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包蟲病致病機制及新藥研發(fā)基礎研究CYP1A2基因單核苷酸多態(tài)性與囊型包蟲病關聯(lián)性分析①

2021-04-15 05:54:46亞庫甫托合提林仁勇呂國棟
新疆醫(yī)科大學學報 2021年3期
關鍵詞:包蟲病易感性關聯(lián)性

亞庫甫·托合提,劉 輝,李 亮,楊 寧,林仁勇,呂國棟

(新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院臨床醫(yī)學研究院,烏魯木齊830054)

包蟲病是棘球絳蟲的幼蟲寄生于宿主體內引起的人獸共患寄生蟲病[1]。我國有2種包蟲病,即細粒棘球蚴引起的囊型包蟲病和由多房棘球蚴引起的泡型包蟲病,在臨床囊性包蟲病最為常見[2]。我國是全球包蟲病患者最多的國家之一,新疆維吾爾自治區(qū)是我國囊性包蟲病流行的重點區(qū)域[3]。西部地區(qū)受包蟲病威脅,每年經濟損失嚴重[4]。目前如何對包蟲病進行有效防治是一個公共衛(wèi)生問題。疾病的嚴重程度、臨床轉歸及疾病感染率由多個因素決定,這其中基因變異有著重要的作用[5]。單核苷酸多態(tài)性(SNP)是基因組中重要的遺傳變異之一,研究人員發(fā)現(xiàn)HLA等基因的SNP與包蟲病感染風險存在關聯(lián)性[6]。然而其他基因的SNP在包蟲病易感性和致病機制中的作用尚待研究。CYP1A2是編碼細胞色素P450超家族酶的一個基因,位于15號染色體上[7],主要在肝細胞中表達,在許多致癌物和內源性化合物的激活和排毒過程中發(fā)揮重要作用[8]。它在維持身體健康扮演著一個重要的角色[9]。已有研究發(fā)現(xiàn)CYP1A2基因遺傳變異與直腸癌、乳腺癌、肺癌、前列腺癌等多種重大疾病發(fā)生密切相關,CYP1A2*C(rs2069514)和CYP1A2*F(rs762551)多態(tài)性是兩個最常被研究基因位點[10]。而目前CYP1A2基因SNP與包蟲病發(fā)病風險的關聯(lián)性研究仍未見報道?;诖耍狙芯刻接慍YP1A2基因SNP與包蟲病患者發(fā)病風險和臨床分型的相關性,為早期識別社區(qū)風險群體提供依據,并評估其作為包蟲病患者早期診斷新型分子標志物的可行性。

1 對象與方法

1.1 對象 選取2012年6月-2018年6月在新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院診斷為囊型包蟲病的患者162例為病例組。選取同期來本院體檢的健康體檢者156例為對照組。兩組受檢者性別構成、年齡相匹配、民族構成差異無統(tǒng)計學意義。所有患者均符合《肝兩型包蟲病診斷治療專家共識》(2015年版)[4]。納入標準為:(1)性別不限,民族不限。(2)患有肝包蟲病和肝臟在CT圖像中能完整并正常呈現(xiàn)的患者。(3)曾與狗等家畜有接觸史或者在日常接觸人群中具有肝包蟲患者。排除標準為:(1)其他合并感染性疾病,代謝性疾病患者。(2)肝臟先天性不完整或功能缺陷者。本研究經過本院倫理委員會審查通過,所有受檢者均同意參加本研究并簽署知情同意書。

1.2 方法

1.2.1 DNA提取 EDTA抗凝管無菌采集5 mL靜脈血,存于-80℃冰箱;北京天根公司全血DNA試劑盒提取DNA,采用Nanodrop 2000分光光度計測量DNA純度和濃度。

1.2.2 基因型檢測 采用TaqMan探針基因分型技術對:rs2069514和rs762551多態(tài)性進行檢測。TaqMan SNP Genotyping Assays試劑盒和TaqMan SNP Genotyping Mix試劑盒購自美國ABI公司。應用7900 HT熒光實時定量PCR儀(ABI,美國)進行PCR反應,CYP1A2基因位點rs2069514-引物序列:F:5'-TTGCAAAAATTCATCAAGCTACA-3',R:5'-GAG TGAGGCCAGGAGTTCAA-3'。rs762551-引物(F:5'-CTGATGCGTGTTCTGTGCTT-3',R:5'-AGAGAGCCAGCGTTCATGTT-3')。PCR反應體系為5μL,包括2×Taq-Man Master Mix試劑2.0μL,40 x TaqMan Genotyping Assay試 劑0.05μL、DNA(15~20 ng/μL)2μL、H2O 0.95μL,共50個循環(huán)。PCR反應參數:95℃10 min,95℃15 s,60℃1 min。每例樣本重復檢測3次。應用Sequence Detector Software version 2.1(SDS version 2.1)圖像分析軟件進行基因型分析。若只有FAM或VIC熒光增強的樣本,其SNP分型為純合子,若FAM和VIC同時增強則為雜合子。

1.3 統(tǒng)計學分析 采用SPSS23.0軟件進行數據統(tǒng)計分析。服從正態(tài)分布的計量資料描述用均數±標準(±s)表示,兩組間差異性分析采用t檢驗,不滿足正態(tài)分布的資料采用非參數檢驗(Kruskal-Wallis)。計數資料采用n表示,組間比較采用卡方檢驗;采用卡方檢驗分析受檢者SNP基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡。應用非條件Logistic回歸模型分析SNP基因型與包蟲病發(fā)病風險的關聯(lián),并通過年齡、性別、民族等因素進行校正,計算OR值和95%置信區(qū)間(CI)。P<0.05表示差異有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 研究對象的一般特征 病例組162例,男性82例、女性80例,年齡(38.4士14.0)歲,對照組156例,男性88例、女性68例,年齡(40.1士12.4)歲。病例組年齡<30歲的47例、30~60歲的104例、>60歲的11例,對照組年齡<30歲的30例、30~60歲的115例、>60歲的11例。病例組中有包蟲活力的134人,無包蟲活力的28人。

2.2 CYP1A2基因SNP不同基因型在人群中的分布 每個SNP位點3種基因型在兩組受檢者中的分布發(fā)現(xiàn),SNP位點rs2069514 GG、GA、AA基因型在兩組分布差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),rs762551位點3種基因型分布在兩組分布差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表1。

表1 CYP1A2基因SNP在病例組和對照組的分布/例(%)

2.3 CYP1A2基因SNP位點rs2069514基因型與囊型包蟲病發(fā)病風險的關聯(lián)性 突變型基因(GA+AA)的人群與野生型基因(GG)人群相比,囊型包蟲病的發(fā)病風險提高了109%[OR(95%CI)=2.09(1.25~3.51),P=0.005],純突變型基因(AA)的人群與包含突變型基因(GA+GG)人群相比,囊型包蟲病的發(fā)病風險降低了48%[OR(95%CI)=0.42(0.21~0.82),P=0.005],見表2。

2.4 CYP1A2基因SNP基因型與包蟲病臨床分型的關聯(lián)性 CYP1A2基因SNP位點rs2069514和rs762551均與包蟲病臨床分型無關聯(lián),差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表3。

表2 CYP1A2基因SNP位點rs2069514基因型與囊型包蟲病發(fā)病風險的關聯(lián)性

表3 CYP1A2基因SNP基因型與包蟲病臨床分型的關聯(lián)性/例(%)

3 討論

包蟲病是由棘球絳蟲幼蟲感染引起的[11]。感染性疾病的發(fā)生和發(fā)展是一個復雜的過程,是致病微生物、宿主與環(huán)境相互作用的結果[12]。暴露于相同的危險因素下,同一地區(qū)的同一人種包蟲病發(fā)病率不同,提示宿主的遺傳多態(tài)性與包蟲病的易感性相關[13]。多項研究報道感染性疾病的易感性與單核苷酸多態(tài)性相關[14],關于包蟲病感染易感性與單核苷酸多態(tài)性相關的研究報道較少。CYP1A2基因SNP與多種疾病易感性密切相關,然而它與包蟲病感染的關聯(lián)性仍未見報道。本研究首次發(fā)現(xiàn)CYP1A2基因SNP與包蟲病感染風險存在顯著關聯(lián)。

人類CYP1A2基因是高度多態(tài)的,其中中國人突變最多的SNP位點是rs2069514、rs762551[15]。rs2069514又稱為-3860 G>A,位于CYP1A2基因編碼區(qū)上游區(qū)域,該SNP突變導致日本吸煙者CYP1A2活性顯著降低[16]。國外研究報道CYP1A2基因SNP位點rs2069514與肺癌風險增加相關,它和膀胱癌風險降低相關[17]。本研究中CYP1A2基因SNP位點rs2069514在病例組和對照組中GG、GA、AA基因型分布有差異,提示CYP1A2基因SNP位點rs2069514與包蟲病易感性相關,包含突變型GA+AA的人群與野生型GG人群相比,囊型包蟲病的發(fā)病風險提高,純突變型AA與GA+GG相比發(fā)病風險降低,提示rs2069514 GA基因型可能是包蟲病感染的危險因素,其影響包蟲病發(fā)生的功能機制有待進一步研究。

有研究報道CYP1A2基因SNP位點rs762551與白種人得肺癌風險增加有關[18],另有研究報道SNP位點rs762551與結直腸癌風險降低相關[19]。而本研究顯示,SNP位點rs762551與包蟲病易感性無相關性。本研究中CYP1A2基因SNP位點rs2069514和rs762551均與包蟲病臨床分型無關聯(lián)性,可能原因是樣本數量較少,需進一步擴大樣本量以獲得更為客觀正確的結果。

CYP1A2是重要的藥物代謝酶[20]。CYP1A2參與眾多的內源性和外源性化合物,包括致癌物的代謝轉化,以及它在各種疾病發(fā)展中發(fā)揮重要作用[7]。CYP1A2表達存在較大的個體差異[10],這跟藥物代謝有關[21]?,F(xiàn)有治療包蟲病的阿苯達唑等藥物的利用效率低[3],CYP1A2參與阿苯達唑的代謝過程[22],提示,開展阿苯達唑藥物代謝額濃度與CYP1A2基因SNP的關聯(lián)性研究很有必要,對臨床指導阿苯達唑治療包蟲病具有一定的意義。

目前包蟲病易感性的研究主要集中在免疫方面[23]。本研究發(fā)現(xiàn)了CYP1A2 SNP與包蟲病感染風險的關聯(lián)性,增加了SNP與包蟲病易感性的一個研究思路。人類基因組序列已揭示約107個人類CYP基因:59個活躍基因和約48個假基因,在編碼異源生物代謝酶的基因(CYP1-3)中,除了相對保守的CYP1A1和CYP2E1外,其他基因也具有大量的SNP位點。本研究僅探索了CYP1A2基因rs2069514和rs762551與囊性包蟲病的相關性,其他SNP位點也具有一定研究價值,尚待今后進一步研究。

綜上所述,CYP1A2基因SNP位點rs2069514與包蟲病易感性相關。在DNA水平研究包蟲病易感性,有助于了解包蟲病的發(fā)病機制,為包蟲病未來的基因診斷以及預防奠定堅實的基礎。

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