孟慶坤 譚 昊 顧 卉 駱佳瑩 王菁菁 王傳合 韓 蘇 孫志軍*
心肌梗死是一種致命性疾病,是人類致死的重要原因[1]。在心肌梗死病理生理變化過程中,心肌細(xì)胞缺血缺氧引起的心肌細(xì)胞凋亡對疾病進(jìn)展及預(yù)后起重要作用。而心肌細(xì)胞的凋亡與基因表達(dá)的調(diào)節(jié)密切相關(guān)[2]。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類不具備編碼蛋白質(zhì)的,轉(zhuǎn)錄長度>200 nt的非編碼RNA[3],在心肌梗死的病理生理過程中發(fā)揮重要作用[4-8]。基于之前的研究發(fā)現(xiàn),lncRNA在大鼠心肌梗死邊緣區(qū)有大量差異表達(dá),以及通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)lncRNA存在多種潛在病理機(jī)制作用[9]。為了模擬心肌缺血缺氧狀態(tài),本研究采用低糖缺氧處理大鼠H9C2細(xì)胞,選取lncRNA芯片中差異表達(dá)顯著的NR_027324作為研究對象,驗證在低糖缺氧H9C2細(xì)胞模型中NR_027324的變化,以及與凋亡的關(guān)系。通過觀察沉默NR_027324對心肌細(xì)胞凋亡的影響,以探討NR_027324調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞凋亡的作用機(jī)制,為防治心肌梗死后心肌細(xì)胞凋亡提供理論基礎(chǔ)。
大鼠H9C2心肌細(xì)胞購自萬類生物技術(shù)有限公司。si-RNA載體由萬類生物技術(shù)有限公司合成。轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine TM2000:Invitrogen,Thermo Fisher Scientific,Inc.,美國。DMEM培養(yǎng)基:Gibco;Thermo Fisher Scientific, Inc.,Waltham,MA,美國。胎牛血清:FBS;EverGreen,浙江天杭生物科技有限公司。TRIpure試劑(Cat. No. RP1001):北京百泰克生物技術(shù)有限公司。Super M-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶(Cat. No. PR6502):北京BioTeke Corporation。SYBR GREEN mastermix(Cat. No. SY1020):北京索萊寶科技有限公司。特異性引物:上海生工生物科技。全蛋白提取試劑盒(cat. no. WLA019)、BCA蛋白濃度測定試劑盒(cat.no.WLA004):萬類生物技術(shù)有限公司。Bax,Bcl-2,cleaved caspase-3,cleaved caspase-9抗體:萬類生物技術(shù)有限公司。辣根過氧化物酶標(biāo)記的二抗:萬類生物技術(shù)有限公司。ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒:萬類生物技術(shù)有限公司。乳酸脫氫酶測定試劑盒(cat.no. WLA072):萬類生物技術(shù)有限公司。
1.2.1 細(xì)胞的培養(yǎng)和低糖缺氧處理、si-RNA轉(zhuǎn)染和分組 采用含10%胎牛血清的高糖DMEM培養(yǎng)基于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)H9C2細(xì)胞,3 d后換液,當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá)到50%時,胰酶消化后,進(jìn)行傳代。si-RNA分子序列設(shè)計合成:選取NR_027324序列進(jìn)行分析,依據(jù)si-RNA原則設(shè)計3條lncRNA NR_027324干擾序列,并設(shè)計一條陰性對照序列。qRT-PCR檢測si-RNA轉(zhuǎn)染效率。細(xì)胞轉(zhuǎn)染:將對數(shù)生長期H9C2細(xì)胞接種于6孔板中(每孔1×105個細(xì)胞),并在37 ℃,5%CO2下孵育24 h。采用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染法,用20 nmol/L最終劑量的小干擾RNA(si-Lnc)或小干擾RNA陰性對照(si-Lnc-NC),使用Lipofectamine 2000根據(jù)制造商的規(guī)程,瞬時轉(zhuǎn)染細(xì)胞,孵育24 h。
實驗分組:對照組(Con):在高葡萄糖(4.5 g/L)的DMEM培養(yǎng)基中添加10%胎牛血清,溫度37 ℃和5%CO2。低糖缺氧組(oxygen and glucose deprivation,OGD):在低葡萄糖(1.0 g/L)DMEM中培養(yǎng),將其置于含1% O2、94%N2和5%CO2的低氧培養(yǎng)箱中培養(yǎng)6 h。沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組(si-Lnc-NC+OGD):轉(zhuǎn)染小干擾RNA陰性對照(si-Lnc-NC)后,給予低糖缺氧培養(yǎng)6 h。沉默NR_027324+低糖缺氧組(si-Lnc+OGD):轉(zhuǎn)染小干擾RNA(si-Lnc)后,給予低糖缺氧培養(yǎng)6 h。
1.2.2 逆轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)分析使用TRIpure試劑提取總RNA。使用Nanodrop 2000系統(tǒng)(Thermo Fisher Scientific,Inc,美國)測量RNA的濃度和純度。根據(jù)制造商的規(guī)程,使用Super M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶合成互補DNA(cDNA)。根據(jù)制造商的規(guī)程,使用SYBR GREEN mastermix對cDNA樣品進(jìn)行擴(kuò)增。利用韓國BIONEER公司生產(chǎn)的ExicyclerTM 96熒光定量儀進(jìn)行熒光定量分析。mRNA和lncRNA的PCR反應(yīng)條件如下:在94 ℃下持續(xù)5 min,然后進(jìn)行40個循環(huán),分別是94 ℃下持續(xù)10 s和60 ℃下持續(xù)20 s。另外,對每個孔使用雙蒸水(ddH2O)作為非模板對照。使用β-actin用于標(biāo)準(zhǔn)化NR_027324的表達(dá)水平。相對表達(dá)通過2-△△Ct法定量,并進(jìn)行了3次重復(fù)。取3次結(jié)果的中位數(shù)計算相對表達(dá)水平。PCR引物序列見表1。
表1 PCR引物序列
1.2.3 乳酸脫氫酶(LDH)檢測 分別轉(zhuǎn)染后,收集各組細(xì)胞上清液,采用LDH測定試劑盒,按照說明書的方案檢測LDH以確定細(xì)胞損傷,在490 nm的酶聯(lián)免疫檢測儀(ELX-800,BIOTEK,美國)測量每一孔的吸光度,每組重復(fù)3次。
1.2.4 噻唑藍(lán)比色法(MTT)檢測 按實驗分組將細(xì)胞接種于96孔板中,每孔細(xì)胞量5×103個,每組設(shè)置5個復(fù)孔,并設(shè)置一對照孔,只加培養(yǎng)基。待細(xì)胞貼壁后進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,置于37 ℃培養(yǎng)24 h,分別按分組進(jìn)行低糖缺氧處理。到達(dá)時間點后,棄去培養(yǎng)基,每孔加入20 μl MTT試劑,37 ℃、5%CO2孵育4 h,棄孔內(nèi)上清液,然后每孔加入150 μl二甲基亞砜(DMSO),避光靜置10 min,在570 nm的酶聯(lián)免疫檢測儀測量每一孔的吸光度,計算5孔的平均值。計算細(xì)胞成活率。細(xì)胞成活率=OD值實驗組/OD值對照組。
1.2.5 蛋白質(zhì)免疫印跡法檢測蛋白表達(dá) 收集各組細(xì)胞,使用全蛋白提取試劑盒裂解總蛋白。使用BCA蛋白濃度測定試劑盒測量蛋白質(zhì)的濃度和純度。每泳道40 μg的蛋白質(zhì)樣品在SDS-PAGE凝膠上分離(10%),并轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯膜(PVDF)上。在室溫下,將膜在5%脫脂牛奶中封閉2 h,然后與一抗孵育在4 ℃下過夜。然后將膜用TBST洗滌3次,與辣根過氧化物酶標(biāo)記的二抗在37 ℃下孵育45 min,然后進(jìn)一步用TBST洗滌6次。隨后,使用ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒檢測印跡,并用凝膠圖象處理系統(tǒng)(Gel-Pro-Analyzer軟件)分析目標(biāo)條帶的光密度值。
采用SPSS 26.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,所有符合正態(tài)分布的計量資料以±s表示,組間比較采用單因素方差分析,兩兩比較行事后比較-最小顯著性差異法t檢驗(post-hoc LSD-t檢驗),雙側(cè),P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
與對照組相比,低糖缺氧組NR_027324表達(dá)量明顯上調(diào),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.001)。低糖缺氧組較對照組LDH升高(P<0.001),成活率下降(P<0.001)。見表2。
表2 低糖缺氧處理H9C2細(xì)胞的NR_027324表達(dá)、LDH、細(xì)胞成活率變化(±s)
表2 低糖缺氧處理H9C2細(xì)胞的NR_027324表達(dá)、LDH、細(xì)胞成活率變化(±s)
注:與對照組比較,aP<0.001;Con,對照組;OGD,低糖缺氧組
組別 NR_027324相對表達(dá)量 LDH(U/L) 細(xì)胞成活率(%)Con 1.004±0.106 55.128±5.875 0.318±0.043 OGD 2.081±0.088a 114.744±2.938a 0.164±0.020a
與沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組比較,沉默NR_027324+低糖缺氧組中NR_027324的相對表達(dá)量顯著下降76.78%(P<0.001)。沉默NR_027324+低糖缺氧組中LDH與沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組比較進(jìn)一步升高(P<0.001);成活率下降(P<0.001)。沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組與低糖缺氧組(不進(jìn)行轉(zhuǎn)染)比較NR_027324的相對表達(dá)量、LDH、成活率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表3。
表3 沉默NR_027324后低糖缺氧H9C2細(xì)胞的NR_027324表達(dá)、LDH、細(xì)胞成活率變化(±s)
表3 沉默NR_027324后低糖缺氧H9C2細(xì)胞的NR_027324表達(dá)、LDH、細(xì)胞成活率變化(±s)
注:與si-Lnc+OGD組比較,aP<0.001;OGD,低糖缺氧組;si-Lnc-NC+OGD,沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組;si-Lnc+OGD,沉默NR_027324+低糖缺氧組
組別 NR_027324相對表達(dá)量 LDH(U/L) 細(xì)胞成活率(%)OGD 2.081±0.088a 114.744±2.938a 0.164±0.020a si-Lnc-NC+OGD 1.996±0.056a 118.269±2.885a 0.179±0.019a si-Lnc+OGD 0.4images/BZ_106_903_2939_908_2939.png63±0.016 173.397±4.934 0.094±0.015
蛋白質(zhì)免疫印跡法檢測結(jié)果顯示與對照組比較,低糖缺氧組H9C2細(xì)胞促凋亡相關(guān)蛋白Bax,cleaved-caspase3和cleaved-caspase9表達(dá)增加,抑制凋亡蛋白Bcl-2表達(dá)下降。沉默NR_027324+低糖缺氧組與沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組比較,H9C2細(xì)胞促凋亡相關(guān)蛋白Bax,cleaved-caspase3和cleaved-caspase9表達(dá)增加,抑制凋亡蛋白Bcl-2表達(dá)下降。沉默NR_027324陰性對照+低糖缺氧組與低糖缺氧組(不進(jìn)行轉(zhuǎn)染)比較,凋亡相關(guān)蛋白差異變化不明顯。見圖1。
圖1 低糖缺氧處理H9C2細(xì)胞及轉(zhuǎn)染小干擾RNA沉默NR_027324后凋亡相關(guān)蛋白表達(dá)(蛋白質(zhì)免疫印跡法)
有研究表明,原代大鼠心肌細(xì)胞經(jīng)過低糖缺氧損傷(oxygen and glucose deprivation, OGD)干預(yù)4 h后,細(xì)胞成活率降低,LDH釋放增多[10]。本研究結(jié)果與上述研究結(jié)果趨于一致,低糖缺氧損傷的H9C2細(xì)胞中,與對照組比較,LDH明顯升高,MTT提示細(xì)胞成活率下降。本研究中蛋白質(zhì)免疫印跡法檢測結(jié)果顯示低糖缺氧大鼠H9C2細(xì)胞中促凋亡相關(guān)蛋白Bax,cleaved-caspase3和cleaved-caspase9表達(dá)增加,抑制凋亡蛋白Bcl-2表達(dá)下降,提示凋亡激活。心肌細(xì)胞凋亡是心肌梗死中導(dǎo)致心肌細(xì)胞損傷的重要原因。多種凋亡相關(guān)基因的異常表達(dá)可促進(jìn)或抑制心肌細(xì)胞凋亡,如Bax、Bcl-2和caspase-3、caspase-9等[11]。Caspase是一類與凋亡密切相關(guān)的蛋白水解酶家族,活化的cleaved caspase-9 是線粒體細(xì)胞凋亡途徑的啟動者,進(jìn)而激活細(xì)胞凋亡的執(zhí)行者cleaved caspase-3蛋白,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[12]。在之前的研究通過芯片技術(shù)分析心肌梗死邊緣區(qū)的lncRNA表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)lncRNA在心肌梗死邊緣區(qū)有大量差異表達(dá)[9]。其中l(wèi)ncRNA NR_027324表達(dá)上調(diào),重注釋分析提示其為H19基因的一段。有研究結(jié)果顯示H19基因?qū)π募〖?xì)胞缺氧損傷具有保護(hù)作用[13-14]。本研究采用低糖缺氧環(huán)境中培養(yǎng)H9C2細(xì)胞的方法模擬大鼠心肌梗死邊緣區(qū)缺血缺氧狀態(tài),研究NR_027324在其中發(fā)揮的作用。結(jié)果顯示,給予沉默NR_027324處理后,低糖缺氧損傷的H9C2細(xì)胞中Bax,cleavedcaspase3和cleaved-caspase9表達(dá)進(jìn)一步增加,抑制凋亡蛋白Bcl-2表達(dá)進(jìn)一步下降。對低糖缺氧損傷的H9C2細(xì)胞進(jìn)一步沉默NR_027324后,LDH進(jìn)一步升高提示細(xì)胞損傷進(jìn)一步加劇,MTT法檢測細(xì)胞成活率進(jìn)一步下降。我們認(rèn)為,NR_027324與低糖缺氧的心肌細(xì)胞凋亡明確相關(guān),沉默NR_027324后能夠促進(jìn)凋亡發(fā)生。進(jìn)而推論NR_027324可能是一種保護(hù)性lncRNA,抑制低糖缺氧H9C2細(xì)胞中的凋亡過程。心肌細(xì)胞經(jīng)過6 h的低糖缺氧干預(yù)后,NR_027324表達(dá)上調(diào),給予沉默其表達(dá)后,凋亡相關(guān)蛋白表達(dá)增加,使LDH釋放增多、細(xì)胞成活率進(jìn)一步下降,反之,低糖缺氧損傷后的NR_027324表達(dá)上調(diào)可能是細(xì)胞應(yīng)對缺血缺氧導(dǎo)致凋亡增加的一種應(yīng)激性自我保護(hù)機(jī)制。內(nèi)源競爭RNA(competing endogenous RNAs, ceRNA)是lncRNA通過內(nèi)源競爭結(jié)合的方式調(diào)節(jié)miRNAs的表達(dá),進(jìn)而發(fā)揮在轉(zhuǎn)錄后翻譯水平調(diào)控靶基因表達(dá)的一種作用方式。重注釋分析提示NR_027324為H19基因的一段,通過生物信息學(xué)分析預(yù)測miR-103-3p可能為其結(jié)合靶點。而在大鼠心肌細(xì)胞中miR-103-3p能夠下調(diào)Atg5的蛋白表達(dá)[15]。我們大膽推測NR_027324可能通過ceRNA的方式調(diào)節(jié)miR-103-3p表達(dá),繼而調(diào)節(jié)下游靶點ATG5的表達(dá),來調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞凋亡。上述推論尚需進(jìn)一步研究證實。
綜上所述,NR_027324能夠調(diào)節(jié)低糖缺氧的大鼠心肌細(xì)胞凋亡過程。在低糖缺氧的大鼠心肌細(xì)胞中,lncRNA NR_027324可能是減少心肌細(xì)胞凋亡的一個可能的治療靶點。不可忽視的是,隨著心肌梗死的時間演變,凋亡也存在動態(tài)變化,lncRNA在其中發(fā)揮的作用可能也有著動態(tài)的變化,需要進(jìn)一步研究證實。