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人類白細(xì)胞抗原組織配型基因分型國家參考品的研制

2021-10-20 08:24胡澤斌高飛劉湘蘭更欣李麗莉黃杰
中國生物制品學(xué)雜志 2021年10期
關(guān)鍵詞:配型凍融分型

胡澤斌,高飛,劉湘,蘭更欣,李麗莉,黃杰

1.中國食品藥品檢定研究院體外診斷試劑檢定所非傳染病診斷試劑室,北京100050 2.北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司,北京101111

人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因位于6 號染色體短臂上6p21.3,全長約3 600 bp,由200 多個基因座位組成,是迄今已知基因中等位基因多態(tài)性最高的基因復(fù)合體[1-2]。HLA 在抗原識別、提呈、免疫應(yīng)答及調(diào)控方面發(fā)揮重要作用,是導(dǎo)致移植排斥的主要抗原,也被稱為移植抗原[3],因此,造血干細(xì)胞及器官移植均需在移植前進(jìn)行HLA 配型[4]。

隨著測序技術(shù)的發(fā)展,基于DNA 序列的分型方法基本取代了傳統(tǒng)的血清學(xué)及細(xì)胞學(xué)分型方法[5-6],主要包括低中分辨序列特異性引物方法(PCR sequence specific primer,PCR-SSP)、中分辨序列特異性寡核苷酸探針方法(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSO)、高分辨基因測序分型方法(sequence-based typing,PCR-SBT)及近年迅速發(fā)展的二代高通量測序方法(next generation sequencing,NGS)[7-8],其中 PCR-SBT 法是 WHO 推薦的HLA 分型方法的金標(biāo)準(zhǔn)。目前,已有多家企業(yè)的HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 基因分型檢測試劑盒獲批上市,同時還有許多企業(yè)正在申報此類試劑盒注冊。我國目前尚無針對HLA 組織配型基因分型檢測相關(guān)試劑盒的國家參考品,無法對該類試劑盒進(jìn)行統(tǒng)一的質(zhì)量評估,為確保其臨床測定結(jié)果準(zhǔn)確可靠,本實驗研制一套涵蓋中國人群常見HLA 位點型別信息的HLA 組織配型基因分型國家參考品,以期為臨床細(xì)胞組織器官移植配型提供保障。

1 材料與方法

1.1 樣本 采集45 名志愿者(均已簽署知情同意書)5 ~ 10 mL 外周血,置無菌肝素鋰抗凝采血管中,2 ~ 8 ℃保存。志愿者外周血基因組DNA 的HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 等 5 個位點的高分辨基因分型信息預(yù)先采用金標(biāo)準(zhǔn)PCR-SBT 法獲得。

1.2 病毒 EB 病毒液由深圳華大智造科技有限公司提供。

1.3 主要試劑及儀器 人外周血淋巴細(xì)胞分離液購自北京索萊寶科技有限公司;基因組DNA 提取試劑盒(磁珠法)及Qubit Fluorometer 3.0 購自深圳華大智造科技有限公司;HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLADRB1、HLA-DQB1 位點基因高分辨分型試劑盒(測序法)購自北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司;Nano-Dorp 分光光度計購自美國安捷倫公司。

1.4 永生化淋巴細(xì)胞系的建立 45 份外周血樣本中加入人淋巴細(xì)胞分離液,300×g離心30 min,獲得單個核淋巴細(xì)胞;加入1.5 mL EB 病毒液,按文獻(xiàn)[9-10]的方法進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)化及細(xì)胞培養(yǎng)。顯微鏡下觀察細(xì)胞由單個逐漸成團(tuán)狀聚集,生長旺盛,則表明永生化細(xì)胞系建立成功。

1.5 國家參考品的制備及驗證 采用基因組DNA提取試劑盒(磁珠法)提取建立成功的永生化細(xì)胞系的基因組DNA,通過分光光度計測定A260/280。將基因組DNA 反復(fù)凍融3 次,取凍融前及凍融后的基因組DNA 樣本,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析。通過 Qubit Fluorometer 3.0 精確定量各樣本的DNA 濃度,將各樣本稀釋至 20 ng / μL,經(jīng) HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 位點基因高分辨分型試劑盒(測序法)對凍融前樣品進(jìn)行全外顯子基因分型,并與預(yù)先采用金標(biāo)準(zhǔn)SBT 法獲得的高分辨基因分型信息進(jìn)行比較。將檢測結(jié)果符合要求的樣本組成一套國家參考品。

1.6 國家參考品的穩(wěn)定性及均勻性驗證 隨機(jī)取3 套參考品在-20 ℃與室溫(20 ~ 25 ℃)之間反復(fù)凍融3 次(每隔1 d 凍融1 次),將凍融前后的基因組DNA 樣本按 1.4 項方法進(jìn)行A260/280測定、DNA 定量和瓊脂糖凝膠電泳分析,并采用PCR-SBT 法進(jìn)行分型驗證。

2 結(jié) 果

2.1 永生化淋巴細(xì)胞系的建立 45 份外周血樣本分離的單個核淋巴細(xì)胞經(jīng)EB 病毒轉(zhuǎn)化后,培養(yǎng)5 ~7 d,鏡下可見少量聚集的細(xì)胞團(tuán);培養(yǎng)10 ~14 d 可見細(xì)胞團(tuán)變大變多,細(xì)胞生長旺盛,表明細(xì)胞已成功轉(zhuǎn)化為淋巴母細(xì)胞樣B 細(xì)胞。見圖1。最終獲得38株永生化HLA 細(xì)胞系,編號為1 ~38。

圖1 細(xì)胞生長情況的鏡下觀察(× 100)Fig.1 Microscopy of cell growth(× 100)

2.2 國家參考品的制備及驗證 經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳分析,凍融前和凍融3 次后的DNA 樣品均未見拖帶或彌散帶,條帶完整清晰,符合實驗室對基因組DNA 完整性的要求,見圖2。DNA 樣品的A260/280均在1.80 ~2.15 之間,表明DNA 的純度較高,滿足檢測要求,且每份樣本2 條染色體的分型結(jié)果均與建系前外周血基因組DNA 的分型信息一致,見表1。將 38 份樣本按 30 μL 進(jìn)行分裝,濃度為 20 ng / μL,組成一套HLA-組織配型國家參考品盤。

圖2 凍融前后DNA 樣本的完整性檢測Fig.2 Integrity of DNA samples before and after freeze-thawing

表1 基因組DNA 樣本的純度及分型結(jié)果Tab.1 Purity and typing of genomic DNA samples

2.3 國家參考品的穩(wěn)定性及均勻性驗證 3 套國家參考品的A260/280在 1.80 ~ 2.15 之間,表明 DNA 純度不受影響;DNA 濃度為(20.0 ± 0.5)ng / μL,表明DNA 穩(wěn)定未降解;經(jīng)SBT 法驗證,3 套國家參考品凍融前后樣本的 HLA-A、B、C、DRB1、DQB1 基因的高分辨分型結(jié)果一致,且與2.2 項分型結(jié)果相符。表明本實驗室研制的HLA 組織配型基因分型國家參考品穩(wěn)定性和均勻性良好。

3 討 論

HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1 基因與組織器官移植密切相關(guān),移植的供受體雙方HLA配型程度越高,移植成功率和受體長期存活率越高[11-12],因此HLA 基因分型試劑盒的質(zhì)量關(guān)乎臨床檢測的準(zhǔn)確性,直接影響移植配型成功率和受體存活率,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)是確保和提升試劑質(zhì)量的重要手段之一[13-14]。

足量原料的持續(xù)供應(yīng)是制約標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)發(fā)展的瓶頸之一,尤其是大量多人份的臨床血液樣本。本研究采用永生化建系的手段解決該困難,充分確保了國家參考品的持續(xù)供應(yīng)及換批連續(xù)性。永生化建系僅需抽取志愿者外周血3 ~5 mL,操作簡便,永生化建立也是HLA 國際質(zhì)控盤通常采用的技術(shù)手段。因此,HLA 組織配型基因分型國家參考品與國際質(zhì)控盤(UCLA,IHWG)技術(shù)水平相當(dāng),本研究建立的HLA基因中國人群實物參考盤為國際間的交流合作提供了支撐。本研究結(jié)果表明,永生化淋巴細(xì)胞系基因組HLA 的檢測結(jié)果與臨床血液樣本DNA 的HLA 分型結(jié)果一致,該永生化淋巴細(xì)胞系的遺傳信息穩(wěn)定,可作為國家參考品的遺傳資源。

HLA 組織配型基因分型參考品為首批研制的定性基因分型參考品,參考品原料系人全血轉(zhuǎn)化的永生化細(xì)胞系,參考品性質(zhì)為DNA 樣本,DNA 樣本自身的均勻性和穩(wěn)定性良好[15-16],常規(guī)在-20 ℃以下保存,且要求干冰或-20 ℃冷鏈運(yùn)輸,用戶不宜反復(fù)凍融后使用。本研究將38 份DNA 樣本反復(fù)凍融3 次后,DNA 樣品的A260/280在 1.80 ~ 2.15 之間,分型結(jié)果均與PCR-SBT 法檢測結(jié)果一致,表明建立HLA組織配型基因分型國家參考品的量值準(zhǔn)確性、均一性和穩(wěn)定性均符合要求,可用于HLA 組織配型類核酸檢測試劑盒的質(zhì)量控制和評價。

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