人類疾病等候選病毒資源的發(fā)掘及病毒多樣性的研究[7～8]；轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,涵蓋全部mRNA和small RNA的測(cè)序與分析[8]；擴(kuò)增子測(cè)序,包括16S rDNA測(cè)序、18S rDNA測(cè)序、轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)測(cè)序及目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增子測(cè)序等,是一種高靶向性的測(cè)序方法,用于分析特定基因組區(qū)域中的基因變異。

在市場(chǎng)上占據(jù)優(yōu)勢(shì)的三大主要測(cè)序平臺(tái)包括Roche公司的454平臺(tái)、Illumina公司的Solexa和HiSeq平臺(tái)及Applied Biosystems(ABI)公司的SOLiD平臺(tái)[9～14]。由于454及SOLiD平臺(tái)存在序列讀長(zhǎng)、費(fèi)用等方面的瑕疵,所以當(dāng)前二代測(cè)序主要以Illumina為測(cè)序平臺(tái)。本文對(duì)煙草中所涉及的二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行了綜述,以期為相關(guān)領(lǐng)域研究者提供新的思路。

1 7種煙草屬植物的基因組測(cè)序

第一個(gè)煙草基因組測(cè)序項(xiàng)目于2003年由美國(guó)煙草基因組計(jì)劃啟動(dòng)[15～16],對(duì)栽培種煙草Hicks Broadleaf的開(kāi)放閱讀框進(jìn)行了測(cè)序[17],并于2007年完成測(cè)序工作,得到了約689 Mb的序列。Matsuoka等[18]為了解析植物細(xì)胞在細(xì)胞分裂過(guò)程中和細(xì)胞分裂終止后基因表達(dá)的變化,用cDNA基因芯片研究了煙草BY-2細(xì)胞系生長(zhǎng)過(guò)程中基因表達(dá)的變化,得到了約9 200條表達(dá)序列標(biāo)簽(expression sequence tags,ESTs)片段,與之對(duì)應(yīng)的基因有7 000個(gè),研究發(fā)現(xiàn):對(duì)數(shù)期細(xì)胞主要表達(dá)DNA/染色體復(fù)制基因的同源物；而平穩(wěn)期(stationary phase)細(xì)胞則表達(dá)多種與受體激酶、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的基因。法國(guó)與英國(guó)合作發(fā)起了歐洲煙草EST計(jì)劃[19],其以烤煙品種K326、白肋煙21和白肋煙TN86為材料,選取植株生長(zhǎng)的不同階段(發(fā)芽期、幼苗期、打頂前后期和成熟期)分別制備植物樣本(種子、根、莖、梗、葉片和花)。該項(xiàng)研究從由56 000份樣本組成的11個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化cDNA文庫(kù)中得到了一個(gè)龐大的煙草EST數(shù)據(jù)集,其研究結(jié)果為推動(dòng)煙草基因研究進(jìn)程做出了重大貢獻(xiàn)。

中國(guó)于2010年啟動(dòng)煙草基因組計(jì)劃,2011年完成了絨毛狀煙草(Nicotiana tomentosiformis)和林煙草(Nicotiana sylvestris)的全基因組序列圖譜[20]；2012—2016年完成了標(biāo)記數(shù)最多、密度最高的煙草分子遺傳連鎖圖譜[21～24]；2014年構(gòu)建了首張煙草單倍體型圖,揭示了煙草百年育種進(jìn)程[20]；同時(shí),建立了煙草基因組數(shù)據(jù)庫(kù),其匯集基因序列、基因芯片、突變體、代謝組等所有產(chǎn)出的數(shù)據(jù)資源,已經(jīng)成為國(guó)際上覆蓋煙草基因組數(shù)據(jù)最全面、體系最完整、最有應(yīng)用和研究?jī)r(jià)值的數(shù)據(jù)庫(kù)和云計(jì)算平臺(tái)[20]。

目前已用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)N.tomentosiformis等7種煙草屬植物的基因組進(jìn)行了測(cè)序,其基因組大小從1.70 Gb到4.60 Gb不等[25～28],具體信息見(jiàn)表1。

此外,現(xiàn)有研究中也有對(duì)煙草葉綠體進(jìn)行全基因組測(cè)序的相關(guān)報(bào)道。Asaf等[29]對(duì)煙草N.otophora的葉綠體全基因組進(jìn)行了測(cè)序,發(fā)現(xiàn)其葉綠體基因組有156 073 bp,共有163個(gè)基因,蛋白質(zhì)編碼基因有110個(gè)；而N.sylvestris、N.tabacum、N.tomentosiformis和N.undulata的葉綠體基因組分別為 155 941 bp、155 943 bp、155 745 bp 和155 863 bp,所含有的基因分別為140個(gè)、144個(gè)、140個(gè)和156個(gè),蛋白質(zhì)編碼基因分別為111個(gè)、98個(gè)、110個(gè)和111個(gè)。

表1 7種煙草屬植物的基因組測(cè)序Table 1 Genome sequencing of seven tobacco species

2 宏基因組測(cè)序

Huang等[30]以煙草K326的烤煙葉為材料,通過(guò)免培養(yǎng)方式對(duì)陳化與未陳化烤煙葉的細(xì)菌多樣性進(jìn)行分析,結(jié)果顯示從未陳化、陳化的烤煙葉中分別鑒定出23個(gè)和15個(gè)細(xì)菌,芽孢桿菌屬(Bacillus)和假單胞菌屬(Pseudomonas)是陳化與未陳化烤煙葉中的優(yōu)勢(shì)屬。Su等[31]以陳化與未陳化津巴布韋烤煙葉為材料,用免培養(yǎng)方式對(duì)其中細(xì)菌的多樣性和系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示從陳化、未陳化的烤煙葉中分別得到65個(gè)和84個(gè)運(yùn)算分類單元(operational taxonomic units,OTUs),兩種烤煙葉中的優(yōu)勢(shì)種各有不同；來(lái)自兩種材料的細(xì)菌可以分為兩個(gè)分支,其中陳化烤煙葉中的細(xì)菌又可以分為兩個(gè)獨(dú)立的亞分支。Wang等[32～33]以來(lái)自紅河和楚雄兩地的陳化烤煙(aging flue-cured tobaccos,AFTs)為材料,用高通量測(cè)序?qū)﹃惢緹煴砻娴募?xì)菌多樣性進(jìn)行了研究,同時(shí)對(duì)細(xì)菌潛在的遺傳能力進(jìn)行了預(yù)測(cè),結(jié)果表明在陳化烤煙表面的主要細(xì)菌可以分為7門(mén)、36科、48屬,芽孢桿菌(Bacillus spp.)在兩種陳化烤煙表面普遍存在；該研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)重建未觀察到的狀態(tài)對(duì)群落進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育研究(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states,PICRUSt),發(fā)現(xiàn)陳化烤煙微生物群落具有諸如香味的生物合成及降解有害化合物的潛在代謝能力。

Tyx等[34]以美國(guó)產(chǎn)的干鼻煙、濕鼻煙和蘇丹toombak為材料,用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)其中細(xì)菌的多樣性和分類豐度(taxonomic abundances)進(jìn)行了研究,結(jié)果表明細(xì)菌可以分為4門(mén)、33科,美產(chǎn)干鼻煙包括4門(mén),濕鼻煙的優(yōu)勢(shì)門(mén)為硬壁菌門(mén)(Firmicutes),toombak的優(yōu)勢(shì)門(mén)為放線菌門(mén)(Actinobacteria)和硬壁菌門(mén)(Firmicutes),這為進(jìn)一步研究無(wú)煙煙草產(chǎn)品獨(dú)特的微生物和化學(xué)環(huán)境奠定了基礎(chǔ)。Al-Hebshi等[35]以來(lái)自4個(gè)國(guó)家的無(wú)煙煙草(包括 American moist snuff,Swedish snus,Sudanese toombaks和Yemeni shammah)為材料,通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)對(duì)其中細(xì)菌的組成和功能進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示:在物種水平上得到491個(gè)分類群(specieslevel taxa),分屬于11門(mén)、178屬；瑞典鼻煙的物種豐富度和多樣性最高,而Yemeni shammah最低,只含芽孢桿菌(Bacillus spp.)；美國(guó)鼻煙中芽孢桿菌屬(Bacillus)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)和大洋芽胞桿菌(Oceanobacillus spp.)的豐度最高；在假定的“高致癌性”產(chǎn)品中,編碼鎘/鋅和鎳轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的基因很豐富。

常安然等[36]以四川涼山州健康現(xiàn)蕾期煙草的根際土為材料,利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)根際土壤細(xì)菌進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)環(huán)境因子有機(jī)質(zhì)、pH、含水量和土壤速效氮對(duì)健康現(xiàn)蕾期煙草根際土壤細(xì)菌有顯著影響。曹毅等[37]以貴州省煙草科學(xué)研究院福泉煙草青枯病病圃內(nèi)的土壤為材料,用454焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)土壤中的細(xì)菌組成進(jìn)行了分析,其研究結(jié)果暗示部分細(xì)菌群落可能與煙草青枯病的發(fā)生相關(guān)。施河麗等[38]通過(guò)宏基因組測(cè)序?qū)η嗫莶“l(fā)病煙株與健康煙株的根際土壤的細(xì)菌群落進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)健康煙株根際土壤的細(xì)菌多樣性、pH、養(yǎng)分及有益菌均要高于患病煙株根際土壤。張笑宇等[39]分析了易感黑脛病煙田與健康煙田煙草在不同生育期內(nèi)的根際土壤微生物動(dòng)態(tài),發(fā)現(xiàn)在煙草生長(zhǎng)過(guò)程中微生物多樣性呈下降趨勢(shì),健康煙田的細(xì)菌多樣性優(yōu)于患病煙田,煙草患黑脛病主要與病原菌增加、土壤微生物群落結(jié)構(gòu)改變及多樣性降低有關(guān)。

張藝潔等[40]采用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)不同施肥處理下連作植煙土壤進(jìn)行了細(xì)菌和真菌的多樣性分析。其研究結(jié)果表明施肥可以明顯改變連作土壤中細(xì)菌與真菌的結(jié)構(gòu),為種煙區(qū)土壤環(huán)境因子與微生物群落多樣性研究提供了理論依據(jù)。Xiao等[41]以湖南省境內(nèi)連續(xù)種植煙草1年、4年、5年和12年的土壤為材料,通過(guò)Illumina平臺(tái)對(duì)土壤微生物群落進(jìn)行了分析。其研究結(jié)果表明冬季休耕期與作物生長(zhǎng)后期的土壤微生物群落存在顯著差異；作物的發(fā)病與土壤細(xì)菌群落、冬季休耕期、作物生長(zhǎng)后期某些細(xì)菌屬的存在顯著相關(guān)；在冬季休耕期,土壤細(xì)菌的豐度低,而由冬季休耕期向作物生長(zhǎng)后期轉(zhuǎn)變時(shí),土壤中的細(xì)菌豐度增加；在作物生長(zhǎng)后期,由于土壤生物量低,故而這個(gè)時(shí)期傾向于病害高發(fā)。Lei等[42]以來(lái)自安徽省池州市的土壤為材料,通過(guò)高通量測(cè)序研究了煙-稻輪作耕作方式對(duì)土壤細(xì)菌多樣性和組成的影響。其研究結(jié)果表明用生石灰或白云石粉塵覆蓋煙草-水稻秸稈、減少施肥會(huì)對(duì)土壤性質(zhì)及微生物多樣性和組成產(chǎn)生影響；水稻秸稈還田可顯著提高土壤微生物的多樣性和豐度,而隨著施肥量的增加,土壤微生物的多樣性和豐度明顯降低,以上信息提示施肥量對(duì)細(xì)菌群落組成有影響。

3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

穆淑媛[7]通過(guò)Illumina HiSeqTM2000平臺(tái)對(duì)煙草(N.tabacum)NC89進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,在對(duì)所得序列進(jìn)行注釋后發(fā)現(xiàn)約有14.61%的單基因簇(unigenes)與植物的生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)。龍妮[2]以N.glauca、N.noctiflora、N.cordifolia、N.knightiana、N.setchellii和N.tomentosiformis 6種煙草野生種為材料,通過(guò)Illumina HiSeq 2000平臺(tái)首次對(duì)這6種野生煙草的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了報(bào)道,并對(duì)其中的抗性基因、與抗性相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子及煙堿轉(zhuǎn)導(dǎo)基因進(jìn)行了鑒定,為煙草抗病品種的選育提供了理論依據(jù)。表2列舉了N.sylvestris[26]、N.tomentosiformis[26]和N.benthamiana[43]3種煙屬植物基因轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的相關(guān)信息,其測(cè)序所用材料涉及根、葉、花等煙草組織。

此外,Faino等[44]通過(guò)深度RNA測(cè)序測(cè)定了感染大麗輪枝菌(Verticillium dahliae)煙草N.benthamiana的轉(zhuǎn)錄組,發(fā)現(xiàn)其總轉(zhuǎn)錄組大小為38.7 Mb,與擬南芥的轉(zhuǎn)錄組相當(dāng)。其研究結(jié)果為病原脅迫下的茄科模式植物提供了一個(gè)轉(zhuǎn)錄本目錄(catalogue of transcripts)。段勝常[45]以接種長(zhǎng)柄鏈格孢菌(Alternaria longipes)和鏈格孢菌(Alternaria alternata)后的煙草V2和NC89為材料,通過(guò)Illumina HiSeq 2000平臺(tái)對(duì)其RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選出了大量潛在的抗病基因,為煙草疾病預(yù)防及煙草育種方面的研究奠定了基礎(chǔ)。王新[46]通過(guò)對(duì)接種青枯菌菌株后的易感煙草和抗病煙草進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選出了大量以上調(diào)為主的差異基因,并發(fā)現(xiàn)在接種青枯菌后,煙草會(huì)啟動(dòng)相關(guān)基因的表達(dá)及多條代謝通路以抵御病原菌的侵染。

Fan等[47]以感染甜菜壞死黃脈病毒(beet necrotic yellow vein virus,BNYVV)的煙草N.benthamiana為材料,通過(guò)基于轉(zhuǎn)錄組的深度測(cè)序揭示了煙草對(duì)含有或缺失RNA4的BNYVV侵染的應(yīng)答。結(jié)果表明由甜菜壞死黃脈病毒的RNA4所引起的涉及RNA沉默、泛素-蛋白酶體途徑、纖維素合成和赤霉素代謝的基因的表達(dá)改變可在植物上表現(xiàn)出嚴(yán)重的癥狀。Geng等[48]以煙草N.benthamiana為材料,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究了煙草脈帶花葉病毒(tobacco vein banding mosaic virus,TVBMV)野生型及減毒突變體接種對(duì)煙草轉(zhuǎn)錄組的影響,結(jié)果表明接種野生型及突變體1 d后,與翻譯相關(guān)的基因表達(dá)上調(diào),而與脂質(zhì)合成和代謝、應(yīng)對(duì)胞外及外部刺激相關(guān)的基因則被下調(diào),在接種10 d后,與光合作用相關(guān)的基因被抑制；野生型及突變體對(duì)參與RNA沉默途徑的基因有不同程度的干擾；感染野生型病毒后,水楊酸和乙烯信號(hào)通路被誘導(dǎo),而茉莉酸信號(hào)通路卻被抑制。Huang等[49]以煙草N.tabacum為材料,通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)對(duì)感染番茄帶狀斑原卵病毒(tomato zonate spot orthotospovirus,TZSV)的煙草進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析,在對(duì)煙草轉(zhuǎn)錄組從頭組裝后鑒定出135 395個(gè)單基因簇(unigenes)；煙草感染TZSV后得到2 102個(gè)差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs),其中1 518個(gè)DEGs被誘導(dǎo),而584個(gè)DEGs則被抑制,該研究結(jié)果有助于進(jìn)一步了解植物對(duì)正痘病毒(orthotospovirus)感染的復(fù)雜反應(yīng)機(jī)制。Li等[50]通過(guò)HiSeqTM2500平臺(tái)對(duì)感染煙草曲莖病毒(tobacco curly shoot virus,TbCSV)的煙草N.benthamiana進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)油菜素內(nèi)酯(brassinosteroid,BR)和茉莉酸(jasmonic acid,JA)的合成及轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因顯著發(fā)生了改變,當(dāng)植物(煙草植株)受到病毒侵染時(shí),與植物防御系統(tǒng)相關(guān)的基因顯著上調(diào)表達(dá),這些結(jié)果為煙草抵御病原菌侵?jǐn)_奠定了研究基礎(chǔ)。

表2 3種煙屬植物的基因轉(zhuǎn)錄組測(cè)序Table 2 Transcriptome sequencing of three tobacco species

表3 二代測(cè)序技術(shù)用于煙草病毒的鑒定Table 3 Tobacco virus detection using next-generation sequencing technology

Chen等[51]以煙草系K326為材料,通過(guò)對(duì)煙草葉片進(jìn)行干旱脅迫和干旱后澆水研究了煙草葉片中的干旱脅迫相關(guān)基因及microRNA,功能注釋表明表達(dá)顯著上調(diào)的基因與抗氧化、刺激和應(yīng)激反應(yīng)相關(guān),而與細(xì)胞周期和光合作用過(guò)程相關(guān)的基因則表達(dá)下調(diào)；在干旱條件下,5個(gè)microRNA家族(miR398、miR390、miR162、miR166 和miR168)存在差異調(diào)節(jié),該研究結(jié)果為從多個(gè)分子遺傳水平上進(jìn)一步研究煙草響應(yīng)干旱脅迫的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。張柳等[52]借助二代測(cè)序技術(shù)研究了煙草在逆境脅迫下(低降雨量)的基因表達(dá)情況,結(jié)果表明雨量降低時(shí)上調(diào)表達(dá)的基因大多是與抗旱以及離子運(yùn)輸或者次生代謝物合成有關(guān)的基因（包括干旱脅迫基因及與黃酮類物質(zhì)和萜類吲哚生物堿合成相關(guān)的基因）。

4 病毒檢測(cè)與鑒定

二代測(cè)序技術(shù)除了可用于基因組測(cè)序、宏基因組測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序外,還可用于煙草病毒的檢測(cè)與鑒定。王芳等[53]以安徽省的煙草樣品為材料,通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)對(duì)煙草干擾小RNA(small interfering RNA,siRNA)進(jìn)行了測(cè)序,以檢測(cè)煙草RNA病毒。結(jié)果顯示該方法可用于檢測(cè)煙草中的天然RNA病毒。王浩軍等[54]用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)安徽皖南煙區(qū)的siRNA進(jìn)行了測(cè)序,建立了一種可在田間對(duì)煙草病毒病進(jìn)行檢測(cè)和發(fā)現(xiàn)煙草新病毒的體系,以實(shí)現(xiàn)對(duì)大田煙草病毒的調(diào)查。劉悅等[55]用二代測(cè)序技術(shù)建立了一種可用于檢測(cè)植物病毒的方法,為通過(guò)宏基因組檢測(cè)植物病毒奠定了基礎(chǔ)。二代測(cè)序技術(shù)不僅可對(duì)已有煙草病毒進(jìn)行檢測(cè),還可對(duì)某些地區(qū)新發(fā)現(xiàn)的煙草病毒進(jìn)行鑒定。當(dāng)前已有將二代測(cè)序技術(shù)用于煙草病毒鑒定的相關(guān)報(bào)道[56～57],表3所列病毒中的BrYV-AH和ChiVMV為安徽煙區(qū)首次發(fā)現(xiàn)。

5 展望

雖然二代測(cè)序技術(shù)在當(dāng)前市場(chǎng)上占有主導(dǎo)地位,但仍面臨儀器昂貴等劣勢(shì),已經(jīng)無(wú)法滿足部分生命科學(xué)的研究。隨著科技的不斷進(jìn)步、測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,以單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)為代表的三代測(cè)序技術(shù)(third-generation sequencing)已應(yīng)用于酵母[58]、兔[59]、高粱[60]、玉米[61]、小麥[62]和棉花[63]等物種,而在煙草中只有漸狹葉煙草(N.attenuata)和歐布特斯煙草(N.obtusifolia)兩個(gè)野生煙草進(jìn)行了第三代測(cè)序[11],其他煙草基因組則使用的是第二代測(cè)序技術(shù)和組裝方法,且部分注釋工作當(dāng)時(shí)尚未完成。新技術(shù)的涌現(xiàn),將為煙草基因組、轉(zhuǎn)錄組等測(cè)序工作帶來(lái)契機(jī),尚未完成基因組與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的煙草可把握時(shí)機(jī),填補(bǔ)煙草基因組測(cè)序空缺,擴(kuò)充并完善煙草基因組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建煙草基因組圖譜；同時(shí)可對(duì)之前已完成測(cè)序的煙草進(jìn)行重測(cè)序、重注釋,以期發(fā)現(xiàn)或發(fā)掘新基因,便于加快煙草的育種進(jìn)程及煙草抗逆機(jī)制的解析,為煙草行業(yè)的蓬勃發(fā)展奠定理論依據(jù)。