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黑木耳59個菌株的遺傳多樣性分析*

2022-02-17 03:21潘春磊王延鋒盛春鴿王金賀于海洋
中國食用菌 2022年1期
關鍵詞:農(nóng)藝黑木耳木耳

潘春磊,王延鋒,盛春鴿,王金賀,張 鵬,于海洋

(黑龍江省農(nóng)業(yè)科學院牡丹江分院,黑龍江 牡丹江 157000)

黑木耳(Auricularia heimuer) 又名光木耳、云耳,隸屬于擔子菌門(Basidiomycota) 傘菌綱(A-garicomycotina) 木耳目 (Agaricomycetes) 木耳科(Auriculariales) 木耳屬 (Auricularia)[1]。黑木耳營養(yǎng)豐富,子實體中含有蛋白質(zhì)、膳食纖維、多糖、氨基酸、黃酮、多酚等物質(zhì)[2-5],微量元素中尤其以鐵的含量最為豐富[6],被譽為食品中的“含鐵冠軍”。黑木耳人工栽培起源于我國,在我國廣泛栽培,目前是我國繼平菇(Pleurotus ostreatus)、香菇(Lentinus edodes) 后的第三大栽培食用菌[7-9],我國也是世界黑木耳產(chǎn)業(yè)發(fā)展最好的國家,據(jù)悉,我國的黑木耳產(chǎn)能高達世界總產(chǎn)能的90%以上[10]。

黑木耳產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,導致其品種數(shù)量也急速增加,然而由于食用菌菌種和種質(zhì)資源的特殊性,導致市場上存在著大量同物異名的現(xiàn)象,極大地限制了食用菌產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展,因此,對種質(zhì)資源進行鑒定和評價分析就顯得尤為重要。SSR分子標記技術在種質(zhì)資源的鑒定評價方面應用極為廣泛[11],卜海東等[12]利用SSR分子標記結合表型形狀構建了寒地梨資源核心種質(zhì),李慧等[13]基于SSR標記構建了平菇栽培品種核心樣本。徐安然等[14]構建了木耳部分種質(zhì)資源的SSR分子身份證。王新新等[15]通過SSR構建了29份雙孢蘑菇菌株的分子身份證,為雙孢蘑菇種質(zhì)資源的研究評價提供了參考。

以農(nóng)藝性狀為基礎的遺傳多樣性研究在植物上得到了廣泛的應用[16]。張向前等[17]對多個燕麥的農(nóng)藝性狀進行調(diào)查;陳影等[18]對木耳進行了以農(nóng)藝性狀為主的多樣性分析,研究燕麥種質(zhì)資源的遺傳多樣性;常艷等[19]對糙皮側耳的農(nóng)藝性狀進行研究,探討各個性狀間的相關性;盛春鴿等[20]以平菇農(nóng)藝性狀為基礎,分析了外引群體和國內(nèi)群體的遺傳差異。以表型為基礎的遺傳多樣性研究國外也有個案,Horvath等[21]通過對梨資源的農(nóng)藝性狀進行調(diào)查,研究其表型多樣性和遺傳結構,Szamosi等[22]對甜瓜種質(zhì)資源進行了農(nóng)藝性狀多樣性分析。

以保藏在黑龍江省農(nóng)業(yè)科學院牡丹江分院的59株主栽黑木耳菌株為試驗材料,通過分子鑒定和農(nóng)藝性狀調(diào)查等方法,對這些菌株的遺傳多樣性進行了客觀的評價,同時也為黑木耳種質(zhì)資源研究提供了一定的理論支持。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

供試材料黑木耳菌株59株,庫存編號AU60~AU96、AU106~AU127,保藏在黑龍江省農(nóng)業(yè)科學院牡丹江分院食用菌研究所。

1.2 試驗方法

1.2.1 供試培養(yǎng)基

1)馬鈴薯綜合培養(yǎng)基(PDA培養(yǎng)基)。

2) 原種和栽培種培養(yǎng)基:木屑78%、麥麩10%、稻糠10%、石灰1%、石膏1%,含水量65%。

1.2.2 全基因組DNA的提取

菌絲DNA的提取使用植物基因組DNA提取試劑盒DP305-03,購自天根生化科技有限公司。

1.2.3 SSR引物、PCR反應體系及數(shù)據(jù)處理

SSR引物、PCR反應體系及數(shù)據(jù)處理方法參考徐安然等[10]的研究結果。引物詳情見表1。

表1 引物名稱及序列Tab.1 Primer name and primer sequence

PCR擴增反應體系:dNTPs 2 μL(2.5 mmol·L-1)、引物0.2 μL~0.3 μL(0.2 mmol·L-1)、10×Ex Taq PCR buffer 2 μL、Ex Taq 0.1 μL(5 U·μL-1)、DNA模板 0.4 μL~0.5 μL,ddH2O 補至 20 μL。

反應程序:94℃預變性5 min;94℃變性30 s,56℃~60℃復性 30 s,72℃延伸 30 s,30 個循環(huán);72℃補齊10 min。聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。

1.2.4 表型試驗設計及出耳管理

試驗于2017年~2019年3年春季在黑龍江省農(nóng)業(yè)科學院牡丹江分院食用菌示范園區(qū)內(nèi)完成,采用隨機區(qū)組設計,3個重復,每個重復60袋。黑木耳栽培采用全光地擺模式,集中開口、集中催芽、集中出耳,割口方式為“Y”字型口。栽培期間注意通風和保持濕度,防止雜菌滋生,特別在耳芽形成后,既要保證濕度又要保證氧氣充足。子實體生長期時,采用“干干濕濕”交替管理方法,直至木耳成熟,進行采摘。

1.2.5 農(nóng)藝性狀測定

供試菌株農(nóng)藝性狀指標和測定方法參考陳影等[23]的部分指標和方法,詳見表2。

表2 黑木耳15個農(nóng)藝性狀的測定方法Tab.2 Value assignment of 15 agronomic traits for Auricularia heimuer

1.2.6 數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計分析

對原基顏色等7個非數(shù)值性狀按照表2所示進行分級賦值后再做數(shù)據(jù)分析,對其他8個數(shù)值性狀進行質(zhì)量化處理,依照王述民[24]描述的方法進行統(tǒng)計,分為10級,1級XiX+2σ,中間每級間隔0.5σ。使用SPSS 23軟件進行聚類及主成分分析,聚類時種質(zhì)間距離采用歐氏距離,類平均(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA) 法。多樣性指數(shù)的計算采用Shannon-Weaver信息指數(shù)。

2 結果與討論

2.1 基于SSR遺傳多樣性分析

基于SSR進行遺傳多樣性分析,59個黑木耳菌株的聚類樹狀圖見圖1。

圖1 59個黑木耳菌株的SSR聚類樹狀圖Fig.1 Dendrogram by cluster analysis based on SSR genetic similarity of 59 strains of Auricularia heimuer

如圖1所示,根據(jù)8對多態(tài)性引物的擴增結果,59個種質(zhì)間的遺傳相似性系數(shù)0.42~1.00,且相似性系數(shù)在0.56處將59個菌株分成4大類,其中最大一類樣本容量較大,共41個菌株。這可能是由于長期人工選擇,導致了雜交育種親緣關系較近的緣故。

2.2 黑木耳農(nóng)藝性狀遺傳多樣性分析

59個菌株的農(nóng)藝性狀研究數(shù)值統(tǒng)計見表3。

表3 59個黑木耳菌株農(nóng)藝性狀統(tǒng)計分析Tab.3 The statistic data of 59 strains of Auricularia heimuer based on agronomic traits

由表3可知,供試菌株的15個農(nóng)藝性狀間存在不同程度的遺傳變異,變異系數(shù)范圍為6%~46%,其中變異最小的是原基形成時間,變異最大的是子實體邊緣特性。遺傳多樣性指數(shù)變化范圍為0.435~2.048,多樣性指數(shù)最小的是原基形成時間,耳片厚度指標的遺傳多樣性指數(shù)最大。

2.3 農(nóng)藝性狀聚類分析及產(chǎn)量回歸模型的構建

15個農(nóng)藝性狀的歐式距離聚類分析結果見圖2。

圖2 15個農(nóng)藝性狀的聚類分析Fig.2 Cluster analysis of 15 agronomic traits

如圖2所示,在歐氏距離10.0處,15個農(nóng)藝性狀被分為兩大類。第一類涵蓋了子實體形狀、子實體腹面褶皺、子實體背面褶皺、子實體邊緣特性、原基顏色、子實體顏色等11個農(nóng)藝性狀,以賦值性狀為主,表明這些賦值性狀彼此之間的相關性較高。第二類涵蓋了產(chǎn)量、耳片長度、耳片寬度等信息,表明這幾個性狀間存在一定程度的相關性。

通過此證據(jù)進一步利用SPSS軟件對數(shù)據(jù)進行挖掘,通過多元逐步回歸分析的方法構建產(chǎn)量(Y)與發(fā)菌時間(X1)、耳片厚度(X2)、耳片長度(X3)、耳片寬度(X4)之間的最優(yōu)回歸模型,得到的回歸方程式為:

由此可見,產(chǎn)量和發(fā)菌時間、耳片厚度、耳片長度呈正相關,與耳片寬度呈負相關。產(chǎn)量性狀與其關系緊密的4個性狀相關程度依次為:耳片厚度(X2)>耳片寬度(X4)>發(fā)菌時間(X1)>耳片長度(X3)。在其他變量保持不變的前提下,耳片厚度每提升一個單位,產(chǎn)量會相應的提升6個單位,耳片厚度是影響產(chǎn)量的重要指標之一。

2.4 主成分分析

對59個菌株的15個農(nóng)藝性狀進行主成分分析,結果見表4。

表4 主成分分析方差解釋Tab.4 Total variance explained by principal component analysis

由表4可知,前4個主成分的累積貢獻率為96.067%,表明這4個因子所含的信息可解釋全部信息量的96%,符合分析要求。

對前4個主成分的載荷矩陣進行分析,見表5。

表5 主成分載荷矩陣Tab.5 Principal component loading matrix

由表5可知,耳片長度、耳片寬度在第1個、第3個主成分上有較高的載荷值,這2個主成分主要解釋了這2個變量,可以把第1個和第3個主成分綜合解釋為子實體形態(tài)性狀指標;產(chǎn)量和耳片寬度2個性狀在第2個主成分上有較高的載荷值,可以把第2個主成分解釋為產(chǎn)量因子;發(fā)菌時間和原基形成時間2個性狀在第4個主成分上有較高的載荷值,可以把第4個主成分解釋為營養(yǎng)發(fā)育因子。此4個主成分分別從營養(yǎng)發(fā)育角度、子實體形態(tài)性狀角度和產(chǎn)量角度綜合評價了木耳菌株。同時這些性狀也是作為木耳菌株特性評價的主要指標。

2.5 基于農(nóng)藝性狀對59個菌株的聚類分析

對59個木耳菌株15個農(nóng)藝性狀進行歐式距離聚類分析,結果見圖3。

圖3 基于農(nóng)藝性狀對59個木耳菌株的聚類分析Fig.3 Cluster analysis of 59 strains of Auricularia heimuer based on agronomic traits

如圖3所示,在歐式距離20的水平上將供試菌株分為兩大類。綜合SSR聚類分析結果和農(nóng)藝性狀可知,此聚類圖與SSR聚類結果關聯(lián)度不大,與農(nóng)藝性狀關聯(lián)度很大。類群1包括AU95、AU113等25個菌株,其最典型的特征是子實體多為典型的元寶型,腹面和背面的褶皺多為平滑型。類群2包括AU71、AU117、AU126等34個菌株,這個類群在歐式距離為16的水平上又分為3個亞類,總體來講,盡管有AU64、AU79、AU70等少數(shù)幾株元寶型子實體菌株編入了這個類群,但這個類群的木耳子實體多數(shù)為菊花型,且腹面背面的褶皺明顯。

3 討論

木耳種質(zhì)資源的評價研究多集中在分子標記的研究方面[25-26],但近年來基于農(nóng)藝性狀的多樣性研究也愈來愈多,農(nóng)藝性狀是實際的感官或測量指標,作為評價種質(zhì)資源多樣性研究的指標一直扮演著極其重要的角色。以農(nóng)藝性狀指標為基礎,結合SSR分子標記,評價了59個木耳菌株的遺傳多樣性,最終發(fā)現(xiàn)分子指標的聚類結果和子實體的農(nóng)藝性狀沒有必然聯(lián)系,兩者只能從不同角度揭示菌株間的遺傳差異。

基于農(nóng)藝性狀的菌株聚類結果將供試菌株分為兩大類群,與子實體形狀及耳片腹面、背面的褶皺情況有極大的關系,但是與耳片長、寬、厚等指標關系不大。15個農(nóng)藝性狀的聚類結果表明,各農(nóng)藝性狀間存在一定的聯(lián)系。多元逐步回歸表明,木耳的產(chǎn)量和發(fā)菌時間、耳片長度、寬度、厚度具有一定的線性關系。在木耳育種進程中,要充分協(xié)調(diào)好外觀、品質(zhì)、產(chǎn)量等性狀,依據(jù)科學的指導和管理,提高生產(chǎn)效益。

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