張靜,張 潔,莫 穎,張 蕾,孫明慧
(新疆醫(yī)科大學(xué)第五附屬醫(yī)院腎病科,烏魯木齊 830000)
糖尿病腎臟?。╠iabetic kidney disease,DKD)是糖尿病患者最嚴(yán)重、最普遍的并發(fā)癥之一,可導(dǎo)致患者死亡,也是終末期腎病(ESRD)的主要促成因素[1]。DKD有多種形態(tài)改變,包括系膜細(xì)胞肥大和增殖、腎小管細(xì)胞上皮—間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelialmesenchymal transition,EMT)、足細(xì)胞凋亡等[2],其中腎小管細(xì)胞EMT是引起腎功能損害最常見(jiàn)的原因[3]。DKD的易感因素包括遺傳、代謝機(jī)制紊亂、高血糖、胰島素抵抗、血流動(dòng)力學(xué)改變、炎癥反應(yīng)、氧化應(yīng)激等[4]。有研究表明,糖尿病患者存在“遺留效應(yīng)”,表觀遺傳因素在該效應(yīng)中起到重要作用[5-6]。
腺嘌呤第6位氮原子上發(fā)生的甲基化修飾(m6A)是真核生物mRNA中最常見(jiàn)的甲基化修飾[7]。類甲基化轉(zhuǎn)移酶3(methyltransferase-like 3,METTL3)是構(gòu)成m6A甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的核心組分,負(fù)責(zé)催化RNA發(fā)生m6A修飾[8]。在2型糖尿病中,葡萄糖調(diào)節(jié)METTL3介導(dǎo)的m6A修飾,然而,METTL3在糖尿病相關(guān)疾病調(diào)控中的作用存在爭(zhēng)議[9],METTL3與DKD發(fā)病機(jī)制之間的關(guān)系仍不清楚。METTL3還可以介導(dǎo)m6A修飾調(diào)控miRNA表達(dá)[10]。有研究表明,多種miRNA在DKD發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮重要作用[11]。其中miR-126參與糖尿病的發(fā)生和發(fā)展,在DKD中的表達(dá)下調(diào),但具體作用機(jī)制尚不清楚[12-13]。本研究旨在探討METTL3對(duì)高糖(HG)誘導(dǎo)的大鼠腎小管上皮細(xì)胞(NRK-52E)和大鼠腎小球系膜細(xì)胞(HBZY-1)增殖的影響及其作用機(jī)制,并闡明METTL3與miR-126的相互作用,為探索DKD新的治療靶點(diǎn)提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
1.1 細(xì)胞與培養(yǎng) 大鼠NRK-52E細(xì)胞和大鼠HBZY-1細(xì)胞均購(gòu)自武漢Procell公司。將NRK-52E細(xì)胞和HBZY-1細(xì)胞轉(zhuǎn)移到含有10%胎牛血清(FBS)和1%青—鏈霉素DMEM培養(yǎng)基的離心管中,1 000 r/min離心10 min,收集細(xì)胞,用含10%FBS的完全培養(yǎng)基懸浮細(xì)胞;將細(xì)胞接種到培養(yǎng)皿中,輕輕吹打混勻,置于37℃、5%CO2飽和濕度細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),間隔2 d更換1次培養(yǎng)液。細(xì)胞融合度達(dá)到約80%時(shí),胰酶消化,傳代,取第3代細(xì)胞用于實(shí)驗(yàn)。
1.2主要試劑FBS、青—鏈霉素、酚紅(Gibco,美國(guó));MTT試劑盒(BioFroxx,德國(guó));TIANScript RT Kit、SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(天根,中國(guó));BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(Solarbio,中國(guó));smad2抗體、METTL3抗體(Proteintech,中國(guó));GAPDH、Goat anti-Rabbit IgG(Bioswamp,中國(guó));轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子(TGF)-β1酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)試劑盒(Cusabio,中國(guó));RNA-Binding Protein Immunoprecipitation Kit(Millipore,美國(guó))。
1.3細(xì)胞分組和轉(zhuǎn)染 取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期、生長(zhǎng)狀態(tài)良好的NRK-52E和HBZY-1細(xì)胞,按3×105個(gè)/孔接種于96孔板,分為對(duì)照組、高糖(HG)組、HG+siRNA陰性對(duì)照(siRNA-NC)組和HG+METTL3 siRNA組。采用LipofectamineTM 2000分別轉(zhuǎn)染siRNA-NC和si-METTL3,細(xì)胞于37℃、CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),6 h后吸出轉(zhuǎn)染液換入正常培養(yǎng),繼續(xù)培養(yǎng)24 h。對(duì)照組用含有5.5 mmol/L葡萄糖的培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h,其他各組用含有35 mmol/L葡萄糖的培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h。METTL3的siRNA序列由擎科生物生物科技有限公司合成,序列如下:METTL3 siRNA1:5’-GUCUAUAGUCCUGAAUUATT-3’;METTL3 siRNA2:5’-GUUGAUUGAGGUAAAGCGATT-3’;METTL3 siRNA3:5’-GGAAUUGGGCAGAGAAU GUTT-3’。
1.4 MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖活性 取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期、生長(zhǎng)狀態(tài)良好的HBZY-1和NRK-52E細(xì)胞,以4×103個(gè)/孔接種于96孔板,培養(yǎng)24 h后,每孔加入10μL MTT溶液,繼續(xù)培養(yǎng)4 h,棄去培養(yǎng)基,加入150μL DMSO震蕩10 min,酶標(biāo)儀測(cè)定568 nm波長(zhǎng)處各孔的吸光值(OD)。
1.5流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞周期 用不含EDTA的0.25%胰酶消化處理細(xì)胞,終止消化后收集細(xì)胞,1 500 r/min離心5 min,棄上清,PBS洗滌2次;1 500 r/min離心5 min,棄上清,PBS重懸細(xì)胞,緩慢加入700μL預(yù)冷的80%乙醇;4℃條件下固定4 h,1 500 r/min離心5min,預(yù)冷PBS洗滌2次;加入100μL RNase,37℃水浴30 min;加入400μL PI,4℃避光染色30 min;用流式細(xì)胞儀在激發(fā)波長(zhǎng)488 nm波長(zhǎng)處檢測(cè)紅色熒光。
1.6 RT-qPCR法檢測(cè)METTL3和miR-126表達(dá)
通過(guò)DNAMAN軟件設(shè)計(jì)METTL3、β-actin、miR-126、U6熒光實(shí)時(shí)定量PCR引物,并由擎科公司合成。METTL3引物上游:5’-TAAGCCCAGCACAACGTCTA-3’,下游:5’-CAACTCCTGGGCAGCA AATT-3’;miR-126引物上游:5’-TGCGCTCGTACCGTGAGTAATA-3’,下 游:5’-CCAGTGCAGG GTCCGAGGTATT-3’;U6引物上游:5’-CGCTTCGGCAGCACATATAC-3’,下 游:5’-AAATATGGAACGCTTCACGA-3’;β-actin引物上游:5’-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3’,下 游:5’-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3’。提取細(xì)胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。PCR反應(yīng)體系:上、下引物10 μmol/L各0.4μL,2×SYBR Select Master Mix 10μL,RNase-free水4.8μL,cDNA模板4μL,50×ROX Reference Dye 20.4μL,配制成20μL體系混合均勻。PCR反應(yīng)條件:在ABI(QuantStudio 6)儀器上保持95℃預(yù)變性10 min;95℃變性15 s,60℃退火60 s,延展95℃,15 s,40個(gè)循環(huán)。采用2-ΔΔCT方法計(jì)算METTL3和miR-126相對(duì)表達(dá)量。
1.7 Western blotting法檢測(cè)METTL3和smad2蛋白表達(dá) 提取細(xì)胞總蛋白,BCA法測(cè)定蛋白濃度;聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,5%脫脂奶粉封閉2 h,加入一抗smad(1∶3 000)、METTL3(1∶3 000)、GAPDH(1∶1 000)稀釋液4℃下孵育過(guò)夜;洗膜,加入HRP標(biāo)記二抗(1∶10 000)室溫孵育2 h,ECL顯色,在暗室中壓片、曝光、顯影,用Band Scan分析條帶灰度值。
1.8細(xì)胞上清液中TGF-β1含量檢測(cè) 收集各組細(xì)胞培養(yǎng)上清液,采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)法檢測(cè)細(xì)胞上清液中TGF-β1含量,檢測(cè)過(guò)程嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作。
1.9 RNA免疫共沉淀技術(shù)(RIP)采用RIP實(shí)驗(yàn)探討miR-126和METTL3之間的結(jié)合情況。RIP分析使用Magna-RIP RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀試劑盒(Magna RIP Kit,Millipore)。測(cè)定抗體的總RNA(輸入對(duì)照)和同型對(duì)照(IgG)。RT-qPCR法檢測(cè)共沉淀RNA。提取細(xì)胞中總RNA,并使用Ribo-Zero磁性試劑盒(Illumina)去除核糖體RNA。用RNA裂解試劑(Ambion)對(duì)核糖核酸進(jìn)行裂解。使用之前在RIP免疫沉淀緩沖液中與磁性Dynabeads結(jié)合的抗m6A抗體(Synaptic Systems,202003)進(jìn)行RNA免疫沉淀,并與片段RNA孵育。經(jīng)蛋白酶K(10 mg/mL)處理后,用苯酚/氯仿/異戊醇提取RNA,用miR-126引物進(jìn)行RT-qPCR驗(yàn)證。
1.10統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 所有數(shù)據(jù)采用SPSS 25.0軟件進(jìn)行處理,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,多組間比較采用方差分析,組間兩兩比較采用LDS-t檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 METTL3 siRNA轉(zhuǎn)染效果及其對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E和HBZY-1細(xì)胞增殖的影響METTL3 siRNA1組、METTL3 siRNA2組、METTL3 siRNA3組METTL3 mRNA表達(dá)均下調(diào),且siRNA1效果最佳,見(jiàn)圖1。因此選擇siRNA1作為后續(xù)轉(zhuǎn)染片段。NRK-52E和HBZY-1細(xì)胞中,HG+METTL3 siRNA組增殖活性均較HG組提高,且METTL3 siRNA對(duì)NRK-52E細(xì)胞的促增殖作用較明顯,見(jiàn)表1。因此選擇NRK-52E細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
圖1 RT-qPCR法驗(yàn)證3條METTL3 siRNA轉(zhuǎn)染效果
表1 METTL3 siRNA對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E和HBZY-1細(xì)胞增殖的影響 ,n=3
表1 METTL3 siRNA對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E和HBZY-1細(xì)胞增殖的影響 ,n=3
與對(duì)照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。
2.2 METTL3 siRNA對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞周期的影響HG+METTL3 siRNA組G1期細(xì)胞所占百分比較HG組降低,而S期細(xì)胞所占百分比較HG組升高,HG+siRNA-NC組與HG組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)圖2、表2。
圖2 各組細(xì)胞周期比較
表2 METTL3 siRNA對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞周期的影響 ,n=3
表2 METTL3 siRNA對(duì)HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞周期的影響 ,n=3
與對(duì)照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。
2.3 METTL3 siRNA可抑制HG處理的NRK-52E細(xì)胞TGF-β1、smad2及miR-126表達(dá) 與對(duì)照組比較,HG組METTL3、smad2蛋白表達(dá)及TGF-β1水平升高;與HG組比較,HG+METTL3 siRNA組MET-TL3、smad2蛋白表達(dá)及TGF-β1水平降低;HG組與HG+siRNA-NC組比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)圖3、表3。
表3 METTL3 siRNA對(duì)NRK-52E細(xì)胞TGF-β1、METTL3、smad2及miR-126表達(dá)的影響 ,n=3
表3 METTL3 siRNA對(duì)NRK-52E細(xì)胞TGF-β1、METTL3、smad2及miR-126表達(dá)的影響 ,n=3
與對(duì)照組比較,*P<0.05;與HG組比較,#P<0.05。
圖3 Western blotting蛋白電泳圖
2.4 METTL3與miR-126的相互作用RIP結(jié)果顯示:METTL3 siRNA可降低HG處理的NRK-52E細(xì)胞miR-126的成熟能力,見(jiàn)圖4。表明METTL3可通過(guò)結(jié)合miR-126發(fā)揮作用。
圖4 RIP實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證METTL3與miR126的相互作用
m6A修飾包括甲基化轉(zhuǎn)移酶(METTL3、METTL14等)、去甲基化轉(zhuǎn)移酶(FTO)和識(shí)別蛋白(YTH家族)[14]。本研究發(fā)現(xiàn),HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞中METTL3表達(dá)量較對(duì)照組顯著升高,而METTL3 siRNA轉(zhuǎn)染的細(xì)胞METTL3表達(dá)水平下降。提示HG刺激可提高甲基轉(zhuǎn)移酶的表達(dá),同時(shí)說(shuō)明RNA甲基化可能調(diào)控DKD發(fā)病機(jī)制。本研究中,HG誘導(dǎo)的細(xì)胞增殖活性顯著降低,通過(guò)siRNA抑制METTL3表達(dá)后,細(xì)胞增殖活性明顯升高。細(xì)胞周期中G1期為DNA合成前期,S期為DNA合成期,G2為DNA合成后期。本研究結(jié)果顯示,METTL3 siRNA使得G1期細(xì)胞減少,S期和G2期細(xì)胞增加,表明沉默METTL3可促進(jìn)HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞DNA復(fù)制,加快細(xì)胞周期進(jìn)程,促進(jìn)細(xì)胞分裂,這與細(xì)胞增殖率升高的結(jié)果相一致。
在DKD的病理生理過(guò)程中,腎纖維化是一個(gè)終點(diǎn)事件,主要特征為ECM蛋白的過(guò)度表達(dá)[15]。腎小管上皮細(xì)胞是DKD纖維化的主要來(lái)源,可以通過(guò)TGF-β1來(lái)調(diào)控[16]。而TGF-β1是DKD纖維化的重要生長(zhǎng)因子之一,能引起細(xì)胞凋亡、肥大、表型轉(zhuǎn)換、ECM積累等[17]。TGF-β1介導(dǎo)的信號(hào)通路主要為T(mén)GF1/smad信號(hào)通路,該通路的激活誘導(dǎo)腎小球硬化和腎小管間質(zhì)纖維化。本研究表明,TGF-β1、smad2在HG組中的表達(dá)量顯著升高,而這種表達(dá)變化可以被METTL3 siRNA抑制。提示METTL3 siRNA可能通過(guò)阻斷TGF1/smad2信號(hào)通路抑制HG誘導(dǎo)的NRK-52E細(xì)胞纖維化。
miRNA可被METTL3以m6A修飾依賴的方式調(diào)控,METTL3可影響miRNA的成熟,METTL3表達(dá)升高會(huì)增加miRNA含量,從而激活相關(guān)信號(hào)通路,促進(jìn)疾病的發(fā)生和發(fā)展[18]。本研究發(fā)現(xiàn),在HG環(huán)境下細(xì)胞miR-126的表達(dá)量升高,METTL3 siRNA明顯降低miR-126的表達(dá)量。為了進(jìn)一步揭示METTL3與miR-126之間的相關(guān)性,本研究采用RIP實(shí)驗(yàn),針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體將相互作用的miR-126和METTL3蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),經(jīng)過(guò)分離純化對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的miR-126進(jìn)行分析,結(jié)果表明METTL3可以特異性靶向miR-126并影響其表達(dá)。
綜上所述,METTL3在HG誘導(dǎo)的腎小管上皮細(xì)胞中的表達(dá)上調(diào),抑制細(xì)胞增殖,其可能的作用機(jī)制為METTL3甲基化修飾miR-126,激活TGF-β1/smad2信號(hào)通路。本研究為DKD的機(jī)制研究提供了新的方向。