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先天性心臟病家系中相關(guān)易感基因的研究進(jìn)展

2021-12-03 18:40艾克拜艾散陳鈾
醫(yī)學(xué)綜述 2021年12期
關(guān)鍵詞:家系基因突變畸形

艾克拜·艾散,陳鈾

(新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院心臟中心,烏魯木齊 830011)

先天性心臟病(congenital heart disease,CHD)是胎兒心臟和大血管在子宮內(nèi)發(fā)育異常所造成的出生缺陷,其發(fā)病率較高。雖然隨著醫(yī)療環(huán)境的持續(xù)改善,CHD患者的存活率大幅度提升[1],但CHD仍是導(dǎo)致嬰幼兒死亡的重要原因[2]。CHD每年導(dǎo)致約300萬嬰兒死亡[3-4],截至2015年全球有4 886.91萬人患有CHD[5]。據(jù)報(bào)道,全球CHD的患病率仍呈持續(xù)上升趨勢[6-7]。遺傳和環(huán)境因素聯(lián)合作用導(dǎo)致CHD。隨著基因測序和分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,越來越多的研究認(rèn)為遺傳因素在CHD中發(fā)揮關(guān)鍵作用[8-10]。CHD具有一定的家族傾向趨勢,CHD家系中的嬰兒患病率較普通人高[11],患有CHD的母親所生嬰兒患CHD的概率是心臟健康母親的3倍[12]。在家族性CHD患者中,有31%~46%的機(jī)會可以識別因果遺傳突變[8]。為探究CHD的復(fù)發(fā)模式,研究者們調(diào)查了1 163例CHD患者家庭中共3 080例經(jīng)臨床確診的個(gè)體,結(jié)果發(fā)現(xiàn)CHD家系中表現(xiàn)出的表型多樣性頻率高于單一性頻率,這表明家系中的CHD遵循特定的復(fù)發(fā)模式,而家系中的共同畸形是由共享易感基因引起,受基因調(diào)控機(jī)制的影響[12]。因此,CHD家系非常適合作為研究CHD發(fā)病分子機(jī)制的研究對象。目前文獻(xiàn)已報(bào)道包括編碼轉(zhuǎn)錄因子、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)子和染色質(zhì)修飾劑在內(nèi)的400個(gè)基因突變與CHD的發(fā)生密切相關(guān)[8,13-14],如NKX2.5、GATA4、TBX5、ZIC3、NOTCH1等?,F(xiàn)就CHD家系中相關(guān)易感基因的研究進(jìn)展予以綜述。

1 染色體異常與CHD

染色體異常是綜合征型CHD的常見病因。染色體異常不僅表現(xiàn)為心臟畸形,還伴有全身各系統(tǒng)或器官的結(jié)構(gòu)異常。約30%染色體異常的兒童患CHD,尤其在非整倍體和染色體數(shù)目異常者中更多見,而CHD患兒的25%~40%通常合并其他臟器畸形或被明確診斷為各種綜合征[15]。

1.1染色體核型異常與CHD 染色體核型異常引起的CHD多表現(xiàn)為綜合征型。不同的綜合征表現(xiàn)出不同表型的心臟畸形。如Down綜合征伴發(fā)完全性房室間隔缺損、室間隔缺損(ventricular septal defect,VSD)、房間隔缺損(atrial septal defect,ASD)、動脈導(dǎo)管未閉(patent ductus arteriosus,PDA)等;Edward綜合征可出現(xiàn)VSD、PDA、ASD等;13-三體綜合征出現(xiàn)的心臟缺陷包括VSD、PDA、ASD、肺動脈狹窄(pulmonary stenosis,PS)等?,F(xiàn)已知40%~50%的Down綜合征患兒的心臟畸形表現(xiàn)為VSD、ASD或房室管畸形,而幾乎所有的Edward綜合征患兒均伴有CHD[11]。約50%的女性Turner綜合征患者可合并CHD,表現(xiàn)為左側(cè)心臟結(jié)構(gòu)異常,如二葉式主動脈瓣、主動脈縮窄、主動脈瓣下阻塞和左心發(fā)育不良綜合征[15-16]。

1.2染色體微缺失與CHD 染色體微缺失可導(dǎo)致心血管畸形,如DiGeorge綜合征、Williams綜合征等。其中,DiGeorge綜合征最為常見。其第22號染色體的長臂著絲粒端22q11.21~22q11.23微片段缺失,大小為1 500~3 000 kb,該缺失片段有TBX1、CRKL、MAPK1等30多個(gè)基因[17]。DiGeorge綜合征患者中60%~80%患有CHD[18],其中圓錐動脈干畸形為最常見,包括法洛四聯(lián)癥(tetralogy of fallot,TOF)、主動脈弓離斷、肺動脈閉鎖伴VSD、永存動脈干(persistent truncus arteriosus,PTA)。在家族性CHD病例中大多數(shù)染色體微缺失是新生的,但6%~28%的CHD患者的22q11.2微缺失是從上一代以常染色體顯性方式遺傳的[9]。有研究者通過結(jié)合先前的研究結(jié)果統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),57%的22q11.2微缺失起源于母親[19]。隨著Fish技術(shù)的發(fā)展,7q11.23染色體微缺失也被檢測到,稱為Williams綜合征[20],其中主動脈瓣上狹窄和周圍 PS為最常見的心血管畸形,分別占45%和37%,其他常見病變包括瓣膜上PS、二尖瓣脫垂和VSD等。85%~97%的Alagille綜合征患兒中存在周圍PS、ASD、VSD和TOF等心血管畸形,其中周圍PS最為常見[21]。此外,由5號染色體短臂缺失引起的5P綜合征雖不常見,但據(jù)Hills等[22]報(bào)道約50%的5P綜合征患者合并CHD,且以左向右分流型多見,如PDA、VSD、ASD,其次也可合并TOF、肺動脈閉鎖、PS、右心室雙出口等。除上述缺失外,1p36、8p23.1、7q11.23、1q21.1、9q34.3等基因組的缺失也是導(dǎo)致CHD的重要原因[23]。

2 單基因突變與CHD

單基因突變可導(dǎo)致綜合征型和非綜合征型CHD。導(dǎo)致CHD的單基因突變大多發(fā)生在對胎兒發(fā)育有較大影響的重要基因上,因此它引起的不僅是心臟畸形,還伴隨其他系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和功能異常,表現(xiàn)為綜合征型CHD,如Nonan、Holt-Oram、Marfan、Alagille、Adams-Oliver綜合征等,這些綜合征型CHD家系對心臟關(guān)鍵調(diào)控基因和致病基因的研究具有重要作用。非綜合征型CHD的發(fā)生與單個(gè)轉(zhuǎn)錄因子和信號通路相關(guān)的單基因的突變有關(guān),這些單基因在復(fù)雜的調(diào)控過程中與環(huán)境一起發(fā)揮作用,致單純心臟發(fā)育畸形。然而,關(guān)于非綜合征型CHD發(fā)病機(jī)制的研究較少。

2.1單基因突變與非綜合征型CHD 單基因突變導(dǎo)致的非綜合征型CHD是散發(fā)的。這類患者的同胞或子代CHD的發(fā)病率較高。近年來,學(xué)者不斷研究發(fā)現(xiàn)了一些非綜合征型CHD家系相關(guān)基因,這些基因在心臟調(diào)控發(fā)育過程發(fā)揮重要作用。

2.1.1NK基因家族 與人類CHD相關(guān)的NK基因家族成員主要包括NKX2.5和NKX2.6。其中,稱為心臟特異性編碼同源盒轉(zhuǎn)錄因子的NKX2.5基因與多種CHD的發(fā)生相關(guān)。NKX2.5基因被認(rèn)為是胚胎進(jìn)化過程中重要的心臟標(biāo)志物易感基因[24],是位于5q34~35的同源盒基因,也是目前研究最廣泛的心臟調(diào)控基因。該基因的突變常見于ASD、VSD、TOF、主動脈縮窄、肺動脈閉鎖等。與非家族性CHD相比,家族性CHD中NKX2.5基因突變的發(fā)生率明顯升高[25-26]。Prendiville等[25]在研究一個(gè)CHD家系時(shí)發(fā)現(xiàn),患者均存在NKX2.5基因的錯(cuò)義突變c.325G>T,提示基因突變可能改變基因的功能,同時(shí)也表明基因型相同的患者臨床表型可能不同。Elles?e等[26]對39例家族性CHD患者進(jìn)行了NKX2-5基因的突變篩查,并在一個(gè)三代常染色體顯性CHD的家族中確定了新的NKX2.5基因突變,該突變?yōu)镹KX2.5基因外顯子1位置112處的單個(gè)核苷酸缺失,不同于既往報(bào)道的59種NKX2.5基因突變。研究證實(shí),NKX2.5基因突變可發(fā)生于各種類型的CHD,其中散發(fā)CHD或VSD家系中均被報(bào)道NKX2.5基因突變[9]。有學(xué)者對210例VSD患者的NKX2.6基因進(jìn)行了測序,結(jié)果在其中1例VSD患者中發(fā)現(xiàn)新雜合子NKX2.6基因突變p.K152Q,該突變與VSD共軛,具有常染色體顯性遺傳特性,而這種突變在對照染色體中不存在[27]。

2.1.2GATA基因家族 目前發(fā)現(xiàn)能引起CHD的GATA基因家族成員有GATA4、GATA5、GATA6。其中,GATA4基因參與調(diào)節(jié)心臟結(jié)構(gòu)基因的表達(dá),并通過其結(jié)構(gòu)與NKX2.5、TBX5等心臟特異性轉(zhuǎn)錄因子之間發(fā)生相互作用,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄調(diào)控。Garg等[28]首次報(bào)道在獨(dú)立的ASD家系中發(fā)現(xiàn)GATA4基因的雜合錯(cuò)義突變G296S,該突變會影響GATA4基因的轉(zhuǎn)錄活性,從而破壞GATA4基因和TBX5基因之間的相互作用。Zhang等[29]在7例CHD患者的三代家系中對NKX2-5、HAND1和GATA4等基因編碼區(qū)域進(jìn)行了排序,結(jié)果在GATA4基因中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)可能導(dǎo)致該家系CHD的新突變。Pulignani等[30]報(bào)道的5例ASD家系遺傳檢測數(shù)據(jù)表明,GATA4基因或NKX2.5基因突變在CHD家系病例中非常罕見。唐胤等[31]對GATA4基因NLS區(qū)域M310V基因突變引起的ASD家系的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行了深入研究,結(jié)果表明M310V基因突變影響了α肌球蛋白重鏈啟動子和GATA4基因核蛋白,這可能是導(dǎo)致該家系A(chǔ)SD的發(fā)病機(jī)制之一。一項(xiàng)研究對52例具有家族性TOF的先證者進(jìn)行了GATA4基因測序,并在3例先證者中鑒定出了3個(gè)新的雜合突變(A9P、L51V和N285S),深入進(jìn)行功能分析表明,GATA4基因突變與DNA結(jié)合親和力和轉(zhuǎn)錄活性降低相關(guān),N285S突變完全破壞了GATA4基因和TBX5基因之間的相互作用,該研究首次提出GATA4基因功能喪失突變與家族性TOF相關(guān)[32]。Kalayini等[33]對66例家族性CHD患者進(jìn)行了染色體分析和GATA4基因突變體篩選,共檢測到12個(gè)GATA4基因突變體,包括5個(gè)內(nèi)含子、2個(gè)外顯子和3個(gè)多態(tài)性,以及2個(gè)錯(cuò)義突變,即c.1220C>A和c.1309G>A,并首次報(bào)道了與c.1309G>A相關(guān)的CHD,且還報(bào)道了一種新型的從頭平衡易位46,XY,t(5; 7)(qter13; qter11)。目前,關(guān)于GATA6基因突變的報(bào)道雖然較少,但其可導(dǎo)致嚴(yán)重的心臟畸形即PTA。一項(xiàng)研究檢測并證實(shí)了一個(gè)PTA家族中的GATA6基因突變E486del[34]。

2.1.3T-box基因家族 在胚胎發(fā)育、心肌細(xì)胞增殖、心腔的形成、瓣膜的發(fā)育及心臟傳導(dǎo)系統(tǒng)分化過程中,T-box基因家族及其轉(zhuǎn)錄因子發(fā)揮重要作用。目前研究發(fā)現(xiàn),T-box有7個(gè)亞型基因在心臟中表達(dá)[35],其中研究最多也較成熟的基因有TBX1、TBX2、TBX5和TBX20。TBX1基因位于第22號染色體(22q11.21),其缺乏或突變可導(dǎo)致心臟流出道和主動脈弓異常,同時(shí)也與DiGeorge綜合征有關(guān),約75%的患者會出現(xiàn)心臟流出道及主動脈弓畸形[36]。TBX5基因突變是人類心臟間隔缺損中發(fā)現(xiàn)的首個(gè)基因突變。該基因位于第12號染色體(12q24.1),主要通過其特定的T-box結(jié)構(gòu)與下游基因相結(jié)合,在心臟間隔形成中起關(guān)鍵調(diào)控作用[37]。Holt-Oram綜合征是由TBX5轉(zhuǎn)錄因子基因突變所致,Patel等[38]在對一個(gè)由9個(gè)受影響的個(gè)體組成的5代非典型Holt-Oram綜合征家系調(diào)查中報(bào)告了既往在Holt-Oram綜合征中很少報(bào)道的完全性房室間隔缺損、左心發(fā)育不良綜合征、PS等心臟缺陷,他們對該家系基因進(jìn)行的進(jìn)一步陣列比較基因組雜交顯示,TBX5基因在12q24.21有48 kb的重復(fù),這是目前關(guān)于TBX5基因內(nèi)復(fù)制及其臨床效應(yīng)的首次報(bào)道。TBX20基因突變存在于常染色體顯性遺傳的心臟間隔缺損家系中[15],可導(dǎo)致多種心臟畸形。Huang等[39]對175例CHD患者的TBX20基因進(jìn)行序列分析,在具有CHD家族史的TOF患者基因中發(fā)現(xiàn)了一種新的序列突變,進(jìn)一步對先證者現(xiàn)有家庭成員進(jìn)行遺傳分析發(fā)現(xiàn),其父親、哥哥和兒子也患有TOF。該研究首次將TBX20基因功能缺失突變與家族性TOF聯(lián)系起來,為CHD的分子發(fā)病機(jī)制提供了新見解。

2.1.4ZIC基因家族 ZIC3基因是ZIC基因超家族的成員,位于X染色體上,是第一個(gè)明確與人類異位綜合征相關(guān)的基因。ZIC3基因參與調(diào)節(jié)左右對稱性發(fā)育,其遺傳伴隨X染色體。目前研究已證實(shí)該基因突變或功能缺失導(dǎo)致內(nèi)臟異位和孤立性的CHD,如大動脈的異位和右心室雙出口等[40]。研究者通過Sanger測序?qū)HD家系中鑒定出的變異體進(jìn)行了確認(rèn),在1例男性患者的ZIC3基因中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的突變(c.890G>T,p.C297F),該突變遺傳于其母親[40]。Cowan等[41]在由440例內(nèi)臟移位CHD患者組成的迄今最大的隊(duì)列研究中驗(yàn)證了11種ZIC3基因突變,其中4種與CHD家系有關(guān)。D′Alessandro等[42]在五代右位心家系中發(fā)現(xiàn)了ZIC3基因的一個(gè)錯(cuò)義突變繼發(fā)的X連鎖內(nèi)臟異位,縱向隨訪發(fā)現(xiàn),該家系在ZIC3基因第三鋅指區(qū)發(fā)生了c.1048A>G(R350G)錯(cuò)義突變。

2.1.5Notch信號通路基因 Notch是一種實(shí)現(xiàn)細(xì)胞間聯(lián)系的信號通路基因,它在許多方面調(diào)控心臟的發(fā)育,包括心臟環(huán)、房室管、瓣膜、流出道、冠狀動脈和房室結(jié)的發(fā)育。該信號通路基因的突變是CHD發(fā)病的重要原因之一。其中,NOTCH1基因的突變已被確認(rèn)為引起散發(fā)性或遺傳性CHD的原因[43-44]。NOTCH1基因突變可引起左或右心臟病變,常遺傳于無癥狀父母,同一種突變可引起孤立或綜合征性CHD[45]。NOTCH1基因的致病突變與Adams-Oliver綜合征中42%的CHD相關(guān)[9]。Southgate等[46]在12例Adams-Oliver綜合征患者家系中進(jìn)行了全外顯子組測序,結(jié)果顯示在47% NOTCH1基因突變陽性先證者和受影響家系中發(fā)現(xiàn)了CHD。Preuss等[43]對來自51個(gè)有遺傳背景家系中的182個(gè)法國-加拿大血統(tǒng)的左心室流出道梗阻患者進(jìn)行了基于家系的全外顯子測序,發(fā)現(xiàn)了主要聚集在Notch信號級聯(lián)基因中罕見或新穎的突變,而且這些突變具有更高的致病性。同時(shí),他們還在3個(gè)獨(dú)立家系15例患者中鑒定了NOTCH1基因中與左右側(cè)心臟畸形相關(guān)的新型共分離致病性突變。截至目前有關(guān)NOTCH2基因突變致病性方面的報(bào)道較少,而這方面的發(fā)現(xiàn)是從Alagille綜合征的研究中得到的,即NOTCH2基因突變可引起Alagille綜合征。Gilbert等[47]在401例Alagille綜合先證者和111名受影響的家庭成員中進(jìn)行了單中心隨訪研究,通過聚合酶鏈反應(yīng)和Sanger測序?qū)NA樣本中NOTCH2基因的致病突變進(jìn)行篩選,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了3個(gè)新的NOTCH2基因突變,且2.5%的研究對象在NOTCH2基因中有致病性突變。

2.2單基因突變與綜合征型CHD 單基因突變常導(dǎo)致綜合征型CHD。其中,Holt-Oram綜合征表現(xiàn)為骨骼畸形、心臟畸形等,其心臟畸形中ASD和VSD較為常見;基因連鎖分析發(fā)現(xiàn),Holt-Oram綜合征是TBX-5等基因突變引起[37]。Marfan綜合征除了眼、骨骼的畸形外,還出現(xiàn)主動脈夾層動脈瘤、主動脈關(guān)閉不全等心臟畸形?;蚍治霭l(fā)現(xiàn),Marfan綜合征是FBN1基因突變引起[48]。JAG1基因是Notch信號通路配體,其突變也可導(dǎo)致Alagille綜合征,而PS和TOF是90%的Alagille綜合征患者最常見的CHD類型[49]。Noonan綜合征也是常見的合并CHD的遺傳綜合征之一,不同類型的基因突變是導(dǎo)致Noonan綜合征表型的原因,其中位于12q24.1區(qū)域的Ras信號通路PTPN11基因突變約占50%[49],其臨床特征除包括身材矮小、畸形等全身特征外,還包括PS合并肺血管發(fā)育不良等心臟畸形。

3 多基因突變與CHD

雖然在CHD的發(fā)生過程中涉及多種基因,但只有少數(shù)是由單基因突變引起。多基因的突變往往在環(huán)境因素的協(xié)同作用下致病。Demal等[50]報(bào)道了多基因遺傳的家庭成員在第1號染色體上均有BMPR1A錯(cuò)義突變和一個(gè)確定的連鎖區(qū)域,他們認(rèn)為BMPR1A突變與連鎖區(qū)域內(nèi)的另一個(gè)遺傳實(shí)體的相互作用可能是疾病的原因,該連鎖區(qū)與嚴(yán)重CHD的發(fā)生有關(guān),包括Ebstein異常、房室間隔缺損等。Preuss等[43]發(fā)現(xiàn),導(dǎo)致CHD的Notch信號級聯(lián)的基因突變主要涉及NOTCH1、ARHGAP31、MAML1、SMARCA4、JARID2、JAG1等基因,表明多基因突變的共同參與是CHD發(fā)生的重要因素。但與CHD發(fā)病相關(guān)的多基因突變的研究較少,有待進(jìn)一步研究。

4 其他遺傳物質(zhì)與CHD

目前,循環(huán)微RNA(microRNA,miRNA)已成為檢測心血管疾病的新型生物標(biāo)志物。相關(guān)研究認(rèn)為,在母體血清中與妊娠相關(guān)的miRNA可能是用于胎兒CHD非侵入性產(chǎn)前診斷的潛在生物標(biāo)志物[51-52]。Song等[53]對來自26個(gè)家庭CHD兒童的miRNA進(jìn)行了篩選,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在ASD兒童中有3種miRNA (hsa-let-7a、hsa-let-7b和hsa-miR-486)表達(dá)明顯上調(diào),并表明這些過量表達(dá)特別存在于ASD兒童中。同時(shí),他們在ASD兒童的母親中也發(fā)現(xiàn)了與hsa-let-7a和hsa-let-7b相似的表達(dá)譜。可見,hsa-let-7a和hsa-let-7b對于檢測ASD以及通過母體樣品預(yù)測其后代中ASD的發(fā)生具有重要的診斷價(jià)值。

5 小 結(jié)

隨著全外顯子組測序、全基因組測序、DNA甲基化分析即RNA測序等技術(shù)的發(fā)展,CHD遺傳學(xué)取得了巨大進(jìn)步。但是目前研究發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)基因只能部分解釋CHD的發(fā)病機(jī)制[54],關(guān)于大多數(shù)CHD的原因仍然未知,CHD在很大程度上具有非孟德爾遺傳模式,需要用復(fù)雜的遺傳學(xué)來描述[14]。一項(xiàng)研究對154個(gè)CHD家系的先證者中進(jìn)行了系統(tǒng)篩查,結(jié)果表明遺傳因素的系統(tǒng)篩查能夠闡明10.4%CHD家系病例的因果變異,可用于遺傳咨詢[55]。目前更多的研究認(rèn)為,CHD的發(fā)病機(jī)制與更復(fù)雜的遺傳機(jī)制和環(huán)境因素的相互作用有關(guān)[17,45,49]。Alankarage等[56]在97個(gè)CHD家系中利用置信基因篩選和綜合分析等兩種方法進(jìn)行了基因組測序,總體上檢測出31%家系中可臨床操作的變異體,如能應(yīng)用于臨床未來可大幅提高變異體的評估及基因?qū)用娴脑\斷率??傊?,CHD家系的研究為尋找CHD的易感基因、揭示CHD的發(fā)病機(jī)制提供了線索,為CHD相關(guān)缺陷的產(chǎn)前診斷和產(chǎn)前干預(yù)提供了理論依據(jù),因此未來需進(jìn)一步研究。

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