耿夢雅,王李卓,章 堯,裴文俊,漆夢湘,楊 夢,許家豪,梁洋洋,呂 坤,何春玲,高家林,2,
皖南醫(yī)學(xué)院1弋磯山醫(yī)院內(nèi)分泌科,2弋磯山醫(yī)院內(nèi)分泌糖尿病研究所,3臨床醫(yī)學(xué)院,4安徽省活性生物大分子研究安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,5基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生化教研室,6中心實(shí)驗(yàn)室,7重大疾病非編碼RNA轉(zhuǎn)化研究安徽普通高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,安徽 蕪湖241002
肝臟具有高水平的新陳代謝應(yīng)激誘導(dǎo)的自噬[1],肝臟自噬通過促進(jìn)大分子和細(xì)胞器的降解為饑餓的細(xì)胞提供氨基酸、葡萄糖和游離脂肪酸[2],用于能量生產(chǎn)和合成新的大分子,并控制線粒體等細(xì)胞器的質(zhì)量和數(shù)量,從而在調(diào)節(jié)肝臟生理中發(fā)揮著動(dòng)態(tài)平衡的作用[3]。已有研究發(fā)現(xiàn),在患有肝相關(guān)疾病的人的肝細(xì)胞中自噬被調(diào)節(jié),自噬參與了各種肝臟疾病的發(fā)生發(fā)展,包括肝炎、脂肪肝、肝硬化、肝細(xì)胞癌[1,4]等。細(xì)胞自噬分為巨自噬、微自噬、和分子伴侶介導(dǎo)的自噬[5],其中巨自噬在本文中稱為自噬,其依賴于自噬小體的產(chǎn)生,通過自噬小體隔離細(xì)胞質(zhì)物質(zhì),然后與溶酶體融合形成自噬溶酶體,并將其內(nèi)容物進(jìn)行降解加工[6],所以巨自噬中的降解和再循環(huán)過程嚴(yán)格取決于溶酶體的功能[7,8]。
肝臟含有豐富的溶酶體,溶酶體是膜結(jié)合的細(xì)胞器,溶酶體膜包含多種蛋白質(zhì),其中溶酶體膜蛋白是溶酶體的一個(gè)重要功能單位,SID1跨膜家族成員2(SID1 transmembrane family member 2,Sidt2)是一種溶酶體膜蛋白,其主要在肝臟和腎臟組織中高表達(dá)[9]。研究表明當(dāng)溶酶體膜蛋白異常時(shí),溶酶體內(nèi)環(huán)境發(fā)生改變,溶酶體不能發(fā)揮正常的生物學(xué)功能,進(jìn)而可能影響自噬[10-11]。自噬異常時(shí)受損的細(xì)胞器和蛋白質(zhì)降解異常,從而導(dǎo)致肝細(xì)胞損傷和細(xì)胞死亡[12]。同時(shí),自噬也可以作為促進(jìn)肝臟疾病發(fā)生和發(fā)展的替代途徑[13]。目前研究表明當(dāng)Sidt2缺失后肝臟出現(xiàn)自噬紊亂[11],但其具體機(jī)制并未得到探究,基于此,我們希望通過對溶酶體膜蛋白Sidt2的研究來進(jìn)一步探究肝臟自噬的改變,希望為肝臟相關(guān)疾病的發(fā)生發(fā)展提供潛在靶標(biāo)。
HL7702人肝臟細(xì)胞購自購自中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會細(xì)胞庫,用10%FBS(Excell Bio)1640培養(yǎng)。細(xì)胞培養(yǎng)箱CO2濃度保持在5%,溫度保持在37 ℃。
購買Lenticrispr-v2(AddgenePlasmid49535)質(zhì)粒,利用sgRNA在線設(shè)計(jì)工具(http://crispr.mit.edu/)設(shè)計(jì)靶向Sidt2的sgRNA,序列如下(F:5'-CACCGCAGGT GCCCCTAATCCTGCG-3',R:5'-AAACCGCAGGATT AGGGGCACCTGC-3'),通過生物公司(SangonBiotech)進(jìn)行合成,使用CRISPR/Cas9 lentivirus system,將Lenticrispr-v2 質(zhì)粒線性化,與退火的sgRNA 雙鏈進(jìn)行連接,構(gòu)建Lenticrispr-v2-Sidt2重組質(zhì)粒。使用Vigofect(VigorousBiotechnology,China)轉(zhuǎn)染試劑,分別轉(zhuǎn)染Lenticrispr-v2質(zhì)粒和Lenticrispr-v2-Sidt2重組質(zhì)粒構(gòu)建慢病毒,將得到的慢病毒轉(zhuǎn)染HL7702細(xì)胞,48 h后使用嘌林霉素篩選72 h,生存下來的細(xì)胞即為轉(zhuǎn)染成功的Sidt2+/+組和Sidt2-/-組。
具體方法如前所述[14],本研究中使用一抗包括兔抗LC3B(1∶1000;Sigma-Aldrich),鼠抗P62(1∶1000;abcam),鼠抗β-actin(1∶1000;Sigma-Aldrich),兔抗SIDT2(1∶1000;abgent),鼠抗LAMP1(1∶1000;Santa),兔抗Atg5(1∶1000;Cell signaling technology),兔抗Atg7(1∶1000;Cell signaling technology),兔抗Atg12(1∶1000;Cell signaling technology)。
將細(xì)胞接種在玻底培養(yǎng)皿上,使用多聚甲醛固定,封閉后使用一抗孵育過夜,二抗黑暗環(huán)境下孵育90 min,使用DAPI(1 μg/mL)染核后在激光共聚焦顯微鏡(Olympus,Japan)下進(jìn)行拍攝。LC3B與P62免疫熒光共定位實(shí)驗(yàn),采用含有LC3B(1∶200;Sigma-Aldrich)及P62(1∶200;abcam)的抗體孵育細(xì)胞過夜,抗鼠二抗Cy3-conjugated Affinipure Goat Anti-Mouse IgG(H+L)(Proteintech;1∶200)與抗兔二抗CoraLite488-conjugated Affinipure Goat Anti-Rabbit IgG(H+L)(Proteintech;1∶200)混合孵育的方式。LC3B 與LAMP1 免疫熒光共定位實(shí)驗(yàn),采用含有LC3B(1∶200;Sigma-Aldrich)及LAMP1(1∶200;Santa)的抗體孵育細(xì)胞過夜,熒光二抗采取上述方法混合孵育。LysoTracker(Beyotime)同樣將細(xì)胞接種在玻底培養(yǎng)皿上,在生長到合適密度之后,加入含有LysoTracker終濃度為75 nmol/L的細(xì)胞培液,刺激45 min后在激光共聚焦顯微鏡(Olympus,Japan)下拍攝。
結(jié)果表示為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差,使用配對t檢驗(yàn)進(jìn)行兩組之間的統(tǒng)計(jì)學(xué)比較,使Graphpad Prism 8.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,本研究中的每組實(shí)驗(yàn)至少獨(dú)立重復(fù)3次。
對HL7702細(xì)胞使用Crispr-Cas9技術(shù)進(jìn)行Sidt2基因的敲除,挑取單克隆細(xì)胞后進(jìn)行測序,測序結(jié)果顯示模型構(gòu)建成功,使用Western blot技術(shù)檢測Sidt2蛋白水平表達(dá)(圖1A),結(jié)果顯示Sidt2-/-組較Sidt2+/+組蛋白水平明顯降低(P<0.05,圖1B)。
圖1 HL7702細(xì)胞Sidt2剔除后蛋白水平驗(yàn)證Fig.1 Protein level verification after Sidt2 deletion in HL7702 cells.A:Western blotting for detecting Sidt2 protein expression before and after Sidt2 deletion;B:Quantitative analysis of the results.*P<0.05.
對HL7702細(xì)胞模型進(jìn)行基礎(chǔ)自噬水平的相關(guān)檢測(圖2A),發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-細(xì)胞較Sidt2+/+細(xì)胞,LC3-II/I和P62表達(dá)明顯增加(P<0.01,圖2B)。
圖2 HL7702細(xì)胞Sidt2剔除后自噬關(guān)鍵蛋白表達(dá)Fig.2 Expression of key autophagy proteins after Sidt2 knockout in HL7702 cells.A:Western blotting for detecting the expression of the key autophagy proteins before and after Sidt2 deletion;B:Quantitative analysis of the results.**P<0.01.
對Sidt2缺失前后自噬相關(guān)蛋白進(jìn)行檢測(圖3A),結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組自噬相關(guān)蛋白Atg5(P<0.001)、Atg7(P<0.01)、Atg12(P<0.05)表達(dá)均明顯降低(圖3B)。
圖3 HL7702細(xì)胞Sidt2剔除后自噬相關(guān)蛋白表達(dá)Fig.3 Expression of autophagy-related proteins after Sidt2 deletion in HL7702 cells.A:Western blotting for detecting the expression of autophagy-related proteins before and after Sidt2 is eliminated;B:Quantitative analysis of the results.*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001.
對Sidt2缺失后自噬關(guān)鍵蛋白表達(dá)及定位進(jìn)行了進(jìn)一步的檢測,可以清楚的發(fā)現(xiàn)LC3B和P62在胞質(zhì)中表達(dá)(圖4A、C),同時(shí)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組LC3B及P62熒光點(diǎn)數(shù)均增加(P<0.001,圖4B、D)。
圖4 免疫熒光檢測HL7702細(xì)胞自噬關(guān)鍵蛋白表達(dá)Fig.4 Immunofluorescence detection of the expression of key autophagy proteins in HL7702 cells (10 μm).A,B:Immunofluorescence assay of LC3B in Sidt2+/+and Sidt2-/-HL7702 cells and quantitative analysis.C,D:Immunofluorescence assay of P62 in Sidt2+/+and Sidt2-/-HL7702 cells and quantitative analysis.***P<0.001.
對Sidt2+/+組及Sidt2-/-組自噬小體和P62貨物蛋白進(jìn)行免疫熒光共定位檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組相比LC3B及P62的皮爾森相關(guān)系數(shù)降低,顯示共定位減少(圖5)。
圖5 Sidt2缺失后LC3B與P62免疫熒光共定位Fig.5 Immunofluorescence co-localization of LC3B and P62 after Sidt2 deletion in HL7702 cells(10 μm).
對Sidt2+/+組及Sidt2-/-組自噬小體及溶酶體標(biāo)記蛋白進(jìn)行免疫熒光共定位檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組相比,LC3B與LAMP1的皮爾森相關(guān)系數(shù)降低(圖6),自噬小體與溶酶體融合減少。
圖6 Sidt2 缺失后LC3B 與LAMP1 免疫熒光共定位Fig.6 Immunofluorescence co-localization of LC3B and LAMP1 after Sidt2 deletion in HL7702 cells(10 μm).
使用溶酶體示蹤劑LysoTracker對Sidt2基因缺失前后酸性溶酶體進(jìn)行標(biāo)記(圖7A),結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2-/-組較Sidt2+/+組相比酸性溶酶體數(shù)量減少(P<0.05,圖7B)。
圖7 Sidt2缺失后酸性溶酶體數(shù)量的改變Fig.7 LysoTracker for detecting the number of functional lysosomes before and after Sidt2 knockout in HL7702 cells and quantitative analysis of the results(10 μm).*P<0.05.
肝病已經(jīng)成為全世界疾病和死亡的主要原因之一[15]。已有研究表明,肝炎、脂肪變、肝細(xì)胞癌等都與自噬的發(fā)生發(fā)展有關(guān)[16],自噬通過消除肝相關(guān)疾病患者體內(nèi)引入的受損細(xì)胞器和蛋白質(zhì),保護(hù)肝細(xì)胞免受損傷和細(xì)胞死亡[2]。
巨自噬在本文中稱為自噬,其過程依賴自噬小體與溶酶體融合形成自噬溶酶體,并將其內(nèi)容物進(jìn)行降解加工的過程[6]。溶酶體的功能對自噬的降解和再循環(huán)過程起著決定性的作用[17,18],而溶酶體膜蛋白是溶酶體的一個(gè)重要功能單位[19,20],參與多種生理過程,如溶酶體的酸化和膜融合[21,22],對溶酶體的結(jié)構(gòu)、形態(tài)和功能維持具有重要作用,已有研究表明多種溶酶體膜蛋白參與了自噬的調(diào)節(jié)過程[14,23,24],因此對溶酶體膜蛋白的研究值得引起更多的關(guān)注。在我們研究全身敲除Sidt2的小鼠時(shí),發(fā)現(xiàn)小鼠肝臟出現(xiàn)脂肪變性[10],而最近有證據(jù)表明,自噬溶酶體途徑在肝細(xì)胞脂質(zhì)代謝中起重要作用,肝臟中自噬的降低可能會導(dǎo)致肝臟脂質(zhì)的積累,同時(shí)脂質(zhì)的積累可能會隨著年齡的增長而導(dǎo)致自噬功能的降低[25,26],因此我們使用Crispr-Cas9技術(shù)構(gòu)建了Sidt2敲除的人肝臟HL7702細(xì)胞模型,并對其進(jìn)行自噬相關(guān)研究,希望為肝臟疾病的發(fā)生發(fā)展提供干預(yù)靶標(biāo)。
我們發(fā)現(xiàn)人肝臟細(xì)胞(HL7702)Sidt2缺失后自噬關(guān)鍵蛋白LC3-Ⅱ/Ⅰ和P62出現(xiàn)堆積,同時(shí)免疫熒光亦表明LC3B及P62熒光點(diǎn)數(shù)增加,LC3-Ⅱ常用作為自噬小體標(biāo)記物[27,28],其表達(dá)增加說明自噬小體增加,而自噬小體的增加可能是自噬被激活導(dǎo)致自噬小體產(chǎn)生增多或者自噬受阻導(dǎo)致自噬小體降解障礙所致。P62的堆積可能是其產(chǎn)生增多或者降解減少所致。以上結(jié)果提示我們Sidt2基因的缺失會導(dǎo)致肝臟細(xì)胞自噬發(fā)生紊亂。隨后,我們對自噬相關(guān)蛋白Atg5、Atg7、Atg12進(jìn)行檢測,自噬相關(guān)蛋白參與自噬小泡延伸形成自噬小體的過程[29,30],當(dāng)Sidt2基因缺失后自噬相關(guān)蛋白表達(dá)降低表明自噬小體的形成受阻,進(jìn)一步說明LC3B的增多是自噬小體降解受阻所致。而P62增加的具體原因還需要進(jìn)一步的研究。
自噬過程中P62 通過自噬溶酶體途徑進(jìn)行降解[31,32],所以我們將研究聚焦在了自噬溶酶體降解途徑上。P62降解的過程首先需要與自噬小體結(jié)合,再通過自噬小體與溶酶體融合形成自噬溶酶體進(jìn)行降解[33],我們首先對自噬小體與P62的結(jié)合進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)Sidt2缺失后代表自噬小體的LC3B 與P62 的共定位降低。這有兩種解釋,其一可能是Sidt2剔除后P62通過自噬溶酶體途徑降解增多所致,其二可能是Sidt2剔除后對貨物蛋白P62的識別及封存出現(xiàn)異常所致[34]。因?yàn)樯鲜鑫覀円呀?jīng)得出自噬小體的增多是降解障礙導(dǎo)致的,同時(shí)P62蛋白水平的增加也表示其降解并不會增多,故自噬小體對貨物蛋白的識別及封存障礙是Sidt2剔除后P62堆積的重要原因[34]。
隨后我們又對自噬溶酶體的形成進(jìn)行了探究。自噬溶酶體是由自噬小體與溶酶體融合形成的,我們發(fā)現(xiàn)Sidt2基因缺失后LC3B與溶酶體膜性標(biāo)志物L(fēng)AMP1[35]共定位降低,提示Sidt2基因的缺失導(dǎo)致自噬小體與溶酶體融合障礙[36]。而由于Sidt2是溶酶體膜蛋白,我們猜想其缺失可能會導(dǎo)致溶酶體的異常[20,21],所以我們使用LysoTracker 對酸性溶酶體進(jìn)行檢測[27],結(jié)果發(fā)現(xiàn)Sidt2缺失后酸性溶酶體數(shù)量減少。以上兩點(diǎn)是導(dǎo)致P62與LC3B堆積自噬受阻的重要原因。已有文獻(xiàn)表明,在肝臟中自噬可以通過脂質(zhì)吞噬作用將脂質(zhì)小滴隔離在自噬小體內(nèi)并在溶酶體內(nèi)降解,以防脂質(zhì)在肝臟中的堆積[37],所以Sidt2缺失導(dǎo)致的自噬受阻可能會導(dǎo)致肝臟脂質(zhì)堆積,進(jìn)而影響肝臟疾病的發(fā)生發(fā)展,這將為我們進(jìn)一步的研究指明方向。
綜上所述,人肝臟細(xì)胞Sidt2基因缺失后自噬小體對貨物蛋白的識別與封存受阻,同時(shí)酸性溶酶體數(shù)量減少、自噬小體與溶酶體融合受阻導(dǎo)致自噬溶酶體形成障礙,從而導(dǎo)致自噬小體與貨物蛋白發(fā)生堆積。我們的研究可能只是Sidt2對人肝臟自噬調(diào)節(jié)的一部分,但為深入探究溶酶體膜蛋白與肝臟疾病的關(guān)系提供了一個(gè)新思路。
南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2021年8期