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基于還原石墨烯和硫堇-金納米粒子復(fù)合物的電化學(xué)DNA生物傳感器的制備

2022-06-17 09:19時(shí)安琪
關(guān)鍵詞:信使探針雜交

董 笑,時(shí)安琪,耿 明

(1淮北師范大學(xué) 信息學(xué)院,安徽 淮北 235000;2安徽師范大學(xué) 化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院,安徽 蕪湖 241000)

0 引言

隨著人類基因組計(jì)劃研究的蓬勃發(fā)展,DNA 生物傳感器在基因測(cè)序、分子診斷和癌癥疾病早期診斷中發(fā)揮的作用也越來(lái)越大[1-3].電化學(xué)DNA 生物傳感器的構(gòu)建一般是通過(guò)共價(jià)鍵合或者化學(xué)吸附作用,將敏感元件探針DNA 固定到電極表面,通過(guò)檢測(cè)雜交過(guò)程產(chǎn)生的電化學(xué)信號(hào)來(lái)實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)目標(biāo)DNA,具有制備簡(jiǎn)單、操作方便、靈敏度高且穩(wěn)定性好的優(yōu)點(diǎn).

石墨烯特殊結(jié)構(gòu)使它具有優(yōu)良電學(xué)、光學(xué)、力學(xué)和熱學(xué)性質(zhì),已經(jīng)作為一種良好的電化學(xué)傳感材料,廣泛用于傳感器的制備中.目前很多課題組已經(jīng)報(bào)道以石墨烯作為修飾電極的DNA生物傳感器[4-9].

本實(shí)驗(yàn)結(jié)合納米金和石墨烯優(yōu)點(diǎn),制備一種以金納米-石墨烯為傳感界面的電化學(xué)三明治型DNA生物傳感器.最佳實(shí)驗(yàn)條件下,該傳感器擁有良好的分析性能及寬的線性響應(yīng)范圍(1.00×10-16mol·L-1~1.00×10-9mol·L-1).該傳感器有望用于實(shí)際樣品的分析.

1 實(shí)驗(yàn)部分

1.1 試劑與儀器

硫堇(上海國(guó)藥化學(xué)試劑有限公司)、還原石墨烯(rGO)(中科炭納米科技有限公司)、氯金酸(HauCl4·4H2O)(上?;瘜W(xué)試劑有限公司)、二烷基磺酸鈉(SDS)(中國(guó)天津阿法埃莎化學(xué)有限公司)、牛血清白蛋白(BSA,96%-99%)(鄭州博賽生物技術(shù)股份有限公司)、不同序列的DNA(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司中).

CHI60C電化學(xué)工作站(上海辰華儀器公司).

掃描電子顯微鏡(SEM)(日本日立公司,JEOLJSM-4800F).

探針DNA序列:5′-SH-(CH2)6-AAA ACC CTC CTC AAC CCC CT-3′.

信使DNA序列:5′-CCT CTA TAC CAA TTT CCA AAA-(CH2)3-3′.

目標(biāo)DNA序列:5′-TGG AAA TTG GTA TAG AGG AGG GGG TTG AGG AGG GT-3′.

單堿基錯(cuò)配序列:5′-TGG AAA TTG GTA TAG AGG AGG GGN TTG AGG AGG GT-3′(“N”代表堿基A,C或者T).

完全不互補(bǔ)序列:5′-CAT GGC GGA AGC CGC TAC GTC CCC GGT CTA CAT TC-3′.

用pH7.4的0.01 mol·L-1磷酸緩沖溶液(PBS)配制不同序列的DNA,存于冰箱中待用.實(shí)驗(yàn)中DNA雜交時(shí)所用溶液為含有0.1 mol·L-1NaCl 的0.01 mol·L-1PBS(pH7.4),電化學(xué)檢測(cè)液為0.10 mol·L-1PBS(pH7.4),實(shí)驗(yàn)用水均為重蒸水.

三電極系統(tǒng):工作電極為玻碳電極或修飾電極(Φ=3 mm),參比電極為飽和甘汞電極(SCE),對(duì)電極為鉑絲電極;

1.2 金納米粒子的合成

金納米粒子(Au NPs)的制備采用檸檬酸三鈉還原氯金酸法,具體過(guò)程如下:將置于圓底燒瓶中的1 mL氯金酸原液(質(zhì)量濃度為1 g·100 mL-1)與99 mL去離子水混合液體加熱至沸騰,迅速將4 mL新配制的檸檬酸三鈉(質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%)溶液加入至燒瓶中,全程保持?jǐn)嚢?,直至溶液顏色逐漸由紫色變?yōu)榫萍t色.約15 min后停止加熱,將溶液冷卻至室溫,移至棕色廣口瓶中存放,置于冰箱中待用.

1.3 信使DNA-硫堇-金納米粒子復(fù)合物的制備

信使DNA-硫堇-金納米粒子復(fù)合物(rDNA-Thi-Au NPs)是根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道的內(nèi)容稍加修改制備而成[10].將300 μL的信使DNA(1.00×10-5mol·L-1)加入到1.7 mL濃縮后的Au NPs溶液中,保持摩爾比(信使DNA:Au NPs)為150.在冰箱里混合放置24 h后,通過(guò)金-硫鍵的作用信使DNA連接在Au NPs上.然后加入含有0.1 mol·L-1NaCl(pH 7.4)的0.01 mol·L-1PBS緩沖溶液使其“老化”12 h.接著,將200 μL硫堇(0.1 mmol·L-1)加入到上述溶液中,室溫下低速攪拌24 h.最后,加入1.0 mL質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的BSA溶液用以封閉活性位點(diǎn).將制備好的復(fù)合物在16 000 r/min條件下離心10 min,將上層清液移除,用去離子水反復(fù)洗滌3次,最后分散在pH值為7.4的0.01 mol·L-1PBS緩沖溶液中(含0.1 mol·L-1NaCl).

1.4 DNA生物傳感器的組裝

在制備修飾電極之前,需對(duì)玻碳電極進(jìn)行預(yù)處理[11].分別用不同粒度的α-Al2O3對(duì)裸玻碳電極拋光處理,然后分別在無(wú)水乙醇、丙酮和去離子水中超聲5 min,最后在氮?dú)鈿夥罩写蹈?

將0.5 mg·mL-1的還原石墨烯在乙醇溶液中進(jìn)行超聲,超聲均勻后,滴涂5.0 μL到預(yù)處理后的電極表面,室溫下晾干,在電極表面形成石墨烯薄膜(rGO).將該電極置于1.0 mg·mL-1HAuCl4/0.10 moL·L-1NaNO3溶液中,-0.20 V條件下恒電位沉積20 s[12],取出后用重蒸水沖洗3次,室溫晾干,獲得Au NPs-rGO修飾電極.

將5.0 μL濃度為1.00×10-5mol·L-1的探針DNA滴涂到構(gòu)建的修飾電極表面,4 ℃條件下放置2 h.然后將其浸泡到質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1% SDS 溶液中5 min,接著用重蒸水沖洗電極3次,完成探針DNA/金納米-石墨烯修飾電極(sDNA/Au NPs-rGO/GCE)的制備.

1.5 電化學(xué)檢測(cè)

首先,將不同濃度的目標(biāo)DNA 先與200 μL 負(fù)載到Au NPs 上的信使DNA 在37 ℃雜交液中雜交45 min[13],然后將探針DNA/金納米-石墨烯修飾電極浸泡到含有目標(biāo)DNA 與信使DNA 的雜交液中,在37 ℃條件下雜交2 h.之后用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1% SDS 溶液和蒸餾水沖洗電極3 次,除去沒(méi)有雜交的目標(biāo)DNA與信使DNA.

采用差示脈沖伏安法(DPV)作為檢測(cè)手段,檢測(cè)液為0.10 mol·L-1PBS緩沖液(pH 7.4).通過(guò)檢測(cè)雜交后硫堇產(chǎn)生的電流信號(hào),發(fā)現(xiàn)與目標(biāo)DNA雜交后硫堇的還原峰電流與目標(biāo)DNA濃度的對(duì)數(shù)呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,進(jìn)而可實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)DNA的定量分析.

2 結(jié)果與討論

2.1 傳感器的制備原理

傳感器的構(gòu)建過(guò)程如圖1所示,還原石墨烯的存在增大電極的比表面積,加快電子的傳遞能力.納米金具有優(yōu)良的光電效應(yīng),而且生物相容性好,可以通過(guò)金-硫鍵來(lái)固定一端修飾有巰基的探針DNA.同時(shí)制備一種信使DNA-硫堇-金納米粒子復(fù)合物,當(dāng)加入目標(biāo)DNA時(shí),探針DNA與信使DNA可以和目標(biāo)DNA分段互補(bǔ)進(jìn)行雜交反應(yīng),形成一種“夾心型”的結(jié)構(gòu).雜交后,連接在復(fù)合物上的硫堇也被修飾到電極表面,硫堇是一種電活性物質(zhì),可以產(chǎn)生很強(qiáng)的電信號(hào),并且目標(biāo)DNA的濃度越大,雜交的信使DNA的數(shù)量越多,接上的硫堇的量也越多,通過(guò)產(chǎn)生的電信號(hào)響應(yīng)值從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)DNA的定量檢測(cè).

圖1 DNA生物傳感器的構(gòu)建原理圖

2.2 金納米粒子-石墨烯/玻碳電極修飾電極的表征

本實(shí)驗(yàn)中,掃描電鏡(SEM)用來(lái)表征修飾電極材料,結(jié)果如圖2所示.圖2A清楚地顯示還原石墨烯光滑的褶皺片層結(jié)構(gòu).當(dāng)在其表面電沉積金納米粒子以后,可以看到金納米粒子大量地分布在電極表面(如圖2B所示).

圖2 不同修飾電極的掃描電鏡圖

2.3 實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化

實(shí)驗(yàn)中對(duì)信使DNA-硫堇-金納米粒子復(fù)合物中加入硫堇量以及雜交時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化,結(jié)果如圖3 所示.當(dāng)加入的硫堇(0.01 mmol·L-1)體積從50 μL 增加到200 μL 時(shí),硫堇的電信號(hào)響應(yīng)值是逐漸增大的(保持目標(biāo)DNA的濃度為一常量),當(dāng)硫堇體積超過(guò)200 μL時(shí)電流基本不再變化(如圖3A所示),表明硫堇與金納米粒子的結(jié)合量達(dá)到飽和.還對(duì)DNA 的雜交時(shí)間進(jìn)行考察,從圖3B 中可以看出雜交時(shí)間從0.5 h變化到2.0 h時(shí),隨著雜交時(shí)間的增加,硫堇的信號(hào)值逐漸增大,2 h后峰電流值基本不再變化,所以選擇的最佳雜交時(shí)間為2 h.按照文獻(xiàn)[14-15],選擇的金納米粒子最佳電沉積時(shí)間為20 s.檢測(cè)液pH 值為7.4,其原因是硫堇的信號(hào)強(qiáng)度與pH有關(guān),它的電極反應(yīng)是一個(gè)2電子及2質(zhì)子的過(guò)程.同時(shí),由于DNA在過(guò)高及過(guò)低的酸度條件下容易變性,因此選擇在生理pH條件下進(jìn)行測(cè)試,其pH值選擇7.4.

圖3 實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化

2.4 分析性能

通過(guò)差示脈沖伏安法(DPV)檢測(cè)傳感器的分析性能.如圖4A所示,在最佳實(shí)驗(yàn)條件下,傳感器與不同濃度的目標(biāo)DNA進(jìn)行雜交,結(jié)果表明檢測(cè)信號(hào)隨著DNA濃度的增大而增強(qiáng),并且在目標(biāo)DNA濃度為1.00×10-16mol·L-1~1.00×10-9mol·L-1范圍內(nèi),硫堇的電化學(xué)信號(hào)與DNA濃度的對(duì)數(shù)與呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系(圖4B所示),線性回歸方程為I(μA)=202.9+11.97 log C(DNA濃度單位是mol·L-1),線性相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.998 9,檢測(cè)限達(dá)到3.5×10-17mol·L-1(信噪比為3).說(shuō)明該生物傳感器具有良好的靈敏性.

圖4 傳感器的分析性能

2.5 選擇性

本實(shí)驗(yàn)中,還對(duì)傳感器的選擇性進(jìn)行考察.實(shí)驗(yàn)中選擇3種單堿基錯(cuò)配DNA、完全錯(cuò)配DNA以及完全互補(bǔ)DNA 序列分別與探針以及信使DNA 進(jìn)行雜交.雜交后歸一化的結(jié)果如圖5 所示,與單堿基錯(cuò)配DNA 雜交后電流值約是完全互補(bǔ)DNA 序列信號(hào)的40%,而完全錯(cuò)配DNA 雜交后信號(hào)響應(yīng)值最小,只有完全互補(bǔ)DNA 信號(hào)的6%.表明該生物傳感器選擇性好,可以很好地區(qū)分單堿基錯(cuò)配DNA 與完全互補(bǔ)DNA.

圖5 傳感器與不同DNA序列雜交后的電流值的歸一化圖

3 結(jié)論

本文構(gòu)建一種基于金納米粒子-石墨烯的修飾電極,該修飾電極具有高的比表面以及很好地導(dǎo)電性.同時(shí),制備一種信使DNA-硫堇-金納米粒子-復(fù)合物,通過(guò)檢測(cè)硫堇的電信號(hào)值實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)DNA的定量分析.該生物傳感器制備過(guò)程簡(jiǎn)單,靈敏度較高,選擇性好,為其他高靈敏生物傳感器的制備提供思路.

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