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陜西扶風某生豬養(yǎng)殖場腸球菌分型與毒力基因檢測

2021-05-06 03:33廉魯昕牛沁雅曹晨陽盛煥精施春雷史賢明楊保偉
關鍵詞:球菌毒力亞型

廉魯昕,牛沁雅,曹晨陽,盛煥精,李 偉,施春雷,史賢明,楊保偉

(1 西北農林科技大學 食品科學與工程學院,陜西 楊凌 712100;2 上海交通大學 農業(yè)與生物學院,上海200240)

腸球菌(Enterococcus)是存在于人和其他動物腸道中的一類常見條件致病菌,普遍存在于畜、禽生長環(huán)境及以畜禽產(chǎn)品為原材料的食品生產(chǎn)和加工環(huán)境中[1]。以前,人們普遍認為該菌對人和動物無害而被作為益生菌添加到動物飼料中,有研究表明,在仔豬飼糧中添加屎腸球菌可以改善生長性能, 維持腸道菌群平衡, 有效增強免疫力[2]。雞飼糧中添加糞腸球菌能提高蛋雞的產(chǎn)蛋量、雞蛋蛋白高度和蛋黃顏色,降低血清和蛋黃總膽固醇含量,調節(jié)腸道微生物數(shù)量[3]。也有研究表明,糞腸球菌生長繁殖速度快,能耐受胃腸道環(huán)境,對O1和O78型大腸桿菌具有抑制作用,適合制作微生態(tài)制劑[4]。然而,2017年CHINET細菌耐藥性的監(jiān)測結果顯示,腸球菌在醫(yī)院分離的革蘭氏陽性臨床致病菌株中位列第二[5],表明分布廣泛的腸球菌可能會引發(fā)人及動物的多種感染,對食品安全和公共衛(wèi)生安全均存在嚴重威脅。

為評估腸球菌可能引起的豬肉食品安全性問題,段志剛等[6]和黃奕雯等[7]先后對鄭州市零售鮮豬肉源腸球菌的亞型及江西省健康和腹瀉豬仔糞便中糞腸球菌攜帶的毒力基因進行了研究,結果表明糞腸球菌、屎腸球菌及其所攜帶的毒力基因可能是引起豬肉食品安全問題的重要因素。陳秀戀等[8]對泉州市熟肉制品中血溶性腸球菌的檢測結果也表明,腸球菌在豬肉食品中廣泛存在,并可引發(fā)潛在食物中毒風險。相對而言,目前針對生豬養(yǎng)殖場中腸球菌的流行、分布和毒力基因攜帶情況研究較少,使豬肉生產(chǎn)鏈中對腸球菌可能引起的安全性把控缺少理論數(shù)據(jù)支撐。為此,本研究以陜西省扶風縣某生豬養(yǎng)殖場為研究對象,對分離于該養(yǎng)殖場不同環(huán)境及相關生物樣品的腸球菌進一步進行分型,并檢測了其攜帶的部分毒力基因,以期為評估由此可能帶來的豬肉食品安全問題提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

2015年12月和2016年4月,從陜西省扶風縣某生豬養(yǎng)殖場采集同批生豬育肥前期和育肥后期的豬糞、豬鼻拭子、豬舍墻壁、豬舍地面、豬舍污水、豬舍土壤、豬槽、豬飼料、豬場空氣沉降物和豬場工作人員糞便樣品,用緩沖蛋白胨水(buffered peptone water,BPW)將樣品進行1∶10稀釋后,在腸球菌增菌肉湯中進行選擇性增菌,將培養(yǎng)后的增菌液劃線接種于mEI平板培養(yǎng),挑取平板上帶有藍黑色暈輪的疑似菌落進行驗證,共分離鑒定出87株腸球菌。將分離菌株保存于西北農林科技大學食品科學與工程學院微生物食品安全研究室。

瓊脂糖(Agarose)購自美國Sigma公司,TaqDNA聚合酶、10×PCR Buffer、dNTPs、Mg2+、100 bp DNA Marker和DL2000 DNA Marker均購自寶生物工程(大連)有限公司,引物由楊凌天潤奧科生物科技有限公司合成。

1.2 儀器與設備

SW-CJ-1CU超凈工作臺,蘇州安泰空氣技術有限公司;微量移液槍、5415D小型臺式高速離心機,德國Eppendorf;MyCircle PCR基因擴增儀(Bio-Rad)、GEL DOC XR凝膠成像系統(tǒng)(Bio-Rad)、LAC-5080S高壓滅菌鍋,上海博迅實業(yè)有限公司;HH-4數(shù)顯恒溫水浴鍋,北京科偉永興儀器有限公司;GNP-9080隔水式恒溫培養(yǎng)箱,上海精宏實驗設備有限公司。

1.3 試驗方法

1.3.1 腸球菌亞型分型 將保存于-80 ℃冰箱的菌株劃線接種于MHA平板進行活化培養(yǎng)[9],挑取單菌落制備DNA模板。使用PCR技術,基于糞腸球菌、屎腸球菌、雞腸球菌的特異性基因對87株腸球菌進行分型,試驗所用引物見表1。

表1 腸球菌分型所用引物信息Table 1 Primer information for Enterococci subtyping

PCR反應體系為25 μL,其中10×Buffer 2.50 μL、Mg2+1.50 μL、dNTP Mixture(2.5 mmol/L)2.00 μL、TaqDNA聚合酶(5 U/μL)0.25 μL、上下游引物(10 μmol/mL)各0.30 μL、ddH2O 13.15 μL、DNA模板5 μL。反應程序為:94 ℃預變性5 min;94 ℃ 30 s,退火(退火溫度見表1)30 s,72 ℃ 30 s,30個循環(huán);72 ℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,低溫送至楊凌天潤奧科生物科技有限公司進行測序,測序結果通過GenBank數(shù)據(jù)庫Blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ Blast.cgi)進行在線比對驗證[6,10]。

1.3.2 毒力基因檢測 采用PCR方法,對ace、cylA、cylB、cylM、cylL1、efaA、esp、gelE、AS、asal和hyl等11種腸球菌中常見的毒力基因進行篩查,引物序列[6,11-15]見表2。PCR反應體系及反應程序同1.3.1,退火溫度如表2所示。

表2 腸球菌攜帶毒力基因檢測所用引物信息Table 2 Primer information for virulence gene detection carried by Enterococci

1.4 數(shù)據(jù)分析

采用Excel 2010和Canoco 5軟件對試驗數(shù)據(jù)和圖像進行處理,用SPSS 20.0和MINITAB 16軟件對數(shù)據(jù)進行卡方檢驗、蒙特爾檢驗等統(tǒng)計學分析(P<0.05,表示差異顯著;P<0.01,表示差異極顯著)。

2 結果與分析

2.1 腸球菌分型

2.1.1 亞型檢測結果 由圖1可知,從陜西省扶風縣生豬養(yǎng)殖場采集樣品中分離出的87株腸球菌可被分為3種確定的亞型和1種其他類亞型,其中糞腸球菌檢出率最高,為57.5%,極顯著(P<0.01)高于屎腸球菌(10.3%)和雞腸球菌(4.6%);其他亞型腸球菌的檢出率為27.6%。

**表示檢出率間差異極顯著(P<0.01)** indicates significant difference among detection rates (P<0.01)

2.1.2 各亞型腸球菌在不同采樣點分離株中的檢出率 由于未在豬槽、豬飼料和豬場空氣沉降物中檢出腸球菌,所以僅對其他來源菌株進行分析,結果見圖2。由圖2可以看出,雞腸球菌(n=4)僅在豬舍墻壁源菌株(75.0%)和土壤源菌株(25.0%)中有檢出,檢出率間無顯著差異。糞腸球菌、屎腸球菌和其他類型腸球菌在6個采樣點分離的菌株中均有檢出。糞腸球菌(n=50)在豬糞源菌株中檢出率最高(40.0%),且顯著(P<0.05)高于豬鼻拭子和豬舍墻壁源菌株(均為14.0%)、豬場工作人員糞便(以下簡稱為人糞)源菌株(4.0%)和豬舍污水源菌株(2.0%)中的檢出率,與豬舍地面源菌株中的檢出率(26.0%)無顯著差異(P>0.05)。屎腸球菌(n=9)在各采樣點分離菌株中的檢出率均無顯著差異(P>0.05),其中在豬舍地面源菌株中的檢出率最高(33.3%),其次是人糞源菌株(22.2%),豬糞、拭子、污水和土壤源菌株中的檢出率均為11.1%。其他類型腸球菌(n=24)在各采樣點分離株中的檢出率間無顯著差異(P>0.05),其中豬鼻拭子源菌株中的檢出率最高(25.0%),其他依次為豬糞(20.8%)和豬舍墻壁、地面(16.7%)、土壤(12.5%)及人糞(8.3%)。

圖柱上標不同小寫字母表示不同采樣點間差異顯著(P<0.05)。下圖同Different lowercase letters indicate significant difference among different sampling sites (P<0.05).The same as below圖2 各亞型腸球菌在不同采樣點的檢出率Fig.2 Detection rates of Enterococci subtypes at different sampling sites

2.1.3 不同采樣點菌株中各亞型腸球菌的組成 由表3可以看出,不同采樣點源菌株中各亞型腸球菌的組成和比例不同。豬糞源菌株中,糞腸球菌檢出率(76.9%)顯著(P<0.05)高于其他類型腸球菌(19.2%)和屎腸球菌(3.9%)。豬鼻拭子源菌株中,屎腸球菌檢出率(7.1%)顯著(P<0.05)低于糞腸球菌(50.0%)和其他類型腸球菌(42.9%)。豬舍墻壁源菌株中,糞腸球菌(50.0%)、雞腸球菌(21.4%)和其他類型腸球菌(28.6%)檢出率間無顯著差異(P>0.05)。豬舍地面源菌株中,糞腸球菌檢出率(65.0%)顯著(P<0.05)高于其他類型腸球菌(20.0%)和屎腸球菌(15.0%)。豬舍污水源菌株中只檢出屎腸球菌和糞腸球菌(均為50.0%)。豬舍土壤源菌株中,屎腸球菌、雞腸球菌和其他類型腸球菌檢出率分別為20.0%,20.0%,60.0%,三者間無顯著性差異(P>0.05)。豬場工作人員糞便中,糞腸球菌、屎腸球菌、其他類型腸球菌檢出率均為33.3%。

表3 不同采樣點菌株中各亞型腸球菌的檢出率Table 3 Detection rates of each subtype of Enterococci at different sampling sites %

2.2 毒力基因檢測

2.2.1 腸球菌中毒力基因檢測 由表4可以看出,在供試的11種毒力基因中,87株腸球菌中共檢出5種毒力基因,其中asal的檢出率最高(50.6%,其他依次為gelE(27.6%)、cylL1(19.5%)、ace(18.4%)和esp(1.2%)。asal的檢出率顯著(P<0.05)高于esp基因,其他基因檢出率間差異不顯著。

表4 腸球菌中毒力基因的檢測結果(n=87)Table 4 Detection of virulence genes in Enterococci isolates (n=87)

由圖3可以看出,5種毒力基因在各亞型腸球菌中的檢出情況不同。糞腸球菌(n=50)中,asal的檢出率(66.0%)顯著(P<0.05)高于gelE(34.0%)、cylL1(26.0%)和ace(22.0%)。屎腸球菌(n=9)中,asal、cylL1、esp、gelE、ace的檢出率分別為55.6%,44.4%,11.1%,66.7%和22.2%,相互間并無顯著差異(P>0.05)。雞腸球菌(n=4)中,asal、gelE和ace的檢出率分別為75.0%,25.0%,75.0%,三者之間無顯著差異(P>0.05)。其他類型腸球菌(n=24)中,只有asal被檢出,檢出率為12.5%。

圖3 不同毒力基因在各亞型腸球菌中的檢出率Fig.3 Detection rate of virulence gene among isolates of different Enterococci subtypes

2.2.2 不同采樣點腸球菌分離株中毒力基因的檢測 由圖4可以看出,5種毒力基因在不同采樣點分離菌中的檢出率具有一定差異。asal基因(n=44)在豬糞源菌株中的檢出率(36.4%)顯著(P<0.05)高于豬鼻拭子、豬舍污水和人糞源菌株中的檢出率(后者分別為9.1%,2.3%和4.5%),而與豬舍墻壁源菌株、豬舍地面源菌株中的檢出率(20.5%,27.3%)間無顯著差異(P>0.05)。cylL1基因(n=17)在豬舍地面源菌株中的檢出率(41.2%)顯著(P<0.05)高于污水和人糞源菌株中的檢出率(均為5.9%),與豬糞和豬鼻拭子源菌株中的檢出率(35.3%,11.8%)間無顯著差異(P>0.05)。esp基因(n=1)僅在豬舍地面源菌株中有檢出。gelE基因(n=24)在豬舍地面源菌株中的檢出率(37.5%)顯著(P<0.05)高于豬鼻拭子、墻壁、污水、土壤源菌株中的檢出率(8.3%,4.2%,8.3%,8.3%),而與豬糞源菌株中的檢出率(33.3%)間無顯著差異(P>0.05)。ace基因(n=16)在豬糞(25.0%)、豬鼻拭子(18.8%)、豬舍墻壁(25.0%)、豬舍地面(25.0%)和豬舍土壤源菌株中的檢出率(6.3%)間無顯著差異(P>0.05)。

2.2.3 生豬育肥前后期菌株中毒力基因的檢測 表5顯示,在育肥前期和后期,ace、cylL1、esp、gelE和asal在所有源菌株中總檢出率分別為93.7%和6.3%,82.3%和17.7%,100%和0%,75.0%和25.0%及84.1%和15.9%。其中豬舍墻壁源菌株中gelE檢出率在育肥后期高于育肥前期,豬場工作人員糞便asal檢出率育肥前后相當,其他均表現(xiàn)為育肥前期高于育肥后期。

2.2.4 毒力基因的分布 毒力基因的分布在一定程度上受到采樣時間、采樣地點和菌株亞型的影響。由圖5可知,從陜西扶風某生豬養(yǎng)殖場分離的87株腸球菌毒力基因的分布受采樣地點的影響較?。坏鞘懿蓸訒r間和菌株亞型的影響較大(P<0.01),其對ace、esp和asal分布的影響尤其明顯。另外,菌株亞型對gelE、cylL1的分布也存在較為明顯的影響。

*標記的因素對腸球菌毒力分布基因影響極顯著(P<0.01)Factors marked by * have significant effects on distribution of Enterococci virulence genes(P<0.01)圖5 腸球菌毒力基因與各影響因素間關系的冗余分析Fig.5 Redundancy analysis of relationship between virulence genes of Enterococci and various influencing factors

3 討 論

腸球菌是一種革蘭氏陽性菌,其對外界環(huán)境的抵抗力較一般細菌強,可在水、土壤及動物腸道內生存。腸球菌是人類和動物腸道正常菌群的一部分,通常在引起腹腔和盆腔感染所分離的混合菌中被發(fā)現(xiàn)。腸球菌既往被認為是人腸道的共棲菌,但近年來的研究證實腸球菌具有一定的致病力[16-17]。

李鵬[18]研究表明,在84株藏豬源腸球菌中,糞腸球菌和屎腸球菌高達76株,在腸球菌中的占比高達90.47%。段志剛等[6]在鄭州市多個市場中采集的零售鮮豬肉樣品中分離得到30株腸球菌,其中67%為糞腸球菌和屎腸球菌。本研究以從陜西省扶風縣某豬場育肥前期和育肥后期豬生物樣品、豬場水體樣品、豬舍環(huán)境涂抹樣品、養(yǎng)殖工作人員糞便等樣品中分離到的腸球菌為材料,采用PCR方法對腸球菌進行了亞型分型和常見毒力基因檢測,結果表明,糞腸球菌和屎腸球菌2種亞型在腸球菌中占比較高,與李鵬[18]、段志剛等[6]的研究結果相一致,由此可以發(fā)現(xiàn),生豬養(yǎng)殖環(huán)境中流行的腸球菌亞型與生豬、市售豬肉中流行的腸球菌亞型較為一致,表明生豬養(yǎng)殖環(huán)境中流行的腸球菌可能就是市售豬肉腸球菌的重要來源之一,成為影響市售豬肉安全的重要因素。本研究中,豬生物樣品和豬舍環(huán)境涂抹樣品中各亞型腸球菌的檢出率較高,可能與該豬場對豬糞便或豬舍清理方式及效率有關。為了防止生豬攜帶的腸球菌污染豬肉,導致食品安全事件發(fā)生,豬場應加強豬糞處理與豬場地面清潔,避免腸球菌在豬場內大范圍傳播。

在先前的研究中,劉利等[19]認為細菌感染過程十分復雜,毒力基因特異性表達及其協(xié)調作用是致病菌侵襲宿主、導致宿主致病的主要機制;也有研究表明,腸球菌致病是由多種毒力基因表達產(chǎn)物協(xié)同作用的結果[20-21]。因此,腸球菌攜帶的毒力基因對生豬養(yǎng)殖、豬肉及其產(chǎn)品安全至關重要。本研究對腸球菌中毒力基因的檢測結果表明,asal的檢出率最高,其次分別為gelE、cylL1、ace和esp,未檢出cylA、cylB和efaA等6種毒力基因。朱宏等[22]對感染尿路的腸球菌毒力基因分析發(fā)現(xiàn),糞腸球菌毒力基因攜帶量顯著高于屎腸球菌,且糞腸球菌中asal的檢出率最高。本研究中毒力基因asal的檢出率最高,可能與糞腸球菌在供試菌株中占比最大有關。而該結果與黃奕雯等[7]對江西省豬源糞腸球菌中部分毒力基因的檢測結果(毒力基因檢出率由高到低依次為efaA、ace、gelE、agg、esp和cylA)略有不同,這可能與毒力基因傳播的地域性以及豬場主要流行的菌株特性有關。但本研究與朱宏等[22]、黃奕雯等[7]的研究及其他研究[23]相比,gelE、ace和esp基因的檢出率均比較高,表明其可能是腸球菌經(jīng)常攜帶的主要毒力基因。

本研究針對不同采樣點樣品源菌株毒力基因的檢測結果表明,多種毒力基因在豬糞源腸球菌中的檢出率均比較高,這可能與腸道是腸球菌存在的主要環(huán)境有關。在生豬育肥前、后期采集到的樣品中,育肥后期腸球菌毒力基因的攜帶率較育肥前期均有不同程度降低,推測可能隨著生豬的不斷生長,豬自身的免疫力逐漸提高,豬體及養(yǎng)殖環(huán)境中腸球菌的種類趨于一致,其攜帶的毒力基因種類和數(shù)量逐漸減少。劉桂華等[24]對吉林省某生豬養(yǎng)殖場不同采樣點育肥前、后期采集的樣品進行腸球菌分離,結果顯示育肥前期腸球菌的檢出率顯著高于育肥后期,育肥后豬齡增大,其本身對腸球菌感染的抵抗力有所增強,與本研究結果相同。比較亞型、采樣地點和采樣時間對毒力基因分布的影響,可知采樣時間和腸球菌亞型對其毒力基因分布的影響較大,與同類研究相比,本研究中采樣點對于毒力基因分布的影響明顯較小,此結果也可能與該生豬養(yǎng)殖場的衛(wèi)生管控情況相關。

大量研究結果證實,腸球菌會引發(fā)禽畜的多種疾病,嚴重時甚至會導致死亡[25-26]。對腸球菌進行有效的亞型分型和毒力基因檢測,為腸球菌致病機理等的進一步研究奠定了良好基礎。依據(jù)本研究結果,可對豬場衛(wèi)生條件做出合理的判斷,進而優(yōu)化衛(wèi)生及質量管控措施,為臨床治療和食品衛(wèi)生安全提供有力的保障。

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