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桃葉蓼白粉菌的顯微觀察及進(jìn)化關(guān)系分析

2022-04-15 06:08:18王占斌陳黃欣
中國農(nóng)學(xué)通報 2022年9期
關(guān)鍵詞:桃葉子囊白粉

孫 博,劉 閏,王占斌,陳黃欣,閻 肅

(東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,哈爾濱 150040)

0 引言

桃葉蓼(Polygonum persicariaL.)是一年生的草本植物,在植物分類學(xué)上屬于蓼科(Polygonaceae)蓼屬(PolygonumL.),桃葉蓼廣泛分布于中國各地,如東北(黑龍江、吉林、遼寧)、華北、華南等地,多在夏季6—9月開花,開花后一個月結(jié)果。桃葉蓼是一種藥用草本植物,全草可入藥,具有祛除濕氣,助消化,除腸道寄生蟲的功效,還可用于治療感冒,腹瀉等。桃葉蓼白粉病是桃葉蓼一種常見的病害,在生長期幾乎每年都普遍發(fā)生。桃葉蓼白粉病具有發(fā)病時間短,流行速度快的特點(diǎn),在陰雨和高濕的條件下適宜發(fā)生[1]。葉片葉柄均可發(fā)病,中下部葉片先發(fā)病,逐漸向上部葉片蔓延[2],起初葉片會產(chǎn)生細(xì)小、淡白色的病斑,后逐漸擴(kuò)大成灰白色粉末狀,嚴(yán)重時會覆蓋整個葉片[3],對桃葉蓼的生長發(fā)育造成嚴(yán)重影響。因此期望能通過本實(shí)驗(yàn)對菌種的分類鑒定為桃葉蓼白粉病的防治提供依據(jù)。

桃葉蓼白粉病原菌在菌物分類學(xué)上分屬于叉絲殼屬,而叉絲殼屬是白粉菌中其中一個重要的屬。1851年,法國人J.H.Leveille建立此屬,迄今為止全世界共報道約70余種。中國叉絲殼屬的種比較多,根據(jù)鄭儒永等人主編的《中國真菌志》第一卷記載有41個種和變種,寄生在19科34屬植物上[4-5]。目前關(guān)于桃葉蓼白粉病的相關(guān)研究在國內(nèi)外都比較少見,在國外可見少量的關(guān)于近似物種萹蓄(Polygonum aviculare)的研究報道,國內(nèi)僅有王偉等[6]曾對萹蓄白粉病進(jìn)行過專項(xiàng)研究報道,但其病原菌的報道最早可以追溯到1913年[7]。

一般情況下,白粉病病原鑒定工作主要是根據(jù)病原菌無性階段形態(tài)特征、分生孢子萌發(fā)方式和有性階段閉囊殼的顯微觀察差異判斷[8],但因?yàn)槠錈o性階段形態(tài)差異較小,有性階段的閉囊殼也不是一直能夠觀察到,所以分類鑒定工作一直相對困難。近年來隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展,rDNA轉(zhuǎn)錄內(nèi)間隔區(qū)(internal transcribedspacer,ITS)和28S rDNA D1/D2區(qū)已被廣泛應(yīng)用于菌物分類鑒定、系統(tǒng)發(fā)育和親緣關(guān)系等研究[9]。為了明確桃葉蓼白粉病病原種類及其分類地位,本文將通過對形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)方法對病原進(jìn)行鑒定和分類[10]。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

白粉菌樣本(TL190501)于2018年05月13日采自黑龍江省哈爾濱市外灘濕地生態(tài)公園,寄主植物為桃葉蓼(Polygonum persicariaL.)。提取白粉菌基因組DNA的試劑盒購自上海生工生物工程股份有限公司。

1.2 實(shí)驗(yàn)方法

1.2.1 白粉菌形態(tài)學(xué)觀察 用刀片輕輕刮或解剖針挑取桃葉蓼葉片表面的白色菌絲及分生孢子、閉囊殼制成臨時玻片,光學(xué)顯微鏡觀察分生孢子、子囊孢子大小、形狀,閉囊殼大小、形狀,附屬絲的相關(guān)特征。如病原菌不能很好地展開則輕輕敲擊蓋玻片,使得閉囊殼開裂釋放其內(nèi)部的子囊以及子囊孢子,統(tǒng)計(jì)其內(nèi)部的子囊以及子囊孢子數(shù)量、形態(tài)、大小并記錄觀察相關(guān)數(shù)據(jù)。

1.2.2 基因組DNA的提取 本實(shí)驗(yàn)對桃葉蓼白粉菌基因組DNA提取采用試劑盒法。(1)首先取一定量的桃葉蓼白粉菌菌絲體(注意不要有其他雜菌的菌絲及子實(shí)體),加入液氮后進(jìn)行充分研磨,將研磨得到的真菌粉末裝入1.5 mL離心管中;(2)加入400 μL緩沖液FP1至離心管中,6 μL的RnaseA(10 mg/mL),置入旋渦震動機(jī)中震蕩1 min,室溫放置時間為10 min;(3)離心管中加入130 μL緩沖液FP2,置入旋渦震蕩機(jī)旋渦振蕩1 min,再置入離心機(jī)12000 r/min條件下離心5 min,棄沉淀,上清液轉(zhuǎn)移,這一步驟重復(fù)2次;(4)然后加入0.7倍體積的異丙醇(約350 μL)至盛有上清液的離心管中,上下?lián)u動充分混勻,約30 s后會出現(xiàn)絮狀的基因組DNA懸浮物,將離心管置入離心機(jī)中12000 r/min離心2 min,棄掉上清液,保留沉淀;(5)加入70%乙醇700 μL,置入旋渦震蕩機(jī)中振蕩5 s混勻,隨后置入離心機(jī)12000 r/min離心2 min,棄掉上清,將這一步驟重復(fù);(6)開蓋倒置盛有沉淀物的離心管,在室溫下晾干10 min,使乙醇徹底揮發(fā);(7)在晾干后的盛有沉淀物的離心管中加入適量的洗脫緩沖溶液TE,置于水浴鍋中65℃水浴45 min使DNA溶解,期間每隔5 min需要顛倒離心管混勻數(shù)次助溶,最終獲得DNA溶液。將該DNA溶液利用瓊脂糖凝膠電泳的方法檢測后保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.3 ITS序列PCR擴(kuò)增 實(shí)驗(yàn)采用的引物序列為:通用引物ITS1(5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')及ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'),通過擴(kuò)增桃葉蓼白粉菌rDNA獲得的目的DNA片段,PCR擴(kuò)增反應(yīng)采用PCRMix試劑。反應(yīng)體系50 μL如下:2 μL模板DNA;PCRMix24μL;ddH2O20μL;P1和P2分別為2μL。PCR擴(kuò)增的條件如下:94℃預(yù)變性2 min;94℃變性30 s;60℃退火30 s;72℃延伸2 min;共30次的循環(huán);72℃最終需要延伸10 min。PCR結(jié)束對得到的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測,溴化乙錠(EB)染色觀察后,對檢測合格的樣品進(jìn)行下一步序列測定和分析[3]。

1.2.4 序列分析 將獲得DNA序列輸入GenBank并進(jìn)行BLAST比對檢索,采用Clustalx l.83將測序得到的白粉菌結(jié)果與從NCBI數(shù)據(jù)庫中抽取得到的22種白粉菌的ITS序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹并推理系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。

2 結(jié)果與分析

2.1 桃葉蓼白粉菌形態(tài)檢測

桃葉蓼白粉菌的菌絲體生于桃葉蓼葉正反兩面,多數(shù)生于葉片正面,少數(shù)生于葉片背面,存留至近存留,菌體在桃葉蓼葉面形成厚或薄的白色病斑,隨著病發(fā)嚴(yán)重最后鋪滿全葉,通常在病害后期子囊果成熟以后菌絲體會消失;分生孢子呈柱形,(26.5-)30.4 ~42.9(-55.3)×(12.9-)14.2 ~16.9(-19.1)μm;萌發(fā)形成附著胞的頂端膨大(圖1-3)。子囊果呈暗褐色,多數(shù)聚生或者近聚生,極少數(shù)散生,多呈扁球形,少數(shù)球形,直徑(87-)94 ~121(-141)μm,有不規(guī)則的多角形壁細(xì)胞,殼壁細(xì)胞直徑6.5 ~16.8(-21.3)μm;附屬絲(8-)12 ~37(-47)根,多見16根,不分枝或不規(guī)則分枝,少數(shù)頂端近雙叉狀分枝1 ~2次,直或彎曲,常作扭曲狀或曲折狀,長度約為子囊果直徑的(0.3-)0.5 ~1(-1.6)倍,長(31-)76 ~159(-211)μm,多見局部粗細(xì)不勻或上下近等粗,寬(3.8-)5.1 ~8.9(-10.6)μm,附屬絲薄壁,多平滑,有少數(shù)較粗糙,附屬絲內(nèi)有隔膜0 ~3個,根部為褐色,向上漸淡至近無色;子囊4 ~8個,多數(shù)呈各種不規(guī)則卵形,少數(shù)近球形,部分有明顯的柄,少數(shù)無柄,(45.8-)51.3 ~72.1(-91.1)×(31.5-)32.0 ~45.8(-51.1)μm;子囊孢子2 ~4個,多見橢圓形,少數(shù)為矩圓形,略帶淡黃色,(16.5-)19.3 ~31.2(-34.2)×(10.2-)11.7 ~16.2(-17.6)μm。

圖1 桃葉蓼葉面上白粉菌分生孢子(20×60)

圖2 載玻片水滴中顯微觀察桃葉蓼白粉菌分生孢子(20×60)

圖3 桃葉蓼葉片白粉菌分生孢子萌發(fā)形成附著胞(20×60)

2.2 桃葉蓼白粉菌進(jìn)化關(guān)系分析

2.2.1 提取桃葉蓼白粉菌基因組DNA及PCR的擴(kuò)增結(jié)果 實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增桃葉蓼白粉菌rDNA獲得目的DNA片段,用膠回收試劑盒回收并純化,電泳檢測所得結(jié)果,回收PCR擴(kuò)增產(chǎn)物后測序,測序結(jié)果獲得堿基序列長度為642 bp,結(jié)果如下:TTCCCGTAATGCCGAGGC TTCATTCGTGGCGTCTGCGGCGTGCTGGGCCGAC CCTCCCACCCGTGTCGATTTGTATCTTGTTGCTT TGGCGGGCCGGGCTACGTCGTCGCTGTCCGCAG GGACACGCGTCGGCCGCCCACCGGTTTCGACTG GAGCGCGCCCGCCAAAGACCCAACCAAAACTCA TGTTGTCTGTGTCGTCTTAGCTTTATAATGAAAAT TGATAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCT GGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAA GTAATGTGAATTGCAGAATTTAGTGAATCATCGA ATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCC GAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAACACCCC CTCCAGCTGCCGTTGTGTGGCTGCGGTGTTGGGG CTCGTCGCGAAGCGGCGGCCCTTAAAGACAGTG GCGGTCCCGACGTGGGCTCTACGCGTAGTAACTT GCTTCTCGCGACAGAGTGACGCCTGGTGGCTTG CCAGAACAACCCCTATTGGGTCCAGTCACATGGA TCACAGGTTGACCTCGAATCAGGTAGGAATACCC GCTGAACTTAAGCATATCAATAGCCGGGAGGAAA A。

2.2.2 桃葉蓼白粉菌ITS序列進(jìn)化樹構(gòu)建結(jié)果與分析從Genebank中選取25種植物白粉菌ITS序列(表1),使用MAGA 5.05軟件根據(jù)鄰近距離法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹推演進(jìn)化關(guān)系與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析比較。

表1 用于同源性比較分析的白粉菌

將本實(shí)驗(yàn)測序結(jié)果與部分選取植物白粉菌ITS序列進(jìn)行比較分析(表1)。對表1白粉菌的ITS序列對比分析結(jié)果見圖4。

圖4 26種白粉菌序列的比對分析

用MEGA5.05軟件分析處理26種白粉菌,完成構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖5)。

圖5 基于ITS序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

根據(jù)基因進(jìn)化樹和堿基序列比對圖表可見,進(jìn)化樹有2個較大的分支,相同種屬植物的白粉菌聚為統(tǒng)一進(jìn)化枝,如桃葉蓼白粉菌(TL190501)的ITS序列與阿塞拜疆萹蓄上的Erysiphe polygoni(LC328323.1)、美國新變種直立萹蓄上的Erysiphe buhrii(KX826856.1)等6種植物上的白粉菌有比較高的相似度,堿基序列相似度可達(dá)99%,親緣關(guān)系極近;與韓國蒔蘿上的Erysiphe heraclei(JX499184.1)、韓國歐芹上的Erysiphe heracleid(KF680162.1)及韓國山蘿卜上的Erysiphe heraclei(KF111807.1)等6種植物白粉菌在親緣關(guān)系上比較接近,堿基序列相似度約97%;與巴西大豆上的Erysiphe diffusa(AY739112.2)及中國紫藤上的Erysiphe diffusa(KM260363.1)親緣關(guān)系比較接近,堿基序列相似度約為95.59%;與美國豌豆上的Erysiphe pisi(FJ378868.1及FJ378871.1)相似度比較低,堿基序列相似度約為94.95%;與法國橡樹上的Erysiphe alphitoides(EF672350.1)及中國大葉楊上的Erysiphesp.(HQ012432.1)親緣關(guān)系較遠(yuǎn),堿基相似度為94%;與美國鱷梨上的Erysiphesp.(MF577080.1)之間相似度較低,它們堿基序列相似度為94.27%;與日本大葉柳上的Erysiphe adunca(LC028970.1)相似度最低,堿基序列相似度僅為92.25%。

根據(jù)堿基序列比對圖可看出,桃葉蓼白粉菌(TL190501)與阿塞拜疆萹蓄上的Erysiphe polygoni(LC328322.1及LC328323.1)僅僅在第13位上有所不同,桃葉蓼白粉菌第13位堿基為G,而阿塞拜疆萹蓄(LC328323.1)白粉菌為T,因此可以初步判定兩種白粉菌為同種同屬白粉菌;與韓國蒔蘿上及韓國山蘿卜的Erysiphe heraclei(JN603995.1及KF111807.1)在第13、79、97、98、105、164、204、428、460、542位堿基不同,親緣關(guān)系比較接近;與印度羅勒上的Erysiphe Pseudoidiumsp.(AY739112.1)在第13、78、79、82、83、86、89、98、105、119、122、126、130等很多堿基上有所不同;與日本大葉柳(LC028970.1)上的Erysiphe adunca在第 4、7、9、13、18、19、24、31、32、44、47、51、53、54、56等較多堿基上有所不同,可見兩種白粉菌親緣關(guān)系較桃葉蓼白粉菌與阿塞拜疆萹蓄親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。而26種植物白粉菌的堿基序列在211 ~378 bp區(qū)間內(nèi)保持著高度的一致性,因此可初步判斷這部分堿基序列可能對白粉菌性狀穩(wěn)定遺傳這一功能起著保障作用。

3 討論

傳統(tǒng)菌物分類學(xué)有關(guān)白粉菌的分類在白粉菌科(Erysiphaceae)內(nèi)屬的劃分主要是根據(jù)形態(tài)(無性世代和有性世代)來進(jìn)行的,如真菌分生孢子的形狀、數(shù)量多少,孢子的大小以及著生的方式,一個閉囊殼內(nèi)有多少子囊以及所含有的子囊孢子數(shù)量等,其他一些重要特征如閉囊殼外所具有附屬絲的形態(tài)特征等也是分類的重要依據(jù)。目前隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)原有的分類方法與分類系統(tǒng)具有一定的缺陷[11-15]。如鉤絲殼屬(Uncinula)、半內(nèi)生鉤絲殼屬(Pleochaeta)和叉鉤絲殼屬(Sawadaea),在它們的頂端附屬絲類型都呈現(xiàn)鉤狀卷曲,但實(shí)際上它們的差別卻比較大。節(jié)絲殼屬(Arthrocladiella)和叉絲殼屬(Microsphaera)二者都具有二叉狀分枝,實(shí)際上它們的無性世代根本不同,前者分生孢子的著生方式為單生,后者分生孢子的著生方式為串生。

近年來,隨著科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,如分子生物學(xué)相關(guān)技術(shù)手段的應(yīng)用,微生物的分類可以更多地采用一些先進(jìn)的技術(shù),使科學(xué)家們可以對白粉菌研究關(guān)注其系統(tǒng)分類學(xué)的關(guān)系[16-18]。微生物學(xué)家對菌物分類的研究目前不僅僅局限在形態(tài)分類上面,目前對白粉病菌的鑒定研究擴(kuò)展了白粉菌的種類及其寄主范圍。分子生物學(xué)方法在病原物的鑒定上具有很多的優(yōu)點(diǎn)和可靠性,在對病原菌物分類及鑒定時,一些國際上通用的大型數(shù)據(jù)庫如GenBank等非常多的生物學(xué)信息可作為物種鑒定重要的參考來源,從而使微生物的分類能夠更加地準(zhǔn)確、有效。因此通過顯微觀察結(jié)合分子分類方法的應(yīng)用在真菌的分類學(xué)上就超來越受到重視[19-20]。

為了減少因?yàn)閭鹘y(tǒng)分類方法造成的誤差,本研究結(jié)合了分子生物學(xué)方法對桃葉蓼白粉菌進(jìn)行進(jìn)化分析,并通過構(gòu)建桃葉蓼白粉菌系統(tǒng)發(fā)育樹,為該病原菌的研究提供了有價值的信息。目前國內(nèi)外的研究中,對桃葉蓼的研究幾乎沒有,通過本實(shí)驗(yàn)可以初步判定桃葉蓼白粉病的病原菌,并通過序列比對分析找到親緣關(guān)系接近的菌種,未來將參考由其同種同屬病原菌侵染發(fā)生的其他白粉病的防治方法,為桃葉蓼白粉病尋找系統(tǒng)的防治措施。

4 結(jié)論

實(shí)驗(yàn)中通過顯微觀察到桃葉蓼白粉菌分生孢子呈柱形;子囊果呈暗褐色,多數(shù)聚生或者近聚生,多呈扁球形;子囊4 ~8個,多數(shù)呈各種不規(guī)則卵形,其中多含2 ~4個橢圓形子囊孢子,可以判斷桃葉蓼白粉病病原菌屬于叉絲殼屬,再結(jié)合序列比對分析確定該菌種與GenBank中的Polygonum aviculare(登錄號為LC328322.1)、Polygonumerectum(登錄號為KX826856.1)之間的親緣關(guān)系最為接近,堿基序列相似度值達(dá)到99%,可以明確其病原菌與萹蓄為同種同屬。本研究將為桃葉蓼白粉病的鑒定提供合理的依據(jù),也為桃葉蓼白粉病的防治提供方向和理論基礎(chǔ)。

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