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長鏈非編碼RNA ZFAS1作為腫瘤預后因子的薈萃分析

2021-10-28 08:25:32李璐燕陳夢湘何國獻余敏吳越向惠英邵世和
臨床檢驗雜志 2021年9期
關鍵詞:生存率癌癥基因

李璐燕,陳夢湘,何國獻,余敏,吳越,向惠英,邵世和

(1.江蘇大學醫(yī)學院,江蘇鎮(zhèn)江212000;2.常州市第二人民醫(yī)院檢驗科,江蘇常州213000)

癌癥作為一種由多種因素引起的疾病,具有較高的發(fā)病率和死亡率。癌癥的早期診斷是改善腫瘤患者預后的有效途徑之一[1],尋找新的腫瘤標志物對癌癥的早期診斷具有重要意義。長鏈非編碼RNA(LncRNA)是長度超過200 bp的非編碼RNA,其作為一種新的生物學標志物,對癌癥的診斷、治療和預后具有一定的臨床價值[2]。多種LncRNA已被證實與癌癥相關,例如,Chen等[3]發(fā)現(xiàn)沉默Lnc00958可以預防胰腺癌的進展。Wu等[4]證實,lncHDAC2能促進肝癌干細胞的擴散和自我更新。Xiao等[5]研究發(fā)現(xiàn),LncRNA-TTTY15在前列腺癌組織中過表達,促進了前列腺癌的進展。ZFAS1最初被證實在乳腺上皮分化和肺泡發(fā)展過程中發(fā)揮調控作用[6]。后續(xù)大量研究發(fā)現(xiàn),該LncRNA在胃癌、食道癌、神經膠質瘤、結直腸癌、非小細胞肺癌和其他癌癥患者中均呈異常表達[7-11],且ZFAS1基因高表達患者的總生存率、無病生存率均較差[12-13]。然而,由于研究癌癥類型單一,樣本量小,結果不具有代表性。因此,本研究旨在通過薈萃(meta)分析確定ZFAS1與癌癥患者臨床預后的關系,并進一步驗證ZFAS1作為腫瘤標志物的潛在價值。

1 材料和方法

1.1文獻檢索策略 利用電子數(shù)據(jù)庫PubMed、Cochrane Library、Web of Science、Wiley Online Library等,使用以下關鍵詞:“ZFAS1”、“LncRNAZFAS1”或“l(fā)ong non-coding RNAZFAS1”、“cancer”和“tumor”進行檢索。檢索日期截至2020年7月10日。

1.2納入和排除標準 納入研究需滿足以下條件:(1)與ZFAS1關聯(lián)的癌癥研究;(2)將患者分為基因高、低水平表達組,分類標準為腫瘤組織中ZFAS1基因的表達水平;(3)提供相關的臨床資料;(4)提供生存分析相關的風險比率(hazard ratio,HR)和95%置信區(qū)間(95% confidence interval,CI)或可以獲取生存曲線。排除標準:(1)綜述、meta分析、病例報告和重復出版物;(2)臨床資料不足的研究。

1.3數(shù)據(jù)提取和質量評估 提取數(shù)據(jù)包括:文章出版信息(包括作者名稱、出版時間、癌癥類型)、基因檢測方法,ZFAS1基因高、低表達組患者數(shù)量,臨床病理參數(shù)(包括TNM分期、是否發(fā)生淋巴結轉移、遠處轉移、性別)以及生存相關(包括生存率和無病生存率)的HR值及95%CI、P值。研究質量評估包括:(1)納入患者的選擇;(2)組間的可比性;(3)隨訪結果。

1.4統(tǒng)計學分析 采用危險比(HR值)及95%CI評估ZFAS1與癌癥患者臨床預后之間的關系。在本次研究所納入的文章中,部分HR值可以直接從原文中獲取,部分研究并未提供,對于無法直接獲得HR值的研究則需通過原文中的生存曲線獲得原始數(shù)據(jù),并使用Engauge Digitizer 4.2版軟件(http://digitizer.sourceforge.net/)計算HR值和95%CI。異質性分析采用卡方Q檢驗和HigginsI2統(tǒng)計量分析?;诤喜⑿康漠愘|性,選擇固定效應模型或隨機效應模型。當異質性明顯(I2>50%或P<0.05)時,采用隨機效應模型,反之則采用固定效應模型。在臨床病理因素方面,將患者按照性別分為男性和女性,根據(jù)是否診斷為淋巴結轉移、遠處轉移分為陽性和陰性,根據(jù)TNM分期分為早期(Ⅰ+Ⅱ期)組和晚期(Ⅲ+Ⅳ期)。

2 結果

2.1研究選擇及特點 根據(jù)文獻篩選策略,共篩出152項研究。閱讀標題和摘要后,有72篇文章因是動物研究、綜述、meta分析或無關研究被刪除。通篇閱讀文章后,因缺乏生存結果或臨床病理參數(shù)的必要信息,有5篇文章被排除。最終選擇21篇文章進行meta分析,共17種癌癥,其中包括肝癌2篇[13-14],結直腸癌4篇[15-18],大腸癌1篇[19],胃癌1篇[20],骨肉瘤1篇[21],卵巢癌1篇[12],非小細胞肺癌1篇[11],膠質瘤1篇[22],膀胱癌1篇[23],黑色素瘤1篇[24],前列腺癌1篇[25],腎透明細胞癌1篇[26],膽管癌1篇[27],食管鱗狀細胞癌1篇[28],鼻咽癌1篇[29],宮頸癌1篇[30],子宮內膜癌1篇[31]。所有患者均基于明確的病理診斷。本次研究共包含1 765例患者,且納入的研究均將患者分為高表達組和低表達組,分類標準為癌癥組織中ZFAS1表達情況,檢測方法均為qRT-PCR。21項研究均來自中國。見表1。

表1 本次meta分析納入研究的臨床特征

2.2ZFAS1表達與癌癥患者總生存率OS及無病生存率DFS的相關性 采用HR值及95%CI分析ZFAS1表達與患者生存率的關系。其中16項研究分析了總生存率OS與ZFAS1表達水平之間的關聯(lián),4項研究分析了無病生存率DFS與ZFAS1表達水平的關聯(lián)。結果顯示,總生存率HR合并結果為1.85(95%CI:1.67~2.05,Z=11.78,P<0.000 01),見圖1A。無病生存率HR合并結果為1.92(95%CI:1.51~2.44,Z=5.35,P<0.000 01),見圖1B。由于研究間不存在明顯異質性,分析方法均采用固定效應模型。此外,根據(jù)腫瘤類型進行亞組分析,將納入的研究按照腫瘤種類分為消化系統(tǒng)腫瘤組(包括胃癌、肝癌、結直腸癌、膽管癌、大腸癌、食管鱗狀細胞癌),呼吸系統(tǒng)腫瘤組(包括非小細胞肺癌、鼻咽癌),泌尿生殖道系統(tǒng)腫瘤組(包括膀胱癌、子宮內膜癌、宮頸癌、腎透明細胞癌、前列腺癌、卵巢癌)及其他系統(tǒng)腫瘤組(包括膠質瘤、骨肉瘤、黑色素瘤)。結果顯示,ZFAS1高表達能夠顯著降低消化系統(tǒng)腫瘤(HR=1.78,95%CI:1.52~2.08,Z=7.18,P<0.000 01),泌尿生殖道系統(tǒng)腫瘤(HR=2.03,95%CI:1.54~2.68,Z=4.99,P<0.000 01),呼吸系統(tǒng)腫瘤(HR=1.64,95%CI:1.30~2.07,Z=4.16,P<0.0001)及其他腫瘤(HR=1.87,95%CI:1.68~2.07,Z=7.10,P<0.000 01)患者的生存率,見圖1C。

注:A,ZFAS1表達與癌癥患者總生存期OS相關性的森林圖;B,ZFAS1表達與癌癥患者無病生存期DFS相關性的森林圖;C,ZFAS1表達與癌癥患者總生存期OS相關性按癌癥類型亞組分析森林圖;degestive system,消化系統(tǒng);respiratory system,呼吸系統(tǒng);urogenital system,泌尿生殖系統(tǒng);other system,其他系統(tǒng)。

2.3ZFAS1表達與癌癥患者臨床病理參數(shù)的相關性 采用OR值及95%CI評估ZFAS1表達與患者臨床病理參數(shù)的關系。其中15項研究共納入1 416例患者的臨床TNM分期數(shù)據(jù),13項研究納入1 070例患者的淋巴結轉移情況,8項研究納入629例患者的癌癥遠處轉移情況,16項研究納入1 447例患者的性別,具體統(tǒng)計數(shù)據(jù)見表2。分析結果顯示,ZFAS1基因高表達的患者與TNM分期為Ⅲ+Ⅳ期(OR=2.87,95%CI:2.31~3.57,Z=9.55,P<0.000 01),更易發(fā)生淋巴結轉移(OR=2.44,95%CI:1.40~4.25,Z=3.13,P=0.002)和腫瘤的遠處轉移(OR=1.90,95%CI:0.86~4.18,Z=1.59,P=0.000 9)有關。而患者性別與ZFAS1的表達并無明顯關聯(lián)(OR=1.06,95%CI:0.86~1.31,Z=0.57,P=0.23)。見圖2。

注:A,TNM分期;B,遠處轉移;C,淋巴結轉移及侵襲;D,性別。

2.4web GEPIA數(shù)據(jù)庫驗證結果 使用基因表達譜動態(tài)分析數(shù)據(jù)庫web GEPIA分析ZFAS1在癌組織與癌旁組織中的表達水平,并通過對TCGA和GTEx項目RNA測序表達數(shù)據(jù)進行分析,結果表明,與相應的癌旁組織相比,ZFAS1在多種癌組織中均明顯升高。見圖3。

注:CHOL,膽管癌;COAD,結腸癌;DLBC,彌漫性大b細胞淋巴瘤;GBM,多形性成膠質細胞瘤;KIRC,腎透明細胞癌;LGG,腦低級別膠質瘤;LIHC,肝臟肝細胞癌;nam(T),癌組織;num(N),癌旁組織。

2.5敏感性分析與發(fā)表偏倚 應用Stata 12.0軟件檢測刪除數(shù)據(jù)對總生存率合并結果的影響,并驗證結果的穩(wěn)健性,漏斗圖結果顯示不存在明顯發(fā)表偏倚。見圖4A、4B。

注:A,敏感性分析結果;B,漏斗圖。

3 討論

LncRNAs曾經被認為是基因垃圾,但越來越多的研究表明,它在腫瘤細胞的生命活動中發(fā)揮重要作用,包括轉錄調控、基因剪接、翻譯和細胞成分的組裝等[32]。多種LncRNAs已經被貼上致癌基因或腫瘤抑制基因的標簽[33-34],對腫瘤診斷具有重要價值。近年來,LncRNAsZFAS1被證實在多種腫瘤組織中異常表達。查閱文獻可知,其在結直腸癌、胃癌、肝癌、膽囊癌等消化系統(tǒng)腫瘤中的研究較為深入廣泛,但在其他類型癌癥中研究相對較少。本次meta分析基于以上研究基礎,綜合分析ZFAS1表達在各系統(tǒng)腫瘤預后診斷價值,亞組分析結果顯示,高表達的ZFAS1與消化系統(tǒng)、泌尿生殖道系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)等腫瘤的低生存率均具有顯著相關性。此外,為重點研究ZFAS1表達水平與癌癥患者臨床病理參數(shù)之間的潛在聯(lián)系,筆者收集了患者性別、TNM分期、淋巴結轉移和遠處轉移等數(shù)據(jù)進行分析。結果表明,與低表達組相比,ZFAS1高表達患者TNM分期更易發(fā)展為Ⅲ/Ⅳ期,且更易發(fā)生淋巴結轉移及遠處轉移。綜上所述,高表達的ZFAS1與腫瘤患者的不良預后具有明顯相關性。

為進一步探究ZFAS1在癌癥中發(fā)揮調控作用的分子機制,筆者發(fā)現(xiàn)目前針對該LncRNA的研究主要集中于競爭性內源性RNA(Competitive endogenous RNA, ceRNA)調控機制。ceRNA假說最早由Leonardo Salmena等提出,該假說論證了細胞中編碼和非編碼RNA是如何相互作用并進一步影響細胞表型[35]。MicroRNA是具有代表性的非編碼RNA,其主要在分子水平上發(fā)揮重要作用,研究證實LncRNAZFAS1與多種miRNAs之間存在調控環(huán)路。通過查閱文獻,筆者發(fā)現(xiàn)能夠與ZFAS1直接結合的MicroRNA主要有miR-150-5p[12,15,24,36-37]、miR-590-3p[38-40]、miR-1271-5p[41-42]、miR-193a-3p[43-44]、miR-421[45],其中miR-150-5p、miR-590-3p被證實在多種癌癥中均能夠被ZFAS1特異性吸附。此外,ZFAS1調控的靶基因具有多樣性,可以從細胞增殖、遷移、侵襲、凋亡及細胞耐藥性等方面調控癌癥進展。

本研究仍存在一定的局限性:(1)納入文章數(shù)量和樣本量有限;(2)所有納入的研究均在中國進行,可能存在種族及地域差異;(3)本次meta分析僅包括英文出版物;(4)部分HR值無法從原文獲取,而是由生存曲線計算獲得。本研究還需在今后的臨床研究中驗證。

綜上所述,本次meta分析證實ZFAS1是一種重要的腫瘤標志物,高表達的ZFAS1預示著癌癥患者較差的生存期和不良的臨床預后。ZFAS1作為ceRNA直接或間接與MicroRNA結合,影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。

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