柴寶峰,李曉琪,劉晉仙
(山西大學(xué) 黃土高原研究所,黃土高原生態(tài)恢復(fù)山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西 太原 030006)
季節(jié)性?xún)鋈谑菧貛Т箨憵夂蚝蜏貛Ъ撅L(fēng)氣候區(qū)重要的氣候特征。世界上大約有一半的湖泊,尤其是在中高緯度地區(qū)的湖泊都存在季節(jié)性?xún)鋈诂F(xiàn)象[1]。湖冰物候受區(qū)域以及全球氣候變化影響,而高海拔的山地是氣候變化的敏感區(qū)[2]。近年來(lái),由于全球氣溫升高,湖泊覆冰時(shí)間減少,導(dǎo)致湖泊的季節(jié)性動(dòng)態(tài)發(fā)生變化[1],進(jìn)而改變湖泊的生態(tài)功能[3]。湖冰在蓄積熱量、控制湖泊水體溫度、維持湖泊生物多樣性等方面發(fā)揮著重要作用。冰層對(duì)湖泊的影響包括降低水溫、降低光合有效輻射、改變湖泊水體混合狀態(tài)、減少水體和大氣交換、減少陸源徑流輸入等,并且可以通過(guò)改變這些能量和物質(zhì)輸入的時(shí)間和空間特征影響湖泊生態(tài)系統(tǒng)。溫度變化直接影響凍融過(guò)程的發(fā)生,并使湖泊水動(dòng)力發(fā)生變化[4],從而對(duì)微生物的分布和多樣性造成影響,進(jìn)而影響到更高的營(yíng)養(yǎng)級(jí),最終對(duì)整個(gè)湖泊生態(tài)系統(tǒng)產(chǎn)生影響[5]。營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)通常是山地湖泊中影響微生物生長(zhǎng)的限制因素,在冰雪覆蓋期間發(fā)生的營(yíng)養(yǎng)狀況的改變可能會(huì)篩選出寡營(yíng)養(yǎng)型微生物類(lèi)群;光有效輻射的降低會(huì)影響光合自養(yǎng)微生物的豐度和活性,從而改變冰期的初級(jí)生產(chǎn)力。盡管湖冰物候的改變會(huì)導(dǎo)致湖泊生態(tài)系統(tǒng)發(fā)生一系列變化,但季節(jié)性?xún)鋈谌绾斡绊懮降睾瓷鷳B(tài)系統(tǒng)中細(xì)菌群落的多樣性目前尚不清楚。已有的研究也僅通過(guò)對(duì)比湖冰產(chǎn)生前后的湖泊條件來(lái)間接推斷微生物群落的變化[6],有研究表明湖泊中的微生物在不同季節(jié)間的變化存在級(jí)聯(lián)效應(yīng),如冬季湖泊中藻類(lèi)的組成和多樣性直接決定春季是否會(huì)出現(xiàn)水華[7],因此進(jìn)一步深入了解冬季湖泊狀況,對(duì)湖泊生態(tài)系統(tǒng)的整體認(rèn)識(shí)具有重要意義。
細(xì)菌是湖泊生態(tài)系統(tǒng)中的重要成員,不僅是多種元素循環(huán)的驅(qū)動(dòng)者,也是水生食物網(wǎng)的主要組分。細(xì)菌群落數(shù)量龐大,種類(lèi)繁多,在微食物網(wǎng)中占據(jù)重要地位。已有研究表明,湖泊深度[8]、營(yíng)養(yǎng)鹽濃度[9]、降水量[10]、水體溫度[11]等都會(huì)影響細(xì)菌群落的多樣性及其空間分布。凍融過(guò)程對(duì)細(xì)菌群落影響的研究多集中在土壤[12]、海洋和極地[13],這些研究結(jié)果表明凍融顯著改變了細(xì)菌群落的組成和結(jié)構(gòu)[14]。在許多淡水和沿海系統(tǒng)中,微生物群落的季節(jié)差異與有機(jī)物和養(yǎng)分輸入的差異有關(guān),而在內(nèi)陸淡水山地湖泊中細(xì)菌群落在凍融過(guò)程中是否和其他生境中的變化具有一致性,目前還未有報(bào)道。因此對(duì)凍融過(guò)程中細(xì)菌群落在湖泊生態(tài)系統(tǒng)中適應(yīng)性的全面了解,對(duì)于未來(lái)更好地管理和維護(hù)湖泊生態(tài)系統(tǒng)功能具有深遠(yuǎn)的意義。本研究通過(guò)分析冰封期和消融期山西寧武公海湖中的細(xì)菌群落,旨在探討以下問(wèn)題:(1)季節(jié)性?xún)鋈谌绾斡绊懠?xì)菌群落的組成和多樣性?(2)季節(jié)性?xún)鋈谌绾斡绊懠?xì)菌群落中不同物種間的互作關(guān)系?
公海湖(38°91′N(xiāo),112°23′E),位于山西省寧武縣西南的管涔山,海拔1 854 m,面積0.36 km2,最大水深約8 m,湖床平坦,為降水補(bǔ)給的小型封閉淡水湖[15]。該區(qū)域?qū)贉貛Ъ撅L(fēng)氣候,冬季寒冷漫長(zhǎng)多風(fēng)雪,夏季涼爽,降水充沛,年平均氣溫6.2℃,年均降水量470 mm~770 mm。公海湖于每年11月初開(kāi)始結(jié)冰進(jìn)入冰封期,一直持續(xù)到翌年3月底,在這段時(shí)間內(nèi)湖面被冰層完全覆蓋,湖水波動(dòng)較小,處于較穩(wěn)定的狀態(tài),隨著天氣轉(zhuǎn)暖,冰層逐漸消融,直至4月底完全融化(圖1)。在冰封期,湖水和外界無(wú)直接接觸,處于隔絕狀態(tài),水體在冰蓋下和大氣之間的物質(zhì)能量交換被阻隔。
圖1 山西省寧武縣公海湖全景圖(A)2019年4月消融期;(B)2018年12月冰封期Fig.1 Gonghai Lake located in Ningwu,Shanxi.(A)Ice free in April 2019;(B)Ice covered in December 2018
1.2.1 樣品采集、理化性質(zhì)測(cè)定
實(shí)驗(yàn)所用樣品分別采集于2018年12月和2019年4月。在公海湖中央從表面到湖底每隔2 m設(shè)立一個(gè)采樣點(diǎn),共5個(gè)采樣點(diǎn)(分別是0 m、2 m、4 m、6 m、8 m),每個(gè)采樣點(diǎn)取3個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)間隔1 m左右。在每個(gè)采樣點(diǎn)利用采水器收集水樣3 L裝于無(wú)菌塑料桶中運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,后用0.2 μm聚碳酸酯濾膜過(guò)濾2.5 L,然后把濾膜放置到無(wú)菌離心管中,于-20℃保存用于后續(xù)微生物基因組的提取,剩余的0.5 L用于理化性質(zhì)分析。
水體溫度(T)、pH、電導(dǎo)率(EC)、溶解氧(DO)、鹽度(SAL)、氨態(tài)氮()和硝態(tài)氮()含量用便攜式水質(zhì)監(jiān)測(cè)儀(Aquread AP-2000,UK)原位測(cè)定;總碳(TC)、總有機(jī)碳(TOC)和無(wú)機(jī)碳(IC)含量用TOC分析儀(Shimadzu,TOC-VCPH,Japan)測(cè)定;亞硝態(tài)氮()、硫酸鹽()和磷酸鹽()含量用全自動(dòng)間斷化學(xué)分析儀(Cleverchem Anna,DeChem-Tech,Germany)測(cè)定。
1.2.2 樣品DNA提取及高通量測(cè)序
用快速提取試劑盒(MP Biomedicals,Solon,OH,USA)提取水體樣本基因組,測(cè)定濃度和純度后于-20℃保存。細(xì)菌PCR擴(kuò)增使用引物338F(ACTCCTACGGGAGGCAGCAG) 和 806R(GGACTACHVGGGTWTCTAAT)擴(kuò)增 V3-V4高變區(qū),擴(kuò)增體系及條件參照Liu等人的方法[16]進(jìn)行。通過(guò)Illumina Miseq高通量測(cè)序平臺(tái)(上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。獲得序列后,將原始序列在FLASH中進(jìn)行合并,并使用QIIME去除嵌合體,按照97%的相似性進(jìn)行操作分類(lèi)單元(operational taxonomic units,OTU)聚類(lèi),細(xì)菌序列使用SILVA庫(kù)進(jìn)行比對(duì),置信閾值為70%。最后對(duì)所得OTU按最小樣本序列數(shù)抽平后進(jìn)行后續(xù)分析。
對(duì)所有數(shù)據(jù)進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn),符合正態(tài)分布檢驗(yàn)的數(shù)據(jù)使用配對(duì)樣本t檢驗(yàn),不符合的使用wilcoxon秩和檢驗(yàn)。水體理化參數(shù)的季節(jié)間差異使用配對(duì)樣本t檢驗(yàn)進(jìn)行分析,細(xì)菌群落α多樣性指數(shù)的季節(jié)間差異和細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類(lèi)群的組間差異用wilcoxon秩和檢驗(yàn)分析;利用Spearman相關(guān)性分析不同季節(jié)優(yōu)勢(shì)類(lèi)群和環(huán)境因子的相關(guān)性(SPSS 20.0);基于Bray-Curtis距離的PCoA用于分析細(xì)菌群落的空間分布格局(R軟件Ape程序包),用ANOSIM分析檢驗(yàn)群落結(jié)構(gòu)的差異性(R軟件Vegan程序包),在Canoco 5軟件中通過(guò)前選擇篩選出對(duì)群落結(jié)構(gòu)有顯著影響的環(huán)境因子,然后通過(guò)冗余分析(RDA)分析細(xì)菌群落和水體理化參數(shù)的關(guān)系。為了揭示細(xì)菌群落間的相互作用,在屬水平采用隨機(jī)矩陣原理(random matrix theory,RMT)構(gòu)建不同時(shí)期微生物共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)[17]。網(wǎng)絡(luò)性質(zhì)參數(shù)及相關(guān)過(guò)程均在Molecular Ecological Network Analyses Pipeline(MENA)(http://ieg4.rccc.ou.edu/mena)網(wǎng)站上完成[18]。為確保在同等條件下進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析,采用0.83的閾值來(lái)構(gòu)建冰封和消融期的兩個(gè)網(wǎng)絡(luò),最后利用Cytoscape 3.6.1軟件將結(jié)果可視化。所有統(tǒng)計(jì)分析的顯著性水平均為95%(P<0.05)。
水體理化參數(shù)在季節(jié)性?xún)鋈谶^(guò)程中發(fā)生了顯著改變。湖面覆冰消融后的4月水體T、DO、、、TC、TOC和IC濃度顯著增高(P< 0.05);而EC和濃度則在12月的冰封期較高(P<0.05);濃度在2個(gè)時(shí)期間沒(méi)有顯著的變化(表1)。
表1 公海湖在消融期和冰封期的水體理化參數(shù)Table 1 Physicochemical parameters in ice-free and ice-cov‐ered periods of Gonghai Lake
在冰封期和消融期的細(xì)菌群落隸屬于53個(gè)門(mén),126個(gè)綱,338個(gè)目,575個(gè)科,1 039個(gè)屬,2 066個(gè)種,5 090個(gè)OTU。相對(duì)豐度>1%的分類(lèi)群定義為優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,相對(duì)豐度<1%的合并為其他(others)。其中6個(gè)門(mén)為優(yōu)勢(shì)門(mén),包括放線菌門(mén)(Actinobacteria)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、藍(lán)藻門(mén)(Cyanobacteria)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)和Patescibacteria(圖2A)。共有27個(gè)優(yōu)勢(shì)屬,其中HgcI_clade是豐度最高的屬,其相對(duì)豐度在冰封期和消融期分別占12.15%和16.82%(圖2B)。
圖2 消融期和冰封期優(yōu)勢(shì)細(xì)菌組成。(A)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén);(B)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬Fig.2 Composition of dominant bacterial taxas during ice free and ice covered periods.(A)Phylum level;(B)Genus level.
對(duì)優(yōu)勢(shì)類(lèi)群相對(duì)豐度的組間差異性分析的結(jié)果顯示,放線菌門(mén)的相對(duì)豐度在消融期顯著高于冰封期,而擬桿菌門(mén)和疣微菌門(mén)的相對(duì)豐度在冰封期較高,其余3個(gè)優(yōu)勢(shì)門(mén)的相對(duì)豐度在季節(jié)性消融過(guò)程中均沒(méi)有發(fā)生顯著變化(圖3A)。在屬水平上,27個(gè)優(yōu)勢(shì)屬中有23個(gè)優(yōu)勢(shì)屬的相對(duì)豐度在湖面覆冰消融過(guò)程中發(fā)生了顯著變化。Fluviicola、LD29、Candidatus_Aquirestis、norank_o__PeM15、GKS98_freshwater_group、norank_f__NS11-12_marine_group、MWH-UniP1_aquatic_group、定慧桿菌(Dinghuibacter)、Terrimicrobium和噬冷菌屬(Algoriphagus)這10個(gè)屬的相對(duì)豐度在冰封期顯著高于消融期;其余13個(gè)屬的相對(duì)豐度則在消融期顯著高于冰封期(圖3B)。優(yōu)勢(shì)類(lèi)群相對(duì)豐度在湖冰凍融過(guò)程中的變化與水體理化參數(shù)有顯著的相關(guān)性,不論是在門(mén)水平還是屬水平不同類(lèi)群相對(duì)豐度的變化主要受T、pH、DO、EC、氮和碳(TC、TOC)等理化因子變化的影響(圖4)。
圖3 消融期和冰封期細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類(lèi)群相對(duì)豐度的變化趨勢(shì)(A)門(mén)水平;(B)屬水平Fig.3 Changes in relative abundance of dominant bacterial taxas during the ice free and ice covered period(A)Phylum level;(B)Genus level
圖4 水體理化參數(shù)和細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類(lèi)群相對(duì)豐度的相關(guān)性熱圖(A)門(mén)水平(B)屬水平Fig.4 Heat map of the correlation between the physical and chemical parameters of the water and the relative abundance of dominant bacterial taxas(A)Phylum level(B)Genus level
細(xì)菌群落的α多樣性在季節(jié)性?xún)鋈谶^(guò)程中發(fā)生了一定的變化。在消融期細(xì)菌群落的OTUs和Simpson指數(shù)顯著高于冰封期(P<0.05),而Shannon指數(shù)在兩個(gè)時(shí)期間沒(méi)有顯著差異(圖5)。OTU數(shù)目與多種理化因子(除了和)存在顯著的相關(guān)性,Simpson指數(shù)主要與TC和TOC顯著相關(guān)(表2)。
圖5 消融期和冰封期細(xì)菌群落的α多樣性Fig.5 Alpha-diversity of bacterial communities during the ice-free and ice-covered periods
表2 細(xì)菌群落α多樣性與水體理化參數(shù)的Spearman相關(guān)性分析Table 2 Spearman Correlation analysis of α-diversity of bacterial community and physicochemical parameters in Gonghai Lake
細(xì)菌群落β多樣性在冰封期和消融期間變化顯著?;贐ray-Curtis距離的PCoA分析結(jié)果顯示,兩個(gè)時(shí)期細(xì)菌群落明顯分離(ANOSIM,R=0.986,P< 0.01),在冰封期不同采樣點(diǎn)的群落更聚集(圖6A)。RDA結(jié)果顯示,細(xì)菌群落β多樣性在2個(gè)時(shí)期的差異主要受水體T、DO、和TOC的顯著影響(F=12.5,P< 0.01,圖6B)。
圖6 消融期和冰封期(A)在OTU水平基于Bray-Curtis距離的細(xì)菌群落PCoA排序圖;(B)細(xì)菌群落與水體理化參數(shù)的RDA分析Fig.6 (A)PCoA ordination of bacterial community distribution pattern based on Bray-Curtis distance at OTU level;(B)RDA analysis of bacterial community and physical and chemical parameters of water in ice-free and ice-covered periods
細(xì)菌群落的共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖(圖7)在冰封期共有93個(gè)節(jié)點(diǎn),155條邊,平均度為3.333,平均聚集系數(shù)為0.298,平均路徑距離為3.671;在消融期節(jié)點(diǎn)數(shù)、邊數(shù)和模塊數(shù)均高于冰封期,共有188個(gè)節(jié)點(diǎn)和677條邊,平均度為7.202,平均聚集系數(shù)為0.277,平均路徑距離為4.049。冰封期正相關(guān)邊數(shù)占82.581%,負(fù)相關(guān)邊數(shù)占17.419%;消融期正相關(guān)邊數(shù)占66.027%,負(fù)相關(guān)邊數(shù)3占3.973%(表3)。兩個(gè)時(shí)期不同屬間主要為正相關(guān)關(guān)系,但由冰封期過(guò)渡到消融期正相關(guān)邊數(shù)占比有所降低,負(fù)相關(guān)邊數(shù)占比提升了將近16%。在冰封期多數(shù)節(jié)點(diǎn)隸屬于變形菌門(mén)(37個(gè)),其次是擬桿菌門(mén)(16個(gè))和放線菌門(mén)(14個(gè));消融期多數(shù)節(jié)點(diǎn)隸屬于變形菌門(mén)(77個(gè)),其次是擬桿菌門(mén)(28個(gè))和放線菌門(mén)(23個(gè))(圖7)。
表3 消融期和冰封期細(xì)菌群落網(wǎng)絡(luò)圖屬性Table 3 Network properties of bacterial community in ice-free and ice-covered periods
圖7 (A)消融期和(B)冰封期細(xì)菌群落共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)Fig.7 Co-occurrence network of bacterial community in(A)ice-free period and(B)ice-covered periods
從冰封期到消融期,細(xì)菌群落的共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)中出現(xiàn)了關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。在消融期共有3個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)分別是norank_f_Rhodocyclaceae、Sphingorhabdus和 氫 噬胞菌屬(Hydrogenophaga),這三個(gè)細(xì)菌屬均隸屬于變形菌門(mén),其中Sphingorhabdus和氫噬胞菌屬為模塊中心點(diǎn),norank_f_Rhodocyclaceae為連接節(jié)點(diǎn)(圖8)。
圖8 消融期和冰封期細(xì)菌類(lèi)群拓?fù)渥饔肍ig.8 Topological roles of bacterial taxas in ice-free and ice-covered periods
微生物豐度和組成的變化往往是對(duì)氣候變化和養(yǎng)分有效性的響應(yīng)[19]。本研究表明,多數(shù)細(xì)菌的相對(duì)豐度在湖冰凍融過(guò)程中發(fā)生了顯著變化,而這與水體的理化參數(shù)變化顯著相關(guān)。季節(jié)性?xún)鋈谥饕捎跍囟茸兓?。溫度可以改變微生物的豐度和代謝活性,對(duì)細(xì)菌群落有選擇作用,同時(shí)對(duì)微生物的季節(jié)動(dòng)態(tài)演替也有很好的預(yù)測(cè)作用[20]。與多數(shù)研究結(jié)果一致,本研究中放線菌門(mén)、變形菌門(mén)、擬桿菌門(mén)為主要優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門(mén),在淡水中廣泛分布。放線菌門(mén)的相對(duì)豐度在消融期顯著高于冰封期,而擬桿菌門(mén)和疣微菌門(mén)的變化趨勢(shì)則相反,在冰封期它們的相對(duì)豐度明顯升高(圖3)。放線菌多數(shù)是好氧菌,多分布在有機(jī)物豐富的地區(qū),屬于放線菌門(mén)的hgcI_clade屬的豐度在消融期顯著高于冰封期,其豐度變化和TOC濃度顯著正相關(guān)。有研究發(fā)現(xiàn)hgcI_clade對(duì)含碳化合物的利用能力較強(qiáng)[21],因此有機(jī)物豐富且DO充足的消融期更適合放線菌的生長(zhǎng)。擬桿菌自身對(duì)低溫嚴(yán)寒有很好的適應(yīng)性[22],所以能夠在冰封期更好的生存,這與在土壤中觀察到的現(xiàn)象一致[23]。疣微菌門(mén)廣泛分布在各個(gè)生境中,在前期的研究中被證明更偏愛(ài)生活在寡營(yíng)養(yǎng)環(huán)境中[24],它們和呈負(fù)相關(guān)關(guān)系(圖4A),在冰封期的相對(duì)豐度顯著高于消融期,歸屬于疣微菌門(mén)的屬LD29被發(fā)現(xiàn)在冰封期的相對(duì)豐度顯著高于消融期(圖3B),冰封期冰蓋減少了外部對(duì)水體的物質(zhì)輸送,湖泊中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)較消融期匱乏(表1),這一時(shí)期可能更適合寡營(yíng)養(yǎng)生活史的疣微菌門(mén)。
消融期細(xì)菌群落的OTUs和Simpson指數(shù)顯著高于冰封期,Shannon指數(shù)也高于冰封期,但未達(dá)顯著水平(圖5)。和已有的研究結(jié)果一致,冰封期細(xì)菌生物量通常較低[25],這可能是由于低溫、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)再礦化減少和陸地有機(jī)物輸入受限等因素所致[26-28]。季節(jié)性?xún)鋈趯?dǎo)致的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生變化主要受T、DO、和TOC的影響(圖6)。許多研究已經(jīng)證實(shí)了水溫是影響水體中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的主要因素[29],而冰封期和消融期的溫度差異顯著(表1)。水溫對(duì)細(xì)菌活性有直接影響,也可通過(guò)調(diào)節(jié)水體中各種生化反應(yīng)、水體中的動(dòng)植物等間接影響其結(jié)構(gòu)和組成。冰封期由于冰層阻隔,冰下水體和外界發(fā)生物質(zhì)交換減少,與消融期相比水體中DO、和TOC含量明顯較少。溶解氧是冬季冰下微生物群落多樣性的限制因子[3],在消融期水體中的溶解氧濃度升高,直接導(dǎo)致需氧細(xì)菌類(lèi)群大量增殖。水體中的和TOC可以通過(guò)上行效應(yīng)對(duì)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生直接影響[30],同時(shí)也可以通過(guò)影響原生動(dòng)物等對(duì)細(xì)菌有捕食作用的生物而對(duì)其造成間接影響[31]。
為了進(jìn)一步研究?jī)鋈谧饔脤?duì)山地湖泊細(xì)菌間相互作用的影響,構(gòu)建了細(xì)菌群落共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖。整體拓?fù)涮卣鞅砻鳎W(wǎng)絡(luò)連通性曲線能較好地?cái)M合冪率模型,R2分別為0.773和0.756,表明網(wǎng)絡(luò)中只有少數(shù)節(jié)點(diǎn)有大量連接。消融期節(jié)點(diǎn)數(shù)和邊數(shù)顯著高于冰封期,說(shuō)明消融期細(xì)菌類(lèi)群間的相互作用更復(fù)雜(表3、圖7)。微生物能對(duì)外界環(huán)境變化作出迅速反應(yīng),網(wǎng)絡(luò)的平均路徑長(zhǎng)度越短,外界干擾越容易在更短的時(shí)間內(nèi)波及整個(gè)網(wǎng)絡(luò)[32-33]。在冰封期共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)的平均路徑短于消融期(3),說(shuō)明在冰封期細(xì)菌群落受外部干擾的敏感性增加,而在消融期隨著湖冰的融化,湖泊環(huán)境條件的改善(與外界物質(zhì)交換不受限,溶解氧含量增加等),細(xì)菌群落對(duì)外部干擾的抵抗能力會(huì)增強(qiáng)。已有的研究表明,越復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)往往對(duì)外界干擾的抵抗力更強(qiáng),對(duì)信息和資源的傳遞也更加高效[34]。
共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)可以代表生態(tài)系統(tǒng)中各種生物間的相互作用,如捕食、競(jìng)爭(zhēng)和互惠共生,各種群通過(guò)相互作用連接在一起,任意兩個(gè)節(jié)點(diǎn)之間的連線代表著微生物間的相互作用或者生態(tài)位共享。正相關(guān)關(guān)系被認(rèn)為是不同物種間的合作和生態(tài)位重疊,而負(fù)相關(guān)關(guān)系是生態(tài)位分離、競(jìng)爭(zhēng)等的結(jié)果[35]。雖然兩個(gè)時(shí)期都是以正相關(guān)邊數(shù)居多,但由冰封期過(guò)渡到消融期,正相關(guān)邊數(shù)占比有所降低,負(fù)相關(guān)邊數(shù)占比提升了將近16%(表3)。這表明雖然各個(gè)類(lèi)群在冰封期和消融期都是以協(xié)同合作為主,但隨著湖面冰層消失,細(xì)菌間競(jìng)爭(zhēng)作用逐漸增強(qiáng),這可能是由于養(yǎng)分的增多導(dǎo)致了細(xì)菌生物量的增加,從而加劇了彼此間的競(jìng)爭(zhēng)作用[18]。也有研究指出,微生物間往往會(huì)形成共同協(xié)作的模式來(lái)共同抵御環(huán)境脅迫[36],這也為上述現(xiàn)象提供了合理的解釋。微生物群落組成的變化往往可以通過(guò)微生物網(wǎng)絡(luò)的模塊變化來(lái)體現(xiàn)[37],消融期更多的模塊數(shù)代表了更高的功能多樣性(圖7,表3)。冰封期節(jié)點(diǎn)最多的細(xì)菌屬于變形菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和放線菌門(mén),消融期節(jié)點(diǎn)最多的細(xì)菌門(mén)和冰封期一致,而這些細(xì)菌類(lèi)群在兩個(gè)時(shí)期均為優(yōu)勢(shì)門(mén),這表明在群落中相對(duì)豐度較高的物種具有較高的交互潛力。不同的節(jié)點(diǎn)可能在網(wǎng)絡(luò)圖中扮演不同的角色,根據(jù)Z-P圖可以識(shí)別微生物網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵物種。從冰封期到消融期,網(wǎng)絡(luò)中關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)增多。消融期共有3個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)(圖8),由此可知,冰封作用導(dǎo)致了微生物網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵物種的減少,使得細(xì)菌類(lèi)群之間的相互作用發(fā)生了改變。
本研究旨在探究細(xì)菌群落的組成和結(jié)構(gòu)在冰封期和無(wú)冰期如何變化。凍融期間細(xì)菌優(yōu)勢(shì)類(lèi)群的相對(duì)豐度受到凍融作用的影響發(fā)生了明顯的改變,冰蓋的形成抑制了一些細(xì)菌類(lèi)群的生長(zhǎng),同時(shí)也促進(jìn)了一些類(lèi)群的生長(zhǎng),各細(xì)菌類(lèi)群的相對(duì)豐度變化趨勢(shì)不一。消融期細(xì)菌群落的α多樣性顯著高于冰封期,且兩個(gè)時(shí)期的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)也具有顯著差異。季節(jié)性?xún)鋈陲@著改變了細(xì)菌各類(lèi)群之間的相互作用,冰消融后細(xì)菌網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性增加,物種之間的競(jìng)爭(zhēng)潛力提高,整個(gè)群落的抗干擾力增強(qiáng)。
山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)2021年5期