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基于循環(huán)生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)的鼻咽癌CBCT圖像修正

2021-06-03 08:40全科潤(rùn)程品晶陳榕欽柏朋剛陳濟(jì)鴻黃妙云陳彥宇洪加標(biāo)
關(guān)鍵詞:放射治療鼻咽癌修正

全科潤(rùn),程品晶,陳榕欽,柏朋剛,陳濟(jì)鴻,黃妙云,陳彥宇,洪加標(biāo)

1.南華大學(xué)核科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南衡陽(yáng)421001;2.福建省腫瘤醫(yī)院放療科,福建福州350014;3.福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院放療科,福建福州350001

前言

放射治療是鼻咽癌的主要治療方式,治療過(guò)程往往持續(xù)數(shù)周。隨著治療分次的增加,患者腫瘤及周?chē)M織的解剖結(jié)構(gòu)和劑量分布將發(fā)生變化,若繼續(xù)采取原放療計(jì)劃方案進(jìn)行照射,可能造成靶區(qū)劑量分布改變,并帶來(lái)嚴(yán)重的放療并發(fā)癥,影響放療精確性[1-2]。自適應(yīng)放療(Adaptive Radiation Therapy,ART)通過(guò)在某次治療過(guò)程中獲取新的引導(dǎo)影像分析分次放療與原放療計(jì)劃之間的差異,指導(dǎo)并調(diào)整后續(xù)分次放療計(jì)劃,是未來(lái)放射治療發(fā)展的趨勢(shì)[3]。錐形束CT(Cone-beam Computed Tomography,CBCT)能采集患者治療期間內(nèi)的解剖信息,廣泛應(yīng)用于圖像引導(dǎo)的放射治療。但由于偽影及重建技術(shù)的限制,對(duì)于具有相同電子密度的材料,CBCT圖像和CT圖像的CT值(Hounsfield Unit,HU)有較大偏差,因此未經(jīng)HU值修正的CBCT圖像不能直接用于劑量計(jì)算,這限制了其在ART中的應(yīng)用潛力[4]。CBCT圖像HU值的傳統(tǒng)校準(zhǔn)方法主要有基于模體的電子密度曲線刻度方法[5]、基于特定患者的方法[6]及基于體素形變配準(zhǔn)的方法[7]等。近年來(lái),深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在圖像處理領(lǐng)域取得巨大突破,尤其是生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)(Generative Adversarial Network,GAN),現(xiàn)已廣泛用于圖像風(fēng)格遷移[8]。在醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域中,GAN廣泛用于從MRI圖像遷移生成偽CT(Synthesized CT,sCT)圖像,這說(shuō)明GAN可能是醫(yī)學(xué)圖像轉(zhuǎn)換的潛在工具[9-10]。本研究擬使用循環(huán)生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)(Cycle-consistent Generative Adversarial Network,CycleGAN)深度學(xué)習(xí)算法[11]對(duì)鼻咽癌CBCT圖像進(jìn)行遷移,生成sCT圖像,對(duì)比sCT圖像與計(jì)劃CT(Planning CT,pCT)圖像的HU值及平滑性,從而探討該算法應(yīng)用于鼻咽癌CBCT圖像HU值修正的應(yīng)用價(jià)值。

1 材料與方法

1.1 數(shù)據(jù)獲取及預(yù)處理

所有CT圖像及CBCT圖像來(lái)自2019年10月~2020年2月在福建省腫瘤醫(yī)院接受放射治療的39例鼻咽癌患者。CT圖像采集于PHILIPS Brilliance Big Bore,球管電壓設(shè)置為120 kV,X射線管電流為225 mA,切片尺寸為512×512;CBCT圖像采集于Elekta XVI,球管電壓為120 kV,X射線管電流為25 mA,圖像體素分辨率為(1×1×1)mm3,切片尺寸為410×410。CBCT圖像均在患者首次治療前獲得。通過(guò)開(kāi)源軟件Elatix,選擇剛性配準(zhǔn)算法對(duì)CT圖像和CBCT圖像進(jìn)行配準(zhǔn),以CBCT圖像為基準(zhǔn),將CT圖像重采樣到CBCT圖像體素及尺寸大小,將所得的重采樣pCT圖像作為本研究圖像評(píng)價(jià)的金標(biāo)準(zhǔn)。為避免頭枕、治療床等非解剖結(jié)構(gòu)對(duì)訓(xùn)練產(chǎn)生影響,基于閾值分割及形態(tài)學(xué)處理方法創(chuàng)建外輪廓的二進(jìn)制掩膜,將掩膜外的區(qū)域體素值設(shè)置為-1 000 HU。將待訓(xùn)練圖像的HU范圍裁剪至[-1 000,2 000]。由于計(jì)算機(jī)GPU顯存的限制,本研究采用的是二維CycleGAN模型。在輸入模型之前,pCT與CBCT均從圖像中心裁剪至256×256尺寸大小且CT值均歸一化到[-1,1]之間。選擇30例患者為訓(xùn)練集,每位患者取70張切片,共包含2 100張pCT圖像和CBCT圖像;其余9例為測(cè)試集,共有630張pCT圖像和CBCT圖像。

1.2 CycleGAN算法模型

傳統(tǒng)的GAN依賴(lài)于生成器與鑒別器的互相博弈學(xué)習(xí)產(chǎn)生較好的輸出結(jié)果。本研究采用的CycleGAN模型相比較于傳統(tǒng)GAN增加了逆向循環(huán)GAN,雙重約束模型以提高輸出圖像的準(zhǔn)確性。

如圖1所示,該模型由兩個(gè)生成器與兩個(gè)判別器組成。在前向循環(huán)中,CBCT通過(guò)生成器GpCT生成類(lèi)pCT域的sCT圖像,再通過(guò)GCBCT重構(gòu)回類(lèi)CBCT域的循環(huán)CBCT(Cycle Cone-Beam Computed Tomography,CCBCT)圖像。同理,逆向循環(huán)中,pCT通過(guò)GCBCT生成偽CBCT(Synthesized Cone-Beam Computed Tomography,SCBCT)圖像,并通過(guò)GpCT重構(gòu)生成循環(huán)CT(Cycle Computed Tomography,CCT)圖像。判別器DpCT和DCBCT用于判別輸入圖像是否為真實(shí)域圖像,確保圖像的遷移。訓(xùn)練過(guò)程中,生成器的目標(biāo)是盡可能生成對(duì)方領(lǐng)域的圖像以欺騙各自相對(duì)應(yīng)的判別器。判別器的目標(biāo)是提高鑒別能力,減少分辨誤差。隨著生成器與鑒別器不斷對(duì)抗優(yōu)化,最終達(dá)到動(dòng)態(tài)平衡。CycleGAN損失函數(shù)分為對(duì)抗損失和循環(huán)一致性損失,計(jì)算公式如下:

式(1)、式(2)為對(duì)抗損失函數(shù)。其中,EpCT[(1-DpCT(pCT))2]是pCT輸入判別器DpCT之后所得實(shí)際判別值與理想值之間均方誤差的期望值,ECBCT[(DpCT(GpCT(CBCT)))2]是CBCT輸入生成器GpCT得到sCT之后再輸入判別器DpCT所得的實(shí)際判別值與理想值之間均方誤差的期望值。ECBCT[(1-DCBCT(CBCT))2]、EpCT[DCBCT(GCBCT(pCT))2]同理。

式(3)、式(4)為循環(huán)一致性損失函數(shù)。ECBCT[||CBCT-GCBCT(GpCT(CBCT))||1]是CBCT輸入GpCT得到sCT之后再輸入生成器GCBCT所得CCBCT與輸入CBCT之間平均絕對(duì)誤差的期望值。EpCT[||pCT-GpCT(GCBCT(pCT))||1]同理。

在整個(gè)訓(xùn)練期間,通過(guò)總目標(biāo)函數(shù)Lcyclegan并行優(yōu)化生成器與判別器。

式(5)中λ為循環(huán)一致性損失與對(duì)抗性損失的權(quán)重比,用來(lái)調(diào)節(jié)最終生成數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性。

圖1 CycleGAN模型Fig.1 Illustration of cycle-consistent generative adversarial network(CycleGAN)

1.3 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)及參數(shù)設(shè)計(jì)

生成器G由編碼層、轉(zhuǎn)換層和解碼層組成。輸入圖像經(jīng)過(guò)編碼層以減少特征圖大小,再經(jīng)過(guò)9層ResNet[12]殘差模塊轉(zhuǎn)換為目標(biāo)域的特征向量,最后經(jīng)過(guò)解碼層得到合成圖像,實(shí)現(xiàn)端到端遷移。判別器D為一個(gè)二分類(lèi)網(wǎng)絡(luò),輸出在[0,1]之間。所有網(wǎng)絡(luò)均在Tensorflow框架下實(shí)現(xiàn),λ設(shè)置為10,采用Adam算法進(jìn)行優(yōu)化[13],取一階矩衰減系數(shù)β1=0.5,二階矩衰減系數(shù)β2=0.5,batchsize=2,epoch=100,初始學(xué)習(xí)率為0.000 2,在20個(gè)epoch后學(xué)習(xí)率線性衰減。

1.4 HU值評(píng)估

使用平均絕對(duì)誤差(Mean Absolute Error,MAE)和平均誤差(Mean Error,ME)比較測(cè)試集sCT、CBCT與pCT之間的差異。計(jì)算公式如下:

其中,f(i,j)為掩膜內(nèi)pCT圖像(i,j)處的像素值;t(i,j)為待比對(duì)圖像(i,j)處的像素值;nxny為像素總數(shù)。

2 結(jié)果

2.1 MAE和ME評(píng)估

9例測(cè)試集的CBCT圖像與pCT圖像以及sCT圖像與pCT圖像之間的MAE與ME見(jiàn)圖2。在體內(nèi)區(qū)域(CT值分布在-1 000-2 000 HU),sCT圖像與pCT圖像的MAE為(99.00±15.37)HU,ME為(-24.00±12.64)HU。對(duì)軟組織區(qū)域而言(CT值分布在-100~150 HU),sCT圖像與pCT圖像的MAE為(48.00±7.45)HU,ME為(-7.00±8.96)HU。

圖2 測(cè)試集CBCT圖像與sCT圖像之間的MAE和ME比較Fig.2 Comparison of MAE and ME between CBCT images and sCT images for test datasets

2.2 HU值分布曲線

在測(cè)試集中隨機(jī)選擇一位患者,比較sCT圖像的HU值分布情況(圖3)。在Line a的HU分布曲線中,區(qū)域1處sCT圖像的MAE為50.6 HU,區(qū)域2處為275.3 HU;在Line b的HU分布曲線中,區(qū)域1處sCT圖像的MAE為9.1 HU,區(qū)域2處為132.6 HU。

3 討論

CBCT技術(shù)已廣泛應(yīng)用于圖像引導(dǎo)的放射治療,在整個(gè)治療過(guò)程中能準(zhǔn)確反映擺位誤差及器官解剖結(jié)構(gòu)發(fā)生變化的信息,但重建技術(shù)及噪聲偽影使其與CT圖像的HU值存在較大偏差,因此當(dāng)CBCT圖像用于劑量計(jì)算時(shí)需要對(duì)HU值進(jìn)行修正。

Zhang等[14]通過(guò)線性擬合方法得到鼻咽癌扇形束CT圖像與CBCT圖像的HU值近似函數(shù),并根據(jù)放射治療計(jì)劃系統(tǒng)中扇形束CT電子密度曲線及該擬合函數(shù),轉(zhuǎn)換后獲得修正后的CBCT電子密度曲線,并進(jìn)行基于CBCT圖像的劑量計(jì)算。結(jié)果表明經(jīng)修正后的CBCT圖像與扇形束CT圖像的MAE差異為111.9 HU,在2%/2 mm標(biāo)準(zhǔn)下,Gamma驗(yàn)證通過(guò)率分別為97.60%±0.83%和97.74%±2.08%。Barateaua等[15]提出基于GAN的深度學(xué)習(xí)算法來(lái)修正CBCT圖像,合成CT圖像在整個(gè)體表輪廓內(nèi)的MAE為82 HU,軟組織的MAE為69 HU,在2%/2 mm標(biāo)準(zhǔn)下,Gamma驗(yàn)證通過(guò)率為98.1%±1.2%,優(yōu)于HU電子密度刻度方法(91.0%±5.3%)。

本研究探索利用CycleGAN算法對(duì)鼻咽癌CBCT圖像進(jìn)行遷移,生成與pCT圖像HU值相似的sCT圖像,以實(shí)現(xiàn)CBCT圖像的修正。通過(guò)對(duì)9例測(cè)試集生成的sCT圖像HU值進(jìn)行評(píng)估,結(jié)果顯示通過(guò)本方法遷移合成的sCT圖像與pCT圖像偏差較小。相比于上述CBCT圖像修正的相關(guān)工作,本方法所遷移的sCT圖像的MAE相比線性擬合方法更低(99 HUvs119 HU)[14],雖在整個(gè)體表輪廓內(nèi)的MAE略高于Barateaua等[15]方法(99 HUvs89 HU),但在軟組織區(qū)域的修正效果更好(48 HUvs69 HU)。圖3區(qū)域2可見(jiàn)本文算法遷移誤差主要集中在峰值附近區(qū)域,這可能是由于訓(xùn)練數(shù)據(jù)較少,生成器在上采樣過(guò)程中丟失局部特征等原因造成。由于MAE是逐個(gè)像素進(jìn)行比較,該區(qū)域在整個(gè)圖像所占份額少,絕大部分為軟組織區(qū)域,因此該區(qū)域誤差對(duì)實(shí)際劑量計(jì)算的影響較小。除此之外,本算法遷移生成圖像在平坦區(qū)域處的平滑度與pCT圖像相當(dāng)(如圖3Line b中區(qū)域1),與Li等[16]基于U-net模型合成CT圖像的結(jié)果一致。本課題組以往研究結(jié)果表明,當(dāng)CT值差異為68 HU時(shí),靶區(qū)劑量學(xué)差異為1.5%,脊髓差異為2%左右[17],因此使用本研究算法遷移生成的sCT圖像可應(yīng)用于劑量計(jì)算。

圖3 CBCT、pCT及sCT圖像的HU值分布比較Fig.3 Comparison of HU profile among CBCT,pCT and sCT images

雖然基于本研究的算法可以較好地修正CBCT圖像HU值,但該算法采用的是二維模型,忽略了圖像層間信息,如果采用三維模型預(yù)期能取得更好的效果[18-19]。其次,由于預(yù)處理配準(zhǔn)時(shí)采用的是剛性配準(zhǔn)算法,重采樣CT圖像與CBCT圖像之間存在一定的不確定性偏差,改進(jìn)配準(zhǔn)算法提高配準(zhǔn)精度能使sCT更加精確[20]。在未來(lái)的研究中本課題組將會(huì)優(yōu)化配準(zhǔn)方法及算法模型,并進(jìn)行基于遷移sCT的劑量學(xué)研究,進(jìn)一步對(duì)該算法進(jìn)行驗(yàn)證。

綜上所述,基于CycleGAN模型的深度學(xué)習(xí)算法能有效修正CBCT圖像HU值,遷移生成的sCT圖像的HU值及平滑度與CT圖像相似,可應(yīng)用于劑量計(jì)算,為CBCT在精確放療中的應(yīng)用提供幫助。

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