程生輝,劉逸軒,姚帥君,門九章
(山西中醫(yī)藥大學(xué),山西 晉中 030619)
過(guò)敏性紫癜是系統(tǒng)性IgA 免疫復(fù)合物介導(dǎo)的白細(xì)胞破碎性血管炎,臨床特征主要為皮膚非血小板減少性紫癜、關(guān)節(jié)炎、胃腸道出血及腎炎等。發(fā)病機(jī)制為毛細(xì)血管變態(tài)反應(yīng)和血管的自體免疫損傷[1]。門氏保元湯是門九章教授治療過(guò)敏性疾病和自身免疫性疾病的常用方主方,由當(dāng)歸、金銀花、元參、黃芪、炙甘草5 味藥組成,以“扶正培元,標(biāo)本兼顧”組方,針對(duì)過(guò)敏性紫氣陰兩虛、熱瘀互結(jié)的病機(jī)特點(diǎn),具有清熱解毒、益氣活血等功效,有著良好的臨床效果[2-3]。
整合藥理學(xué)是融合了中藥學(xué)、藥理學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多個(gè)學(xué)科的交叉學(xué)科,用以研究藥物與機(jī)體的相互作用及作用原理[4]。通過(guò)中醫(yī)藥整合藥理學(xué)平臺(tái)(TCMIP,http:www.tcmip.cn),本研究對(duì)門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜的機(jī)制進(jìn)行了探究與分析,為闡釋本方分子機(jī)制以及臨床新藥研發(fā)提供依據(jù)。
在整合藥理學(xué)平臺(tái)(http://www.tcmip.cn/)中的中藥材數(shù)據(jù)庫(kù),收集中藥材當(dāng)歸、金銀花、元參、黃芪、甘草所含有的化學(xué)成分,建立門氏保元湯的化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)。
通過(guò)整合藥理學(xué)平臺(tái)“整合藥理學(xué)分析工具”采取化學(xué)成分二維結(jié)構(gòu)相似性搜索,即采用MACCS 分子指紋特征提取方法和Tani-moto 系數(shù)定義的相似度計(jì)量方法,針對(duì)中藥化學(xué)成分和美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局上市藥物進(jìn)行相似性打分,從而獲取高可信度(相似度>0.8)的中藥候選靶點(diǎn)譜,在平臺(tái)“中藥成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)”版塊分別輸入當(dāng)歸、金銀花、元參、黃芪、炙甘草,即可獲得不同的藥物的化學(xué)成分信息,并可提取不同成分對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)信息。
整合藥理學(xué)平臺(tái)TCMIP 平臺(tái)依托“人類表型本體數(shù)據(jù)庫(kù)(HPO)”“Drugbank 數(shù)據(jù)庫(kù)”“基因相關(guān)性數(shù)據(jù)庫(kù)(DisGeNET)”“治療靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)(TTD)”等資源,構(gòu)建疾病和常見(jiàn)臨床表型相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)。在平臺(tái)“疾病相關(guān)分子集及其功能挖掘”板塊以“allergic purpura”為疾病或癥狀進(jìn)行檢索,提取檢索出來(lái)的所有治療靶點(diǎn)。
TCMIP 平臺(tái)整合了蛋白互作數(shù)據(jù)庫(kù)(Database of Interacting Protein,DIP)、分子交互數(shù)據(jù)庫(kù)(molecular interaction Database,MINT)人類蛋白質(zhì)參考數(shù)據(jù)庫(kù)(Human Protein Reference Database,HPRD)、反應(yīng)途徑數(shù)據(jù)庫(kù)(Reactome Pathway Database,Reactome)等8 個(gè)現(xiàn)有的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)的信息,通過(guò)整合藥理學(xué)平臺(tái)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建門氏保元湯的潛在作用靶點(diǎn)-過(guò)敏性紫癜疾病靶點(diǎn)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)整合藥理學(xué)平臺(tái)網(wǎng)絡(luò)分析模塊,計(jì)算靶點(diǎn)之間的PPI 網(wǎng)絡(luò)特征值,以“節(jié)點(diǎn)連接度(degree)”的2 倍中位數(shù)為卡值,選取中藥靶點(diǎn)-疾病基因網(wǎng)絡(luò)的核心節(jié)點(diǎn)(hubs);并且在此基礎(chǔ)上,以“節(jié)點(diǎn)連接度(degree)”“節(jié)點(diǎn)緊密度(closeness)”和“節(jié)點(diǎn)介度(betweenness)”的中位數(shù)為卡值,選取滿足3 個(gè)卡值的節(jié)點(diǎn)為關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),而后對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行富集分析,選取P 值前20 的通路,構(gòu)建“中藥-成分-靶點(diǎn)-通路”的多維關(guān)系網(wǎng)絡(luò),并對(duì)其進(jìn)行可視化分析。
TCMIP 基于基因本體數(shù)據(jù)庫(kù)(gene ontology,GO)和京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(kyoto Encyclopedia of genes and genomes,KEGG),確定藥物靶點(diǎn)所參與的生物學(xué)反應(yīng)和通路。結(jié)合富集計(jì)算,獲得門氏保元湯及其治療過(guò)敏性紫癜關(guān)鍵網(wǎng)絡(luò)靶點(diǎn)的生物學(xué)功能及其所參與的網(wǎng)絡(luò)通路。按P 值大小取前20 個(gè)GO 及KEGG 分析結(jié)果。
門氏保元湯共收集化學(xué)成分301 個(gè),化合物主要為黃酮類、三萜類和有機(jī)酸類等。當(dāng)歸收集到的成分有66 個(gè),主要為有機(jī)酸類和揮發(fā)油化合物;元參收集到的成分有30 個(gè),主要為環(huán)烯醚萜苷、苯丙素苷類化合物;金銀花共收集化學(xué)成分47 個(gè),主要為有機(jī)酸類、黃酮類、揮發(fā)油類化合物;黃芪共收集化學(xué)成分27 個(gè),主要為三萜皂苷類、黃酮類化合物;甘草共收集化學(xué)成分131 個(gè),主要為三萜類、黃酮類化合物。當(dāng)歸的60 個(gè)化學(xué)成分共預(yù)測(cè)出251 個(gè)靶標(biāo),元參中30 個(gè)化學(xué)成分共預(yù)測(cè)出73 個(gè)靶標(biāo),金銀花中47 個(gè)化學(xué)成分共預(yù)測(cè)出133 個(gè)靶標(biāo),黃芪中27 個(gè)成分共預(yù)測(cè)出249 個(gè)靶標(biāo),甘草中131 個(gè)化學(xué)成分共預(yù)測(cè)出184個(gè)靶標(biāo)。
對(duì)中藥方劑候選靶標(biāo)進(jìn)行功能分析(表1),可見(jiàn)候選靶標(biāo)基因功能涉及輔因子代謝、四氫葉酸互變、一氧化氮合酶合成、肽基-絲氨酸磷酸化調(diào)節(jié)等條目。對(duì)中藥方劑候選靶標(biāo)進(jìn)行通路富集分析(表2),可見(jiàn)涉及通路有四氫蝶呤合成、葉酸和嘌呤代謝、細(xì)胞內(nèi)受體的類泛素化、核受體轉(zhuǎn)錄途徑等通路。
通過(guò)整合藥理學(xué)平臺(tái)的網(wǎng)絡(luò)分析模塊,構(gòu)建了門氏保元湯潛在靶點(diǎn)與疾病靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò)。根據(jù)上述條件共獲得62 個(gè)靶點(diǎn)并篩選出25個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)(表5),采用PPI 模塊構(gòu)建了“藥物-疾病核心靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)(圖1),圖中節(jié)點(diǎn)的大小與degree 呈正比。
GO 和KEGG 富集分析結(jié)果顯示,門氏保元湯對(duì)過(guò)敏性紫癜的干預(yù)機(jī)制涉及B 細(xì)胞增殖、一氧化氮生物合成過(guò)程、輔因子代謝過(guò)程、血小板聚集、細(xì)胞因子介導(dǎo)的信號(hào)通路等多個(gè)條目(表3)。通路富集分析結(jié)果顯示主要集中在NF-κB 信號(hào)通路異常導(dǎo)致免疫缺陷、血小板聚集、四氫蝶呤合成、內(nèi)皮型一氧化氮合酶激活、BRAF 的異常轉(zhuǎn)導(dǎo)以及BRAF 對(duì)RAF 激酶的異常激活等通路(表4)。
表1 門氏保元湯候選靶點(diǎn)功能信息
表2 門氏保元湯候選靶點(diǎn)參與的通路信息
表3 門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜靶點(diǎn)生物過(guò)程富集分析
涉及到的通路主要有NF-κB 信號(hào)通路、血小板聚集、四氫蝶呤合成、內(nèi)皮型一氧化氮合酶激活、BRAF 編碼RAF 激酶等通路。從候選靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)與“藥物-化學(xué)成分-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò)圖(圖2),認(rèn)為門氏保元湯對(duì)過(guò)敏性紫癜的干預(yù)作用與血小板代謝、NF-κB 信號(hào)通路以及BRAF 編碼RAF 激酶等有關(guān)。
表4 門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜靶點(diǎn)通路富集分析
表5 門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜關(guān)鍵靶點(diǎn)
圖1 門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
門氏保元湯由當(dāng)歸、金銀花、元參、黃芪、炙甘草組成,黃芪多糖可以顯著增加胸腺和脾內(nèi)T 細(xì)胞的數(shù)量,進(jìn)而促進(jìn)IgG 的生成,從而提高機(jī)體的免疫功能;抑制血小板相關(guān)抗體,減少血小板的損傷與破壞[5]。黃芪甲苷、黃芪黃酮等能使血管的通透性得到改善,使毛細(xì)血管對(duì)損傷的抵抗力增強(qiáng),使出血的風(fēng)險(xiǎn)得到降低[6]。當(dāng)歸有機(jī)酸具有抑制抗血小板凝聚的作用,當(dāng)歸多糖具有升高血小板和刺激骨髓造血的功能[7]。元參苯丙素苷能減少血管炎癥,元參環(huán)烯醚萜苷能有效抑制血小板聚集[8]。金銀花有機(jī)酸類化合物有抗血小板凝聚和保護(hù)內(nèi)皮細(xì)胞過(guò)氧化損傷的作用[9]。甘草中的甘草皂苷和甘草黃酮類能抑制致炎性因子,有明顯的抗變態(tài)反應(yīng)作用[10]。
圖2 門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜“中藥-成分-核心靶點(diǎn)-通路”多維網(wǎng)絡(luò)關(guān)系
經(jīng)過(guò)富集分析得出,門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜與NF-κB 信號(hào)通路、內(nèi)皮型一氧化氮合酶激活、血小板代謝以及BRAF 編碼RAF 激酶有著密切的關(guān)系。研究發(fā)現(xiàn)NF-κB 是一種由兩個(gè)亞單位(P50 和P65)組成的二聚體[11]。由于NF-κB 參與多種蛋白基因轉(zhuǎn)錄,且與T 細(xì)胞的活化密切相關(guān)[12]。T 細(xì)胞過(guò)度激活是過(guò)敏性紫癜發(fā)病的機(jī)制之一,有研究認(rèn)為黃芪能抑制NF-κB 的活性,從而減少T 細(xì)胞的過(guò)度活化[13]。NO 是具有免疫調(diào)節(jié)作用的小分子,可調(diào)節(jié)血管張力及血流速度,防止血小板黏附和血栓形成[14]。研究表明,黃芪多糖能激活被抑制的AMPK-eNOS 通路,進(jìn)而保護(hù)血管內(nèi)皮細(xì)胞[15]。當(dāng)歸能夠?qū)ρ“寰奂a(chǎn)生明顯的抑制作用,也可以提高已聚集血小板的解聚率[16],從而對(duì)過(guò)敏性紫癜起到一定的治療作用。血小板膜糖蛋白(ITGA2B)是一類與血小板凝聚有關(guān)的蛋白,這類蛋白主要參與出血與凝血過(guò)程,并發(fā)揮著重要的作用。對(duì)于HSP 患兒來(lái)說(shuō),其自身的血小板聚集功能加強(qiáng),因而存在血液的高凝狀態(tài)甚至?xí)纬晌⒀?。ITGA2B 含量的增加是導(dǎo)致血小板凝聚、微血栓形成的關(guān)鍵原因[17]。而當(dāng)歸有機(jī)酸、金銀花有機(jī)酸、元參環(huán)烯醚萜苷有抗血小板凝聚的作用,能降低細(xì)胞內(nèi)ITGA2B 的水平,從而對(duì)過(guò)敏性紫癜起到治療作用。有研究報(bào)道,BRAF 基因編碼RAF 家族蛋白激酶,該蛋白在調(diào)節(jié)MAPK-ErK 信號(hào)通路中起重要作用,影響細(xì)胞分裂,分化和分泌;并且影響著腫瘤的產(chǎn)生及進(jìn)展,有著生長(zhǎng)、增殖甚至是凋亡細(xì)胞的作用[18-19]。有研究發(fā)現(xiàn)可通過(guò)活化MAPK/Erk 信號(hào)通路,對(duì)糖尿病血管病變中起到抑制作用[20],另有研究發(fā)現(xiàn)白芷提取物可能通過(guò)增加NO 和TNF-α 產(chǎn)物,激活MAPK 通路發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)作用,進(jìn)而抑制大腸癌瘤體的增長(zhǎng)[21]。潘耀謙等[22]研究發(fā)現(xiàn)Erk 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路通過(guò)強(qiáng)大的級(jí)聯(lián)反應(yīng)參與了家兔腦炎原蟲性腦肉芽腫的形成,在腦肉芽腫形成過(guò)程中促進(jìn)星形膠質(zhì)細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞和成纖維細(xì)胞增殖。
綜上所述,本研究借助整合藥理學(xué)這一新興學(xué)科理念及技術(shù),對(duì)門氏保元湯治療過(guò)敏性紫癜的作用機(jī)制及藥效物質(zhì)基礎(chǔ)進(jìn)行分析,既為該方未來(lái)的進(jìn)一步研究提供理論依據(jù),也為過(guò)敏性紫癜的臨床治療提供更加開(kāi)闊的思路。
山西中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào)2021年1期