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精神分裂癥患者的差異代謝物篩選方法研究及應(yīng)用*

2021-07-07 09:37菲,3△
中國衛(wèi)生統(tǒng)計 2021年3期
關(guān)鍵詞:模式識別代謝物組學(xué)

劉 娟 劉 壯 王 菲,3△

【提 要】 目的 應(yīng)用單變量分析聯(lián)合正交偏最小二乘判別分析(orthogonal signal correction partial least squares discrimination analysis,OPLS-DA)探索精神分裂癥患者與健康對照者的代謝譜差異。方法 收集118例精神分裂癥患者與123例健康對照者的血漿并進行非靶向代謝組學(xué)檢測,運用非參數(shù)檢驗聯(lián)合OPLS-DA模式識別方法篩選差異代謝物,然后進行通路分析探索紊亂的代謝通路。結(jié)果 基于非靶向代謝組學(xué)技術(shù)檢測到669個代謝物,聯(lián)合非參數(shù)檢驗(Wilcox-Mann-Whitney test)與OPLS-DA方法篩選出52個差異代謝物(P<0.05,VIP>1.5),主要涉及糖代謝、氨基酸代謝和脂代謝。通路分析結(jié)果顯示,丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸代謝通路與三羧酸(tricarboxylic acid,TCA)循環(huán)失調(diào)相關(guān)(FDR<0.05)。結(jié)論 應(yīng)用單變量分析聯(lián)合多元模式識別技術(shù)進行精神分裂癥的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析,能夠識別與疾病分子機制相關(guān)的差異代謝物,有助于了解疾病的本質(zhì)并為精神分裂癥的診斷、干預(yù)及治療提供依據(jù)。

精神分裂癥(schizophrenia,SZ)是一種嚴(yán)重的精神障礙,全球患病率約1%,通常伴隨認(rèn)知、情感體驗、社交能力的損害,多發(fā)病于青壯年,病情反復(fù),給患者、家庭和社會造成了沉重的經(jīng)濟負(fù)擔(dān)[1-2]。精神分裂癥的病因復(fù)雜,目前主要的假說有神經(jīng)遞質(zhì)紊亂假說和神經(jīng)發(fā)育障礙假說,但其確切的分子機制迄今不明[3]。神經(jīng)細(xì)胞代謝的紊亂可能導(dǎo)致神經(jīng)發(fā)育和腦結(jié)構(gòu)的異常,即使是微小的代謝率改變也會影響中樞神經(jīng)遞質(zhì)如多巴胺、乙酰膽堿、Y- 氨基丁酸(Y-aminobutyric acid,GABA)的釋放和合成[4-5]。研究發(fā)現(xiàn),精神分裂癥患者前額葉皮質(zhì)葡萄糖代謝率降低,這可能與其受損的認(rèn)知功能密切相關(guān)[6]。越來越多的證據(jù)提示,精神分裂癥的發(fā)病不僅僅是大腦結(jié)構(gòu)功能的改變,更可能是一種全身系統(tǒng)性疾病,因此從系統(tǒng)水平描述機體整體改變對理解復(fù)雜疾病的病理生理變化尤為重要[7-8],同時也為精神障礙的診斷、預(yù)防和治療提供了新的思路。

近年來,隨著代謝組學(xué)逐漸應(yīng)用于精神疾病的研究,并發(fā)現(xiàn)精神分裂癥與廣泛的代謝紊亂密切相關(guān),如能量代謝相關(guān)代謝通路、抗氧化系統(tǒng)相關(guān)代謝通路、神經(jīng)遞質(zhì)代謝、氨基酸(如谷氨酸,色氨酸,苯丙氨酸,精氨酸,組氨酸,?;撬幔彼?代謝、脂肪酸代謝、磷脂代謝[9-12]等。

精神疾病的代謝組學(xué)分析產(chǎn)生信息含量豐富的高維小樣本數(shù)據(jù),傳統(tǒng)的單變量分析方法無法從海量的代謝譜信息中發(fā)現(xiàn)代表組間差異的穩(wěn)定標(biāo)志物,這是目前代謝組學(xué)發(fā)展過程中所面臨的一個重要挑戰(zhàn)[13-15]。正交偏最小二乘判別分析(orthogonal signal correction partial least squares discrimination analysis,OPLS-DA)是一種新型的多元統(tǒng)計數(shù)據(jù)分析方法,其最大特點是可以去除自變量中與分類變量無關(guān)的數(shù)據(jù)變異,使分類信息主要集中在一個主成分中,模型變得簡單和易于解釋,判別效果更加明顯。利用OPLS-DA方法來分析代謝組學(xué)數(shù)據(jù),得到對分類有較大貢獻的差異性物質(zhì),從而有助于挖掘疾病代謝模式變化的關(guān)鍵信息[16-18]。

本研究基于超高效液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(UHPLC-MS),獲取精神分裂癥患者與健康對照組血漿樣本的非靶向代謝譜信息,聯(lián)合單變量統(tǒng)計分析與多元模式識別方法鑒別患者組的差異代謝物,進而發(fā)現(xiàn)其紊亂的代謝通路,探索精神分裂癥代謝譜模式的變化,從系統(tǒng)水平對精神分裂癥患者的分子機制進行研究,以期為臨床診斷、干預(yù)和治療提供參考。

資料與方法

1.研究對象

患者組由中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院門診收集的118例精神分裂癥患者組成。納入標(biāo)準(zhǔn):18歲以上患者符合精神障礙診斷與統(tǒng)計手冊(第四版)(diagnostic and statistical manual of mental disorders-IV version,DSM-IV)軸I精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn);18歲以下患者符合精神障礙調(diào)查篩查表及半定式診斷檢查(the schedule for affective disorders schizophrenia for school-age children-present and lifetime version,K-SADS-PL)精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn);年齡11~55歲。健康對照組通過社會招募納入與患者組性別、年齡、身體質(zhì)量指數(shù)(body mass index,BMI)相匹配的健康人,共123例。納入標(biāo)準(zhǔn):無精神疾病障礙的診斷史及家族史;11~55歲。所有診斷會談均在中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院精神醫(yī)學(xué)科完成,由2名經(jīng)培訓(xùn)的精神科專業(yè)人員獨立評估,使用簡明精神病評估量表(brief psychiatric rating scale,BPRS)評估精神癥狀的嚴(yán)重程度。

全部受試排除標(biāo)準(zhǔn):(1)神經(jīng)系統(tǒng)或其他精神疾病障礙診斷;(2)重大軀體疾病史;(3)藥物、酒精濫用或依賴史;(4)合并內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病如糖尿病、高血壓、高脂血癥;(5)懷孕或哺乳期婦女。

本研究獲得中國醫(yī)科大學(xué)倫理委員會批準(zhǔn),且所有受試者在入組前被詳細(xì)告知研究目的、方法和風(fēng)險,均自愿參加并簽署知情同意書。

2.非靶向代謝組學(xué)分析

采集所有參與者的外周血樣本,取肘靜脈血5ml于EDTA抗凝管中,血液樣本于2000g離心10min,分離出血漿樣品置于-80℃冰箱保存。在代謝組學(xué)分析前先進行樣品預(yù)處理,將血漿樣本取出,于4℃解凍,加入代謝組提取液以沉淀蛋白,渦旋,離心,復(fù)溶后干燥保存,直至檢測。血漿代謝組學(xué)信息在Ultimate 3000超高效液相色譜與Q Exactive Orbitrap質(zhì)譜儀(UHPLC-HRMS)(Thermo Scientific,San Jose,USA)串聯(lián)儀器上采集。實驗測定過程中加入質(zhì)量控制(QC)樣本的測定,每30個樣本加入一個QC樣本,以確定樣品數(shù)據(jù)的可靠性和可重復(fù)性。數(shù)據(jù)預(yù)處理通過Compund Discoverer version 2.1和TraceFinder software version 4.1(Thermo Scientific,USA)軟件完成,包括峰對齊、峰檢測參數(shù)設(shè)定、峰面積提取和數(shù)據(jù)歸一化。統(tǒng)計分析通過SPSS 25.0和SIMCA-P 14.1完成。

3.統(tǒng)計分析與生信分析

采用單變量與多元模式識別技術(shù)結(jié)合的方法篩選差異代謝物,其中單變量分析根據(jù)數(shù)據(jù)的正態(tài)分布情況選擇獨立樣本t檢驗或者非參數(shù)檢驗(Wilcox-Mann-Whitney test),采用FDR方法進行校正,P<0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計學(xué)意義;多元模式識別技術(shù)采用正交偏最小二乘判別分析區(qū)分組間代謝譜差異,通過

OPLS-DA建模獲得變量重要性評分(variable importance in projection,VIP)評價模型中變量對類別區(qū)分的貢獻程度。以P<0.05且VIP>1.5的變量作為差異代謝物,并通過MetaboAnalyst 4.0(http://www.metaboanalyst.ca/)在線平臺對差異代謝物進行通路分析,通路分析FDR<0.05被識別為顯著改變的代謝通路。

結(jié) 果

1.所有研究對象的基本特征

兩組受試對象在性別、年齡、身體質(zhì)量指數(shù)方面差異無統(tǒng)計學(xué)意義(p>0.05),在簡明精神病評定量表得分的差異有統(tǒng)計學(xué)意義。見表1。

表1 受試對象的人口學(xué)資料

2.篩選差異代謝物

經(jīng)過UHPLC-MS分析,共獲得669個代謝物,其中正離子模式(ESI+)下檢測到473個,負(fù)離子模式(ESI-)下檢測到196個。在QC和內(nèi)標(biāo)物校準(zhǔn)代謝物的響應(yīng)后,90.8%的代謝物在正模式下相對標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD<20%,95.4%的代謝物在負(fù)離子模式下的RSD<20%,表明本次非靶向代謝組學(xué)分析表現(xiàn)出極好的穩(wěn)定性與可重復(fù)性。

如圖1所示,數(shù)據(jù)不服從正態(tài)分布,故聯(lián)合非參數(shù)檢驗(Wilcox-Mann-Whitney test)與OPLS-DA方法進行差異代謝物的篩選,發(fā)現(xiàn)52個代謝物(P<0.05,VIP>1.5)在患者組中改變,包括糖代謝的中間代謝產(chǎn)物的水平降低,如葡萄糖/果糖,甘油酸,檸檬酸/異檸檬酸,延胡索酸和蘋果酸;氨基酸代謝的中間代謝產(chǎn)物的水平降低,如?;谋奖彼?,亮氨酸,異亮氨酸,色氨酸,天冬酰胺;不飽和脂肪酸代謝相關(guān)的代謝物的升高,如棕櫚油酸和油酸;甾體代謝物水平的降低以及磷脂代謝物的改變。

圖1 精神分裂癥患者組與健康對照組之間差異代謝物的類別

3.生信分析

如圖2所示,進一步的通路分析結(jié)果顯示,丙氨酸、天冬氨酸、谷氨酸代謝通路與三羧酸(tricarboxylic acid,TCA)循環(huán)失調(diào)相關(guān)(FDR<0.05)。

圖2 通路分析結(jié)果

討 論

本研究對精神分裂癥患者與健康對照者進行血漿代謝譜信息采集,采用單變量分析聯(lián)合多元模式識別方法進行差異代謝物的篩選,發(fā)現(xiàn)患者組存在廣泛的糖代謝和氨基酸代謝相關(guān)代謝物水平的降低,不飽和脂肪酸水平的升高,甾體代謝物的降低,以及膜磷脂代謝的紊亂。患者組上述改變的代謝譜是圍繞以三羧酸循環(huán)為核心的能量代謝紊亂展開的。

在本研究中,患者組TCA循環(huán)中的檸檬酸/異檸檬酸、琥珀酸、延胡索酸和蘋果酸明顯低于健康對照組(圖3),表明精神分裂癥患者存在TCA循環(huán)代謝率的降低。先前的研究發(fā)現(xiàn)支持這一結(jié)果,Liu和Cai等人發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者存在延胡索酸和檸檬酸水平的改變[19-20];Bubber等人針對首次發(fā)作精神分裂癥患者的尸檢研究發(fā)現(xiàn)其大腦中TCA循環(huán)的一系列酶水平顯著改變[21]。綜上所述,TCA循環(huán)的改變可能對機體與大腦代謝產(chǎn)生深刻的影響并導(dǎo)致精神分裂癥的發(fā)病。

近年來,關(guān)于精神分裂癥的發(fā)病機制,有研究提出線粒體功能與能量代謝障礙假說[22-23]。能量代謝不僅包含糖代謝,還涉及到大部分脂類與氨基酸的合成與氧化分解。根據(jù)本研究結(jié)果,精神分裂癥患者表現(xiàn)出葡萄糖/果糖和氨基酸代謝的代謝物水平降低,這與之前的研究發(fā)現(xiàn)一致[24-25]。葡萄糖是能量的主要來源,先前的多個研究均發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者尸檢腦組織、腦脊液和外周血中糖代謝相關(guān)的代謝物及酶水平等顯著降低,提示糖代謝的降低與精神分裂癥的認(rèn)知功能、語言交流等癥狀密切相關(guān)[26-29]。其中,色氨酸與神經(jīng)遞質(zhì)5-HT的合成與代謝有關(guān),而GABA是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),這些氨基酸的降低表明精神分裂癥存在神經(jīng)遞質(zhì)代謝的紊亂[30]。此前已有研究報道,精神分裂癥患者的脂代謝如磷脂,甾體代謝物等改變[31],提示神經(jīng)細(xì)胞膜及神經(jīng)元活動相關(guān)脂質(zhì)的異常參與精神分裂癥的分子機制。不飽和脂肪酸如棕櫚油酸和油酸的神經(jīng)保護作用已有報道,Yang等人基于代謝組學(xué)的研究發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者提示上調(diào)的脂肪酸分解代謝可能是由于代償下降的糖代謝水平,彌補能量供應(yīng)的不足[25]。結(jié)合以上發(fā)現(xiàn),能量代謝的紊亂可能進一步導(dǎo)致廣泛的糖、脂、氨基酸、神經(jīng)遞質(zhì)代謝的改變,與精神分裂癥的發(fā)病密切相關(guān)。

綜上所述,在精神分裂癥的代謝組學(xué)研究中,基于多元統(tǒng)計模式識別方法對信息量巨大的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進行分析,有利于挖掘與疾病病理生理機制相關(guān)的代謝特征。本研究利用單變量分析聯(lián)合多元模式識別方法篩選差異代謝物,進一步發(fā)現(xiàn)了以TCA循環(huán)為核心的能量代謝障礙在精神分裂癥發(fā)病中的重要作用。未來針對能量代謝相關(guān)分子改變的研究將有助于了解精神分裂癥的本質(zhì),成為研究其發(fā)病機制的突破口。

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