谷思涵,李思博,魏松紅,劉 偉
(沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 植物保護(hù)學(xué)院,沈陽(yáng) 110161)
到2050 年,世界人口將達(dá)到90 億,伴隨著人口快速增加而來(lái)的糧食危機(jī)將愈演愈烈,而人口增長(zhǎng)又主要集中在以水稻、小麥、玉米等為主食的發(fā)展中國(guó)家[1]。為了滿足此需求,水稻生產(chǎn)將面臨諸多挑戰(zhàn),由稻巨角間座殼(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病世界性水稻病害,也是我國(guó)水稻生產(chǎn)上的三大病害之一[2]。水稻中天然攜帶能夠抵御稻瘟病菌的抗瘟基因,目前大量的抗稻瘟病基因已被定位和克隆,為全面認(rèn)識(shí)稻瘟病菌與水稻互作提供了有力依據(jù)[3]。水稻抗稻瘟病的基因已發(fā)現(xiàn)80 余個(gè),其中Pib、Pita 和Pi9 等28 個(gè)基因已被成功克隆,這些基因大多分布于第6,11,12 號(hào)染色體上。作為稻瘟病抗性基因密集區(qū)域,第6 染色體的Pi9 和 Pi2 位點(diǎn)周圍已被成功克隆10 個(gè)以上的抗病基因[4]。AMANTE-BORDEOS 等(1992)首次從野生稻中發(fā)現(xiàn)具有廣譜抗性基因Pi9,并獲得了RFLP 分子標(biāo)記[5]。與Pi9 來(lái)自同一位點(diǎn)上的抗病基因Pi2 由MEW 等(1994)利用分子標(biāo)記定位于RG64 和AP22 之間[6],ZHOU 等[7]運(yùn)用圖位克隆法完成克隆??共』蚨鄶?shù)屬于NBS-LRR 類基因,這類基因都包含兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,核苷酸結(jié)合位點(diǎn)(NBS)與富亮氨酸重復(fù)序列(LRR)。LRR 結(jié)構(gòu)域因重復(fù)序列數(shù)量、長(zhǎng)度及組合各不相同,導(dǎo)致組成的抗性蛋白結(jié)構(gòu)各有差異[8]。LRR 能夠與無(wú)毒基因編碼產(chǎn)物直接作用,影響植株的抗病性。當(dāng)LRR 結(jié)構(gòu)單一時(shí),易被無(wú)毒基因編碼變異產(chǎn)物攻克,從而使品種抗性喪失,所以多基因聚合品種與抗譜多樣化已成為當(dāng)前品種抗病性改良的主要研究方向[9]。本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)185 份遼寧省水稻生產(chǎn)品種和實(shí)驗(yàn)材料中 9 種抗稻瘟病基因 Pi5、Pi36、Pi37、Pib、Pid2、Pid3、Pik、Pikh 和 Pita的攜帶情況進(jìn)行鑒定,以期為稻瘟病的抗病育種品種、合理布局及科學(xué)防治提供依據(jù)[10]。
供試185 份水稻(Oryza Sativa L.)材料收集自遼寧省內(nèi)7 個(gè)主要水稻產(chǎn)區(qū):沈陽(yáng)、大連、丹東、營(yíng)口、盤錦、撫順和鐵嶺,其中29 份為生產(chǎn)品種,155 份為育種材料,1 份為對(duì)照(高感品種麗江新團(tuán)黑谷)。
遼寧省稻瘟病菌主要致病菌株采自遼寧省7 個(gè)主要水稻產(chǎn)區(qū)沈陽(yáng)、大連、丹東、營(yíng)口、盤錦、撫順和鐵嶺。
1.2.1 稻瘟病菌單孢分離及產(chǎn)孢培養(yǎng) 病菌單孢分離:在TOA(番茄燕麥瓊脂培養(yǎng)基)平板上將保存于4℃或-80℃冰箱內(nèi)的稻瘟病菌活化,25℃恒溫培養(yǎng)5~10d,至有灰色孢子產(chǎn)生。然后在顯微鏡下挑取單個(gè)孢子轉(zhuǎn)入PDA 培養(yǎng)基培養(yǎng),待菌絲生長(zhǎng)較多時(shí)轉(zhuǎn)入TOA 平板,25℃恒溫培養(yǎng)7~10d。
病菌產(chǎn)孢培養(yǎng):在濕潤(rùn)條件下用無(wú)菌棉簽輕刮去產(chǎn)孢平板表面菌絲。于超凈工作臺(tái)無(wú)菌風(fēng)下吹干,蓋雙層滅菌紗布。在模擬自然條件下培養(yǎng)5~7d,直至孢子大量產(chǎn)生。
菌懸液配制:用3mL 的無(wú)菌蒸餾水將產(chǎn)孢培養(yǎng)平板上的孢子洗脫。用血球計(jì)數(shù)法在顯微鏡下將稻瘟病菌的分生孢子濃度調(diào)整為每毫升2.5×106個(gè)孢子,以備接種采用。
1.2.2 水稻秧苗培育 將有機(jī)土與基質(zhì)按2∶1 混合均勻,每個(gè)穴盤內(nèi)放置一半底土,再將鑒定材料穴播于育苗盤內(nèi),每份材料播1 穴,每穴10 粒種子,后用混合土封頂均勻。育苗期間每天換水1 次,每天保持通風(fēng)。
1.2.3 接種鑒定 于水稻3 葉1 心時(shí)期,將配制好的各菌株菌懸液均勻噴于葉片上,每品種3 次重復(fù),接種后24h 用塑料膜覆蓋黑暗條件下保濕,模擬自然條件觀察發(fā)病情況。
1.2.4 調(diào)查記載標(biāo)準(zhǔn) 記載標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)全國(guó)稻瘟病菌生理小種聯(lián)合試驗(yàn)組于1980 年制定的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)[11],于接種8~10d 后調(diào)查菌株在不同供試品種上的抗?。≧)反應(yīng)類型和感病(S)反應(yīng)類型。
1.2.5 抗病比率計(jì)算 抗病比率即為表現(xiàn)為抗病的植株占總數(shù)的比率。
1.2.6 水稻品種基因組提取 采用TIANGEN 植物基因組DNA 提取試劑盒(DP320-02)提取水稻DNA。
1.2.7 引物及反應(yīng)程序 參考文獻(xiàn)引物[12-13]及優(yōu)化反應(yīng)體系和條件(表1),Primer1~9 用于稻瘟病抗性基因的鑒定。每個(gè)水稻品種檢測(cè)各類稻瘟病抗性基因設(shè)3 次重復(fù)。PCR 反應(yīng)體系 (25μL):2×Taq PCR Master Mix(康為世紀(jì)生物科技有限公司,CW0682M)12.5μL,正向引物和反向引物各 1μL(10μg·mL-1),DNA 模板1μL(20~80ng·mL-1),之后用 ddH2O 補(bǔ)足至 25μL。PCR 反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性 5 min,94℃變性 30~60s,54~60℃退火60s,具體依據(jù)引物的G/C 含量來(lái)定,72℃延伸30~90s,具體依據(jù)目的片段長(zhǎng)度而定,30 個(gè)循環(huán),72℃延伸5min。
1.2.8 PCR 擴(kuò)增結(jié)果的電泳檢測(cè) 4μL PCR 產(chǎn)物與 2μL 1.5×Loading buffer 混合液(4∶1)混合后,在 1%瓊脂糖凝膠中電泳,Goldview 染色后,在凝膠成像系統(tǒng)下拍照。
由表2 可知,185 份材料中,接種稻瘟病菌表現(xiàn)高抗(HR)有9 份,占總數(shù)的4.86%,分別為鹽粳231、遼粳401、沈農(nóng) 315、沈農(nóng) Y16、沈農(nóng) Y65、沈農(nóng) H4、沈農(nóng) H9、沈農(nóng) H17 和沈農(nóng) H28;表現(xiàn)抗病(R)和中抗(MR)的材料各70 和71 份,分別占總數(shù)的37.84%和38.38%;表現(xiàn)感病(S)的材料為4 份,表現(xiàn)中感(MS)的材料為30份,分別占總數(shù)的2.16%和16.22%。
表1 抗病基因引物Table1 Primers for resistance genes
由表3 可知,在185 份供試水稻材料中,攜帶抗病基因Pita 的共184 份,占總數(shù)的99.46%,攜帶該基因且表現(xiàn)抗病的水稻材料共149 份,占總數(shù)的80.54%,為分布頻率最高的抗病基因類型。攜帶抗病基因Pik 的共63 份,占總數(shù)的33.51%,攜帶該基因且表現(xiàn)抗病的水稻材料共53 份,占28.65%,為分布頻率最低的抗病基因類型。其余的分布頻率各不相同。
如表4 所示,當(dāng)水稻材料只攜帶單基因Pita 時(shí)抗病比率為75%;當(dāng)水稻材料同時(shí)攜帶2 種基因Pib 和Pid3、Pid3 和 Pita、Pikh 和 Pita 時(shí)抗病比率為 100.00%;當(dāng)水稻材料同時(shí)攜帶 3 種基因 Pid3、Pikh、Pita 時(shí)抗病比率為 100.00%;當(dāng)同時(shí)攜帶 4 種基因 Pi5、Pid3、Pikh、Pita 和 Pid2、Pid3、Pikh、Pita 時(shí)抗病比率為 100.00%;當(dāng)同時(shí)攜帶 5 種基因 Pi36、Pid2、Pid3、Pikh、Pita 和 Pid2、Pid3、Pik、Pikh、Pita 時(shí)抗病比率為 100.00%,而攜帶Pi36、Pi37、Pid2、Pid3、Pita 抗病比率為0;當(dāng)同時(shí)攜帶6 種抗病基因時(shí),抗病比率由 0.00%到100.00%不等;當(dāng)同時(shí)攜帶7 種抗病基因時(shí)抗病比率由42.86%到100.00%不等;當(dāng)同時(shí)攜帶8 種抗病基因時(shí)抗病比率由80.00%到100.00%不等;當(dāng)同時(shí)攜帶9 種抗病基因時(shí)抗病比率僅為72.73%。
植物受體常常是由抗病R 基因編碼的富亮氨酸重復(fù)蛋白或者激酶。因?yàn)榭剐砸蕾囉谑荏w配體的相互作用,大多數(shù)R 基因在抗病品種與易感品種的遺傳雜交中占主導(dǎo)地位[14-16]。大多數(shù)R 基因編碼NLR 蛋白質(zhì),但Pid2 是例外,它對(duì)受體型激酶細(xì)胞外B 凝集素和細(xì)胞內(nèi)的血清素蘇氨酸激酶域進(jìn)行編碼。第二個(gè)例外是Pi21 基因,它編碼了一種富含蛋白質(zhì)的假定重金屬結(jié)合域。大多數(shù)的抗性基因聚集在一起,通常位于6 號(hào)和11 號(hào)染色體上[17]。Pi9與 Pi2 位點(diǎn)包含一組 NLR 基因,其中一類基因有5 個(gè)等位基因分別為 Pi9、Pi2、Piz-t、Pi50 和Pigm,另一類有3 個(gè)等位基因Pi-d3、Pid3-A4 和Pi25。抗病基因與無(wú)毒基因互作有3 種形式,第1 類主要是典型的一種R 基因和一種Avr 基因符合基因?qū)虻幕プ髂J?,例如Pi-ta 與Avr-pita[18]和Pi54 與Avr-pi54[19],端粒連接的毒性基因Avr-pita,用中性的方式對(duì)分泌蛋白進(jìn)行編碼,其編碼的功能蛋白質(zhì)是一種成熟的蛋白酶包含c 端176 個(gè)氨基酸[20],pita 編碼了一種有928 種氨基酸的細(xì)胞質(zhì)NLR 受體。Avr-pi54 編碼一個(gè)預(yù)測(cè)n-末端分泌一個(gè)信號(hào)肽(SP)的分泌蛋白,Pi54 前身為Pik-h,是從水稻特特普中克隆出來(lái)的編碼預(yù)測(cè)330 aa-NLR 蛋白質(zhì),與Pita 不同Pi54 并不直接表達(dá),而是誘導(dǎo)病原體攻擊的防御表達(dá)。第2 類是兩種R 基因和一種Avr 基因的互作模式,例如Pik-1 和Pik-2 與Avr-pik[21-22]。第3 種互作類型建立在第2 種類型之上的模式,兩種不同的Avr 蛋白可以被一個(gè)復(fù)雜的R 蛋白識(shí)別,例如,復(fù)合NLR 蛋白質(zhì)RGA4 與 RGA5異質(zhì)二聚體可以與 Avr-pia 或 Avr1-co39 其中任何一個(gè)相互作用[23]。本試驗(yàn)中攜帶 Pi36、Pi37、Pib、Pid2、Pid3、Pik、Pikh 和Pita 的23 份水稻材料的抗病比率高達(dá)100%,而攜帶9 種抗病基因時(shí)抗病比率僅為72.73%。由此可見并非攜帶抗病基因種類越多抗性越好,這可能是由于抗病基因之間存在某種關(guān)聯(lián),或是協(xié)同作用或是拮抗作用,這種關(guān)聯(lián)促進(jìn)了水稻抗病性的提高,另一方面當(dāng)水稻所攜帶抗病基因數(shù)量較多時(shí),體內(nèi)的抗性基因之間是否存在拮抗作用反而降低了水稻抗性,對(duì)于抗性基因之間的互作還需進(jìn)一步研究。
表2 185 份供試材料的表型鑒定Table 2 Phenotypic identification of 185 test varieties
表3 水稻抗病基因分布頻率Table 3 Gene distribution frequency of resistance genes
表4 供試185 份水稻材料所攜帶的抗稻瘟病基因類型及數(shù)目統(tǒng)計(jì)Table 4 The type and number of blast resistant genes in 185 rice samples were analyzed
試驗(yàn)結(jié)果表明攜帶抗病基因Pita 共184 份占總數(shù)的99.46%,為分布頻率最高的抗病基因類型。攜帶抗病基因Pik 共63 份占總數(shù)的33.51%,為分布頻率最低的抗病基因類型。其余基因Pi5、Pi36、Pi37、Pib、Pid2、Pid3、Pikh 的分布頻率各不相同。有 23 份水稻品種同時(shí)攜帶有 Pi36、Pi37、Pib、Pid2、Pid3、Pik、Pikh 和 Pita 且抗病比率為 100%,說(shuō)明 Pi36、Pi37、Pib、Pid2、Pid3、Pik、Pikh 和 Pita 基因之間可能存在協(xié)同效應(yīng),它們共同作用增加了水稻材料的抗性。為了闡明寄主和病原體的共同進(jìn)化,并提供預(yù)防或控制稻瘟病的適當(dāng)方法,全世界研究人員時(shí)刻關(guān)注并開發(fā)新的能有效鑒定無(wú)毒基因和抗性基因的方法。本研究從分子生物學(xué)的角度出發(fā),通過(guò)對(duì)遼寧省水稻品種抗稻瘟病基因型鑒定,為抗病育種及遼寧省稻瘟病的防控提供了依據(jù)。