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鹽生植物內(nèi)生菌多樣性與募集研究進(jìn)展

2022-03-15 05:39:56穆耶賽爾奧斯曼祖力胡瑪爾肉孜田永芝安登第
中國野生植物資源 2022年11期
關(guān)鍵詞:鹽生定殖類群

穆耶賽爾·奧斯曼,祖力胡瑪爾·肉孜,田永芝,安登第

(新疆師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,新疆 烏魯木齊 830054)

鹽生植物是能夠在高鹽度(>200 mmol/L NaCl)土壤中生長的一類植物,僅占植物種類的約1%[1],但它們對鹽堿土壤特別是荒漠生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定發(fā)揮著重要作用。全世界有10億公頃的土地受鹽堿的影響[2]并以每年10%的速度遞增[3],故此鹽生植物對全球生態(tài)系統(tǒng)安全特別是人類可持續(xù)發(fā)展至關(guān)重要。

研究已證實(shí)所有植物的生長發(fā)育均與環(huán)境及體內(nèi)微生物相關(guān),其中共生微生物是植物生態(tài)多樣性產(chǎn)生的動(dòng)力并具有決定性作用[4-5],且物種的進(jìn)化也是由共生微生物推動(dòng)的[6-7],亦表明鹽生植物適應(yīng)高鹽度的機(jī)制與高度專一的、耐鹽的內(nèi)生和根際微生物相關(guān),這些微生物可促進(jìn)植物生長和對不利環(huán)境的耐受[8-13]。故此了解鹽生植物內(nèi)生菌多樣性及募集策略對揭示共生抗逆機(jī)制及將其應(yīng)用于環(huán)境改良有重要價(jià)值。

1 脅迫塑造鹽生植物內(nèi)生菌類群

植物與微生物共生是自然界的普遍現(xiàn)象,研究顯示地球上約30萬種植物中,每種都是一種或多種內(nèi)生菌的宿主,內(nèi)生菌種類從數(shù)個(gè)到數(shù)百個(gè)不等[14]。作為鹽生植物,其遭受的非生物因子脅迫,特別是陰陽離子脅迫比其它植物更為嚴(yán)重,但它們?nèi)匀豢梢陨娌l(fā)展壯大,其原因之一是與共生微生物的協(xié)同作用,已有大量報(bào)道證實(shí)了與鹽生植物相關(guān)的內(nèi)生細(xì)菌具有促進(jìn)宿主生長及提高鹽耐受的特性[8,15-17],如分離自耐鹽水稻的內(nèi)生鐮刀霉屬(Fusariumsp.)真菌接種到鹽敏品種IR-64上可促進(jìn)其在鹽脅迫下的生長并提高植株同化率、葉綠素穩(wěn)定性等[18],顯示了內(nèi)生菌在宿主環(huán)境適應(yīng)中的重要價(jià)值。

植物體內(nèi)微環(huán)境被認(rèn)為是相對穩(wěn)定的[19-20]且營養(yǎng)豐富,為內(nèi)生菌生存提供了良好條件,內(nèi)生菌多樣性與組成似乎也應(yīng)相對穩(wěn)定,但其實(shí)內(nèi)生菌多樣性與多種植物、細(xì)菌和環(huán)境因素[21]相關(guān),其中一些微生物似乎只適合生活在植物體內(nèi),如存在于鹽生植物(Arthrocnemum macrostachyum)體內(nèi)的加拿大嗜色鹽桿菌(Chromohalobacter canadensis)和此前從未作為內(nèi)生菌報(bào)道過的Rudaea cellulosilytica,以及嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)和鹽單胞菌屬(Halomonas)等部分菌株,并不能總在其宿主生長的土壤中被檢測到[22],也無法證實(shí)這些類群是由種子傳播的;而加拿大嗜色鹽桿菌在低鹽度植物體內(nèi)豐度低,但一旦在高鹽環(huán)境的植物中定居就會(huì)獲得優(yōu)勢[22]。此現(xiàn)象有悖于常識(shí),但似乎可用代謝重置(Metabolism reconfiguration)[23]來解釋,即生存于高鹽環(huán)境的植物會(huì)被激活特定的生理和分子反應(yīng)而導(dǎo)致代謝變化,從而為特定微生物提供更適合的營養(yǎng)或更適宜的環(huán)境。

土壤鹽梯度直接影響立地植物多樣性[24]和土壤微生物多樣性,隨鹽度增加微生物多樣性降低[25],而內(nèi)生菌來源于土壤是公認(rèn)的事實(shí)[26],故此植物內(nèi)生菌多樣性必然受土壤鹽梯度的影響,如高鹽度環(huán)境鹽角草(Salicornia europaea)內(nèi)生細(xì)菌OTUs的數(shù)量較高,變形菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteriodetes)為優(yōu)勢菌門,而低鹽區(qū)厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)和綠彎菌門(Chloroflexi)的數(shù)量較多[27],且鹽脅迫可促進(jìn)內(nèi)生菌與植物的結(jié)合[28],顯示鹽脅迫可塑造內(nèi)生菌多樣性和類群結(jié)構(gòu),而不同種類的植物通過根分泌物介導(dǎo)根際微生物的豐度和活力[29]是內(nèi)生菌物種特異性的基礎(chǔ)。

植物體內(nèi)離子濃度受土壤含鹽量的影響[30]進(jìn)而對內(nèi)生菌組成施加影響,其中最顯著的是植物的根,研究顯示鹽脅迫會(huì)導(dǎo)致植物根70%以上的內(nèi)生菌類群發(fā)生變化[31]。Szymańska等[11]對波蘭中部的兩個(gè)鹽梯度(55 dS·m-1和112 dS·m-1)鹽堿地的鹽角草根可培養(yǎng)內(nèi)生菌分析顯示,主要類群硬壁菌門和放線菌門源自低鹽區(qū)的分別占40.9%和36.4%,而源自高鹽區(qū)的則分別占31.8%和27.3%,顯示鹽度可降低優(yōu)勢菌群的豐度;采用高通量測序技術(shù)對生長在兩種鹽濃度土壤(113 dS·m-1和64 dS·m-1)的鹽角草根內(nèi)生菌多樣性分析顯示,高鹽分土壤鹽角草內(nèi)生菌主要類群包括浮霉菌門(Planctomycetes)和酸桿菌門(Acidobacteria),低鹽度土壤上內(nèi)生菌主要類群為厚壁菌門、放線菌門和綠彎菌門,變形菌門和擬桿菌門(Bacteriodetes)是兩個(gè)鹽度共有的優(yōu)勢菌門[27]。我國新疆古爾班通古特沙漠的鹽角草根、莖和枝的可培養(yǎng)內(nèi)生菌則以放線菌門(65.6%)為主,其次為硬壁菌門(18.8%)和變形菌門(15.6%)[32],顯著區(qū)別于波蘭鹽角草。二者的區(qū)別是受原生境土壤理化性質(zhì)影響,亦或是受鹽梯度影響?依據(jù)目前資料尚難以做出判斷。但You等[33]對三個(gè)地理環(huán)境的三種濱海鹽生植物內(nèi)生真菌的研究顯示,不同物種間內(nèi)生菌類群差異巨大,且內(nèi)生菌對鹽的耐受性與宿主鹽環(huán)境相關(guān),高鹽環(huán)境植物的內(nèi)生菌對鹽的耐受性更高,顯示植物內(nèi)環(huán)境并非之前認(rèn)為的那樣溫和,其對內(nèi)生菌的生物學(xué)特性似乎具有“馴化”作用,即高鹽環(huán)境導(dǎo)致植物體內(nèi)離子濃度增加,進(jìn)而“富集”了耐鹽類群或通過脅迫“馴化”了固有類群的耐鹽能力。

鹽梯度不僅影響鹽生植物內(nèi)生菌的多樣性,也會(huì)影響植物不同器官的內(nèi)生菌組成[28]。Bibi等[34]對豬毛菜(Salsola imbricate)內(nèi)生菌的分離鑒定顯示,根內(nèi)生菌優(yōu)勢類群是放線菌門,而葉中為硬壁菌門。Furtado等[35]對鹽角草的分析顯示,幼芽中的細(xì)菌多樣性顯著低于根,根內(nèi)生菌群落的變異也明顯高于枝條,且不同組織的微生物類群亦差異顯著。對鹽生植物補(bǔ)血草(Limonium sinense)內(nèi)生菌的可培養(yǎng)與非培養(yǎng)分析也顯示根與葉存在顯著差異[36],顯示內(nèi)生菌類群也具有組織特異性。

2 鹽生植物內(nèi)生菌募集

共生是微生物與宿主相互選擇的結(jié)果[37-38],植物體內(nèi)微生物群落的建立是由特定的規(guī)則控制的[39-40],作用于宿主的選擇壓力會(huì)影響相關(guān)微生物群落,并為宿主選擇適合的微生物,從而影響植物的適應(yīng)性[41],而鹽生植物可能招募特定的細(xì)菌來增強(qiáng)它們對惡劣環(huán)境的耐受能力[36]。

內(nèi)生菌定殖是一個(gè)復(fù)雜的過程,可以分為五個(gè)階段:(1)游離于土壤中的微生物識(shí)別根分泌物并趨向運(yùn)動(dòng);(2)吸附于根表面;(3)形成生物膜;(4)穿透根表面;(5)定殖于植物內(nèi)部[42-43]。內(nèi)生菌的定殖是通過一系列包括運(yùn)動(dòng)性、附著、植物聚合物降解和逃避植物防御等特性實(shí)現(xiàn)的[21],其定殖過程的每一個(gè)階段都是由各種生物分子推動(dòng)雙方基因表達(dá)而實(shí)現(xiàn)的[44],其中微生物感應(yīng)和快速響應(yīng)植物信號并侵入宿主體內(nèi)的的能力是其定殖成功的關(guān)鍵。定殖首先是自由生活的細(xì)菌向根的趨化并附著在根表面,其中甲基受體趨化蛋白(MCPs)在第一階段起主要作用,這是一類跨膜傳感器,可以探測到細(xì)菌周圍的分子,從而引導(dǎo)它們接近或遠(yuǎn)離植物根部[45],而定殖過程與細(xì)菌運(yùn)動(dòng)性[46-47]、附著[48-49]、成功攻擊植物根表面[50-51]及適應(yīng)體內(nèi)環(huán)境[52]等均相關(guān)。

內(nèi)生菌的主要來源是根際[53-54]。研究認(rèn)為內(nèi)生菌源于土壤微生物群落在趨化作用下定殖于根[40,55-56],然后遷移到地上部分,或通過垂直(種子)傳播[57]而建立。植物根是內(nèi)生細(xì)菌數(shù)量最多、種類最豐富的器官[58],擁有大量微生物物種的土壤是微生物的“種子庫”,這些微生物的特性會(huì)影響植物的生理和根系分泌物的分布,進(jìn)而對根內(nèi)微生物的組成結(jié)構(gòu)產(chǎn)生重要影響[59]。試驗(yàn)證實(shí),接種到土壤的細(xì)菌首先在根際定殖[60],然后附著在根表面形成細(xì)胞串[61],之后在根表面和一些根真皮細(xì)胞定殖,形成微菌落或生物膜[62]。Wagner等[63]對一種多年生野芥屬植物Boechera stricta的研究表明,細(xì)菌群落在葉片和根系中具有高度相似性,表明細(xì)菌群落是從土壤中募集的[42]。Mora-Ruiz等[22]對鹽生植物Arrocnemum macrostachyum的根、綠莖和紅莖三個(gè)部位的內(nèi)生菌多樣性分析顯示,從根到紅葉其多樣性逐步減少,即細(xì)菌的定殖源于根際土壤,隨后通過根遷移到植物的空中部分,故此認(rèn)為植物內(nèi)生菌來源于土壤。

植物只能募集已經(jīng)存在于土壤中的微生物[54],故此土壤對植物內(nèi)部共生微生物組成和多樣性有決定作用,而土壤理化性質(zhì)是決定其中細(xì)菌種類組成的主要因素,根區(qū)土壤含鹽量是影響鹽角草內(nèi)生菌菌群構(gòu)建的主要因素,高鹽分土壤中δ-變形菌門(Deltaproteobacteria)、酸桿菌門、暖發(fā)菌門(Caldithrix)、纖維桿菌門(Fibrobacteres)和疣微菌門(Verrucomicrobia)顯著較多說明鹽生細(xì)菌在緩解鹽生植物的鹽脅迫方面具有潛在的作用[27]。同時(shí)土壤陰陽離子對內(nèi)生菌組成也有直接影響,如Szymańska等[27]報(bào)道,內(nèi)生細(xì)菌群落與土壤CaCO3、電導(dǎo)率(ECe)、Na+、K+、Mg2+、Cl-、SO2-4、HCO3-呈正相關(guān)。但鹽堿土壤中微生物多樣性隨鹽濃度的增加呈線性下降,高鹽會(huì)降低微生物多樣性而增加相對豐度,細(xì)菌類群在鹽濃度3.5~4.5%與4.5~5.5%之間相似,但與1.5~2.0%和7.5~8.5%間顯著不同[25],高鹽脅迫會(huì)增加微生物在根的定殖速率,表明鹽脅迫促進(jìn)了內(nèi)生菌與植物的結(jié)合[28]。鹽生植物A.macrostachyum是可耐受高達(dá)1030 mmol/L NaCl的一種植物[30],其內(nèi)生菌組成在不同鹽度土壤中生長時(shí)與相應(yīng)的根際土壤群落共享9%到53%[22],證實(shí)根定殖是其內(nèi)層組成的主要貢獻(xiàn)者[40]。

植物對內(nèi)生菌的募集是其相互間復(fù)雜交流的過程,微生物須識(shí)別根系分泌物中的特定化合物,而植物產(chǎn)生這些根分泌物是為了獲得自身的生態(tài)優(yōu)勢[64]。當(dāng)然這個(gè)募集過程也受到植物內(nèi)環(huán)境和遺傳因素[65]的影響,而一旦進(jìn)入根部,內(nèi)生細(xì)菌就可以系統(tǒng)地感染鄰近的植物組織而成為內(nèi)生菌,并通過對宿主的代謝與基因表達(dá)的調(diào)控而提高其環(huán)境適應(yīng)性。

3 展望

內(nèi)生菌賦予宿主植物更廣泛的環(huán)境適應(yīng)能力,而微生物是否可以成為內(nèi)生菌受多種因素的影響和限制。首先是宿主植物通過根系分泌物組建根際微生物群落,盡管此過程看似是由植物決定的,但實(shí)際上土壤固有微生物類群才是關(guān)鍵;被富集的微生物依趨化效應(yīng)接近并在宿主根表面附著,然后啟動(dòng)相應(yīng)的侵入機(jī)制感染植物并在成功逃避宿主免疫系統(tǒng)后成為內(nèi)生菌。進(jìn)入植物體內(nèi)的微生物相互間還會(huì)產(chǎn)生強(qiáng)烈的相互作用,包括對生態(tài)位和營養(yǎng)的競爭、對宿主代謝的調(diào)控、自身對內(nèi)環(huán)境的適應(yīng)等,一方面獲得自身的生存空間,另一方面對宿主產(chǎn)生或正面、或負(fù)面(如病原菌)的影響。在全面了解微生物對宿主的調(diào)控機(jī)制的基礎(chǔ)上,采用對土壤施用微生物肥料(接種)的方式調(diào)控內(nèi)生菌類群是利用微生物增強(qiáng)植物環(huán)境適應(yīng)性的重要措施,特別對于鹽生植物而言,選取耐鹽且可內(nèi)生的菌株接種于土壤,是拓展鹽生植物環(huán)境適應(yīng)性的有效手段,必將對利用微生物促進(jìn)鹽堿地植物生長改善環(huán)境起到積極作用。

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