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基于機(jī)器學(xué)習(xí)的表層土壤成礦元素空間預(yù)測(cè):以稀有金屬銣元素為例

2022-07-09 09:03戴亮亮聶小力吳歡歡湯媛媛彭志剛
現(xiàn)代地質(zhì) 2022年3期
關(guān)鍵詞:土地質(zhì)量表層變量

戴亮亮,聶小力,郭 軍,鞏 浩,吳歡歡,張 濤,湯媛媛,毛 聰,彭志剛,賀 燦

(1.中國(guó)地質(zhì)調(diào)查局 長(zhǎng)沙自然資源綜合調(diào)查中心,湖南 長(zhǎng)沙 410600;

2.中國(guó)地質(zhì)調(diào)查局 西安礦產(chǎn)資源調(diào)查中心,陜西 西安 710000)

0 引 言

隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和人工智能算法的進(jìn)步,大數(shù)據(jù)在傳統(tǒng)行業(yè)獲得了巨大成功,并形成了“互聯(lián)網(wǎng)+”的經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展新形態(tài)[1]。相比于其他傳統(tǒng)領(lǐng)域,大數(shù)據(jù)在地學(xué)領(lǐng)域特別是地球化學(xué)領(lǐng)域研究相對(duì)滯后,相關(guān)研究成果缺乏[2]。在中國(guó)知網(wǎng)檢索“地球化學(xué)”關(guān)鍵詞(2021年5月18日)可以得到將近17萬(wàn)條文獻(xiàn)記錄,而以“大數(shù)據(jù)+地球化學(xué)”為關(guān)鍵詞檢索,僅能得到約160條文獻(xiàn)記錄,相比于2018年4月20日增加了120篇文獻(xiàn)[3],文獻(xiàn)增量相對(duì)較少,在國(guó)際主要數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行類似檢索結(jié)果也相差無(wú)幾,這表明擁有海量定量數(shù)據(jù)的地球化學(xué)領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)的研究屈指可數(shù),急需加強(qiáng)大數(shù)據(jù)的相關(guān)研究。

大數(shù)據(jù)是基于數(shù)據(jù)的科學(xué)[4],從數(shù)據(jù)本身出發(fā),通過(guò)對(duì)這些含有意義的數(shù)據(jù)進(jìn)行專業(yè)化處理,挖掘數(shù)據(jù)間的規(guī)律和相關(guān)關(guān)系,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)科學(xué)方法難以發(fā)現(xiàn)的新認(rèn)識(shí)和新規(guī)律[5]。近兩年,隨著地質(zhì)信息化建設(shè)和大數(shù)據(jù)智能地球科學(xué)的快速發(fā)展[6],大數(shù)據(jù)正在成為地球科學(xué)領(lǐng)域新的爆發(fā)點(diǎn),取得了一系列新的成果與認(rèn)識(shí)[7-8],如基于大數(shù)據(jù)分析的大地構(gòu)造環(huán)境的判別[9-15],基于大數(shù)據(jù)和機(jī)器學(xué)習(xí)地球化學(xué)異常信息的提取和對(duì)比研究[16-17],基于機(jī)器學(xué)習(xí)的微量元素定量預(yù)測(cè)[3,18],大數(shù)據(jù)在礦產(chǎn)資源預(yù)測(cè)與評(píng)價(jià)領(lǐng)域中的應(yīng)用[19-23],由此可見(jiàn)大數(shù)據(jù)對(duì)于地球科學(xué)的核心價(jià)值就在于分類和預(yù)測(cè)。我國(guó)自1999年開(kāi)始實(shí)施土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查工作以來(lái)[24-25],在巖石、土壤、農(nóng)作物和灌溉水方面積累了大量的定性定量數(shù)據(jù)[26],但受限于調(diào)查的尺度,土壤樣品分析測(cè)試的指標(biāo)有很大的差異,1∶250 000土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查要求分析表層土壤樣品54項(xiàng)指標(biāo),主要服務(wù)于農(nóng)業(yè)種植、生態(tài)環(huán)境和礦產(chǎn)資源等方面[27],但調(diào)查的精度無(wú)法精細(xì)化指導(dǎo)礦產(chǎn)勘查工作,1∶50 000土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查在1∶250 000的基礎(chǔ)上開(kāi)展工作,但測(cè)試的指標(biāo)以服務(wù)農(nóng)業(yè)種植和生態(tài)環(huán)境為主[28],由于經(jīng)費(fèi)的限制,很少涉及金屬礦產(chǎn)元素,進(jìn)而導(dǎo)致了大比例尺的表層土壤調(diào)查出現(xiàn)了一定的礦產(chǎn)元素?cái)?shù)據(jù)缺失。同一區(qū)域的1∶250 000表層土壤樣品和1∶50 000表層土壤樣品具有相同的采樣介質(zhì)、成土母質(zhì)背景和表生地球化學(xué)過(guò)程,因此我們希望以同一區(qū)域1∶250 000測(cè)試指標(biāo)建立一個(gè)預(yù)測(cè)模型,對(duì)1∶50 000大比例尺表層土壤未測(cè)元素指標(biāo)含量進(jìn)行空間預(yù)測(cè),來(lái)補(bǔ)全1∶50 000土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)庫(kù)中缺少的礦產(chǎn)元素含量,服務(wù)于礦產(chǎn)資源勘查。

本文將以羅山地區(qū)表層土壤地球化學(xué)元素指標(biāo)為研究對(duì)象,運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)隨機(jī)森林方法,立足對(duì)表層土壤地球化學(xué)元素間相關(guān)關(guān)系的挖掘,重點(diǎn)探討由表層土壤的已知元素含量預(yù)測(cè)Rb元素含量的過(guò)程和結(jié)果,為機(jī)器學(xué)習(xí)算法在地球化學(xué)元素空間預(yù)測(cè)和進(jìn)一步拓展土地質(zhì)量地球化學(xué)數(shù)據(jù)的服務(wù)應(yīng)用維度提供借鑒。

1 材料與方法

1.1 數(shù)據(jù)集

本文研究的羅山地區(qū)1∶250 000表層土壤數(shù)據(jù)(2 548組數(shù)據(jù))來(lái)源于全國(guó)地質(zhì)資料館,具有54項(xiàng)指標(biāo)含量值,該樣品基本采樣密度為1個(gè)點(diǎn)/km2,采樣深度為0~20 cm,4 km2內(nèi)的4個(gè)子樣組合成1個(gè)分析樣,樣品元素含量的測(cè)定均由具有相關(guān)測(cè)試資質(zhì)的實(shí)驗(yàn)室完成,嚴(yán)格按照《DZ/T 0258—2014多目標(biāo)區(qū)域地球化學(xué)調(diào)查規(guī)范(1∶250 000)》[27]進(jìn)行質(zhì)量控制。羅山地區(qū)1∶5萬(wàn)表層土壤數(shù)據(jù)為2020年實(shí)測(cè)(1 761組數(shù)據(jù)),具有17項(xiàng)指標(biāo)含量值,采樣深度為0~20 cm,樣品空間分布相對(duì)均勻,平均采樣密度為9個(gè)點(diǎn)/km2,樣品采集充分考慮地塊代表性,在每個(gè)樣點(diǎn)的20~50 m范圍內(nèi)采集4~6個(gè)子樣,充分混勻后采用四分法獲取約1.5 kg土壤裝入樣品袋中,待樣品自然風(fēng)干后過(guò)2 mm(10目)尼龍篩,均勻獲取500 g送實(shí)驗(yàn)室分析測(cè)試,樣品野外處理及加工嚴(yán)格執(zhí)行《DZ/T 0296—2016土地質(zhì)量地球化學(xué)評(píng)價(jià)規(guī)范》[28]。

1.2 變量遴選和研究方法

1∶5萬(wàn)表層土壤具有17種元素指標(biāo)(Se、B、As、Hg、V、Cr、Mn、Co、Ni、Cu、Zn、Mo、Cd、Pb、pH、K、P)的數(shù)據(jù),由于預(yù)測(cè)變量較多,為了提高預(yù)測(cè)的精度,防止過(guò)擬合,需要根據(jù)每個(gè)預(yù)測(cè)變量對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果的重要程度來(lái)對(duì)預(yù)測(cè)變量進(jìn)行優(yōu)選,確定最佳的預(yù)測(cè)變量集。變量的漏選會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵信息丟失,降低模型的準(zhǔn)確度,使模型無(wú)法準(zhǔn)確描述變量間的復(fù)雜關(guān)系,而多余的預(yù)測(cè)變量又會(huì)增加模型的復(fù)雜度和學(xué)習(xí)難度,同時(shí)也會(huì)將噪聲引入建模過(guò)程中,進(jìn)而導(dǎo)致模型過(guò)擬合,降低泛化能力[29-31]。因此需通過(guò)變量的重要性度量對(duì)變量進(jìn)行優(yōu)選,留下對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果影響最大的變量集,隨機(jī)森林中常用的變量重要性度量計(jì)算方式主要有基于基尼指數(shù)(GI)和袋外數(shù)據(jù)錯(cuò)誤率(OOB)[32-33],本文選擇基尼指數(shù)來(lái)計(jì)算出所有變量的重要性評(píng)分,因?yàn)槠湓谠u(píng)價(jià)地球化學(xué)元素含量這種連續(xù)性變量時(shí)具有更好的穩(wěn)定性[34]。本文變量遴選的方法主要分為兩步,第一步對(duì)所有變量進(jìn)行變量重要性度量并進(jìn)行排序,第二步采用機(jī)器學(xué)習(xí)中常用的學(xué)習(xí)曲線來(lái)確定最優(yōu)的預(yù)測(cè)變量數(shù)量,其原理是根據(jù)預(yù)測(cè)變量的重要性度量從高至低累計(jì)選取預(yù)測(cè)變量進(jìn)行建模,對(duì)模型的擬合優(yōu)度和均方根誤差進(jìn)行對(duì)比,進(jìn)而確定最優(yōu)的預(yù)測(cè)變量數(shù)量。

隨機(jī)森林算法是一種用隨機(jī)方式建立的,以決策樹(shù)為基學(xué)習(xí)器構(gòu)建的集成學(xué)習(xí)算法[35],且每個(gè)決策樹(shù)之間都是相互獨(dú)立的,其輸出的結(jié)果是由每個(gè)決策樹(shù)輸出結(jié)果的眾數(shù)(分類)或整體平均(回歸)而定[36-37],使得整體模型的結(jié)果具有較高的精確度和泛化性能。近些年,隨機(jī)森林算法由于其強(qiáng)大的性能,已經(jīng)成功地應(yīng)用到各領(lǐng)域的多種預(yù)測(cè)模型之中,被譽(yù)為“代表集成學(xué)習(xí)技術(shù)水平的方法”[38-39]。相比于其他機(jī)器學(xué)習(xí)建模算法,隨機(jī)森林算法具有一些明顯的優(yōu)勢(shì)[40-41],主要體現(xiàn)在:①實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單,訓(xùn)練可以高度并行化,特別是對(duì)于大樣本的地球化學(xué)海量數(shù)據(jù)具有明顯的速度優(yōu)勢(shì);②能處理高維數(shù)據(jù)(多個(gè)元素指標(biāo)),具有較強(qiáng)的抗過(guò)擬合能力;③通過(guò)訓(xùn)練,可以準(zhǔn)確獲取元素間的相互關(guān)系,給出各個(gè)特征對(duì)于輸出的重要性度量;④隨機(jī)采樣的過(guò)程,使訓(xùn)練出的模型的方差小,泛化能力強(qiáng);⑤對(duì)數(shù)據(jù)集的適應(yīng)能力強(qiáng),既能處理離散型數(shù)據(jù),也能處理連續(xù)型數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)集無(wú)需規(guī)范化[42]。因此,把隨機(jī)森林算法應(yīng)用于地球化學(xué)元素空間預(yù)測(cè)研究具有很好的契合性。如前面所述,隨機(jī)森林模型是由一棵棵決策樹(shù)組成,一般來(lái)說(shuō)決策樹(shù)的數(shù)量越多,建模的結(jié)果往往越好,但當(dāng)決策樹(shù)數(shù)量達(dá)到一定值后,隨機(jī)森林模型的精確性往往不再上升而是開(kāi)始上下波動(dòng),并且決策樹(shù)越多,模型會(huì)越復(fù)雜,訓(xùn)練時(shí)間也會(huì)越長(zhǎng)。為了平衡建模效果和模型復(fù)雜度,本文通過(guò)構(gòu)建學(xué)習(xí)曲線來(lái)擬合決策樹(shù)數(shù)量和建模效果的關(guān)系(圖1)。如圖1所示,當(dāng)決策樹(shù)數(shù)量為150棵時(shí),模型具有較低的復(fù)雜度,同時(shí)也具有較好的建模效果。

圖1 隨機(jī)森林決策樹(shù)的數(shù)量對(duì)模型擬合優(yōu)度和均方根誤差的影響Fig.1 The influence of the number of random forest decision trees on the model’s goodness of fit and root mean square error

2 結(jié)果與討論

2.1 變量選擇結(jié)果

圖2 預(yù)測(cè)變量數(shù)量對(duì)模型擬合優(yōu)度和均方根誤差的影響Fig.2 The influence of the number of predictors of the model on the goodness of fit and the root mean square error

本文用于變量遴選的學(xué)習(xí)曲線是一條預(yù)測(cè)變量數(shù)作為橫坐標(biāo)、預(yù)測(cè)模型的擬合優(yōu)度和均方根誤差作為縱坐標(biāo)的曲線(圖2),其中對(duì)全部數(shù)據(jù)(2 548組)進(jìn)行變量重要性度量是利用Python隨機(jī)森林模塊的內(nèi)置函數(shù)實(shí)現(xiàn)。由圖2可知,當(dāng)預(yù)測(cè)變量在4個(gè)以下時(shí),模型的效果隨著預(yù)測(cè)變量的增加有著巨大提升,說(shuō)明此時(shí)模型處于欠擬合狀態(tài),當(dāng)選取重要性度量最高的8個(gè)預(yù)測(cè)變量時(shí),模型既可以具有較好的擬合優(yōu)度和較低的均方根誤差,又具有較低的模型復(fù)雜度,具有較高的計(jì)算效率,因此本文選取變量重要性最高的K、B、Ni、V、Zn、As、Co和Cu作為預(yù)測(cè)因子(圖3)。

圖3 基于隨機(jī)森林算法的預(yù)測(cè)變量重要性度量Fig.3 The importance of predictor variables based on the random forest algorithm

圖4 隨機(jī)森林模型對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)(a)和測(cè)試數(shù)據(jù)(b)的回歸結(jié)果Fig.4 The regression results of the random forest model on training data and test data

在自然界中Rb沒(méi)有自己的獨(dú)立礦物,由于離子半徑等地球化學(xué)性質(zhì)與K相近,Rb常以類質(zhì)同象的形式賦存于鉀長(zhǎng)石和云母等含鉀礦物晶格中,因此Rb的含量與K具有密切的正相關(guān)關(guān)系[43]。 B為不相容元素,離子半徑小,在內(nèi)生作用過(guò)程中,常在巖漿作用的晚期富集,同Rb一樣,從超基性巖、基性巖到中性巖和酸性巖B含量逐漸增加,大部分 B分散在造巖礦物中,主要以進(jìn)入鉀長(zhǎng)石等長(zhǎng)石類礦物為主,巖石風(fēng)化成土過(guò)程中,B和Rb均容易被黏土礦物吸附,較為相似的內(nèi)生和表生作用可能使Rb和B具有一定的相關(guān)性[44]。Rb與Ni、V、Zn、As和Co等元素的關(guān)系可能與有機(jī)質(zhì)和黏土礦物的選擇性吸附有關(guān)[45]。

2.2 預(yù)測(cè)結(jié)果分析

本文隨機(jī)森林建模是通過(guò)Python語(yǔ)言中的sklearn庫(kù)實(shí)現(xiàn),采用研究區(qū)1∶250 000表層土壤數(shù)據(jù)的80%(2 038組)作為訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,用來(lái)建立隨機(jī)森林預(yù)測(cè)模型,20%數(shù)據(jù)(510組)用來(lái)對(duì)建立的模型進(jìn)行驗(yàn)證。首先通過(guò)K、B、Ni、V、Zn、As、Co、Cu和Rb的含量,建立隨機(jī)森林模型,如圖4(a)所示,縱坐標(biāo)表示預(yù)測(cè)值,橫坐標(biāo)表示實(shí)際值,中分線表示實(shí)際值與預(yù)測(cè)值相等,模型對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)的擬合優(yōu)度高達(dá)0.983 2,說(shuō)明隨機(jī)森林模型對(duì)該訓(xùn)練數(shù)據(jù)的訓(xùn)練效果較好。再用劃分的20%表層土壤的K、B、Ni、V、Zn、As、Co和Cu的含量數(shù)據(jù)作為預(yù)測(cè)變量輸入到建立的隨機(jī)森林模型中得到預(yù)測(cè)的Rb元素含量,并將預(yù)測(cè)值與實(shí)際值進(jìn)行對(duì)比,隨機(jī)森林模型對(duì)測(cè)試數(shù)據(jù)的預(yù)測(cè)結(jié)果如圖4(b)所示,圖中的點(diǎn)密度基本上分布在中分線附近,預(yù)測(cè)結(jié)果的擬合優(yōu)度為0.895 6,說(shuō)明該模型很好地預(yù)測(cè)了Rb元素的含量,也進(jìn)一步表明根據(jù)本文方法篩選出的預(yù)測(cè)變量是有效的。

為了更直觀地對(duì)比測(cè)試數(shù)據(jù)的實(shí)際值和預(yù)測(cè)值,本文利用GeoIPAS軟件分別制作了實(shí)際值和預(yù)測(cè)值的地球化學(xué)圖(圖5)。從圖5中可知,預(yù)測(cè)圖能夠準(zhǔn)確地反映Rb元素的空間含量特征,預(yù)測(cè)圖的高、低值區(qū)域與實(shí)際圖具有很好的套合關(guān)系,僅有一些微小的差異,這說(shuō)明建模的過(guò)程是可靠的,預(yù)測(cè)的結(jié)果也是可信的。

2.3 模型應(yīng)用

圖5 測(cè)試數(shù)據(jù)Rb地球化學(xué)圖:實(shí)際圖(a)和預(yù)測(cè)圖(b)Fig.5 Rb geochemical map of test data: actual map (a) and predicted map (b)

圖6 預(yù)測(cè)表層土壤Rb元素地球化學(xué)圖(a)和成土母質(zhì)圖(b)Fig.6 Predicted surface soil Rb element geochemical map (a) and soil parent material map (b)

通過(guò)上述1∶250 000表層土壤數(shù)據(jù)建立的模型,將1∶50 000表層土壤的K、B、Ni、V、Zn、As、Co和Cu的含量數(shù)據(jù)作為輸入變量導(dǎo)入模型中,得到預(yù)測(cè)的Rb元素含量,并利用GeoIPAS軟件繪制了Rb元素地球化學(xué)圖(圖6(a)),通過(guò)與研究區(qū)的成土母質(zhì)背景(圖6(b))對(duì)比可知,預(yù)測(cè)結(jié)果比較符合實(shí)際特征:①Rb元素含量的高值區(qū)與花崗巖出露區(qū)高度套合,這是因?yàn)樽匀唤鏡b通常以伴生狀態(tài)賦存于花崗巖或花崗偉晶巖中[43];②Rb元素含量的低值區(qū)與第四系全新統(tǒng)沖積物分布密切相關(guān),其原因?yàn)镽b離子半徑較大,水化能(離子被水分子包圍的牢固程度)小,陽(yáng)離子易被帶負(fù)電的膠體黏土礦物吸附在原地,不易隨水流遷移[46],因此在第四系沖積物中含量相對(duì)較低,出現(xiàn)低值區(qū);③已發(fā)現(xiàn)螢石礦的周圍往往都有Rb元素含量高值區(qū),因?yàn)槲炇V常常有鋰銣云母伴生[47]。

3 結(jié)論與展望

本研究立足土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查出現(xiàn)的小比例尺調(diào)查元素多而大比例尺調(diào)查元素少的現(xiàn)狀,旨在對(duì)大比例尺缺失的礦產(chǎn)元素進(jìn)行空間預(yù)測(cè),通過(guò)大量數(shù)據(jù)的訓(xùn)練和學(xué)習(xí),以稀有金屬Rb元素為例,定量探索土地質(zhì)量地球化學(xué)數(shù)據(jù)之間的關(guān)系。以同一地區(qū)1∶250 000表層土壤元素含量數(shù)據(jù)建立隨機(jī)森林模型,在1∶50 000尺度Rb元素的空間預(yù)測(cè)取得了良好的效果,Rb元素預(yù)測(cè)值與地質(zhì)背景和表生地球化學(xué)過(guò)程保持較高的一致性,可視化結(jié)果較好地展現(xiàn)了表層土壤Rb元素的空間分布主要受地質(zhì)背景和表生地球化學(xué)作用控制。主要結(jié)論如下:①在構(gòu)建隨機(jī)森林模型時(shí),采用變量重要性度量排序和構(gòu)建學(xué)習(xí)曲線的組合方法進(jìn)行預(yù)測(cè)變量的優(yōu)選,模型對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)和測(cè)試數(shù)據(jù)的擬合優(yōu)度分別達(dá)到0.983 2和0.895 6,說(shuō)明預(yù)測(cè)變量的優(yōu)選方法是有效的;②由變量重要性度量結(jié)果可知,表層土壤中Rb元素含量與K、B含量具有很強(qiáng)的相關(guān)性;③通過(guò)對(duì)大比例尺Rb元素空間預(yù)測(cè)結(jié)果的佐證,表明將大數(shù)據(jù)機(jī)器學(xué)習(xí)算法引入表層土壤地球化學(xué)元素含量的空間定量預(yù)測(cè)具有可行性。

土地質(zhì)量地球化學(xué)調(diào)查近些年積累了海量數(shù)據(jù),立足數(shù)據(jù)的特點(diǎn),本文僅以Rb元素為例,介紹了小比例尺建模、大比例尺預(yù)測(cè)的方法,展示了該算法變量?jī)?yōu)選的過(guò)程和預(yù)測(cè)的能力。首次嘗試把大數(shù)據(jù)機(jī)器學(xué)習(xí)算法運(yùn)用到土地質(zhì)量地球化學(xué)數(shù)據(jù)定量預(yù)測(cè)中來(lái),并在大比例尺的礦產(chǎn)元素空間定量預(yù)測(cè)中取得了較好的效果,對(duì)預(yù)測(cè)的結(jié)果進(jìn)行了相關(guān)的佐證,具有廣闊的應(yīng)用推廣前景,進(jìn)一步拓展了土地質(zhì)量地球化學(xué)數(shù)據(jù)的服務(wù)應(yīng)用維度。隨著新時(shí)代地質(zhì)調(diào)查事業(yè)“三大轉(zhuǎn)變”的大力推進(jìn),每一名地質(zhì)調(diào)查人員都應(yīng)當(dāng)積極向科技創(chuàng)新和信息化建設(shè)轉(zhuǎn)變,運(yùn)用新技術(shù)新方法充分挖掘數(shù)據(jù)潛力,提升數(shù)據(jù)服務(wù)水平,全面提高地質(zhì)調(diào)查成果的服務(wù)能力。

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