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耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌耐藥監(jiān)測及分子耐藥機制的研究進展

2021-04-03 21:24梁武華梁敏煜周海燕吳耀勛
當代醫(yī)學 2021年19期
關鍵詞:烯類克雷伯青霉

梁武華,梁敏煜,周海燕,吳耀勛

(1.玉林市婦幼保健院新生兒科,廣西 玉林 537000;2.吉林醫(yī)藥學院,吉林 吉林 132000)

肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumonia,KP)為腸桿菌屬,是社區(qū)和醫(yī)院獲得性感染的常見致病菌,可導致呼吸道、消化道、皮膚、泌尿道、血液等部位感染。根據中國CHINET網2018年監(jiān)測[1],該菌在臨床分離的腸桿科細菌中,已經超越大腸桿菌成為第一位的致病菌。碳青霉烯類抗生素是治療肺炎克雷伯菌感染最有效的藥物。但隨著抗生素的泛用和濫用,耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumonia,CRKP)菌株不斷出現和傳播[2-4],成為全球關注的公共衛(wèi)生問題。2017年WHO將CRKP列為21世紀最重要的耐藥病原菌之一[5],給感染控制帶來巨大挑戰(zhàn)。如何加強CRKP的耐藥性監(jiān)測和流行病學研究,探究CRKP產生耐藥的分子機制,分析耐藥規(guī)律和特點,控制多重耐藥菌的傳播擴散,指導臨床合理抗感染治療,成為目前的研究熱點。本文就CRKP耐藥監(jiān)測和分子耐藥機制的研究進展做一綜述。

1 CRKP耐藥監(jiān)測

1.1 CRKP感染流行現狀 2001年Yigit等[6]首先在美國北卡羅萊那州醫(yī)院發(fā)現第一株CRKP,此后CRKP在世界各國陸續(xù)被報道[7-9]。2007年Wei等[10]在我國浙江省最早分離出CRKP的菌株。2008年在印度發(fā)現對包括碳青霉烯類在內的所有β內酯胺類抗生素耐藥的“超級細菌”[11],引起全球廣泛關注。

近年來我國臨床分離的肺炎克雷伯菌中CRKP陽性率大幅度增加。王娜等[12]調查某醫(yī)院6年間CRKP的分布及變遷情況,結果顯示,CRKP檢出率由2012年的0.4%上升至2017年的29.5%;重癥監(jiān)護病房(ICU)CRKP的分離率明顯高于普通病房。吳方強等[13]報道:安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院從4 830份感染者標本中檢出CRKP 690株,占14.29%,2018年CRKP分離率為16.67%,高于2014年的12.98%;中國人民解放軍總醫(yī)院2013年至2017年病原菌分布及藥敏分析結果顯示[14],醫(yī)院共從標本中分離出4 946株KP,其中710株為CRKP,占14.4%,且醫(yī)院CRKP由2013年的3.2%增至2017年的29.3%。趙建平等[15]對某三甲醫(yī)院2011年至2018年CRKP的分離情況和耐藥現狀進行分析,CRKP檢出率由2011年的0上升到2018的26.5%,增長趨勢明顯;2018年全國細菌耐藥監(jiān)測網(CARSS)監(jiān)測結果顯示[16],2013年,CRKP菌株的檢出率為4.9%,2018年已上升至10.1%,各省分布有差異,全國CRKP檢出率最高的地區(qū)是河南省、上海市及北京市,其中河南省上升幅度最大,較2017年25.9%上升至32.5%。面對CRKP檢出率持續(xù)增加的嚴峻形勢,臨床需引起高度重視,應給予更多的關注,加強對CRKP的動態(tài)監(jiān)測和主動監(jiān)測。

CRKP引起院內感染暴發(fā)流行事件屢有發(fā)生,在英國、中東地區(qū)、我國山東省等地均曾被報道過[17-19]。NICU是肺炎克雷伯菌感染的高發(fā)區(qū),近年來不斷出現CRKP在新生兒病房暴發(fā)流行[20-21]。賈楠等[22]曾報道5株攜帶NDM-1基因及其他多重耐藥基因的“超級細菌”引起新生兒病房醫(yī)院感染的聚集暴發(fā)。提示由CRKP引起的感染和暴發(fā)已成為非常棘手的嚴重問題,應加強碳青霉烯類抗菌藥物應用的管理及醫(yī)院感染的防控手段,避免耐藥細菌的暴發(fā)和流行。

1.2 CRKP耐藥現狀 21世紀初,碳青霉烯類抗生素對肺炎克雷伯菌的敏感性為100%[23]。近年來,隨著CRKP的出現,檢出率不斷上升,耐藥率呈持續(xù)升高趨勢。意大利的一項研究[24]顯示,在檢出的131株肺炎克雷伯菌菌株中,對至少一種碳青霉烯類具有耐藥性的有42株(占32.1%);Liapis E等[25]對法國21家醫(yī)院產KPC酶的53棵菌株研究發(fā)現:95%的菌株對厄他培南不敏感;在國內,張凡等[26]調查我國2009年至2016年耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的藥物敏顯示:193株CRKP對9種抗菌藥物耐藥率均高于65%,其中對亞胺培南從53.3%上升至91.5%,對美羅培南從40.0%上升至90.2%,總耐藥率分別為77.2%和80.8%,耐藥形勢嚴重。歐陽娜等[27]回顧分析2009年至2018年10年間10 075株KP,結果顯示,KP對碳青霉烯類抗生素的耐藥率呈逐年快速上升的趨勢,對亞胺培南的耐藥率從0.6%上升至34.3%;對美羅培南的耐藥率從1.5%上升至32.7%。2018年歐洲抗菌素耐藥性監(jiān)測網(EARS-Net)最新數據提示[28]:2018年肺炎克雷伯菌對亞胺培南的耐藥性為26.6%,對美羅培南的耐藥性為17.6%。2018年中國CHINET網的細菌耐藥監(jiān)測結果顯示[1],肺炎克雷伯菌對亞胺培南和美羅培南的耐藥率分別從2005年的3.0%和2.9%上升至2018年的25.0%和26.3%,耐藥率上升幅度高達8倍多。值得關注的是,5所兒童醫(yī)院(含婦幼保健院)中除1所醫(yī)院分離的肺炎克雷伯菌對亞胺培南的耐藥率為2.5%外,其余4所的耐藥率范圍為32.1%~45.5%,提示免疫功能低下者為CRKP的易感人群。英國曾經發(fā)出警示,需洞察CRKP對碳青霉烯類抗生素耐藥性的“威脅”[29]。因此,面對KP對碳青霉烯類的耐藥率明顯上升趨勢,需引起臨床的高度重視,加強CRKP的耐藥性監(jiān)測,獲得常見臨床分離菌對碳青霉烯類抗生素的耐藥率,采取積極有效措施,控制耐藥細菌在全國范圍內的傳播。

2 分子基因耐藥機制

在細菌耐藥性監(jiān)測的基礎上,開展適當的耐藥基因檢測和分子分型,可揭示耐藥菌的耐藥機制和傳播規(guī)律,為防治和控制耐藥菌傳播提供臨床依據。CRKP耐藥性與其產生及攜帶不同的耐藥基因密切相關。主要包括:①產碳青霉烯酶;②高產AmPC酶或超廣譜β內酰胺酶(ESBLS)合并外膜的丟失;③膜孔蛋白基因缺失或表達下調;④外排泵基因高表達;⑤PBPS蛋白缺失或親和力下降等。上述耐藥基因可單獨或共同作用,從而降低碳青霉烯類抗生素耐藥或敏感性。

2.1 碳青霉烯酶 碳青霉烯酶是一類β-內酰胺酶,能水解包括碳青霉烯類藥物在內的幾乎所有β-內酰胺類抗生素。按照Ambler分子分類,可進一步分別為A,B,D 3類。

2.1.1 A類酶 A類酶包括GES、KPC、SME、SHV-38、SCF-1等,其中產肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase,KPC)型最常見。KPC由質粒介導,憑借可移動元件,向不同菌株、菌種間迅速擴散,造成院內感染,并在不同地區(qū)間傳播、流行。目前發(fā)現KPC有19種基因型,其分布呈顯著地域特點。國外主要以KPC-3型為主,我國以KPC-2型多見。高倩倩[30]收集上海兩所教學醫(yī)院84株CRKP菌株分析常見耐藥基因,其中bla-KPC-2陽性率為90.5%,克隆分型中ST-11型占71株(84.5%),提示CRKP耐藥主要與bla-KPC-2有關。ST-11為CRKP的主要克隆分型,呈克隆傳播趨勢。黃亞雨等[31]分析33株CRKP菌株,攜帶KPC基因32株,攜帶SHV基因30株,攜帶NDM-1基因1株;同源性分析顯示,ST-11/A型29株,ST-15/B型2株,提示CRKP耐藥與攜帶KPC耐藥基因有關,與SHV共同作用并致耐藥。大部分CRKP為ST-11型,同源性程度高,易在醫(yī)院內克隆性傳播。

2.1.2 B類酶 B類酶為金屬β-內酰胺酶,包括IMP,VIM,GIM,SIM,NDM(新德里金屬酶)等。其中最主要的為NDM,2008年首先在一位印度裔尿路感染患者中分離出并命名為NDM-1[32],至今已發(fā)現NDM-1的15種蛋白位點突變體。在我國NDM-1不斷有報道并呈上升趨勢[33-35],近年來在國內外逐漸有產NDM-5腸桿菌科細菌的報道[36-38]。該類型NDM基因有共同的特點,即有獨特的基因序列,其基因元件位于質粒上,易在不同菌株間轉移、傳播,引起廣泛耐藥,產生廣泛耐藥與質粒水平傳播密切相關。攜帶NDM基因的KP除黏霉素外,對所有抗生素耐藥,被冠以“超級細菌”,大大增加CRKP感染的治療難度,已成為人類公共健康的主要威脅,成為臨床抗感染治療的主要挑戰(zhàn)。

2.1.3 D類酶 D類酶又稱苯唑西林酶(OXA酶)。在肺炎克雷伯菌中檢出最多的是OXA-48,有11種OXA-48型碳青霉烯酶的變體。Poirel等[39]最早在一個土耳其患者中發(fā)現,后迅速在美國、印度、中國等國家流行[40]。OXA-48型主要由質粒編碼,可在不同菌屬的腸桿菌科細菌中傳播;攜帶該基因的肺炎克雷伯菌,可同時產生KPC,ESBLS酶等,表現出對碳青霉烯類的強水解活性;當合并膜孔蛋白缺失或OmpK35和Omp K36的變異時,導致對碳青霉烯類抗生素高水平耐藥[41]。其他類型OXA酶也與CRKP耐藥有關。

2.2 AmpC酶 AmpC酶又稱頭孢菌素酶,有40多種基因型,國外以CMY-2型多見,我國多見類型為DHA-1型和ACT-1型[42]。Shi等[43]發(fā)現,DHA-1型伴隨膜孔蛋白(Ompk36)變異,可導致肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類耐藥。AmpC酶以質粒作為載體,通過接合,轉化,轉導等方式,導入肺炎克雷伯菌體內缺乏的AmpC基因,促使該菌產生AmpC酶,并使耐藥基因在不同菌株間轉移。質粒介導的AmpC酶是肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類抗生素產生耐藥性的主要原因。

2.3 膜孔蛋白基因缺失或表達下調 膜孔蛋白是肺炎克雷伯菌細胞外膜上一種特殊的水溶性通道蛋白,由OmpK35、OmpK36、OmpK37基因編碼,其中起關鍵作用的是OmpK35、OmpK36。膜孔蛋白是物質交換的通道,碳青霉烯類抗生素通過膜孔蛋白進入菌體內,殺滅細菌,從而發(fā)揮抗菌作用[44]。當膜孔蛋白缺失或表達下調時,抗菌藥物無法進入菌體內,從而產生耐藥。以往研究[45]發(fā)現,當膜孔蛋白缺失同時合并產ESBls或AmpC酶時,才表達對碳烯類抗生素高水平耐藥。而羅洪英等[46]在分析70株CRKP菌株中發(fā)現:產KPC酶同時Ompk35表達下調占50.77%,缺失占9.23%;OmpK36表達下調占3.08%,缺失占55.3%;說明產KPC酶同時合并膜孔蛋白的表達降低或缺失,與細菌耐藥性密切相關。而最新的研究[47]發(fā)現:質粒介導的NDM-1酶合并OmpK36表達降低或缺失,是導致肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類抗生素高水平耐藥的主要原因。

2.4 外排泵基因高表達 外排泵在肺炎克雷伯菌中廣泛分布,普遍存在。AcrAB-TolC外排系統(tǒng)是肺炎克雷伯菌最主要的外排泵,存在于細菌內膜。研究[48]發(fā)現,外排泵基因被底物誘導激活后,呈高表達狀態(tài),將進入細菌中的抗菌藥物主動排出體外,導致肺炎克雷伯菌產生耐藥性,甚至多重耐藥性。國內zhuo等[49]首次從多重耐藥肺炎克雷伯菌中檢出mdf-A,Smr,tehA等外排泵結構基因,證實AcrAB-TolC外排系統(tǒng)高表達會導致KP的多重耐藥。OqxAB外排泵系統(tǒng)是近年來在KP中發(fā)現的一種較新的外排泵,由OqxA和OqxB共同編碼,共同存在,其中OqxB起主要作用[50],其主要通過促進細菌生物膜形成,介導肺炎克雷伯菌產生耐藥。Filgona等研究[51]發(fā)現:應用外排泵抑制劑后,CRKP對厄他培南、多尼培南的MIC值明顯降低,表明外排泵基因和其他耐藥機制共同存在,參與耐藥。

2.5 PBPS蛋白缺失或親和力下降 PBPS即青霉素結合蛋白,其位于細菌內膜,是能與β-內酰胺類抗生素共價結合的一類酶。β-內酰胺類抗生素與PBPS結合后,干擾酶的正常功能,引起細菌自溶或形成球狀體、絲狀體,最終細菌分裂而發(fā)揮殺菌作用[52]。不同種類細菌所含PBPS不盡相同,但結構和功能卻很相似。研究[53]證實,PBPS的結構變異,數量改變或與抗生素親和力下降,是導致KP對β-內酰胺類抗生素耐藥的主要原因。還有研究[54]表明,PBPS通過靶位點改變,使進入菌體內抗生素不能與PBPS位點結合,因而不能發(fā)揮殺菌作用而耐藥。而最新的研究[55]顯示,多個PBPS聯合變異,可導致KP高水平耐藥。因此,PBPS蛋白缺失或親和力下降,對細菌耐藥性的產生起至關重要的作用。

3 小結與展望

肺炎克雷伯菌作為一種條件致病菌,是導致院內感染和社區(qū)獲得性感染的主要細菌。碳青霉烯類抗生素是治療肺炎克雷伯菌感染的“中流砥柱”。但在強大的抗生素應用壓力下,隨著臨床應用不斷增加和濫用,CRKP檢出率不斷增加,CRKP感染逐年攀升,多重耐藥日益嚴重。CRKP耐藥性與其產生不同的耐藥基因,并通過質粒傳導密切相關,遏制CRKP的進一步流行傳播迫在眉睫。展望未來,積極開展CRKP菌株的主動監(jiān)測,及時獲得分離菌對各種抗生素的耐藥率,指導臨床合理治療。在此基礎上,開展分子水平的耐藥基因檢測,揭示CRKP的分子耐藥機制和傳播規(guī)律,掌握本地菌株的流行趨勢和耐藥特點,有針對性的制定合理有效的預防控制措施,將有助于有效防止肺炎克雷伯菌多重耐藥的產生和蔓延。

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