李影,黃幼生,解娜,2,翁陽(yáng)
1 海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院病理科,海口 570102;2 海南醫(yī)學(xué)院口腔組織病理學(xué)教研室
胃癌是全球常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,患者生存期、預(yù)后與胃癌高侵襲、轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)相關(guān)[1]。盡管胃癌多模式治療(全身化療、放療、手術(shù)、免疫治療等)取得很大進(jìn)步,但晚期胃癌5 年生存率仍不到20%,這可能與腫瘤細(xì)胞的高度異質(zhì)性有關(guān)[2-3]。因此,探索新的與胃癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的生物學(xué)標(biāo)記物,為胃癌個(gè)體化治療提供新的靶點(diǎn)具有重要意義。Ras 相關(guān)的C3 肉毒素底物1(RAC1)是Rho-GTPase 家族中最重要的成員之一[4],在細(xì)胞骨架重塑、運(yùn)動(dòng)和周期轉(zhuǎn)運(yùn)中發(fā)揮關(guān)鍵作用[5]。RAC1 主要存在2 種形式,活性RAC1(RAC1-GTP)和非活性RAC1(RAC1-GDP)[6-8]。大部分RAC1-GTP 是不活躍的,當(dāng)RAC1 被激活時(shí),參與肌動(dòng)蛋白應(yīng)力纖維和黏附斑塊的形成,促進(jìn)細(xì)胞骨架重組,調(diào)節(jié)片狀偽足和絲狀偽足延伸,影響細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和極化,促進(jìn)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和遷移,抑制細(xì)胞凋亡[9]。研究發(fā)現(xiàn),RAC1 過(guò)度激活與乳腺癌、結(jié)直腸癌、前列腺癌、宮頸癌等進(jìn)展、轉(zhuǎn)移、治療抗性和總體預(yù)后差有關(guān),有望成為腫瘤靶向治療的候選靶點(diǎn)[10]。然而在胃癌組織中,RAC1-GTP 與患者臨床病理特征及預(yù)后的關(guān)系尚不清晰。我們基于癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)分析RAC1 mRNA 的表達(dá)與胃癌臨床病理特征及預(yù)后的關(guān)系,并收集胃癌患者臨床資料,進(jìn)一步驗(yàn)證生物信息學(xué)分析結(jié)果。
1.1 臨床資料 從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.cancer. gov)下載RNA 表達(dá)譜和胃癌患者的臨床數(shù)據(jù),共收集445 份胃癌樣本,刪除信息不匹配或數(shù)據(jù)不完整的樣本,最終納入胃癌樣本386份,其中配對(duì)樣本27 份。收集2020 年1 月—2021 年10 月海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院臨床病理科存檔的62 份胃癌及其配對(duì)正常胃黏膜石蠟標(biāo)本。從上海芯超生物科技有限公司購(gòu)買(mǎi)有完整隨訪信息的組織芯片1張,其陣列編號(hào)為HStm-Ade180Sur-06,芯片批號(hào)XT14-008,芯片共有樣本90 例,包括癌及癌旁正常胃黏膜組織。患者術(shù)前均未接受放療或化療,病理分期參照第8 版美國(guó)癌癥聯(lián)合委員會(huì)(AJCC)發(fā)布的胃癌分期標(biāo)準(zhǔn)。所有標(biāo)本的獲取經(jīng)過(guò)海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)審核通過(guò),并獲得患者或其家屬知情同意。
1.2 組織芯片構(gòu)建 取62 份胃癌及其配對(duì)正常胃黏膜石蠟標(biāo)本,切片,HE染色,顯微鏡下標(biāo)記具有代表性的正常組織及非壞死區(qū)域腫瘤組織,用內(nèi)徑
1.5 mm 的中空管芯,從標(biāo)記好的供體蠟塊中獲取目標(biāo)組織芯柱,并用直徑1.3 mm 的實(shí)性管芯插入中空管芯,頂出組織芯柱,填充到受體蠟塊??字?。熱蠟封邊,60 ℃恒溫烤箱烤1 h,室溫放置30 min,再放入4 ℃冰箱冷凍后脫模。粗修后以3~5 μm 厚度切片,置于組織防脫片上。以胃腸道間質(zhì)瘤為起始標(biāo)記點(diǎn)。
1.3 胃癌及其正常胃黏膜組織芯片中RAC1 mRNA表達(dá)檢測(cè) 采用RNAscope法。用RNAscope2.5 HD試劑盒對(duì)甲醛固定石蠟包埋(FFPE)樣本進(jìn)行RAC1 mRNA 原位雜交檢測(cè)。操作步驟參照說(shuō)明書(shū),組織切片用二甲苯、100%乙醇脫蠟,雙氧水孵育10 min,RNAscope 靶標(biāo)修復(fù)試劑孵育15 min,RNAscope 蛋白酶Plus 孵育30 min。然后將載玻片與RAC1 mRNA 探針在HybEZ 雜交爐(美國(guó)ACD 公司)中40 ℃孵育2 h,雜交洗滌后,使用HD2.5 檢測(cè)試劑盒(美國(guó)ACD 公司)對(duì)載玻片進(jìn)行信號(hào)放大,并使用Fast-RED 溶液A 和B(1∶60)混合物檢測(cè)雜交信號(hào)。用50%蘇木精Ⅰ進(jìn)行復(fù)染,隨后將載玻片在60 ℃干燥烘箱中干燥15 min 后封片。人類(lèi)管家基因PPIB 為陽(yáng)性對(duì)照,DapB 為陰性對(duì)照。標(biāo)準(zhǔn)顯微鏡(20~40 倍)下檢查RNAscope 結(jié)果。參照RNAscope?2.5HD 可見(jiàn)光紅色試劑盒用戶手冊(cè)半定量評(píng)分指南,將每個(gè)細(xì)胞的信號(hào)點(diǎn)數(shù)量估計(jì)值作為判斷標(biāo)準(zhǔn),每10 個(gè)細(xì)胞的染色點(diǎn)少于1 個(gè)信號(hào)點(diǎn)為0 分,1~3 個(gè)信號(hào)點(diǎn)/細(xì)胞為1 分,4~10 個(gè)信號(hào)點(diǎn)/細(xì)胞(非常少的細(xì)胞簇狀點(diǎn))為2 分,>10 個(gè)信號(hào)點(diǎn)/細(xì)胞(具有簇狀信號(hào)點(diǎn)的陽(yáng)性細(xì)胞少于10%)為3分,>10 個(gè)信號(hào)點(diǎn)/細(xì)胞(具有簇狀信號(hào)點(diǎn)的陽(yáng)性細(xì)胞少于10%)為4 分[11]。評(píng)分<2 分為低表達(dá),評(píng)分≥2 分為高表達(dá)。
1.4 胃癌及其正常胃黏膜組織中RAC1-GTP 蛋白表達(dá)檢測(cè) 采用免疫組化法。石蠟芯片經(jīng)切片、烤片、二甲苯脫蠟、水化、阻斷過(guò)氧化物酶后,Tris-EDTA 修復(fù)液熱修復(fù)法修復(fù)12 min、冷卻7 min。RAC1-GTP 一抗(1∶200,武漢紐斯特生物技術(shù)有限公司)37 ℃孵育1 h。PBS 清洗5 min×3 次,二抗(福州邁新生物技術(shù)開(kāi)發(fā)有限公司)37 ℃孵育20 min。PBS 清洗5 min×3 次,DAB 顯色(福州邁新生物技術(shù)開(kāi)發(fā)有限公司)至陽(yáng)性對(duì)照明顯的棕黃色,洗滌后蘇木精襯染1 min。結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn):陽(yáng)性細(xì)胞染色定位在細(xì)胞膜和(或)細(xì)胞質(zhì),呈淡黃色、棕褐色顆粒。根據(jù)陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)百分比及陽(yáng)性細(xì)胞染色強(qiáng)度進(jìn)行評(píng)分,陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)百分比<5%為0 分、5%~25%為1 分、>25%~50%為2 分、>50%為3 分;無(wú)著色(0 分)、淡黃色為1 分、棕黃色為2分、黃褐色為3 分。兩項(xiàng)評(píng)分相乘結(jié)果<3 為低表達(dá),≥3 為高表達(dá)[12]。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS26.0 統(tǒng)計(jì)軟件。符合正態(tài)分布計(jì)量資料用-x±s表示,比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用率或例表示,比較采用χ2檢驗(yàn);單變量生存分析采用Kaplan-Meier 生存分析法;用Cox 比例風(fēng)險(xiǎn)模型分析胃癌患者預(yù)后的影響因素。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中RAC1 mRNA 表達(dá)變化及其與患者臨床病理特征的關(guān)系 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中胃癌組織中RAC1 mRNA 相對(duì)表達(dá)量(155.1 ± 43.6)高于癌旁正常胃黏膜組織(116.0 ± 30.1),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。RAC1 mRNA 表達(dá)變化與胃癌發(fā)病部位、浸潤(rùn)深度有關(guān)(P均<0.05),見(jiàn)表1。以RAC1 mRNA 表達(dá)的均值為界,分為高表達(dá)、低表達(dá)。RAC1 mRNA 高表達(dá)與低表達(dá)胃癌患者中位生存期分別為396、500 d,比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
表1 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中RAC1 mRNA表達(dá)與胃癌患者臨床病理特征的關(guān)系(例)
2.2 胃癌組織中RAC1 mRNA 表達(dá)變化及其與患者臨床病理特征關(guān)系的臨床驗(yàn)證 胃癌組織中RAC1 mRNA 高表達(dá)率為80.6%(50/62)、低表達(dá)率為19.3%(12/62);癌旁正常胃黏膜組織中RAC1 mRNA低表達(dá)率為90.3%(56/62)、高表達(dá)率為11.5%(6/62)。二者比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。RAC1 mRNA的表達(dá)變化與胃癌患者性別、年齡及腫瘤發(fā)生部位、最大徑、分化程度、浸潤(rùn)深度、病理分期、脈管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移均無(wú)關(guān)(P均>0.05)。見(jiàn)表2。
2.3 胃癌組織中RAC1-GTP蛋白表達(dá)變化及其與患者臨床病理特征的關(guān)系 胃癌組織中RAC1-GTP 蛋白在胞質(zhì)內(nèi)點(diǎn)狀或彌漫表達(dá),低表達(dá)率為22.3%(34/152)、高表達(dá)率為77.6%(118/152);癌旁正常胃黏膜組織中RAC1-GTP 蛋白不表達(dá)或胞質(zhì)內(nèi)點(diǎn)狀表達(dá),低表達(dá)率為84.8%(129/152)、高表達(dá)率為15.1%(23/152)。二者比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。RAC1-GTP蛋白表達(dá)變化與胃癌浸潤(rùn)深度、病理分期、脈管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P均<0.05)。見(jiàn)表2。
表2 RAC1 mRNA及RAC1-GTP蛋白表達(dá)與胃癌患者臨床病理特征的關(guān)系(例)
2.4 RAC1-GTP蛋白表達(dá)與胃癌患者預(yù)后的關(guān)系 有完整隨訪資料的胃癌組織芯片90 份,采用電話隨訪的方式,隨訪時(shí)間為1~83 個(gè)月。RAC1-GTP 蛋白低表達(dá)、高表達(dá)患者的中位生存期分別為80、20個(gè)月,二者比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
2.5 RAC1-GTP 對(duì)胃癌患者預(yù)后的影響 單因素Cox 回歸分析顯示,90 例胃癌患者預(yù)后與腫瘤分化程度、浸潤(rùn)深度、病理分期、脈管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及RAC1-GTP 蛋白表達(dá)有關(guān)(P均<0.05)。多因素Cox回歸分析顯示,腫瘤病理分期高、RAC1-GTP 蛋白高表達(dá)是胃癌預(yù)后的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素(P均<0.05)。見(jiàn)表3。
表3 影響胃癌患者預(yù)后的單因素、多因素分析
RAC1 被認(rèn)為是一種促進(jìn)人類(lèi)癌癥惡性轉(zhuǎn)化和進(jìn)展的癌基因[13]。RAC1 在多種惡性腫瘤(肺癌、腎細(xì)胞癌、乳腺癌、上皮性卵巢癌、肝細(xì)胞癌等)中高表達(dá)及活性增強(qiáng)[14]。RAC1 的活化與腫瘤進(jìn)展、轉(zhuǎn)移、治療抗性以及各種實(shí)體腫瘤患者的總體預(yù)后較差有關(guān)[10]。我們前期研究顯示,RAC1 在胃癌組織中高表達(dá),與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、浸潤(rùn)深度、TNM 分期相關(guān)[15];在結(jié)直腸癌中miR-142-3p 模擬物轉(zhuǎn)染結(jié)腸癌細(xì)胞可抑制RAC1 的表達(dá),降低癌細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力[16]。以上研究證實(shí)RAC1 在人類(lèi)癌癥中起關(guān)鍵作用。
隨著基因組科學(xué)和下一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,在大量生物體中發(fā)現(xiàn)了豐富的基因組信息,新的蛋白質(zhì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)也正在被引入。已經(jīng)開(kāi)發(fā)的許多公開(kāi)可用的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫(kù)和資源可幫助我們快速找到合適的蛋白質(zhì)相關(guān)信息學(xué)資源[17]。本研究首先通過(guò)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析RAC1 mRNA 的表達(dá)及其與臨床病理特征的關(guān)系,結(jié)果顯示RAC1 mRNA 在胃癌中高表達(dá),且RAC1 mRNA 表達(dá)與腫瘤部位、浸潤(rùn)深度有關(guān),與患者的性別、年齡、病理分期、淋巴結(jié)是否轉(zhuǎn)移、生存期無(wú)關(guān)。此結(jié)果與后續(xù)RNAscope?原位雜交結(jié)果不完全一致,可能與其數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)來(lái)源不同有關(guān)。
為驗(yàn)證以上結(jié)論,本研究選用來(lái)自海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院病理科的胃癌組織標(biāo)本,制作胃癌組織芯片。相比傳統(tǒng)的全組織切片,組織芯片有以下幾點(diǎn)優(yōu)勢(shì):實(shí)驗(yàn)條件一致,減少樣本間實(shí)驗(yàn)偏差;降低免疫組化的試劑成本和不同組織間的染色差異,減少實(shí)驗(yàn)錯(cuò)誤;經(jīng)濟(jì)優(yōu)勢(shì),節(jié)省了消耗品和勞動(dòng)力;操作程序更快速,可以節(jié)省大量時(shí)間;最低最大限度地減少組織的使用[18-20];在組織芯片中進(jìn)行免疫組化及原位雜交檢測(cè),操作更為便捷,結(jié)果更為可靠。由于臨床胃癌組織新鮮標(biāo)本難以取得,且mRNA 容易降解,不易在石蠟組織切片中檢測(cè)到。近年來(lái),RNAscope?在腫瘤(包括乳腺癌、肺癌、肝癌、胃腺癌、食管癌、淋巴瘤、尿路上皮癌等)的研究中都有應(yīng)用,非常有效且特異地檢測(cè)到mRAN 的表達(dá)。據(jù)此我們選用RNAscope?檢測(cè)RAC1 mRNA 在胃癌組織中的表達(dá)。RNAscope?是一種新的現(xiàn)代原位雜交技術(shù),具有高度敏感性和特異性,具有獨(dú)特的探針設(shè)計(jì)策略(雙Z 設(shè)計(jì)),可以同時(shí)進(jìn)行信號(hào)放大和背景噪聲抑制[21],實(shí)現(xiàn)單分子的可視化,同時(shí)在甲醛固定、石蠟包埋組織切片中保留組織形態(tài)[22]。與聚合酶鏈反應(yīng)分析相比,它更穩(wěn)定方便,還可在光學(xué)顯微鏡下在甲醛固定和石蠟包埋切片中觀察單細(xì)胞水平的mRNA[23]。與其他方法相比,它采用的探針池允許檢測(cè)片段化RNA,解決了在常規(guī)甲醛固定石蠟包埋標(biāo)本中檢測(cè)部分降解的RNA 這一難題[21]。我們利用RNAscope?也同樣在胃癌及其配對(duì)組織中觀察到RAC1 mRNA 明顯的表達(dá)信號(hào)。在普通光學(xué)顯微鏡下可以直觀地觀察到每個(gè)細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)的RAC1 mRNA 紅色信號(hào)點(diǎn)。結(jié)果顯示,胃癌組織RAC1 mRNA 高表達(dá)率高于癌旁正常胃黏膜組織;但與胃癌臨床病理特征無(wú)明顯相關(guān)性。說(shuō)明RAC1 mRNA 表達(dá)的增高可能是胃癌發(fā)生的一個(gè)早期分子事件。
研究結(jié)果顯示,總RAC1 的免疫反應(yīng)性不能作為乳腺癌患者的預(yù)后因素,是由于RAC1 mRNA 或RAC1 蛋白的數(shù)量并不總是反映RAC1 的活性;且RAC1-GTP 表達(dá)與乳腺癌患者的細(xì)胞增殖和不良預(yù)后密切相關(guān)[24]。也有研究表明,RAC1-GTP 參與結(jié)直腸癌干細(xì)胞的調(diào)節(jié),RAC1-GTP 在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)水平與TNM 分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移以及患者的生存顯著相關(guān)[10,25]。本研究結(jié)果同樣顯示,RAC1-GTP 蛋白在胃癌組織中高表達(dá),與腫瘤的浸潤(rùn)深度、病理分期、脈管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),且RAC1-GTP 高表達(dá)是胃癌患者預(yù)后不良的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素。
總之,本研究證明RAC1 mRNA 及RAC1-GTP在胃癌組織中高表達(dá),并且RAC1-GTP 高表達(dá)與腫瘤的浸潤(rùn)深度、病理分期、脈管侵犯、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),說(shuō)明RAC1 的活性狀態(tài)的高低與胃癌的進(jìn)展有關(guān);并且RAC1-GTP 的高表達(dá)與胃癌患者的不良預(yù)后密切相關(guān),或能成為胃癌新的預(yù)后指標(biāo)及潛在的治療靶標(biāo)。本研究?jī)H從組織學(xué)水平證明RAC1 與胃癌進(jìn)展存在密切關(guān)系,從細(xì)胞水平及活體內(nèi)進(jìn)一步深入研究將有助于闡明RAC1 促胃癌發(fā)展的作用機(jī)制。