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實(shí)時(shí)熒光PCR 法檢測(cè)結(jié)核桿菌的臨床價(jià)值

2021-09-22 07:56:32魏進(jìn)武廖俐雅余登瓊吳朝菊袁世梅
中外醫(yī)療 2021年20期
關(guān)鍵詞:抗酸涂片靈敏度

魏進(jìn)武,廖俐雅,余登瓊,吳朝菊,袁世梅

重慶市墊江縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,重慶 408300

結(jié)核病是一種嚴(yán)重危害人民健康的慢性傳染病,是全球需要面對(duì)的重要公共衛(wèi)生問(wèn)題,也是我國(guó)重點(diǎn)控制的重大疾病之一。我國(guó)是全球30 個(gè)結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國(guó)家之一,位居全球第2 位[1]。每年新報(bào)告肺結(jié)核患者約80 余萬(wàn)例,位居甲乙類(lèi)傳染病第2 位[2],結(jié)核桿菌是引發(fā)肺結(jié)核的主要病原菌,該菌的細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)較為特殊,具有較強(qiáng)的耐藥性,能夠抵抗多種藥物,形成耐藥性的機(jī)制較為復(fù)雜[3]。這種病菌能夠侵犯全身的器官,其中最為常見(jiàn)的就是肺部受到侵害,進(jìn)而形成肺結(jié)核。肺結(jié)核是一種具有較強(qiáng)傳染性的傳染性疾病,并且能夠通過(guò)空氣進(jìn)行傳播。實(shí)驗(yàn)室病原學(xué)檢查是診斷結(jié)核病的主要手段。肺結(jié)核主要是通過(guò)藥物治療,如果患者化療無(wú)效、多重耐藥的厚壁空洞、大塊干酪灶結(jié)核性膿胸、支氣管胸膜瘺、大咯血保守治療無(wú)效,需要進(jìn)行肺結(jié)核外科手術(shù)治療[4]。針對(duì)肺結(jié)核,還應(yīng)做到早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療,改善預(yù)后,促進(jìn)患者病情好轉(zhuǎn)。該次研究方便選取2018 年1 月—2020 年9 月該院門(mén)診和住院部接收的疑似肺結(jié)核患者作為研究對(duì)象,應(yīng)用涂片法、QT-PCR 法、固體培養(yǎng)法進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌檢測(cè),并比較三者的優(yōu)異性,現(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料

方便選取該院門(mén)診和住院部接收的疑似肺結(jié)核的患者作為該次的研究對(duì)象,其中男性3 728 例,女性3 338例。納入標(biāo)準(zhǔn):具有咳嗽、咳痰、低熱、盜汗、痰中帶血等癥狀或已診斷肺結(jié)核患者的密切接觸者的患者,且近1個(gè)月未進(jìn)行抗結(jié)核治療,同意參與該次研究。排除標(biāo)準(zhǔn):近1 個(gè)月進(jìn)行抗結(jié)核治療。

1.2 方法

1.2.1 儀器與試劑 抗酸染色液:冷染法;結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群核酸檢測(cè)試劑盒(QT-PCR 法)和核酸提取試劑(磁珠法);核酸提取儀(型號(hào):Lab-Aid808),PCR 熒光定量分析儀(型號(hào):宏石SLAN-48P);羅氏培養(yǎng)基。

1.2.2 檢驗(yàn)方法 嚴(yán)格按照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》、商品試劑盒說(shuō)明書(shū)及儀器標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行操作。

①標(biāo)本采集和處理:患者清晨起床后首先給予清水漱口,用力咳痰置于無(wú)菌痰杯中,立即送檢。涂片法連續(xù)3 d 留清晨痰液。

②固體培養(yǎng)法(56 例):視樣本黏稠程度,加1~2 倍4% NaOH,震蕩使樣本液化,取液化后的標(biāo)本0.1~0.3 mL,以無(wú)菌操作接種于羅氏培養(yǎng)基斜面上,置培養(yǎng)箱中37℃孵育。7 d 后有菌落生長(zhǎng),報(bào)固體培養(yǎng)法結(jié)核桿菌陽(yáng)性。若8 周內(nèi)未生成菌落,則報(bào)告陰性。

③痰涂片鏡檢(7 066 例):取痰標(biāo)本中干酪樣、膿樣或可疑部分0.05 mL,在玻片正面均勻涂抹成10 mm×20 mm 的卵圓形痰膜,厚度為透過(guò)痰膜看報(bào)紙上的5號(hào)字時(shí)字跡較模糊為適宜,室溫中干燥后加熱固定,后加入石碳酸復(fù)紅染液室溫染色10 min,水洗后使用3%的鹽酸酒精脫色,再使用亞甲基藍(lán)復(fù)染0.5~1 min,水洗后等待自然干燥,最后放置在顯微鏡下查看。若淡藍(lán)色背景下可見(jiàn)紅色略帶彎曲的桿菌,且有分枝生長(zhǎng)態(tài)勢(shì)即為陽(yáng)性[5]。

④QT-PCR 法檢測(cè)(942 例):用1~2 倍體積的4%NaOH 溶液液化痰樣本,上機(jī)提取核酸,將提取好的核酸取30 μl 加入擴(kuò)增管(擴(kuò)增管中已預(yù)置反應(yīng)體系),震蕩混勻并瞬時(shí)離心后進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)條件設(shè)置:UNG 處理50℃2 min,預(yù)變性95℃10 min ;Touchdown 循環(huán)程序:95℃10 s,71℃15 s(每個(gè)循環(huán)下降1℃),78℃15 s,循環(huán)10 次;PCR 循環(huán)程序:95℃10 s、61℃15 s、78℃15 s,循環(huán)45 次。每批次實(shí)驗(yàn)設(shè)置陰陽(yáng)對(duì)照及臨界水平對(duì)照,擴(kuò)增結(jié)束按試劑盒說(shuō)明書(shū)要求分析結(jié)果,結(jié)果有效且樣本Ct 值≤25 判斷結(jié)果為陽(yáng)性。

1.3 觀察指標(biāo)

觀察3 組患者抗酸桿菌陽(yáng)性檢出率。對(duì)比涂片法與QT-PCR 法抗酸桿菌陽(yáng)性檢出率、特異性、靈敏度、準(zhǔn)確率。特異性=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陽(yáng)性例數(shù))×100.00%;靈敏度=真陽(yáng)性例數(shù)/(真陽(yáng)性例數(shù)+假陰性人數(shù))×100.00%;準(zhǔn)確率=(真陽(yáng)性例數(shù)+真陰性例數(shù))/總例數(shù)×100.00%。

1.4 統(tǒng)計(jì)方法

采用SPSS 26.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì)所有數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。滿(mǎn)足正態(tài)性檢驗(yàn)與方差齊性檢驗(yàn)的計(jì)量資料以()表示,多組樣本間差異比較采用單因素方差分析,如有顯著性差異,組間兩兩比較用LSD 法檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以[n(%)]表示,采用χ2檢驗(yàn),均作雙側(cè)檢驗(yàn),P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 3 組患者納入對(duì)象一般資料比較

3 組患者的性別、年齡、病程3 項(xiàng)一般資料對(duì)比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性,見(jiàn)表1。

表1 3 組患者一般資料比較

2.2 3 組患者固體培養(yǎng)法抗酸桿菌陽(yáng)性檢出率比較

共有561 例應(yīng)用固體培養(yǎng)法檢測(cè),其結(jié)核桿菌的陽(yáng)性例數(shù)為205 例,陽(yáng)性率為36.54%。固體培養(yǎng)法將作為結(jié)核桿菌檢出的金標(biāo)準(zhǔn)。典型的結(jié)核桿菌菌落呈菜花狀,見(jiàn)圖1、圖2。

圖1

圖2

2.3 3 組患者涂片法與QT-PCR 法抗酸桿菌陽(yáng)性檢出率比較

涂片法結(jié)核桿菌的陽(yáng)性例數(shù)為162 例,陽(yáng)性檢出率為2.29%;QT-PCR 法結(jié)核桿菌的陽(yáng)性例數(shù)為281 例,陽(yáng)性率為29.83%,對(duì)比兩組的陽(yáng)性檢出率,QT-PCR 法高于涂片法,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表2。

表2 3 組患者涂片法與QT-PCR 法抗酸桿菌陽(yáng)性檢出率比較[n(%)]

2.4 3 組患者涂片法與QT-PCR 法檢驗(yàn)靈敏度、特異性和準(zhǔn)確率比較

對(duì)352 例同時(shí)進(jìn)行固體培養(yǎng)法、涂片法及QT-PCR法的病例進(jìn)行分析,以固體培養(yǎng)法結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn)。涂片法(取樣1~3 次,首次陽(yáng)性即記為陽(yáng)性,否則繼續(xù)采樣第2次或第3 次,有1 次陽(yáng)性則記為陽(yáng)性)檢測(cè)的靈敏度、特異性和準(zhǔn)確率分別為69.78%、90.61%、82.39%;QTPCR 法檢測(cè)的靈敏度、特異性和準(zhǔn)確率分別為83.45%、86.85%、85.51%,QT-PCR 法靈敏度明顯高于涂片法,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表3。

表3 352 例患者同時(shí)進(jìn)行固體培養(yǎng)、涂片和QT-PCR 檢測(cè)結(jié)果比較(%)

3 討論

肺結(jié)核是一種慢性傳染性疾病,該病是由結(jié)核分枝桿菌引起,會(huì)對(duì)患者全身的器官和組織造成傷害,對(duì)患者、家庭、社會(huì)均會(huì)帶來(lái)較為嚴(yán)重的危害。目前我國(guó)的肺結(jié)核發(fā)病率逐年升高,并且結(jié)核病當(dāng)中出現(xiàn)越來(lái)越多的耐藥型病例,1 例活動(dòng)性的肺結(jié)核患者每年可傳染引起20 例左右的新發(fā)感染者,20%患者在早期無(wú)明顯臨床癥狀或癥狀較輕微,因此在結(jié)核分枝桿菌感染的最初階段,快速檢測(cè)到結(jié)核分枝桿菌,才能有效地從源頭控制結(jié)核病的擴(kuò)散[6-7]。臨床常用的檢測(cè)肺結(jié)核的方式主要有直接涂片抗酸染色鏡檢,即該次研究所用的涂片法、液體培養(yǎng)法和羅氏固體培養(yǎng)法,該次研究使用固體培養(yǎng)法,并作為研究的金標(biāo)準(zhǔn),以及該次研究探索的QT-PCR 法檢測(cè),這種方法主要用于檢測(cè)結(jié)核桿菌核酸。

涂片法是3 種檢驗(yàn)方法中最早啟用檢測(cè)結(jié)核桿菌的方法,這種方法的優(yōu)點(diǎn)是操作較為簡(jiǎn)單,便捷,且并不需要特殊儀器設(shè)備,適合無(wú)法開(kāi)展分子檢測(cè)的基層實(shí)驗(yàn)室使用。其局限性在于染色不僅結(jié)核分枝桿菌呈陽(yáng)性,而非結(jié)核分枝桿菌如麻風(fēng)桿菌也呈陽(yáng)性;該方法還容易受到溫度、染色時(shí)間、染色液質(zhì)量,以及操作人員的主觀意識(shí)影響;該方法使用的標(biāo)本并未進(jìn)行消化滅活,容易污染環(huán)境,老處理不當(dāng)會(huì)存在巨大的生物安全風(fēng)險(xiǎn);另外,標(biāo)本荷菌量較低時(shí),鏡檢也不易查見(jiàn)抗酸桿菌,假陰性的概率特別大,要求檢測(cè)人員具備較高的技術(shù)水平和職業(yè)素養(yǎng)。據(jù)盛莉等[8]報(bào)道,留痰時(shí)留第1口痰和第2 口痰也會(huì)影響抗酸桿菌檢出率。多方面因素導(dǎo)致不易控制檢測(cè)工作的質(zhì)量,且涂片法單次送檢的陽(yáng)性率比文中所訴陽(yáng)性率更低,通常需多次送檢,在檢驗(yàn)的時(shí)效性與經(jīng)濟(jì)性上并不都優(yōu)于QT-PCR 法[9]。

固體培養(yǎng)法作為檢驗(yàn)的金標(biāo)準(zhǔn),能夠有效降低因標(biāo)本產(chǎn)生的假陽(yáng)性和假陰性的干擾因素,能夠通過(guò)確定性的陽(yáng)性標(biāo)本去考核其他方法的真陽(yáng)性率。但該方法培養(yǎng)周期長(zhǎng),且非結(jié)核分枝桿菌也有生長(zhǎng),實(shí)際工作中培養(yǎng)的菌落形態(tài)并非都能生長(zhǎng)成典型的菜花樣。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)規(guī)定要求,結(jié)核桿菌的培養(yǎng)物如需開(kāi)蓋進(jìn)行進(jìn)一步檢測(cè),需在BSL-3 實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行[10-11]。目前絕大多數(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)尚不具備此條件,因此,只能依靠肉眼觀察菌落形態(tài)進(jìn)行鑒別,故會(huì)導(dǎo)致假陽(yáng)性率的提升,且該方法的靈敏度較低。

QT-PCR 法檢測(cè)結(jié)核桿菌的特異性及靈敏度均較強(qiáng),并且能夠?qū)Σ煌?lèi)型的標(biāo)本通過(guò)提取結(jié)核桿菌DNA 進(jìn)行精確的檢測(cè),在很大程度上提高了結(jié)核桿菌檢測(cè)的真陽(yáng)性率和準(zhǔn)確性,適用于體外難于培養(yǎng)和生長(zhǎng)緩慢的病原體。QT-PCR 法根據(jù)試劑盒不同檢測(cè)的靶基因不同,包括插入序列6110(IS6110)、IS986、16Sr-RNA、MPB64、MTP40、65KD、2 個(gè)或多個(gè)序列聯(lián)合應(yīng)用等[12-14],該研究中所采用的試劑盒的靶基因是針對(duì)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群所特有的IS6110 基因,不會(huì)受到各種分枝桿菌種(如龜、鳥(niǎo)、土地、施式、堪薩斯、亞洲分枝桿菌等)的影響,確診的價(jià)值較為顯著。隨著全自動(dòng)核酸提取儀的普及,能夠進(jìn)行自動(dòng)化的批量操作,減少了人為因素的影響。但由于開(kāi)展分子檢測(cè)需要專(zhuān)門(mén)設(shè)計(jì)的基因擴(kuò)增檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,且需經(jīng)專(zhuān)業(yè)培訓(xùn)取得上崗資質(zhì)的人員才能進(jìn)行操作,故結(jié)核桿菌核酸檢測(cè)并未大范圍普及[15],在應(yīng)用PCR 過(guò)程中還應(yīng)該注意一些問(wèn)題,例如在樣本收集、處理、運(yùn)送、保存過(guò)程中避免失誤,提高工作質(zhì)量,減少檢測(cè)的誤差,避免在處理標(biāo)本過(guò)程中出現(xiàn)交叉污染等情況,降低假陽(yáng)性率和假陰性率[16]。該研究中,QT-PCR 法的靈敏度為83.45%,明顯高于涂片法,但仍然遠(yuǎn)低于廠家給定的靈敏度值,可能原因?yàn)椋孩贈(zèng)]有去污步驟,不排除存在PCR 抑制因子,在低菌量時(shí)影響較大;②固體培養(yǎng)法存在一定的假陽(yáng)性;③部分樣本過(guò)于黏稠,核酸提取前的樣本液化不完全。特異性為86.85%,導(dǎo)致特異性低的原因?yàn)椋号囵B(yǎng)陰性而分子檢測(cè)陽(yáng)性的例數(shù)稍多,標(biāo)本荷菌量太低可能會(huì)出現(xiàn)培養(yǎng)陰性結(jié)果,這與培養(yǎng)的手工操作和檢測(cè)的敏感度有關(guān)。

該次研究將該院門(mén)診與住院部收治的疑似結(jié)核病的患者作為研究對(duì)象,應(yīng)用3 種方式進(jìn)行結(jié)核桿菌檢測(cè),結(jié)果顯示,7 066 張涂片中陽(yáng)性例數(shù)為162 例,陽(yáng)性率為2.29%;942 例樣本進(jìn)行了QT-PCR 法檢測(cè),陽(yáng)性例數(shù)為281 例,陽(yáng)性率為29.83%;固體培養(yǎng)法的結(jié)核桿菌的陽(yáng)性例數(shù)為205 例,陽(yáng)性率為36.54%,由于固體培養(yǎng)法標(biāo)本均來(lái)源于結(jié)核門(mén)診,并且作為該次研究的金標(biāo)準(zhǔn),因此陽(yáng)性率較高,但是依舊存在一定影響因素。而涂片法陽(yáng)性率過(guò)低,原因可能為:①方法學(xué)局限;②與該研究中樣本的來(lái)源有關(guān),樣本來(lái)源于各臨床科室并非都來(lái)自于結(jié)核門(mén)診,該研究中的涂片法陽(yáng)性率也與相關(guān)報(bào)道的2.72%相近[17]。QT-PCR 法陽(yáng)性率高于涂片法,且樣本來(lái)源于涂片法相同,適合進(jìn)行比較。涂片法檢測(cè)的靈敏度為69.78%,QT-PCR 法靈敏度為83.45%,與呂純芳等[18]報(bào)道的靈敏度為83.7%的數(shù)據(jù)相近。QTPCR 法靈敏度高于涂片法(P<0.05)。結(jié)果表明,QTPCR 法陽(yáng)性率、靈敏度、準(zhǔn)確率均優(yōu)于涂片法。涂片法影響因素較多,存在一定的漏診率。PCR 方法靈敏度和特異性均較高,并且較為平均,檢測(cè)的準(zhǔn)確性更高。

綜上所述,應(yīng)用QT-PCR 法檢測(cè)結(jié)核桿菌的應(yīng)用價(jià)值更高,優(yōu)于傳統(tǒng)的涂片法,具有較高的陽(yáng)性率、特異性和靈敏度,且QT-PCR 法可在接收標(biāo)本的當(dāng)日得出檢測(cè)結(jié)論,時(shí)效性遠(yuǎn)優(yōu)于固體培養(yǎng)法。如同時(shí)在PCR基礎(chǔ)上應(yīng)用固體培養(yǎng)法,能夠增強(qiáng)準(zhǔn)確性,最終確定患者結(jié)核桿菌為陽(yáng)性,提高檢測(cè)的準(zhǔn)確率,因此可以臨床推廣,逐步替代涂片法。

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