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云斑白條天牛腸道木質(zhì)素降解菌的分離與鑒定

2021-07-04 11:11:10段慧娟方小英朱林慧李貝娜彭思穎楊振德
廣西植保 2021年2期
關(guān)鍵詞:苯胺藍(lán)木酚天牛

段慧娟,方小英,朱林慧,李貝娜,彭思穎,楊振德

(廣西大學(xué)林學(xué)院 南寧市 530004)

木質(zhì)素是具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的高分子化合物,是由苯丙烷單元結(jié)構(gòu)通過醚鍵和碳碳鍵組成的具有三維空間結(jié)構(gòu)的無定型芳香類化合物,與纖維素和半纖維素構(gòu)成植物骨架的主要成分[1]。其不易降解,但含量豐富,占陸生植物干重15%~40%,是含量僅次于纖維素的生物多聚體[2-3]。木質(zhì)素作為農(nóng)作物秸稈以及城市生活垃圾中常見的難降解物質(zhì)[4],將其焚燒既產(chǎn)生資源浪費,又造成環(huán)境破壞。同時,木質(zhì)素作為造紙業(yè)的副產(chǎn)物,由于難降解,如果直接排放環(huán)境中,會造成水生生態(tài)系統(tǒng)的破壞[5]。由于存在于細(xì)胞壁中的纖維素受到木質(zhì)素的保護,木質(zhì)素是否被有效降解對纖維素降解有著重要作用[3]。因此,開發(fā)高效降解木質(zhì)素的技術(shù)成為木質(zhì)纖維素資源化利用與環(huán)境保護的重要問題。

目前木質(zhì)素降解方法主要為物理法、化學(xué)法和生物法。微生物降解法具有反應(yīng)條件溫和、成本低、環(huán)境友好等特點[6],成為國內(nèi)外研究者關(guān)注的焦點。其原理為降解木質(zhì)素的微生物通過氧化斷裂木質(zhì)素側(cè)鏈Cα-Cβ鏈,徹底降解產(chǎn)物主要是CO2和H2O[7]。目前研究木質(zhì)素降解菌株中主要以真菌、細(xì)菌為主,真菌中白腐菌對木質(zhì)素具有強的降解能力,受到廣泛關(guān)注[6]。然而細(xì)菌具有適應(yīng)性強、來源廣,更易于工業(yè)化生產(chǎn)等優(yōu)點,具有廣闊的發(fā)展前景。細(xì)菌通過產(chǎn)酶對木質(zhì)素進行降解,主要包括3種酶:漆酶、木質(zhì)素過氧化物酶與錳過氧化物酶。每個漆酶蛋白分子含有4個銅原子,是漆酶催化反應(yīng)的活性中心[8]。范晶晶等[9]研究發(fā)現(xiàn)金屬銅離子和錳離子在合適的濃度能刺激產(chǎn)漆酶,酶活性最高可達(dá)263.44 U/L。木質(zhì)素過氧化物酶主要來源于真菌,在細(xì)菌中如鏈霉菌(Streptomycescinnamomensis)能夠分泌過氧化物酶降解木質(zhì)素,但活性較低。Jing等[10]通過優(yōu)化培養(yǎng)基組成使過氧化物酶活性得到大幅度提升。

昆蟲對地球上所有可利用的物質(zhì)資源幾乎都可以分解,如天牛幼蟲蛀食木材,其腸道微生物處于常溫中性條件下可對木材消化降解[11]。本研究以云斑白條天牛〔Batocera lineaolata(Chaevroat)〕為研究對象,利用愈創(chuàng)木酚選擇性培養(yǎng)基和苯胺藍(lán)平板法,初步篩選其腸道內(nèi)具有木質(zhì)素降解功能的菌株,以期為木質(zhì)素降解菌株資源的開發(fā)與應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 樣品采集和培養(yǎng)基

樣品為云斑白條天牛4齡幼蟲,于2018年5月上旬至6月上旬采集于廣西國有高峰林場六里分場(108°20′E,22°58′N)的桉樹林。

愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基[12]:愈創(chuàng)木酚1.0 g,酒石酸銨0.1 g,蛋白胨2.6 g,MnSO4·7H2O 0.5 g,KH2PO41 g,Na2HPO40.2g,瓊脂15 g,蒸餾水定容至1000mL,調(diào)節(jié)pH至7.0~7.2,121℃高壓滅菌20 min。

苯胺藍(lán)培養(yǎng)基[12]:苯胺藍(lán)0.1 g溶于10 mL蒸餾水,酵母膏10 g,葡萄糖20 g,瓊脂15 g,蒸餾水定容至990 mL,分開121℃高壓滅菌20 min。

1.2 木質(zhì)素降解菌的初篩

選取3頭云斑白條天牛4齡幼蟲,用酒精沖洗并浸泡3 min進行表面消毒。用無菌水沖洗3次。在垂直超凈工作臺上,用解剖針、解剖剪、鑷子解剖取出腸道,將腸道上的脂肪等物質(zhì)用無菌水沖走后放入玻璃勻漿器,加入1 mL無菌水進行研磨,制成腸道勻漿液。用高速冷凍離心機以5 000 r/min離心5 min。

取稀釋103、104、105倍的勻漿稀釋液各100μL均勻涂布在愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基上,每個濃度3個重復(fù),在30℃的恒溫培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)2 d。,待菌落長出后,用接種環(huán)從每種稀釋梯度的培養(yǎng)基上挑取大小、形態(tài)、顏色有差異的單菌落,在新的愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基上劃線分離4~5次,直至得到單一純菌落。選擇培養(yǎng)基以愈創(chuàng)木酚為唯一碳源,因此,可在該選擇培養(yǎng)基上生長的菌落即可初步確定為具有降解木質(zhì)素能力的細(xì)菌。

1.3 木質(zhì)素降解菌的復(fù)篩

將獲得的各個純培養(yǎng)菌株用接種環(huán)點種在苯胺藍(lán)培養(yǎng)基上,在恒溫培養(yǎng)箱30℃倒置培養(yǎng)2 d后,出現(xiàn)透明水解圈,用游標(biāo)卡尺測量水解圈直徑(D)和菌落直徑(d),進行3次重復(fù)取平均值,計算水解圈和菌落直徑比值(D/d),選擇D/d值大的菌株即為降解木質(zhì)素能力強的菌株。

1.4 木質(zhì)素降解菌的鑒定

1.4.1 菌株形態(tài)觀察根據(jù)《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊》[13]和《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》[14]對分離所得的菌株進行菌體形態(tài)觀察、革蘭氏染色反應(yīng)測定。

1.4.2 菌株16SrDNA基因測序

將在30℃的恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)2 d的菌株接種到液體愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基中,30℃振蕩培養(yǎng)48 h后,取細(xì)菌懸液2 mL,11 500 r離心1 min,倒去上清液。采用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(天根DP302),按其說明書提取供試菌株的總DNA,用Nanodrop 2 000可見分光光度計測定所提取DNA的OD260/OD280比值,確定DNA純度和濃度,在DYY-8C電泳儀上用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測總DNA是否有降解現(xiàn)象。采用王蕊蕊等[15]的方法,以提取的總DNA為模板,利用細(xì)菌16SrDNA的通用引物:正向引物27F(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’)和 反向 引物1 492 R(5’-GGTTACCTTGT-TACGACTT-3’)進行PCR擴增,PCR反應(yīng)體系為:12.5μL Eay Taq PCR SuperMix(+dye),1.0μL 27F(10 mmol/L)和1.0μL 1 492 R(10 mmol/L),1.0μL DNA模 板(50 ng/μL)12.5μL ddH2O。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸1 min,進行35個循環(huán);72℃10 min終末延伸;4℃條件下保存。反應(yīng)完成后,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,合格后委托北京睿博興科生物技術(shù)有限公司進行測序。在NCBI平臺(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上將測序的結(jié)果進行Nucleotide BLAST序列比對,并用MEGA 7.0建立系統(tǒng)發(fā)育樹,確定菌屬分類地位。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌株形態(tài)

在愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基上共篩選出37株細(xì)菌菌株,其中,B01和B12菌株在苯胺藍(lán)平板上水解圈直徑(D)分別為0.95 cm和0.80 cm,菌株菌落直徑分別為0.60 cm和0.50 cm,D/d值分別為1.60和1.58,比值最大(圖1)。其中菌株B01在愈創(chuàng)木酚培養(yǎng)基上為白色,表面光滑,邊緣規(guī)則,單菌落呈現(xiàn)圓形,中間顏色較邊緣深,不透明。革蘭氏染色呈現(xiàn)紅色,桿狀,可以判定菌株B01為革蘭氏陰性菌。菌株B12在培養(yǎng)基上為白色,表面光滑,邊緣規(guī)則,單菌落呈現(xiàn)圓形,中間凸起,不透明,革蘭氏染色呈現(xiàn)紅色,球狀,判定為革蘭氏陰性菌。

圖1 菌株B01和B12在愈創(chuàng)木酚選擇培養(yǎng)基上的菌落特征及在苯胺藍(lán)培養(yǎng)基上的水解圈

2.2 菌株的16S rDNA序列分析

提取菌株B01和菌株B12的DNA之后,通過細(xì)菌通用引物27F-1 492 R進行PCR擴增,用1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,所得基因片段如圖2所示,條帶明亮清晰,均在1 500 bp左右。

圖2 菌株B01和B12的PCR擴增產(chǎn)物

據(jù)測序結(jié)果在NCBI上進行分析比對,選取BLAST中相似度較高的細(xì)菌序列,并下載相關(guān)序列后,利用MEGA7.0軟件的NeighborJoining法構(gòu)建細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育樹。如圖3所示,菌株B01和Pseudo?monasbaetica(NR 116 899.1)在同一分支上,因此,將該菌初步判斷為假單胞菌屬;菌株B02和Kosako?nia arachidis(NR 116 403.1)在同一分支上,因此,將該菌初步判斷為考氏科薩克氏菌屬。

圖3 菌株B01和B12的16S rDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹

3 討論

細(xì)菌具有良好的環(huán)境適應(yīng)性與豐富的生物多樣性,在強酸、強堿、高溫等環(huán)境下可以生存,在降解木質(zhì)素上具有很好的發(fā)展?jié)摿16]。近些年來,細(xì)菌降解木質(zhì)素的研究受到越來越多的關(guān)注。降解木質(zhì)素的細(xì)菌主要有厭氧梭菌屬(Clostridium)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、雙芽孢桿菌屬(Amphiba?cillus)、微球菌屬(Micrococcus)等[17]。木質(zhì)素降解酶系非常復(fù)雜,其完整的代謝途徑與降解機理尚未明確[16],代謝途徑研究較為明確的主要是以鞘氨醇單胞菌SYK-6為研究對象構(gòu)建的代謝途徑[17]。細(xì)菌降解木質(zhì)素獲得大量有用代謝產(chǎn)物,如生物乙醇、生物柴油、沼氣、氫氣等新能源物質(zhì)[18]。因此,研究新的木質(zhì)素降解菌資源,對環(huán)境保護、資源利用等具有重要意義。

本研究從云斑天牛腸道內(nèi)分離獲得具有降解木質(zhì)素能力的細(xì)菌菌株2個,分別屬于假單胞菌屬和考氏科薩克氏菌屬。假單胞菌屬屬于變形菌門(Proteobacteria)假單胞菌科(Pseudomonadaceae)的細(xì)菌,考氏科薩克氏菌屬屬于變形菌門(Proteobacteria)腸桿菌科(Enterobacteriaceae)的細(xì)菌。假單胞菌屬是木質(zhì)素最有效降解者[19],為油污土壤微生物中的優(yōu)勢菌屬[20],作為非絲狀細(xì)菌可降解木質(zhì)纖維素低分子量部分以及木質(zhì)纖維素的降級產(chǎn)物[21]。有研究發(fā)現(xiàn),假單胞菌屬生長溫度范圍較廣,在4℃~43℃均可生長,其多數(shù)最適生長溫度為30℃,在pH值為7.0~8.5之間生長,生長范圍較小[22]。假單胞菌屬與其他細(xì)菌組成復(fù)合菌群可進一步提高木質(zhì)素降解速率[23],Ca2+、Mn2+和Fe3+對熒光假單胞菌GcM5--1A胞外木質(zhì)素過氧化物酶活力有較強的促進作用[24]。

目前關(guān)于考氏科薩克氏菌屬木質(zhì)素降解研究較少,未建華[25]從黃翅大白蟻(Macrotermesbarneyi)腸道固氮微生物中分離得到Kosakonia屬,其大多為固氮菌[26]。李鋒[27]以堿木質(zhì)素為唯一碳源,從白蟻(Termite)腸道中分離出Kosakonia屬。木質(zhì)素降解酶的合成與活性的強弱受培養(yǎng)基環(huán)境的pH影響較大[28]。傅慧靜等[28]發(fā)現(xiàn)松墨天牛(Monochamusalter?natus)腸道中的黏質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)處于偏酸性環(huán)境中過氧化物酶活性較強,陳建軍等[29]研究發(fā)現(xiàn)黃孢原毛平革菌(Phanerochaetechrys?osporium)的漆酶在pH=4時活性較大,可見酸性條件對酶的活性也有較大影響。

本研究從云斑天牛腸道細(xì)菌中分離出考氏科薩克氏菌屬,豐富了木質(zhì)素降解菌株資源,為云斑天牛腸道微生物進一步開發(fā)利用提供了理論基礎(chǔ)。下一步將對假單胞菌屬和考氏科薩克氏菌屬降解木質(zhì)素的微觀過程、降解機理以及菌株的產(chǎn)木質(zhì)素降解酶的工業(yè)化生產(chǎn)條件等方面開展深入研究。

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