吳楠，雷博宇，周友兵，謝宗強(qiáng)＊

1. 中國科學(xué)院植物研究所植被與環(huán)境變化國家重點實驗室，北京 100093

2. 中國科學(xué)院大學(xué)，北京 100049

數(shù)據(jù)庫（集）基本信息簡介

數(shù)據(jù)庫（集）名稱 湖北神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄 數(shù)據(jù)作者 吳楠，雷博宇，周友兵，謝宗強(qiáng) 數(shù)據(jù)通信作者 謝宗強(qiáng)（xie@ibcas.ac.cn） 數(shù)據(jù)時間范圍 文獻(xiàn)發(fā)表時間：1950–2016 年；物種采集時間：1957–2014 年 地理區(qū)域 湖北神農(nóng)架（109°29′34.8″–111°56′24″E、30°57′28.8″–32°14′6″N） 數(shù)據(jù)格式 *.xlsx 數(shù)據(jù)量 249 KB 數(shù)據(jù)服務(wù)系統(tǒng)網(wǎng)址 http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/861 基金項目 CERN 監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)，國家生態(tài)系統(tǒng)觀測研究共享服務(wù)平臺（2005DKA10300）。 數(shù)據(jù)庫（集）組成 整個數(shù)據(jù)集共由929 條記錄組成，分別包括（1）以采自神農(nóng)架的標(biāo)本為模式標(biāo)本確定的動物物種915 種，隸屬于3 門8 綱31 目187 科，涵蓋脊椎動物1 門2 綱4 目6 科7 種和無脊椎動物2 門6 綱27 目181 科908 種；（2）14 種甄別為無效模式標(biāo)本的物種。數(shù)據(jù)內(nèi)容由31 個字段組成，分別為：編號、物種有效性、門、門拉丁名、綱、綱拉丁名、目、目拉丁名、科、科拉丁名、屬拉丁名、中文名、拉丁學(xué)名、正模數(shù)量、正模性別、正模采集地點、正模采集時間、正模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地、配模數(shù)量、配模性別、配模采集地點、配模采集時間、配模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地、副模數(shù)量、副模性別、副模采集地點、副模采集時間、副模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地、憑證標(biāo)本是否僅來自于神農(nóng)架地區(qū)、參考文獻(xiàn)及備注。

引 言

一直以來，作為新種發(fā)表和物種命名的依附實體，模式標(biāo)本既是系統(tǒng)分類研究不可缺少的科學(xué)依據(jù)，也是研究學(xué)者開展專科專屬研究，編寫全國和地方生物志，進(jìn)行生物區(qū)系調(diào)查研究、開發(fā)、利用和保護(hù)生物資源的重要基本資料[1-5]。模式標(biāo)本的數(shù)量是一個國家或地區(qū)分類學(xué)研究積累的重要反映，其數(shù)量越多說明該地區(qū)的相關(guān)研究越深入，受關(guān)注度的程度越高，進(jìn)行分類與區(qū)系研究也就越便利[1,6]。因此，模式物種具有極高的學(xué)術(shù)價值和保藏價值。生物多樣性是人類賴以生存、發(fā)展的條件和基礎(chǔ)，面對日益嚴(yán)峻的生物多樣性喪失形勢及全世界未實現(xiàn)2010年生物多樣性目標(biāo)的背景[7]，了解區(qū)域內(nèi)的模式物種資源對及時有效的開展生物多樣性熱點地區(qū)的保護(hù)和生態(tài)學(xué)研究工作具有重要意義。

神農(nóng)架位于中國地勢第二階梯的東部邊緣，地處鄂渝陜交界，為大巴山脈東段中山地貌。經(jīng)專家咨詢和研討，依據(jù)地質(zhì)歷史和地形地貌特點將其自然地理范圍確定為109°29′34.8″–111°56′24″E、30°57′28.8″–32°14′6″N，面積約12 837 km2[8]。該區(qū)域東起湖北?？悼h，西至陜西鎮(zhèn)坪縣，南達(dá)湖北巴東縣，北至湖北竹溪縣，地處中國東部平原丘陵向西部高原山地過渡及亞熱帶氣候向暖溫帶氣候過渡的地區(qū)，具北亞熱帶季風(fēng)氣候特點[9]。神農(nóng)架是動植物種類的交匯地和第四紀(jì)冰川時期野生動植物的“避難所”，擁有豐富的生物多樣性，是全球具有國際意義的生物多樣性研究與保護(hù)關(guān)鍵地區(qū)之一，亦是中國種子植物特有屬三大分布中心之一，歷來受到分類學(xué)家的青睞，同時于2016年被列入《世界遺產(chǎn)名錄》[10]。18世紀(jì)后，國內(nèi)外科學(xué)家對神農(nóng)架開展過多次科學(xué)考察，采集并命名了多種植物物種[11-14]。新中國成立后，中國科學(xué)家對湖北神農(nóng)架先后開展了地質(zhì)、地貌、植物、動物、氣候等方面的綜合調(diào)查與研究，并發(fā)表了一系列論文與專著，如《神農(nóng)架魚類》（內(nèi)部資料）《神農(nóng)架自然保護(hù)區(qū)科學(xué)考察集》[11]《神農(nóng)架地區(qū)自然資源綜合調(diào)查報告》[13]等。但是，對于該地區(qū)模式動物的研究相對匱乏，且存在研究內(nèi)容較為分散、信息更新不夠及時等問題。因此，很有必要對神農(nóng)架地區(qū)的動物模式物種及其分類厘定進(jìn)行整合，以便能較好了解湖北省神農(nóng)架地區(qū)動物模式標(biāo)本的種類信息及其分類變動，為湖北省野生動物保護(hù)工作做好鋪墊。

本數(shù)據(jù)集在參考《神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄》[10]《中國昆蟲模式標(biāo)本名錄》（第1、2、3 卷）[3-5]等資料的基礎(chǔ)上，對采集并發(fā)表于湖北神農(nóng)架地區(qū)的動物模式標(biāo)本的原始發(fā)表文獻(xiàn)、標(biāo)本數(shù)量及標(biāo)本存放機(jī)構(gòu)進(jìn)行了系統(tǒng)整理，確定了物種有效性和分類歸屬，盡可能整合最新的研究成果，同時聽取專家意見。最終，在專著《神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄》[10]的基礎(chǔ)上，整理匯總出一套相對完整的湖北神農(nóng)架地區(qū)動物模式標(biāo)本名錄數(shù)據(jù)集。

1 數(shù)據(jù)采集和處理方法

1.1 數(shù)據(jù)采集

在《神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄》[10]的基礎(chǔ)上，參考了《中國昆蟲模式標(biāo)本名錄》（第1、2、3 卷）[3-5]的分類體系，并通過以下方式進(jìn)行數(shù)據(jù)的采集：①以“Shennongjia”和“New species”在Scholar Google（http://www.scholar.google.com/）和Web of Science（http://www.isiknowledge.com）網(wǎng)站上搜索英文資料；②以“神農(nóng)架”和“新種”在Scholar Google、中國知網(wǎng)（http://www.cnki.net/）和維普網(wǎng)（http://www.cqvip.com/）上搜索中文文獻(xiàn)；③查閱相關(guān)的志書[3-5,15-16]和專題網(wǎng)站（中國昆蟲模式標(biāo)本數(shù)據(jù)庫http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=specimen.specimen 及中國昆蟲新種數(shù)據(jù)庫http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=newinsect.species1）。收集到的全部資料發(fā)表時間為1950–2016 年，模式物種采集時間為1957–2014 年。

1.2 處理方法

我們參考了《中國昆蟲模式標(biāo)本名錄》（第1、2、3 卷）[3-5]、《長江三峽庫區(qū)昆蟲》（上、下）[15-16]等專著和國內(nèi)外發(fā)表的文獻(xiàn)或書籍，將其中于湖北神農(nóng)架區(qū)域內(nèi)分布的動物模式物種標(biāo)本信息匯總整理，同時對模式物種進(jìn)行分類厘定。本數(shù)據(jù)集僅包含正式發(fā)表的物種，及其在神農(nóng)架地區(qū)的分布信息（正模、配模、副模分別的數(shù)量、性別、采集地點、采集時間、原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地、參考文獻(xiàn)）?；凇渡褶r(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄》一書，本數(shù)據(jù)集于“備注”部分羅列了部分需要分類討論的物種，具體內(nèi)容可參考該書。

2 數(shù)據(jù)樣本描述

本名錄由929 條記錄組成，主要分為2 個部分，分別是（1）有效物種名錄：以采自神農(nóng)架的標(biāo)本為模式標(biāo)本確定的動物物種915 種，隸屬于3 門8 綱31 目187 科；（2）無效物種名錄：14 種甄別為無效模式標(biāo)本的物種。其中，12 個物種的拉丁學(xué)名為之前已記錄物種的同物異名，根據(jù)發(fā)表的時間優(yōu)先原則，將這些以神農(nóng)架標(biāo)本命名的新物種確定為無效模式標(biāo)本；2 個物種（陽日條鰍和紅須鰍鮀）除原始文獻(xiàn)外再未檢索到其他相關(guān)信息，且世界魚類數(shù)據(jù)庫（FishBase，http://www.fishbase.org/search.php，2017-12-15）及《中國脊椎動物紅色名錄》[17]也均未列出此2 物種，故亦將其甄別為無效模式物種[10]。本名錄涵蓋模式物種分類信息（物種編號、物種有效性、物種所屬的分類階元及物種中文名和拉丁學(xué)名）、模式標(biāo)本信息（正模、配模、副模分別的數(shù)量、性別、采集地點、采集時間、原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地）、文獻(xiàn)信息（包括物種發(fā)表的原始文獻(xiàn)及分類修訂的相關(guān)文獻(xiàn)）、憑證標(biāo)本是否僅來自于神農(nóng)架地區(qū)及備注。具體的字段名、類型及示例見表1。

表1 湖北神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄示例

字段名 數(shù)據(jù)類型 樣例 拉丁學(xué)名 字符型 Gongylidioides foratus 正模數(shù)量 數(shù)值型 1 正模性別 字符型 ♂ 正模采集地點 字符型 湖北神農(nóng)架木魚鎮(zhèn) 正模采集時間 字符型 1986. Ⅵ～Ⅷ 正模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地 字符型 白求恩醫(yī)科大學(xué)生物學(xué)教研室 配模數(shù)量 數(shù)值型 1 配模性別 字符型 ♀ 配模采集地點 字符型 湖北神農(nóng)架木魚鎮(zhèn) 配模采集時間 字符型 1986. Ⅵ～Ⅷ 配模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地 字符型 白求恩醫(yī)科大學(xué)生物學(xué)教研室 副模數(shù)量 數(shù)值型 24 副模性別 字符型 14♀♀10♂♂ 副模采集地點 字符型 湖北神農(nóng)架木魚鎮(zhèn) 副模采集時間 字符型 1986. Ⅵ～Ⅷ 副模原始文獻(xiàn)中的標(biāo)本存放地 字符型 白求恩醫(yī)科大學(xué)生物學(xué)教研室 憑證標(biāo)本是否僅來自于神農(nóng)架地區(qū) 字符型 是 參考文獻(xiàn) 字符型 (1) 馬曉麗, 朱傳典. 1990. 中國瘤胸蛛屬二新種 (蜘蛛目: 皿蛛科: 微蛛亞科).動物分類學(xué)報, 15: 431-435. (2) Tu LH, Li SQ. 2006. A review of Gongylidioides spiders (Araneae: Linyphiidae: Erigoninae) from China. Revue Suisse de Zoologie, 113: 51-65. 備注 字符型 分類討論

3 數(shù)據(jù)質(zhì)量控制和評估

本名錄是一個基于已出版的專著《神農(nóng)架動物模式標(biāo)本名錄》[10]整合的數(shù)據(jù)資料集（庫），在信息匯總、整理過程中，以《中國昆蟲模式標(biāo)本名錄》（第1、2、3 卷）[3-5]作為分類階元的主要參考依據(jù)，嚴(yán)格遵循動物模式物種須有規(guī)范的模式標(biāo)本（正模、配模、副模）描述、明確的模式標(biāo)本存放地（正模、配模、副模分別在原始文獻(xiàn)中出現(xiàn)的存放地）、公開的學(xué)術(shù)刊物（原始發(fā)表文獻(xiàn)及分類厘定參考文獻(xiàn)）、明確的縣級（或村、鎮(zhèn)）記錄的原則。

模式標(biāo)本的正模、配模和副模，若原始文獻(xiàn)未提供其明確的信息，則用“不詳”標(biāo)注。本名錄中的所有數(shù)據(jù)均來源于公開發(fā)表的文獻(xiàn)或?qū)Ｖ颐織l記錄后附有原始文獻(xiàn)，可供使用者查詢出處。

4 數(shù)據(jù)價值

模式標(biāo)本的數(shù)量是一個國家或地區(qū)分類學(xué)研究積累的重要反映，具有極高的學(xué)術(shù)價值和保藏價值。自18 世紀(jì)以來，分類學(xué)家及相關(guān)研究學(xué)者在湖北神農(nóng)架地區(qū)開展了大量的科學(xué)考察活動，采集并發(fā)現(xiàn)了大批物種新記錄，撰寫了大量學(xué)術(shù)文章及專著。然而，直至今日，對于神農(nóng)架地區(qū)模式動物的整合性研究仍較為匱乏，且目前的研究結(jié)果體現(xiàn)出研究內(nèi)容較為分散、數(shù)據(jù)信息較為陳舊、信息更新不夠及時等問題。本名錄搜集整理了相關(guān)權(quán)威網(wǎng)站及發(fā)表時間跨度達(dá)80 余年的國內(nèi)外文獻(xiàn)、專著，內(nèi)容豐富、全面。本數(shù)據(jù)集可供從事動物學(xué)及保護(hù)生物學(xué)科研、教學(xué)的學(xué)者、自然保護(hù)科技工作者及自然資源管理人員查閱，為構(gòu)建其他區(qū)域性或大尺度的模式標(biāo)本數(shù)據(jù)集提供參考。

致 謝

中國科學(xué)院水生生物研究所張浩淼、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)劉曉艷提供了部分文獻(xiàn)，中國科學(xué)院植物研究所研究生余小林、崔繼法、王冰鑫以及安徽大學(xué)陳文文幫助查找了部分文獻(xiàn)，湖北神農(nóng)架國家級自然保護(hù)區(qū)管理局李立炎、王大興、李純清、王志先等提供了相關(guān)資料，中國科學(xué)院植物研究所申國珍、熊高明、徐文婷、樊大勇、趙常明提供了寶貴建議，在此一并致謝。

數(shù)據(jù)作者分工職責(zé)

吳楠（1993—），女，在讀博士，研究方向為動植物多樣性及種子傳播方式的海拔分異。主要承擔(dān)工作：動物模式標(biāo)本名錄、物種信息收集整理和文章撰寫。

雷博宇（1995—），男，在讀博士，研究方向為海拔梯度上果實性狀對動植物互惠網(wǎng)絡(luò)的調(diào)控作用。主要承擔(dān)工作：本文模式標(biāo)本名錄鑒別和文章修改。

周友兵（1980—），男，博士，副研究員，研究方向為動植物互作關(guān)系與森林更新。主要承擔(dān)工作：本文研究思路、框架指導(dǎo)、模式標(biāo)本名錄及物種信息鑒別等。

謝宗強(qiáng)（1965—），男，博士，研究員，研究方向為森林生態(tài)學(xué)、保護(hù)生態(tài)學(xué)等。主要承擔(dān)工作：本文研究思路、框架指導(dǎo)、模式標(biāo)本名錄、物種信息鑒別和文章修改。