1中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所發(fā)布白木香基因組精細(xì)圖譜
近日,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所合作發(fā)布了白木香基因組精細(xì)圖譜,相關(guān)研究結(jié)果已發(fā)表在GigaScience期刊。該基因組精細(xì)圖譜的發(fā)布將為野生白木香種群保護(hù)生物學(xué)、沉香結(jié)香機(jī)制和香味基因及樹種的進(jìn)化研究奠定良好基礎(chǔ),也為基于基因組的白木香分子育種的深入工作提供了可能,在基礎(chǔ)研究及應(yīng)用領(lǐng)域均具有重要意義。該研究利用Oxford Nanopore和Illumina測序,結(jié)合Hi-C數(shù)據(jù)生成了220.6 Gb的高質(zhì)量讀長。組裝后的白木香基因組大小約為726.5 Mb,其中716.6 Mb的序列被錨定至8條染色體上,Scaffold N50為88.8 Mb,BUSCO分析結(jié)果為95.2%。重復(fù)序列占基因組的比例為59.1%,共注釋了29 203個蛋白質(zhì)編碼基因。根據(jù)單拷貝基因的系統(tǒng)發(fā)育和分化時間估算,發(fā)現(xiàn)白木香與其在錦葵目(Malvales)的最近共同祖先大約在53.2~84.4百萬年前分開。
白木香(Aquilaria sinensis (Lour.) Spreng)是瑞香科(Thymelaeaceae)中第一個基因組組裝至染色體水平的物種,隨著后期更多個性化數(shù)據(jù)的裝配和分析,新版基因組圖譜將保持持續(xù)更新。白木香是傳統(tǒng)名貴藥材和天然香料“沉香”的重要基源植物,主要分布于中國南部的熱帶及亞熱帶地區(qū)。在自然條件下,僅有7%~10%的白木香可以結(jié)香,且結(jié)香過程極為緩慢,通常需要數(shù)十年。良好的醫(yī)藥價值和巨大的經(jīng)濟(jì)效益,導(dǎo)致了人們對白木香的掠奪式采伐,其野生資源已日漸枯竭。野生白木香是國家II級保護(hù)植物,被《中國生物多樣性紅色名錄(高等植物卷)》和IUCN Redlist列為易危(VU)物種,收錄在CITES附錄二中。
2中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所湛江站橡膠樹抗寒研究團(tuán)隊(duì)助橡膠生產(chǎn)春耕忙
3月5日,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所橡膠樹抗寒研究團(tuán)隊(duì)羅萍研究員、賀軍軍副研究員和張華林博士一行3人,到廣東省新時代農(nóng)場開展橡膠樹病害防治和膠園林下種植技術(shù)指導(dǎo)。
受早春氣候影響,新時代農(nóng)場的橡膠樹第一蓬葉已經(jīng)完全抽葉,但白粉病發(fā)病嚴(yán)重,團(tuán)隊(duì)經(jīng)過仔細(xì)調(diào)查分析后,給出科學(xué)合理應(yīng)對措施:本輪葉片已無噴藥救治的必要,待落葉再抽葉時加強(qiáng)防治。
為了緩解目前橡膠產(chǎn)業(yè)困難,新時代農(nóng)場計(jì)劃在膠園林下種植特色產(chǎn)業(yè)提高膠農(nóng)收益,穩(wěn)定膠工隊(duì)伍。針對農(nóng)場這一需求,橡膠樹抗寒研究團(tuán)隊(duì)與農(nóng)場領(lǐng)導(dǎo)生產(chǎn)技術(shù)人員座談,詳細(xì)調(diào)研了膠園情況,并結(jié)合實(shí)際提出種植一些特色農(nóng)作物的建議,比如樹菠蘿、化橘紅、魔芋、五指毛桃、砂仁等,并就有關(guān)林下種植技術(shù)進(jìn)行了指導(dǎo),助力新時代農(nóng)場春耕復(fù)產(chǎn),為農(nóng)場發(fā)展膠園林下經(jīng)濟(jì),提高膠農(nóng)收益,穩(wěn)定膠工隊(duì)伍起到了積極的效果。
3中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所芒果專家開展攀枝花精準(zhǔn)扶貧產(chǎn)業(yè)技術(shù)培訓(xùn)
2020年,是精準(zhǔn)扶貧工作“國考”之年,為了助力攀枝花精準(zhǔn)脫貧工作順利收官,夯實(shí)貧困戶依靠科技發(fā)展產(chǎn)業(yè)增收致富基礎(chǔ)。3月13日,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所芒果技術(shù)專家、攀枝花市仁和區(qū)掛職副區(qū)長梁清志、區(qū)委黨校副校長阮善倫、教科研室主任歐陽定平及黨校教師一行,到攀枝花仁和區(qū)布德鎮(zhèn)新橋村開展“精準(zhǔn)扶貧產(chǎn)業(yè)培訓(xùn)”,共計(jì)120余位學(xué)員參加了此次培訓(xùn)。該培訓(xùn)班為布德鎮(zhèn)芒果產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供了強(qiáng)有力的思想引領(lǐng)和技術(shù)支撐,極大地增強(qiáng)了當(dāng)?shù)剞r(nóng)戶依靠科技致富的信心和決心。
該培訓(xùn)班將基層黨建宣傳與農(nóng)業(yè)實(shí)用技術(shù)普及結(jié)合起來,將理論講解與現(xiàn)場示范結(jié)合起來,充分調(diào)動學(xué)員積極性。同時,專家還和果農(nóng)們一同深入芒果園,實(shí)地查看芒果生長情況,并就芒果現(xiàn)在花期的修剪進(jìn)行現(xiàn)場教學(xué)指導(dǎo)。
4中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品加工研究所與農(nóng)業(yè)機(jī)械研究所在廣東恩平開展木薯種植機(jī)械化技術(shù)培訓(xùn)
2020年3月17~18日,為響應(yīng)國家復(fù)工復(fù)產(chǎn)的號召,不誤農(nóng)時保春耕,國家木薯產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系機(jī)械化崗位科學(xué)家團(tuán)隊(duì)到廣東省恩平市橫陂鎮(zhèn)開展木薯種植機(jī)械化技術(shù)培訓(xùn)與示范。
當(dāng)?shù)剞r(nóng)民非??春媚臼懋a(chǎn)業(yè)的發(fā)展,種植的木薯可加工成飼料,用木薯飼料喂養(yǎng)肉鵝,實(shí)現(xiàn)種養(yǎng)有機(jī)結(jié)合。但種植木薯耗費(fèi)大量的人工,造成種植過程中效率低、成本高、風(fēng)險(xiǎn)大,而木薯種植機(jī)械化恰好可以有效解決木薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸問題,雙方計(jì)劃在恩平建立一個木薯種植機(jī)械化示范基地。
為做好技術(shù)服務(wù)工作,達(dá)到農(nóng)機(jī)農(nóng)藝有效結(jié)合,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品加工研究所與農(nóng)業(yè)機(jī)械研究所團(tuán)隊(duì)除提供機(jī)具外,還對全套機(jī)械化方案包括木薯品種、耕地規(guī)劃整理、栽培農(nóng)藝、后續(xù)田間管理、采收、飼料加工、全套機(jī)具的操作使用等給予全程的技術(shù)支撐。本次種植環(huán)節(jié)的技術(shù)培訓(xùn),重點(diǎn)培訓(xùn)了種植大戶木薯起壟機(jī)、木薯種植機(jī)的作業(yè)方法,為下一步帶動更多農(nóng)民采用木薯生產(chǎn)機(jī)械化技術(shù)打下了初步基礎(chǔ),將有利于促進(jìn)當(dāng)?shù)啬臼懋a(chǎn)業(yè)節(jié)本增效和農(nóng)民增收。
5中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院香料飲料研究所咖啡資源育種團(tuán)隊(duì)在咖啡資源分類與進(jìn)化研究取得新進(jìn)
咖啡為世界第一大飲料作物。全世界有80多個國家和地區(qū)種植咖啡,是“一帶一路”沿線熱帶國家農(nóng)業(yè)收入的重要來源,在全球經(jīng)貿(mào)活動及人類生產(chǎn)生活中發(fā)揮著重要作用。
C.arabica,C. canephora和C. excelsa是世界知名的三大咖啡遺傳資源,其中,C. arabica為異源四倍體,而C. canephora和C. excelsa為二倍體。近年來,主導(dǎo)品種C. arabica咖啡易受病害干擾,限制了品質(zhì)和產(chǎn)量的提升,影響咖啡種植農(nóng)戶收益和全球咖啡貿(mào)易。將具有特殊風(fēng)味物質(zhì)和抗病等優(yōu)異性狀的等位基因?qū)胫鲗?dǎo)品種C. arabica咖啡,以期獲得優(yōu)質(zhì)、抗逆的新品種是咖啡育種工作者的首要任務(wù),而解析三大類咖啡遺傳資源的遺傳與分化關(guān)系是咖啡分子育種的關(guān)鍵所在。因此,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院香料飲料研究所咖啡資源育種研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國科學(xué)院武漢植物園對來自20多個國家的三大遺傳類群咖啡93份核心資源進(jìn)行全基因組重測序分析,挖掘出約1 536.8萬個單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。通過種群進(jìn)化、種群分層分析發(fā)現(xiàn)三大遺傳咖啡類群高度分化,C. arabica和C.canephora遺傳類群親緣關(guān)系較密切;基因標(biāo)注和候選基因功能富集分析,發(fā)現(xiàn)每個譜系中大多基因是獨(dú)立選擇,只有少數(shù)2個或3個是平行選擇,而這些基因可能有助于適應(yīng)性進(jìn)化。同時,研究進(jìn)一步分析了與咖啡因和風(fēng)味物質(zhì)合成相關(guān)的基因和SNP位點(diǎn)在3個遺傳類群分裂過程中的差異,明確了咖啡因N-甲基轉(zhuǎn)移酶(NMTs)是咖啡因合成途徑中最重要的酶,一些咖啡類脂相關(guān)的SNPs在不同物種間表現(xiàn)出明顯的等位基因頻率偏差。該結(jié)果為咖啡優(yōu)異性狀候選基因挖掘、親本選配等咖啡分子輔助育種提供理論依據(jù)。
6中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院香料飲料研究所緊盯咖啡生產(chǎn)
每年1~3月是咖啡成熟盛期,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院香料飲料研究所咖啡研究中心、中國熱帶作物學(xué)會咖啡專業(yè)委員會專家多日來通過微信、電話、入戶指導(dǎo)等多種途徑,對咖啡種植戶、種植合作社進(jìn)行技術(shù)指導(dǎo),幫助咖啡農(nóng)戶解決銷售難的問題。
3月19日,龍宇宙研究員、林興軍副研究員、陳鵬農(nóng)藝師對萬寧市蓮花村咖啡種植戶進(jìn)行技術(shù)指導(dǎo)。專家對檳榔間作咖啡、咖啡水肥一體化、咖啡種植等咖啡園所存在問題進(jìn)行指導(dǎo),幫助農(nóng)戶提高咖啡長勢。3月24日,林興軍副研究員、陳鵬農(nóng)藝師、譚軍博士赴海南省白沙縣元門鄉(xiāng)白沙隕石嶺咖啡專業(yè)種植合作社指導(dǎo)咖啡加工廠建設(shè)。近幾年來,中國熱科院香飲所為白沙縣66.7 hm2的咖啡示范種植基地提供技術(shù)指導(dǎo),通過不斷完善咖啡初加工技術(shù),建立咖啡加工廠,提高加工能力,提升咖啡品質(zhì),助力咖啡農(nóng)戶增收。
參考文獻(xiàn)
[1]摘自中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院網(wǎng),2020-03-04—2020-03-28.