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染色體微陣列分析技術(shù)產(chǎn)前診斷胎兒先天性肺囊性腺瘤樣畸形的應(yīng)用價值

2020-12-09 09:42:06王榮躍樓文文宮劍黃賢蘋許張曄
浙江醫(yī)學(xué) 2020年22期
關(guān)鍵詞:單純性致病性染色體

王榮躍 樓文文 宮劍 黃賢蘋 許張曄

先天性肺囊性腺瘤樣畸形(congenital cystic adenomatoid malformation,CCAM)是一種以肺組織多囊性腫塊伴有支氣管結(jié)構(gòu)增生為特征的病變,病變組織由肺循環(huán)供血,80%位于單側(cè),20%位于雙側(cè)[1]。CCAM發(fā)病率為1/35 000~1/25 000[2],男女發(fā)病率相似。產(chǎn)前CCAM可引起胎兒水腫、羊水過多、縱隔移位或消退[3]。染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技術(shù)可用來檢測染色體微缺失、微重復(fù)[4],已應(yīng)用于發(fā)育遲緩、智力障礙患兒的診斷[5]和先天性異常胎兒的產(chǎn)前診斷[6-7],可檢測>100 k的拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)[8-9],優(yōu)于傳 統(tǒng) 的 細 胞 遺 傳 學(xué) 核 型 分 析。為探討CNV與CCAM之間的關(guān)系,本研究采用CMA技術(shù)對超聲診斷CCAM的胎兒進行全基因組檢測,從而指導(dǎo)母兒預(yù)后情況的判斷。

1 對象和方法

1.1 對象 選取2018年3月至2019年12在本院就診的產(chǎn)前超聲診斷胎兒為CCAM的孕婦23例。孕婦年齡17~42(29±5)歲,胎齡17~30+6(19±3)周。根據(jù)胎兒是否合并其他結(jié)構(gòu)異常,分為單純性CCAM 19例和非單純性CCAM 4例。本研究經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會審查通過,所有胎兒父母均簽署知情同意書。

1.2 方法

1.2.1 胎兒CCAM診斷 產(chǎn)前胎兒CCAM診斷由兩位經(jīng)驗豐富的超聲科醫(yī)師會診確診,必要時行胎兒胸部MRI檢查。

1.2.2 產(chǎn)前診斷方法 超聲檢查提示患有CCAM的胎兒,征得孕婦以及家屬同意并簽署產(chǎn)前診斷知情同意書,采用羊膜腔穿刺術(shù)或臍靜脈穿刺術(shù)取得胎兒標本進行CMA檢測。

1.2.3 DNA提取 采用Qiagen試劑盒(美國Qiagen公司)從臍血(0.5 ml)和羊水(10 ml)中提取基因組 DNA。如需排除母血污染和解釋意義不明的CNV時,則提取父母的外周血標本的基因組。

1.2.4 染色體核型分析 對臍血或羊水進行培養(yǎng)、收獲、染色、滴片后,再行染色體核型分析。

1.2.5 CMA檢測 嚴格按照美國Affymetrix公司提供的標準流程進行操作,對基因組DNA進行消化、擴增、純化、片段化、標記、與芯片雜交、洗滌及芯片掃描,所使用的芯片為全基因組CytoScan 750K芯片(美國Affymetrix公司)。該芯片同時具備單核苷酸多態(tài)性探針和寡核苷酸探針。

1.2.6 數(shù)據(jù)分析 應(yīng)用配套的CHAS軟件及相關(guān)的生物信息學(xué)方法分析CMA的檢測結(jié)果,根據(jù)DNA片段拷貝數(shù)的散點圖分布判斷CNV及染色體微缺失、微重復(fù)。根據(jù)文獻及公共數(shù)據(jù)庫分析>100 kb的CNV的臨床意義,CNV比對分析過程中所參考的數(shù)據(jù)庫包括人類基因組結(jié)構(gòu)變異數(shù)據(jù)庫(DGV)數(shù)據(jù)庫(http://dgv.tcag.ca/dgv/app/)、疾病相關(guān) CNV 數(shù)據(jù)庫(DECIPHER)(https://decipher.sanger.ac.uk/)、人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM)(https://www.omim.org)等。根據(jù)CNV的性質(zhì)不同分為良性CNV、致病性CNV和臨床意義不明確的CNV(variants of uncertain significance,VOUS)。

1.2.7 CNV的驗證 對含有致病性CNV及VOUS胎兒的父母外周血樣本行CMA分析,進一步明確CNV是遺傳還是新發(fā),協(xié)助判斷CNV的性質(zhì)。

1.2.8 隨訪時間 產(chǎn)前超聲診斷CCAM的胎兒并分娩的,隨訪至出生6個月,了解其出生后CCAM情況。

2 結(jié)果

2.1 產(chǎn)前診斷CCAM胎兒的一般情況 4例非單純性CCAM胎兒合并其他異常,其中合并胎兒生長受限1例,羊水過少2例,心臟移位并羊水過多1例。

2.2 CMA檢測結(jié)果 23例胎兒的基因組均存在CNV,每例胎兒的基因組含有1~5個CNV,片段大小為300 kb~6.20 Mb。3例胎兒檢出致病性CNV,檢出率為13.0%;單純性CCAM胎兒與非單純性CCAM胎兒的致病性CNV檢出率分別為10.5%(2/19)和25.0%(1/4)。3例胎兒相關(guān)情況見表1。17q12微缺失區(qū)段包含腎囊腫和糖尿?。╮enal cysts and diabetes,RCAD)綜合征的關(guān)鍵區(qū)域1.60 Mb的微缺失(圖1)。17p12微缺失區(qū)段包含遺傳性壓力易感性周圍神經(jīng)病(hereditary neuropathy with liability to pressure palsies,HNPP)綜合征的關(guān)鍵區(qū)域1.40 Mb微缺失(圖2)。Xq27.1q28微重復(fù)區(qū)域包含關(guān)鍵基因SOX3基因。經(jīng)過父母驗證后VOUS檢出率為8.7%(2/23),VOUS檢測情況見表 2。

2.3 妊娠結(jié)局情況 19例單純性CCAM胎兒引產(chǎn)1例,分娩18例;4例非單純性CCAM胎兒引產(chǎn)1例,分娩2例,失訪1例,見表3。20例CCAM胎兒出生后經(jīng)過 6個月隨訪,7例(35.0%)自發(fā)消退;5例(25.0%)接受了手術(shù)治療,術(shù)后恢復(fù)良好;8例(40.0%)分娩后CT檢查仍有CCAM,但拒絕手術(shù)仍在隨訪中。

3 討論

2013年美國婦產(chǎn)科協(xié)會(ACOG)建議將染色體微陣列基因芯片技術(shù)分析應(yīng)用于產(chǎn)前診斷,指出若超聲診斷胎兒結(jié)構(gòu)異常并同意行侵入性產(chǎn)前診斷的,用CMA可替代染色體核型分析[10]。Liao等[11]對超聲異常但染色體核型分析正常的446例胎兒中進行CMA檢測,發(fā)現(xiàn)11.4%的胎兒存在致病性CNV。通過CMA檢測可發(fā)現(xiàn)出生缺陷相關(guān)的致病基因,如在先天性食管閉鎖胎兒中通過CMA檢測發(fā)現(xiàn)了GL13基因變異[12],在骨骼發(fā)育異常的胎兒中通過CMA檢測發(fā)現(xiàn)了PPKAR1A基因、MITF基因變異[13]。本研究使用全基因組CytoScan 750K芯片對23例伴或不伴其他超聲結(jié)構(gòu)異常的CCAM胎兒進行檢測,結(jié)果顯示致病性CNV的檢出率為13.0%,與Deng等[14]報道基本一致。

表1 致病性CNV的CMA檢測結(jié)果

圖1 病例1染色體17q12區(qū)域發(fā)生1.60 Mb的微缺失

圖2 病例2染色體17p12區(qū)域發(fā)生1.40 Mb微缺失

表2 VOUS檢測結(jié)果

表3 CCAM胎兒妊娠結(jié)局情況

本研究顯示單純性CCAM胎兒與非單純性CCAM胎兒的致病性CNV檢出率分別為10.5%和25.0%。單純性CCAM胎兒中發(fā)現(xiàn)的兩個致病性CNV與CCAM的發(fā)生不一定有關(guān),但有可能是潛在危害健康的原因。

本研究中病例1在17q12染色體上存在1.60 Mb微缺失,與RCAD綜合征(OMIM 137920)相關(guān)。RCAD綜合征是一種常染色體顯性遺傳病,其特征是腎發(fā)育異常(特別是多發(fā)性腎囊腫、腎小球囊性病變、腎發(fā)育不良)和糖尿病[15]。Donnelly等[16]研究中提示17q12微缺失是產(chǎn)前超聲異常中僅次于22q11微缺失綜合征的第二常見的基因芯片異常。RCAD綜合征的發(fā)生與HNF1B(OMIM 189907)基因缺失相關(guān)[16]。Jain等[17]在正常胎兒的肺、肝、胰腺和胃中檢測到HNF1B mRNA,該夫婦經(jīng)過充分的遺傳咨詢后,不愿意接受有可能表現(xiàn)異常的胎兒,回當?shù)蒯t(yī)院引產(chǎn)。

本研究中病例2在17p12染色體上存在1.40 Mb微缺失,與HNPP綜合征(OMIM 162500)相關(guān),HNPP綜合征表現(xiàn)為復(fù)發(fā)性局灶性運動和感覺性周圍神經(jīng)病[18],呈常染色體顯性遺傳,輕微外傷可引起局灶性脫髓鞘性神經(jīng)病發(fā)作[19]。該夫婦家庭經(jīng)濟條件差,經(jīng)過充分遺傳咨詢后仍堅決要求引產(chǎn)。本研究中病例3在Xq27.1q28染色體上存在9.53 Mb微重復(fù),包含SOX3(OMIM 313430)基因,會引起垂體功能下降,經(jīng)過遺傳咨詢后,該夫婦有宗教信仰,要求繼續(xù)妊娠,分娩后予門診隨訪未見新生兒有異常表型,無特殊面容,發(fā)育接近正常同齡兒,仍在隨訪中。

CCAM的預(yù)后主要取決于其在宮內(nèi)是否合并其他相關(guān)畸形。大多數(shù)病變會在出生后的第1年持續(xù)存在,會增加肺部感染的風(fēng)險,Davenport等[20]推薦積極手術(shù)治療。然而,Calvert等[21]發(fā)現(xiàn)在出生后的第1年,CCAM會自發(fā)消退,他們主張對無癥狀嬰兒進行密切隨訪,并對持續(xù)性病變進行再次檢查。本研究中,25.0%(5/20)的胎兒分娩后進行了手術(shù),術(shù)后恢復(fù)良好;35.0%(7/20)的胎兒分娩后在生后3~6個月左右病變自發(fā)消退。由于本研究病例數(shù)較少,需要進一步擴大病例數(shù)才能更好得出結(jié)論。但是這個結(jié)果可能有助于增加孕婦繼續(xù)妊娠的信心,尤其是對于那些懷有單純CCAM并且CMA結(jié)果陰性的胎兒孕婦。

綜上所述,CMA技術(shù)能檢出部分致病性CNV,即亞顯微染色體異常,能更好地指導(dǎo)及提高CCAM病變的產(chǎn)前咨詢及管理,避免過度引產(chǎn)。

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