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LINC00958調(diào)控子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的作用機制研究

2021-12-23 01:50易莉莎鄭博宇劉志紅黃子健
關(guān)鍵詞:熒光素酶癌細(xì)胞內(nèi)膜

易莉莎,鄭博宇,劉志紅,黃子健

(廣州市婦女兒童醫(yī)療中心 婦產(chǎn)科,廣東 廣州 510623)

子宮內(nèi)膜癌是最常見的婦科惡性腫瘤,也是婦女中發(fā)病率居第四位的腫瘤。隨著化療、放療和外科手術(shù)聯(lián)合治療的開展,子宮內(nèi)膜癌患者生存率有顯著提高。早期子宮內(nèi)膜癌患者的5年生存率可高達(dá)90%,但Ⅲ期和Ⅳ期患者5年生存率僅有60%或20%[1]。

長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類長度大于200nt不具有蛋白編碼功能的RNA[2],研究證實多個lncRNA可參與子宮內(nèi)膜癌發(fā)生發(fā)展。lncRNA NEAT1通過調(diào)控miR-144-3p/EZH2軸促進(jìn)子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖、遷移和浸潤[3],抑制lncRNA CCAT2可通過吸附miR-216b抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移[4],lncRNA HEIH可通過活化MAPK信號通路增加子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞對紫杉醇的耐藥[5]。

多項研究顯示,LINC00958在腫瘤中高表達(dá)并發(fā)揮癌基因的作用。LINC00958(BLACAT2)在膀胱癌組織中高表達(dá),與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)[6],并通過吸附miR-379a-3p上調(diào)IGF1R的表達(dá)[7]。Luo Z等證實LINC00958可通過調(diào)控JNK/c-JUN信號通路促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌的增殖和轉(zhuǎn)移[8]。最近,有研究發(fā)現(xiàn)LINC00958通過吸附miR-625-5p上調(diào)LRRC8E的表達(dá)從而促進(jìn)宮頸癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[9]。除了可調(diào)控腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移,LINC00958還被證實可通過與miR-5095結(jié)合增加宮頸癌細(xì)胞的放療敏感性[10]。此外,抑制LINC00958可通過靶向miR-3619-5p抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖、浸潤和遷移,并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[11]??梢?,LINC00958在多種腫瘤中發(fā)揮癌基因的作用,并可通過吸附miRNA發(fā)揮其功能。

而LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中的表達(dá)和作用尚未見報道,本文擬通過生物信息學(xué)分析LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)及其與臨床分期、預(yù)后的關(guān)系,并檢測其對子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的影響,通過預(yù)測和驗證可與LINC00958結(jié)合的miRNA探討LINC00958調(diào)控子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的分子機制,初步闡明其在子宮內(nèi)膜癌中表達(dá)的意義和作用。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞系MEG3、HEC-1B購自中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心。試劑:高糖DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清、胰酶購自美國Thermo Fisher公司、Lipofectamine 2000(貨號:11668019)、Trizol(Invitrogen公司);CCK-8試劑盒(C0038,上海碧云天生物);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(RR037A,寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司);SYBR定量PCR試劑盒(RR820A,寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司);miRNA檢測試劑盒(上海吉瑪生物);雙熒光素酶活性報告分析試劑盒(Promega公司);所有引物、siRNA由華大基因合成。

1.2 生物信息學(xué)分析

利用在線數(shù)據(jù)庫GEPIA(http:∥gepia.cancer-pku.cn/detail.php)分析TCGA數(shù)據(jù)庫中LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織及正常子宮內(nèi)膜組織中表達(dá)差異、LINC00958在不同級別子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)差異,篩選與LINC00958表達(dá)密切相關(guān)的前20個基因。利用Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫(http:∥kmplot.com/analysis)繪制不同LINC00958表達(dá)子宮內(nèi)膜癌患者的生存曲線。利用在線軟件Kobas3.0(http:∥kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3)分析LINC00958及與其表達(dá)密切相關(guān)的20個基因參與的信號通路。采用ENCORI(http:∥starbase.sysu.edu.cn/index.php)預(yù)測能與LINC00958結(jié)合的miRNA并分析LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)。

1.3 細(xì)胞培養(yǎng)

使用含10%胎牛血清的高糖DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)MEG3、HEC-1B細(xì)胞于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱中。

1.4 細(xì)胞總RNA抽提和逆轉(zhuǎn)錄cDNA

收集1×106個細(xì)胞,加入1 mL Trizol裂解5 min,再加入200 μL氯仿,劇烈震蕩混勻后冰上靜置10 min,4℃ 12000 rpm離心15 min,取400μl上清加入400 μL異丙醇,劇烈震蕩混勻后置于-20 ℃沉淀30 min,4 ℃ 12 000 rpm離心10 min,棄上清,1 mL預(yù)冷的75%無酶水乙醇洗滌2次,加入30 μL無酶水溶解。采用Nanodrop2000測定RNA濃度。根據(jù)逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書取1 μg total RNA在20 μL體系中合成cDNA。

1.5 實時熒光定量PCR

利用 SYBR定量PCR試劑盒檢測細(xì)胞中LINC00958的表達(dá)水平。上游引物序列:5’-CAGCGAAAGGCAGCTGATTC-3’,下游引物序列:5’-ATAAAGTGGTCTGGGCCTGC-3’,以GAPDH為內(nèi)參,上游引物序列:5’-GAAGGTGAAGGTCGGAGTC-3’,下游引物序列:5’-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3’。每個樣本設(shè)立3個復(fù)孔,實驗重復(fù)3次,目的基因相對表達(dá)水平以2-△△Ct表示。采用miRNA逆轉(zhuǎn)錄和qPCR檢測試劑盒(上海吉瑪生物)檢測miR-129-2-3p的表達(dá),以U6為內(nèi)參。

1.6 細(xì)胞轉(zhuǎn)染

轉(zhuǎn)染前24 h,取對數(shù)生長期的細(xì)胞,接種于6孔板中,密度為5×105/孔,按照Lipofectamine2000說明書,每孔加入2條LINC00958 siRNA各100 pmol(siRNA1序列:5’- UACUUGAAAACUCAUAGUGAG -3’,siRNA2序列:5’- AACAGUUUUAAAAAUUAG-CUG -3’)、對照序列(si-NC:5’-UUUUUAUUGAGU-CUAUUUGAU-3’),分別與含5μl Lipofectamine 2000的DMEM混合后,靜置20 min,加入1.5 mL培養(yǎng)基中。miR-129-2-3p mimics和對照序列的轉(zhuǎn)染步驟與siRNA轉(zhuǎn)染步驟相同,轉(zhuǎn)染48小時后,采用RT-qPCR檢測轉(zhuǎn)染效率。

1.7 雙熒光素酶報告分析

根據(jù)ENCORI在線軟件預(yù)測到的LINC00958與miR-129-2-3p結(jié)合位點,設(shè)計合成野生型序列:5’-CCAGGACAACAGGGAAGCTTGCAGCAAGATA-GCTCCAGGTTGGATTCATGCTTCGCACCCCAAGGG-CTGCCAGCCAGAGAGGAGGAGAAGCAATCACTCC-TGCAGTTTCTGAACACTAC- 3’和突變型序列:5’-CCAGGACAACAGGGAAGCTTGCAGCAAGATAGCTCCAGGTTGGATTCATGCTTCGCACCCCGGAAATCGCCAGCCAGAGAGGAGGAGAAGCAATCACTCCTGCAGTTTCTGAACACTAC- 3’,并克隆至pMIR-report載體,構(gòu)建pMIR-WT(野生型)和pMIR-MUT(突變型)載體。分別將質(zhì)粒與miR-129-2-3p與對照序列(NC)共轉(zhuǎn)染接種于24孔板的HEC-1B細(xì)胞,培養(yǎng)48h后裂解細(xì)胞,采用雙熒光素酶報告分析試劑盒檢測各組細(xì)胞中熒光素酶活性。每組設(shè)3個重復(fù)孔,實驗獨立重復(fù)3次。

1.8 CCK-8法檢測細(xì)胞增殖

細(xì)胞轉(zhuǎn)染24小時后,調(diào)整細(xì)胞密度為1×104/孔接種于96孔板中,其中一部分實驗組分2組:對照組,si-LINC00958組;另一部分實驗分2組:miRNA對照序列與siRNA對照序列共轉(zhuǎn)染組、miR-129-2-3p mimics與si-LINC00958共轉(zhuǎn)染組。每組設(shè)6個復(fù)孔,然后將96孔板放入培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24 h、48 h、72 h,每孔加入10 μL CCK-8試劑,37 ℃培養(yǎng)箱孵育2 h,檢測OD450 nm處的值,繪制細(xì)胞生長曲線。

1.9 統(tǒng)計學(xué)分析

采用SPSS 21.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,結(jié)果以3次獨立實驗的均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表達(dá),兩樣本間均數(shù)的比較采用t檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)

在線數(shù)據(jù)庫GEPIA分析顯示LINC00958在174例子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)顯著高于正常子宮內(nèi)膜組織(n=91,P<0.001)(見圖1A);ENCORI數(shù)據(jù)庫分析548例子宮內(nèi)膜癌組織中LINC00958的表達(dá)也顯著高于35例正常子宮內(nèi)膜組織(P<0.001)(見圖1B);但是LINC00958的表達(dá)在不同級別子宮內(nèi)膜癌組織中無差異(見圖1C)。

2.2 LINC00958表達(dá)與子宮內(nèi)膜癌患者預(yù)后的關(guān)系

Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫分析LINC00958表達(dá)與子宮內(nèi)膜癌患者總生存率的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn)LINC00958高表達(dá)患者總生存率高于低表達(dá)患者,P=0.00073(見圖2A),LINC00958高表達(dá)患者的無病生存率也高于低表達(dá)患者,P=0.017(見圖2B)。

A.GEPIA數(shù)據(jù)庫分析LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá),Tumor:子宮內(nèi)膜癌組織,Normal:正常子宮內(nèi)膜組織,n:病例數(shù),*P<0.05;B.ENCORI數(shù)據(jù)庫分析LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá),Tumor:子宮內(nèi)膜癌組織,Normal:正常子宮內(nèi)膜組織;C.GEPIA數(shù)據(jù)庫分析LINC00958在不同分級子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)。

2.3 抑制LINC00958對子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的影響

轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA后,采用RT-qPCR檢測LINC00958在子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞MEG3、HEC-1B中的表達(dá)。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA1和siRNA2后MEG3細(xì)胞中LINC00958的表達(dá)分別為對照組的0.567±0.054和0.618±0.078倍,HEC-1B細(xì)胞中LINC00958的表達(dá)分別為對照組的0.657±0.063和0.610±0.086倍,差異有統(tǒng)計學(xué)意義,說明干擾成功(圖3A)。采用CCK8檢測干擾LINC00958的表達(dá)后子宮內(nèi)膜癌MEG3和HEC-1B細(xì)胞增殖情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在MEG3細(xì)胞中抑制LINC00958的表達(dá)48 h和72 h后可顯著抑制細(xì)胞增殖(圖3B),在HEC-1B細(xì)胞中轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA1后72 h,細(xì)胞增殖受抑制,而轉(zhuǎn)染siRNA2可在48h和72h抑制細(xì)胞增殖(見圖3C)。

2.4 LINC00958可與miR-129-2-3p結(jié)合

ENCORI在線軟件預(yù)測發(fā)現(xiàn)LINC00958可與miR-129-2-3p結(jié)合,且只有1個結(jié)合位點(見圖4A)。然后,我們通過GEPIA數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜癌組織中LINC00958與miR-129-2-3p的表達(dá)并不相關(guān)(圖4B)。隨后,我們采用雙熒光素酶報告分析發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics與野生型載體組的熒光素酶活性為對照組的0.637±0.081倍,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),而轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics與突變型載體組的熒光素酶活性為對照組的0.934±0.112倍,轉(zhuǎn)染對照序列和突變型載體組的熒光素酶活性為對照組的1.184±0.157倍,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(見圖4C),說明miR-129-2-3p可與LINC00958結(jié)合。

2.5 LINC00958通過吸附miR-129-2-3p調(diào)控子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖

ENCORI在線軟件分析了538例子宮內(nèi)膜癌組織和35例正常子宮內(nèi)膜組織中miR-129-2-3p的表達(dá),結(jié)果顯示miR-129-2-3p在子宮內(nèi)膜癌組織中表達(dá)顯著低于正常子宮內(nèi)膜組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001)(圖5A)。向子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics后,RT-qPCR檢測證實miR-129-2-3p在MEG3和HEC-1B細(xì)胞中的表達(dá)顯著增加,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)(圖5B)。CCK8實驗檢測發(fā)現(xiàn),在MEG3細(xì)胞中過表達(dá)miR-129-2-3p 72 h后,細(xì)胞增殖能力顯著下降(P<0.05),在HEC-1B細(xì)胞中過表達(dá)miR-129-2-3p 48 h和72h后,細(xì)胞增殖能力也顯著下降(P<0.05和P<0.01)(圖5C和5D)。在過表達(dá)miR-129-2-3p的同時抑制LINC00958的表達(dá)72 h后可顯著抑制MEG3和HEC-1B細(xì)胞的增殖能力(圖5E和5F)。

A.Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫分析LINC00958表達(dá)與子宮內(nèi)膜癌患者總生存率的關(guān)系;B.Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫分析LINC00958表達(dá)與子宮內(nèi)膜癌患者無病生存率的關(guān)系。紅色曲線為高表達(dá)組,黑色曲線為低表達(dá)組。

A: RT-qPCR檢測2條LINC00958 siRNA轉(zhuǎn)染MEG3和HEC-1B細(xì)胞后LINC00958的表達(dá);B:CCK8檢測轉(zhuǎn)染2條LINC00958 siRNA后MEG3細(xì)胞增殖;C:CCK8檢測轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA后HEC-1B細(xì)胞增殖。*P<0.05,**P<0.01。

A:ENCORI在線軟件預(yù)測到miR-129-2-3p能與LINC00958結(jié)合;B:GEPIA數(shù)據(jù)庫分析子宮內(nèi)膜癌組織中miR-129-2-3p與LINC00958表達(dá)相關(guān)性;C:雙熒光素酶活性報告分析檢測子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞中LINC00958能否與miR-129-2-3p結(jié)合,WT:與miR-129-2-3p結(jié)合位點野生型LINC00958序列,MUT:與miR-129-2-3p結(jié)合位點突變型LINC00958序列,Control:對照序列,miR-129-2-3p:miR-129-2-3p mimics。*P<0.05。

A.ENCORI數(shù)據(jù)庫分析miR-129-2-3p在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá),Tumor:子宮內(nèi)膜癌組織,Normal:正常子宮內(nèi)膜組織;B.RT-qPCR檢測MEG3和HEC-1B細(xì)胞經(jīng)轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics和對照序列后miR-129-2-3p的表達(dá);C.CCK8實驗檢測MEG3細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics和對照序列24 h、48 h和72 h后細(xì)胞增殖能力;D.CCK8實驗檢測HEC-1B細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics和對照序列24 h、48 h和72 h后細(xì)胞增殖能力;E.CCK8實驗檢測MEG3細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics的同時轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA或?qū)φ招蛄?4 h、48 h和72 h后細(xì)胞增殖能力;F.CCK8實驗檢測HEC-1B細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-129-2-3p mimics的同時轉(zhuǎn)染LINC00958 siRNA或?qū)φ招蛄?4 h、48 h和72 h后細(xì)胞增殖能力。*P<0.05,**P<0.01。

3 討 論

多項研究表明LINC00958在多種腫瘤中表達(dá)上調(diào),包括乳腺癌[12]、肝細(xì)胞癌[13]、膠質(zhì)瘤[14]等,但LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中的表達(dá)尚不清楚。本研究首先采用在線數(shù)據(jù)庫GEPIA和ENCORI分析了LINC00958在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)其在子宮內(nèi)膜癌組織中的表達(dá)顯著高于正常子宮內(nèi)膜組織,但其表達(dá)與患者臨床分期無關(guān),在Ⅰ至Ⅳ期患者組織中的表達(dá)無差異。為了進(jìn)一步明確LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中臨床檢測的意義,本研究采用Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)LINC00958高表達(dá)患者的總生存率和無病生存率均高于低表達(dá)患者,說明LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中的表達(dá)與患者預(yù)后呈正相關(guān)。由于沒有對子宮內(nèi)膜癌患者進(jìn)行分子分型,因此并不清楚LINC00958在ER陽性和陰性的患者中的表達(dá)差異及對兩組患者預(yù)后的影響,也不清楚LINC00958在POLE熱點突變、MSI穩(wěn)定、p53野生型與突變型患者中的表達(dá)差異和對患者預(yù)后的影響。

研究證實,lncRNA表達(dá)失調(diào)可促進(jìn)或抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖。Jian F等發(fā)現(xiàn)SOCS2-AS1可通過降解AURKA抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖[15],抑制lncRNA SNHG9可抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖和糖酵解[16],LINC00461通過靶向miR-219-5p/COX2信號軸促進(jìn)子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞生長和遷移[17],說明lncRNA在子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖中發(fā)揮重要作用。本研究前期通過抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞中LINC00958的表達(dá),采用CCK8檢測細(xì)胞增殖情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)抑制LINC00958可顯著抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞MEG3和HEC-1B的增殖,結(jié)果表明LINC00958同樣參與了子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的調(diào)控。

lncRNA發(fā)揮作用的機制之一就是吸附miRNA,釋放miRNA靶基因。有數(shù)項研究已證實LINC00958可與多個miRNA結(jié)合,參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的調(diào)控,如:miR-185-5p[18]、miR-5095[10]、miR-627-5p[19]等。為了明確LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中調(diào)控增殖的作用機制,本研究首先采用ENCORI在線軟件預(yù)測了能可以LINC00958結(jié)合的miRNA,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-129-2-3p可能與LINC00958結(jié)合,然后雙熒光素酶報告分析證實兩者在子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞中可結(jié)合,但兩者表達(dá)不相關(guān),說明LINC00958僅能吸附miR-129-2-3p,但不能調(diào)控其表達(dá),而miR-129-2-3p也不能調(diào)控LINC00958的表達(dá)。為了進(jìn)一步證明miR-129-2-3p是否參與LINC00958對子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的調(diào)控,本研究采用CCK8實驗證實在過表達(dá)miR-129-2-3p的同時抑制LINC00958,可更大程度抑制子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖,說明LINC00958通過吸附miR-129-2-3p發(fā)揮調(diào)控子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞增殖的作用。

本研究初步闡明了LINC00958在子宮內(nèi)膜癌中的表達(dá)、臨床意義及通過吸附miR-129-2-3p調(diào)控細(xì)胞增殖的作用機制。在子宮內(nèi)膜癌中,LINC00958吸附miR-129-2-3p后可對哪些基因和信號通路產(chǎn)生影響,仍有待進(jìn)一步研究。

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