劉 玲,程 明,,唐仕成,鄭 丹,柯皓天,李瓊秀
(1.四川省絲綢工程技術(shù)研究中心,四川 成都 610031; 2.四川省絲綢科學(xué)研究院,四川 成都 610031)
四川幅員遼闊,自然環(huán)境復(fù)雜多樣,擁有豐富的桑樹資源,一些科研單位利用分子標(biāo)記輔助育種、輻射育種、化學(xué)誘變等方法選育了大量桑樹品種[1],為蠶桑生產(chǎn)作出了很大貢獻(xiàn)。四川省絲綢科學(xué)研究院長期致力于桑樹育種及其分子生物學(xué)研究,目前已育成了人工四倍體桑品種團(tuán)桑6號(hào)[2]和團(tuán)桑 11號(hào)[3]、果桑品種團(tuán)桑 9 號(hào)[4],它們分別于2013年、2013年和2016年通過了四川省農(nóng)作物品種審定委員會(huì)審定。目前在四川省絲綢科學(xué)研究院的桑樹資源圃中保存著百余份種質(zhì)資源,其中團(tuán)桑2號(hào)、團(tuán)桑3號(hào)、團(tuán)桑4號(hào)、團(tuán)桑B號(hào)、團(tuán)桑5號(hào)、團(tuán)桑10號(hào)、團(tuán)桑12號(hào)、團(tuán)桑13號(hào)和團(tuán)桑14號(hào)已有選育報(bào)告但未審定,團(tuán)桑1號(hào)、團(tuán)桑3A號(hào)、團(tuán)桑7號(hào)、團(tuán)桑8號(hào)、團(tuán)桑15號(hào)和團(tuán)桑16號(hào)作為育種材料保存。為了更好地了解并利用這些資源,本研究采用ISSR分子標(biāo)記對18份團(tuán)桑資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。
實(shí)驗(yàn)材料取自四川省絲綢科學(xué)研究院資源圃(表1)。
表1 供試材料表Table 1 Name of materials used
桑樹基因組DNA采用稍加改進(jìn)的CTAB法[5],從0.15 g硅膠干燥的桑葉中提取。取3 μL提取到的DNA,在1%瓊脂糖凝膠電泳20 min,電泳完畢后先后用紫外反射透射儀和微量紫外分光光度計(jì)檢測DNA的質(zhì)量和濃度,將合格的DNA置于-20℃保存。
參考英屬哥倫比亞大學(xué)2006年公布的ISSR引物序列和已有的ISSR在桑樹方面的研究結(jié)果[6],選擇42個(gè)引物,由上海生工生物股份有限公司合成。以2份桑種質(zhì)基因組DNA為模板,對42個(gè)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,篩選出擴(kuò)增條帶多且清晰的引物用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
PCR反應(yīng)在Thermal Cycler(上海山富科學(xué)儀器有限公司)上進(jìn)行。PCR反應(yīng)體系(10 μL)如表2,PCR反應(yīng)程序參照參考文獻(xiàn)[6]。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳30 min后,用紫外反射透射儀觀察并拍照保存,用于后續(xù)的數(shù)據(jù)整理。
手工記錄不同遷移率條帶。同一遷移率,根據(jù)條帶的有無分別記為“1”和“0”,在Excel中形成數(shù)據(jù)矩陣,根據(jù)Nei's方法[7],用Popgene32軟件[8]評價(jià)引物的擴(kuò)增效果,并采用非加權(quán)組平均法UPGMA對24份供試材料進(jìn)行聚類分析。
表2 PCR反應(yīng)體系(10 μL)Table 2 PCR reaction system(10 μL)
從42條引物中篩選出9條擴(kuò)增條帶清晰的引物進(jìn)行正式實(shí)驗(yàn),9條引物共擴(kuò)增出56條清晰條帶,其中55條為多態(tài)性條帶,多態(tài)性比率為98.21%;平均每條引物擴(kuò)增出6.22條條帶,其中6.11條為多態(tài)性條帶;引物ID8擴(kuò)增出的條帶數(shù)最多為8條,多態(tài)性100%,引物ID6擴(kuò)增出的條帶數(shù)最少為4條,也全部具有多態(tài)性;所有引物擴(kuò)增出的片段大小為200~2000 bp(圖1,表3)。
表3 9條ISSR引物擴(kuò)增結(jié)果Table 3 Amplification results of 9 ISSR primers
以9條引物擴(kuò)增的55條多態(tài)性條帶為基礎(chǔ),利用Popgene32軟件計(jì)算每份種質(zhì)桑間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離。結(jié)果表明,24份供試桑的遺傳相似系數(shù)為0.4643~0.9107,遺傳距離為0.0935~0.7673。聚類分析圖(圖2)中,首先分出的是團(tuán)桑14號(hào),其余23份桑聚為一個(gè)大支,這一大支分為5個(gè)分支:團(tuán)桑1號(hào)、團(tuán)桑11號(hào)、團(tuán)桑6號(hào)、團(tuán)桑9號(hào)、團(tuán)桑10號(hào)和團(tuán)桑7號(hào)在分支①;團(tuán)桑2號(hào)、團(tuán)桑3號(hào)、團(tuán)桑4號(hào)、團(tuán)桑5號(hào)、團(tuán)桑8號(hào)、團(tuán)桑12號(hào)、白桑、蒙桑、團(tuán)桑B號(hào)和華桑在分支②;團(tuán)桑13號(hào)、團(tuán)桑15號(hào)和山桑在分支③;團(tuán)桑16號(hào)、雞桑在分支④;團(tuán)桑3A號(hào)和川桑在分支⑤。
采用9條ISSR引物對18份團(tuán)桑資源和6份野生桑進(jìn)行遺傳多樣性分析,共擴(kuò)增出56條條帶,其中多態(tài)性條帶55條,占98.21%,平均每條引物擴(kuò)增出6.22條條帶。24份供試桑的遺傳相似系數(shù)為0.4643~0.9107,遺傳距離為0.0935~0.7673。在UPGMA聚類分析中,團(tuán)桑14號(hào)首先被分出,其余的23份桑聚為一個(gè)大支。團(tuán)桑14號(hào)是盤桑2號(hào)(是四川省三臺(tái)蠶種場從一株30年樹齡的老桑樹上采穗,進(jìn)行嫁接繁殖,從中選出的豐產(chǎn)性能好、桑椹多而大、春季葉片大的葉果兼用桑品種[9])經(jīng)秋水仙素誘導(dǎo)得到的,其單獨(dú)被分出,說明其遺傳背景與其他23份桑資源不同。
團(tuán)桑6號(hào)和團(tuán)桑9號(hào)聚在分支①中,這兩個(gè)品種有相同親本。團(tuán)桑6號(hào)是以二倍體塘10×倫109的雜種實(shí)生苗為材料,用秋水仙堿溶液誘導(dǎo)其體細(xì)胞染色體加倍,經(jīng)無性固定育成人工四倍體桑品種(2n=4x=56)[2];團(tuán)桑9號(hào)系從塘10×倫109 F1雜交桑的果桑株系中選出的果用桑品種[4]。
團(tuán)桑13號(hào)系將二倍體塘10×倫109 F1幼苗誘導(dǎo)為四倍體,與二倍體四川花桑雜交而育成的雜種優(yōu)勢強(qiáng)、產(chǎn)葉量高、葉質(zhì)優(yōu)、生長旺盛的人工三倍體[10],與團(tuán)桑15號(hào)、山桑聚在分支③中,說明團(tuán)桑13號(hào)、團(tuán)桑15號(hào)、山桑的親緣關(guān)系近。
團(tuán)桑4號(hào)和團(tuán)桑B號(hào)系四川省絲綢科學(xué)研究院從1.2萬株豐馳桑中,經(jīng)過初選、復(fù)選、擴(kuò)大繁殖、田間測試中選出的[11]。團(tuán)桑4號(hào)葉形肥大、產(chǎn)葉量高、全開雌花、結(jié)果多,可作為葉果兼用品系;團(tuán)桑B號(hào)葉片較肥大、產(chǎn)葉量高、開少量雄花。這兩個(gè)桑資源來源相同,都聚在分支②中。
聚類結(jié)果還說明團(tuán)桑12號(hào)與白桑的親緣關(guān)系近,團(tuán)桑B號(hào)與華桑的親緣關(guān)系近,團(tuán)桑16號(hào)與雞桑的親緣關(guān)系近,團(tuán)桑3A號(hào)與川桑的親緣關(guān)系近。