程維舜,羅茜,洪娟,王素萍,黃翔,杜雷,姜利,張利紅,陳鋼
(武漢市農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境與安全研究所,湖北武漢 430074)
西瓜(Citrullus lanatus(Thunb.)Matsum.&Nakai)是葫蘆科西瓜屬重要的經(jīng)濟作物,原產(chǎn)于非洲南部[1-2],瓜瓤脆嫩,味甜多汁,營養(yǎng)價值高,富含多種礦物質(zhì)和維生素,在全球范圍內(nèi)被廣泛種植。目前,我國每年西瓜種植面積和產(chǎn)量均居世界第一位,據(jù)FAO 數(shù)據(jù)統(tǒng)計,2018 年我國西瓜栽培面積149.91 萬hm2,總產(chǎn)量6 153.69 萬t[3]。西瓜產(chǎn)業(yè)在調(diào)整農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)、保持生產(chǎn)平穩(wěn)發(fā)展和促進農(nóng)民增收中發(fā)揮著重要作用[4]。
目前,我國西瓜制種完全實現(xiàn)雜種化,種子質(zhì)量的核心指標(biāo)就是雜交種的純度,純度鑒定對于保障良種銷售收益和種植收益來說尤為重要。傳統(tǒng)的西瓜雜交種純度鑒定方法是將雜交種種植后,通過比較成株的形態(tài)學(xué)特征進行鑒定[5],這種方法周期長、工作量大、難度大,且易受環(huán)境、季節(jié)因素影響導(dǎo)致結(jié)果準(zhǔn)確性差,鑒定效果不理想。因此育種的專業(yè)性要求越來越強,而目前的田間表型鑒定愈發(fā)不適應(yīng)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的發(fā)展需要。隨著現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)的不斷發(fā)展,特別是分子標(biāo)記的快速發(fā)展,分子標(biāo)記的應(yīng)用將加速雜交種純度的鑒定過程,而且鑒定過程不受環(huán)境和人為因素影響,甚至不需要特定的育種工作者。該技術(shù)不分時間,作物生長時期,多態(tài)性強,能在短時間內(nèi)準(zhǔn)確地反映出種子的真實性[6-7]。因此在品種鑒定及種子檢測中具有良好的應(yīng)用前景。
武農(nóng)8 號是由武漢市農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物所培育的適合湖北省春季西瓜產(chǎn)區(qū)設(shè)施和露地種植的綜合抗病性強、高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)雜交西瓜新品種(品種登記號為GPD 西瓜(2017)420128)。隨著西瓜栽培面積的逐年擴大,為保證雜交種的質(zhì)量,亟需開展雜交種純度的快速鑒定試驗。本研究采用熒光標(biāo)記SSR 技術(shù),利用基于西瓜全基因組序列開發(fā)出來的能夠最大限度代表西瓜遺傳多樣性的23 對核心SSR 引物[8-9],對西瓜新品種武農(nóng)8 號的雜交種進行引物篩選和純度鑒定,以期建立快速、準(zhǔn)確的雜交種純度的室內(nèi)檢測技術(shù),為西瓜新品種的推廣應(yīng)用提供技術(shù)支撐和保障。
武農(nóng)8 號(F1)及其父本(W07-5)、母本(W07-3)種子均由武漢市農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所提供。武農(nóng)8 號系武漢市農(nóng)科院作物所雜交選育成的優(yōu)質(zhì)、早熟、小果型西瓜新品種。植株長勢強健,易坐果,耐裂,果實膨大快,單果質(zhì)量1.43~2.06 kg。果實橢圓形,果皮綠色,覆墨綠色齒條,厚度0.54 cm,蠟粉輕;果肉紅色,中心糖含量12.5%,邊糖含量10%,肉質(zhì)松脆細(xì)嫩,品質(zhì)佳。生育期95 d,果實發(fā)育期27~31 d,適合各地春播大中棚早熟覆蓋栽培。產(chǎn)量2 513 kg/667 m2左右,商品率高。
1.2.1 西瓜種子全基因組DNA 提取
選擇籽粒飽滿的武農(nóng)8 號及其親本種子各100 粒,55 ℃溫水浸種6 h,置于恒溫種子催芽箱中28 ℃催芽,出芽后播種于營養(yǎng)缽中,待植株具2 片真葉時,用改良CTAB 法提取葉片中的DNA。將幼嫩真葉組織30~40 mg置于2.0 mL 預(yù)冷過的離心管中,迅速撒上約0.5 mg 的DIECA 晶體,加入液氮,用組織搗碎儀打碎樣品成粉末狀,加入700 μL、2%CTAB 預(yù)熱緩沖液及0.5 mg 的活性炭,65 ℃水浴1 h,加入700 μL 氯仿-異戊醇混合液(24:1),混勻,12 000 r/min 離心10 min;吸取上清液加入預(yù)先裝有700 μL 異丙醇的1.5 mL 離心管中,混勻后放入-20℃冰箱30 min,12 000 r/min 離心10 min;棄上清液,用70%乙醇溶液洗滌兩遍,自然條件下干燥后,加入100 μL ddH2O 溶解DNA,用微量分光光度計檢測DNA 質(zhì)量,-20 ℃保存留用。
1.2.2 SSR 分子標(biāo)記的PCR 擴增與電泳檢測
選擇基于西瓜全基因組序列開發(fā)出來的能夠最大限度代表西瓜遺傳多樣性的23 對核心SSR 引物進行引物篩選和多態(tài)性分析,23 對熒光引物由武漢擎科生物科技有限公司合成(表1),其他分子生物學(xué)相關(guān)試劑均購自TAKARA。
PCR 擴增反應(yīng)體系及程序:在PCR 管中加入dNTP 0.25 mmol/L,正、反向引物各0.2 μmol/L,TaqDNA 聚合酶1.0 U,10×PCR 緩沖液(含Mg2+),武農(nóng)8 號及其親本基因組DNA 60 ng、滅菌雙蒸水補充到15 μL,利用DNA 分析儀檢測時使用熒光標(biāo)記的引物;混勻后置于PCR 儀上進行擴增。PCR 反應(yīng)程序為94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,共34 個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min;4 ℃保存待用。
PCR 擴增產(chǎn)物的毛細(xì)管電泳熒光檢測分析:將待用的6-FAM 和HEX 熒光標(biāo)記的PCR 擴增產(chǎn)物用超純水稀釋30 倍,TAMRA 和ROX 熒光標(biāo)記的PCR 擴增產(chǎn)物稀釋10 倍。分別將等體積的上述4 種稀釋后的溶液混合,從混合液中吸取1 μL 加入DNA 分析儀專用深孔板中。板中各孔分別加入0.1μLLIZ500 分子量內(nèi)標(biāo)和8.9 μL去離子甲酰胺。將樣品在PCR 儀上95 ℃變性5 min,取出立即置于碎冰上,冷卻10 min 以上。瞬時離心10 s 后置于DNA 分析儀上。使用DNA 分析儀的片段分析軟件,讀出每個樣品的等位變異大小數(shù)據(jù)。
1.2.3 SSR 分子標(biāo)記的純度鑒定
以父母本樣品DNA 的特異峰作為對照,只有同時具有親本特異峰的單株才可確定為武農(nóng)8 號雜交種,否則為雜種;種子純度按公式(1)計算。
表1 西瓜23 對SSR 核心引物Table 1 23 pairs of core primers in watermelon
1.2.4 田間形態(tài)鑒定
將取材后的西瓜植株按照編號順序定植,參照小果型西瓜栽培技術(shù)進行管理,在坐果期和幼果期,根據(jù)果實的果型、皮色和條帶特征逐株進行純度鑒定,將標(biāo)記鑒定結(jié)果與田間鑒定結(jié)果進行比較分析。
將23 對引物在武農(nóng)8 號及其父母兩個親本間進行擴增,結(jié)果發(fā)現(xiàn)表現(xiàn)“雙親互補型”共顯性條帶的引物僅有1 對(見上頁圖1),即BVWS01897。BVWS01897 在F1擴出的條帶一條來自父本211bp,是一條來自母本242bp,為典型的“雙親互補型”條帶,且條帶較為清晰、無雜帶,該引物可用于武農(nóng)8 號雜交種的純度鑒定。
利用篩選出來的SSR 引物BVWS01897 對100 株武農(nóng)8 號西瓜植株進行純度鑒定,SSR-PCR 擴增結(jié)果發(fā)現(xiàn),99 個單株既具有母本特異峰也具有父本特異峰,是真正的雜交種,10 號單株不具有父本特異峰,有且僅有母本擴增特異峰,說明10 號單株為母本自交株(見圖2),武農(nóng)8 號雜交種的純度為99%。
坐果期、幼果期至果實成熟期田間調(diào)查結(jié)果發(fā)現(xiàn),母本W(wǎng)07-5 植株生長勢中等,早熟,極易坐果。全生育期87 d,果實發(fā)育期27 d,高圓形,果皮綠色覆窄齒條帶,果肉紅色,瓤質(zhì)細(xì)脆,纖維少,中心糖含量12%,果皮韌,皮厚0.5 cm 左右,單瓜質(zhì)量1.0~1.5 kg。父本W(wǎng)07-3 植株生長勢強,分枝力較強,早熟,易坐果,全生育期89 d,果實發(fā)育期28 d,長橢圓形,果皮綠色覆齒條,果肉淺紅色,瓤質(zhì)細(xì)脆,中心可溶性固形物13%,皮厚約0.4 cm,單果質(zhì)量1.5~2.0 kg。武農(nóng)8 號植株生長勢較強,主蔓長3.8 m,主莖粗0.4~0.5 cm。葉片羽裂狀,葉色綠。主蔓第一雌花著生節(jié)位第7~9 節(jié),以后每隔4~6 節(jié)著生一朵雌花,花為雌雄同株異花。坐果能力強,果實發(fā)育天數(shù)27~31 d,果形指數(shù)1.29,果皮綠色覆齒條,外觀亮麗。皮厚0.54 cm,果皮硬度達(dá)47.10 kg/cm2,不易裂果,不易倒瓤。果肉紅色,肉質(zhì)細(xì)、脆多汁,口感極佳,中心含糖量約12.5%,邊糖含量約10%,單果質(zhì)量1.43~2.06 kg。10 號植株與果實植物學(xué)形態(tài)與母本性狀完全一致,其余植株果實與武農(nóng)8 號典型特征吻合,短橢圓形,淺綠果皮覆蓋深綠細(xì)齒條帶,條帶數(shù)11~14 之間。田間形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果與分子標(biāo)記鑒定結(jié)果高度一致。
在西瓜雜交制種的過程中,母本和父本分別種植在不同區(qū)域,雌花開花前,母本需要人工去雄,開花期再授以父本花粉來完成雜交過程,從而產(chǎn)生雜交種。如果母本去雄不徹底或漏去雄,花粉就可能落到雌花柱頭上產(chǎn)生自交種,極大地影響制種純度。因此,西瓜雜交種必需進行種子純度鑒定。首先,傳統(tǒng)的大田形態(tài)學(xué)鑒定方法成本高、耗時久等諸多缺陷嚴(yán)重制約了西瓜產(chǎn)業(yè)的發(fā)展;其次,由于西瓜遺傳基礎(chǔ)較窄,蛋白質(zhì)種類和同工酶位點都有限,很難區(qū)分親緣關(guān)系很近的雜交種;第三,初代的RAPD 分子標(biāo)記技術(shù)本身的重復(fù)性、穩(wěn)定性不高,引物的多態(tài)性較低。因此,傳統(tǒng)的大田形態(tài)學(xué)鑒定方法很難應(yīng)用到西瓜雜交種純度鑒定中[10]。基于PCR 技術(shù)的SSR 分子標(biāo)記是第二代分子標(biāo)記技術(shù),具有多態(tài)性豐富、重復(fù)性好、共顯性遺傳等特點,廣泛應(yīng)用于農(nóng)作物品種鑒定[11]。由于常規(guī)的SSR 標(biāo)記聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測方法需要在每塊膠上設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)帶型對照[12],才能確定待檢樣品在泳道上的位置,但當(dāng)待檢樣品在凝膠泳道上的位置與標(biāo)準(zhǔn)帶型對照較遠(yuǎn),且標(biāo)準(zhǔn)帶型對照上相鄰等位基因片段差異較小時,待檢樣品的等位基因類型就難以確定,那么對檢測結(jié)果就有影響。而SSR 熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳檢測方法,依據(jù)待檢樣品目標(biāo)峰的位置,與同一毛細(xì)管泳道的內(nèi)標(biāo)LIZ 比較,直接讀出目標(biāo)DNA 片段的準(zhǔn)確大小,無需設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)帶型對照。顯然與常規(guī)的凝膠電泳檢測方法相比,熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳檢測數(shù)據(jù)更為準(zhǔn)確。因此,筆者篩選的SSR 引物BVWS01897,能特異鑒定武農(nóng)8 號及其親本,本研究通過對23 對西瓜SSR 核心引物的篩選,發(fā)現(xiàn)1 對引物在武農(nóng)8 號及其親本間具有多態(tài)性,特異引物對武農(nóng)8 號進行純度鑒定的結(jié)果與大田鑒定結(jié)果高度一致,充分說明SSR 技術(shù)室內(nèi)快速鑒定西瓜品種純度是可行的。