吳同壘,冀夢瑤,周詩淼,張瑩輝,李佩國*,蔣 卉* (.河北科技師范學院 河北省預防獸醫(yī)學重點實驗室,河北 秦皇島 066004;.中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京 00080)
腸炎沙門菌能夠引起多種動物的腹瀉、嘔吐等臨床癥狀,以及幼齡動物的大規(guī)模死亡[1-2];成年動物抵抗力強,往往呈隱性感染,但可通過其分泌物向外界排菌,這也是導致其所致疾病難以凈化的主要原因[3]。被污染的動物產(chǎn)品被人類食用或人類直接接觸感染動物可引起胃腸炎等疾病,對人類健康造成嚴重威脅[4]。因此,控制動物及動物產(chǎn)品中沙門菌的流行,對人類健康和公共衛(wèi)生有著重要意義。目前防控沙門菌感染主要依賴抗生素,但耐藥菌株的出現(xiàn)給防控工作帶來了巨大壓力。進一步研究其耐藥機制,對防治沙門菌感染具有重要意義。
生物被膜能夠顯著增強細菌的耐藥性,幫助細菌逃避機體的免疫防御反應,造成慢性感染,給疾病防控帶來一定的困難。甘油激酶(glycerokinase,GlpK)在大多數(shù)細菌和動物細胞中普遍存在,主要參與甘油代謝和質(zhì)膜的合成[5]。多項研究證實,分枝桿菌屬細菌可利用GlpK調(diào)節(jié)細菌的耐藥性,針對GlpK靶點而設(shè)計的藥物可有效治療結(jié)核病,揭示了GlpK與耐藥性之間的關(guān)系[6-7]。腸炎沙門菌GlpK能否影響細菌生物被膜的形成,進而影響其耐藥性,需要進一步闡明。
本研究構(gòu)建了腸炎沙門菌GlpK基因敲除菌株,并進行生物被膜分析和藥敏試驗,為新型靶向抗菌藥物的研發(fā)奠定了重要基礎(chǔ)。
1.1 菌株來源腸炎沙門菌c50336、溫敏型質(zhì)粒pKD3、pCP20,重組酶表達質(zhì)粒pKD46,由河北科技師范學院預防獸醫(yī)學重點實驗室保存;質(zhì)粒pMD18-T購自寶生物工程(大連)有限公司。
1.2 試劑和試劑盒Taq酶、T4連接酶購自寶生物工程(大連)有限公司;DNA Marker、熒光定量PCR試劑購自康為世紀生物公司;反轉(zhuǎn)錄試劑、限制性內(nèi)切酶和蛋白Marker購自Thermal Scientific公司;L-阿拉伯糖購自Sigma公司;ID32E生化鑒定試紙條購自Biomerieux公司,細菌RNA提取試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司。
1.3 基因敲除和回補相關(guān)引物的設(shè)計根據(jù)NCBI的GenBank中腸炎沙門菌基因組GlpK的基因信息設(shè)計引物。引物P3和P4由兩部分組成,用于擴增氯霉素基因,下劃線部分與GlpK基因同源,其余部分與氯霉素基因同源;引物P5、P6根據(jù)引物P3和P4與GlpK同源片段兩側(cè)的序列設(shè)計,用于敲除菌株的鑒定;引物P1和P2用于pKD46質(zhì)粒的鑒定;引物P7、P8用于GlpK回補表達菌株的構(gòu)建。引物信息見表1,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
表1 引物序列及相關(guān)信息
1.4 GlpK基因敲除菌株及回補株的構(gòu)建提取質(zhì)粒pKD46,電擊轉(zhuǎn)化至腸炎沙門菌c50336中,具體操作:取c50336培養(yǎng)至對數(shù)期,使用預冷的去離子水洗滌3次并重懸,87 μL/管分裝,取3 μL質(zhì)粒pKD46,與之混勻進行電擊,電壓為1.8 kV,電擊后使用LB液體培養(yǎng)基于37℃培養(yǎng),涂布含Amp的LB平板,長出單菌落后,以引物P1和P2鑒定。
以質(zhì)粒pKD3為模板,使用引物P3、P4進行擴增和回收,獲得同源片段;在培養(yǎng)至對數(shù)期的c50336(攜帶pKD46)菌液中加入終濃度30 mmol/L的阿拉伯糖誘導2 h,將同源片段電擊轉(zhuǎn)化至c50336(攜帶pKD46)菌株中,電擊過程同前所述;涂布含氯霉素的LB平板,長出單菌落后使用引物P5和P6鑒定。陽性菌經(jīng)42℃熱激去除質(zhì)粒pKD46,命名為c50336::cat。將質(zhì)粒pCP20電轉(zhuǎn)化入c50336::cat,經(jīng)抗性篩選得到丟失氯霉素片段的菌株,即為2次重組菌株c50336ΔglpK,以引物P5和P6對其進行鑒定。42℃熱激去除質(zhì)粒pCP20。
以引物P7和P8擴增GlpK基因,雙酶切后克隆至回補質(zhì)粒pMD18-T,即為pMD18-T-glpK,將質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化至菌株c50336ΔglpK中,即為回補菌株 c50336ΔglpK+glpK。
1.5 生長曲線測定和生化特性分析培養(yǎng)過夜細菌按1∶100轉(zhuǎn)接新鮮LB或LB(含氯霉素)液體培養(yǎng)基,37℃,180 r/min振蕩培養(yǎng);在多個時間點測定菌液D600 nm,并繪制生長曲線。使用ATB自動鑒定系統(tǒng)進行菌株生化特性分析,簡要操作如下:挑取單菌落分散在生理鹽水中,滴加在ID32E生化鑒定試紙條上,并使用礦物油滴加在厭氧孔;將試紙條放在濕盒中,37℃培養(yǎng)過夜;次日向吲哚孔滴加James后上機分析。
1.6 生物被膜形成能力檢測采用試管法和微孔板法進行生物被膜測定。試管法操作步驟:過夜培養(yǎng)菌液按照1∶100比例轉(zhuǎn)接到含有6 mL液體培養(yǎng)基的試管中,28℃低速振蕩培養(yǎng)72 h(轉(zhuǎn)速60 r/min ),棄去液體培養(yǎng)基,使用PBS小心洗滌5次。試管洗滌后,使用酒精燈火焰干燥,加入甲醇(要沒過菌液平面)固定10 min,棄去甲醇,用PBS反復清洗;加入2%的結(jié)晶紫溶液染色30 min,用PBS反復清洗,觀察試管壁上的生物被膜。微孔板法簡要步驟:將過夜培養(yǎng)菌液加入到96孔微量板中,每孔加入200 μL,按照上述方法培養(yǎng)、洗滌和染色后,加入100 μL無水乙醇,溶解孔壁上結(jié)晶紫,測定D570 nm光密度值。
1.7 藥敏試驗取菌液均勻涂板,使用無菌鑷子取藥敏紙片貼于平板上,37℃倒置培養(yǎng)12 h。觀察抑菌圈并測量抑菌圈直徑,根據(jù)NCCSL標準判定結(jié)果。
1.8 Curli菌毛和纖維素的檢測Curli菌毛檢測步驟:滴加菌液到含有160 mg/L剛果紅與10 mg/L考馬斯亮藍的無鹽LB平板上,28℃培養(yǎng)2 d,觀察菌落形態(tài)和顏色。能夠形成Curli菌毛的菌落表面粗糙、干燥,顏色更紅,反之,則出現(xiàn)顏色較淺且光滑的菌落。纖維素的檢測步驟:滴加菌液到含有 Calcofluor White Stain(200 mg/L)的無鹽LB平板上,28℃培養(yǎng)2 d,在紫外燈下觀察。能夠形成纖維素的菌落熒光強度高,反之,熒光強度低。
1.9 生物被膜相關(guān)基因的表達分析培養(yǎng)細菌c50336、c50336ΔglpK至對數(shù)期,使用細菌RNA提取試劑盒提取RNA;用DNaseⅠ去除DNA后,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,選擇文獻[8]中與生物被膜形成相關(guān)的基因及其引物,采用染料法進行熒光定量PCR分析,內(nèi)參使16S rRNA。引物序列見表2。
表2 PCR引物名稱及序列
2.1 GlpK基因缺失菌株和回補菌株的構(gòu)建以1次重組菌株c50336ΔglpK::cat和2次重組菌株c50336ΔglpK的菌液為模板,使用引物P5、P6鑒定,結(jié)果見圖1A,與預期相符,證明GlpK基因敲除菌株構(gòu)建成功。以回補菌株c50336ΔglpK+glpK菌液為模板,以引物P7、P8進行鑒定,結(jié)果見圖1B,與預期結(jié)果一致,表明回補菌株構(gòu)建成功。
A.GlpK基因敲除菌株的鑒定結(jié)果(M.DL5000 Plus DNA Marker;1.c50336;2.c50336ΔglpK::Cat;3.c50336ΔglpK);B.回補菌株的鑒定結(jié)果(M.DL2000 Plus DNA Marker;1.c50336;2.c50336ΔglpK;3.c50336ΔglpK+glpK)圖1 GlpK基因敲除菌株的鑒定和回補菌株驗證
2.2 菌株生長曲線測定和生化特性分析生長曲線繪制結(jié)果(圖2)顯示,3株菌株的生長曲線趨勢一致,基因敲除菌株c50336ΔglpK菌株的生長相比于野生型c50336菌株,無明顯差異,表明在LB培養(yǎng)的條件下,腸炎沙門菌缺失GlpK基因?qū)ιL和營養(yǎng)代謝影響不大。生化特性鑒定結(jié)果(表3)顯示,菌株c50336ΔglpK和c50336ΔglpK+glpK的d-纖維二糖發(fā)酵結(jié)果為陰性,野生型菌株c50336為陽性,菌株c50336ΔglpK的α-半乳酸酐酶αGAL為陽性,菌株c50336為陰性,菌株c50336ΔglpK+glpK為陽性,表明GlpK基因缺失腸炎沙門菌的生化特性影響較小。
WT.c50336;KO.c50336ΔglpK;RS.c50336ΔglpK+glpK圖2 生長曲線
表3 GlpK基因敲除菌株生化鑒定結(jié)果
2.3 生物被膜檢測采用試管法和微孔板法進行生物被膜測定,試管法檢測結(jié)果見圖3A,可見菌株c50336ΔglpK試管中形成的生物被膜相比于c50336和c50336ΔglpK+glpK淺且細。結(jié)晶紫染色法檢測結(jié)果顯示,c50336ΔglpK菌株黏附的結(jié)晶紫吸光度值,明顯低于菌株c50336和c50336ΔglpK+glpK(圖3B)。上述結(jié)果表明GlpK敲除可降低腸炎沙門菌的生物被膜形成能力。
A.試管法;B.微孔板法。WT.c50336;KO.c50336ΔglpK;RS.c50336ΔglpK+glpK;**.示0.001
2.4 藥敏試驗耐藥性結(jié)果顯示(表4),相對于野生型菌株c50336,菌株c50336ΔglpK對喹諾酮類藥物、內(nèi)酰胺類藥物中的頭孢曲松和頭孢拉定,替米考星、氨基糖甙類藥物中的諾氟沙星和恩諾沙星,酰胺醇類中的氟苯尼考,以及乙酰甲喹的敏感性顯著提高?;匮a菌株耐藥性得到部分恢復,但對替米考星和乙酰甲喹等藥物敏感性未得到恢復,可能的原因是回復菌株GlpK基因表達水平并未完全達到生理水平,且由于染色體上GlpK的敲除導致附近處于同一操縱子下的基因的表達受到抑制,進而影響了菌株耐藥性。這些結(jié)果表明敲除GlpK基因降低了腸炎沙門菌的耐藥性。
表4 GlpK基因缺失菌株藥敏試驗結(jié)果
2.5 Curli菌毛和纖維素檢測Curli菌毛試驗檢測結(jié)果顯示菌株c50336和c50336ΔglpK+glpK形成紅色、邊緣粗糙的菌落,而菌株c50336ΔglpK形成白色且邊緣光滑的菌落(圖4A),表明GlpK基因缺失降低了腸炎沙門菌產(chǎn)生Curli菌毛的能力。纖維素檢測結(jié)果顯示菌株c50336的菌落熒光強度比菌株c50336ΔglpK亮,菌株c50336ΔglpK+glpK的菌落熒光強度得到一定恢復(圖4B)。結(jié)果表明敲除GlpK基因能抑制腸炎沙門菌纖維素的產(chǎn)生。
WT.c50336;KO.c50336ΔglpK;RS.c50336ΔglpK+glpK圖4 Curli菌毛(A)和纖維素的檢測(B)
2.6 生物被膜相關(guān)基因的表達基因表達分析結(jié)果顯示bcsgD、bcsA、ropS、ompR、rfbH和fimD表達量均發(fā)生不同程度降低(圖5),表明GlpK影響生物被膜的形成是多種機制共同作用的結(jié)果,這在一定程度上揭示了其在生物被膜形成中的作用機制。
WT.c50336;KO.c50336ΔglpK;*.示0.01
腸炎沙門菌是重要的人獸共患致病菌,主要引起幼齡動物死亡和成年動物的隱性感染以及人類胃腸炎,具有重要的公共衛(wèi)生學意義。細菌可在人、動物、動物產(chǎn)品和環(huán)境之間循環(huán)傳播,給疾病的防控工作帶來嚴重挑戰(zhàn)。在臨床實踐中,腸炎沙門菌感染往往依靠抗生素進行防治,隨著而來的是耐藥菌株的大量出現(xiàn)。相關(guān)研究顯示,甘油激酶GlpK可介導分枝桿菌的耐藥,針對該基因設(shè)計的靶向藥物可有效治療相關(guān)疾病[6-7]。因此,本研究構(gòu)建了腸炎沙門菌GlpK基因敲除菌株,并進行了生長曲線、生化特性、耐藥性和生物被膜形成能力分析,結(jié)果顯示GlpK基因敲除可顯著降低腸炎沙門菌的耐藥性和形成生物被膜的能力,降低了其Curli菌毛和纖維素的產(chǎn)生,下調(diào)了生物被膜形成相關(guān)基因的表達,研究結(jié)果為腸炎沙門菌新型靶向抗菌藥物的研發(fā)奠定了重要基礎(chǔ)。
耐藥甚至多重耐藥菌株給相關(guān)疾病的防控工作帶來極大壓力。不同于抗生素類藥物,新型靶向藥物不易產(chǎn)生耐藥,是目前抗菌藥物研發(fā)的重要方向。GlpK可介導分枝桿菌的耐藥性,但在腸炎沙門菌中的作用尚不明確。本研究通過同源重組技術(shù)構(gòu)建了腸炎沙門菌GlpK敲除菌株,采用K-B紙片法分析其耐藥性的變化,證明GlpK基因可介導腸炎沙門菌對喹諾酮類藥物、內(nèi)酰胺類藥物中的頭孢曲松和頭孢拉定,替米考星、氨基糖甙類藥物中的諾氟沙星和恩諾沙星,酰胺醇類中的氟苯尼考,以及乙酰甲喹的耐藥性。研究結(jié)果證明GlpK可影響腸炎沙門菌的耐藥性,為新型靶向藥物的研制奠定了重要基礎(chǔ)。
生物被膜是為單一或多種類細菌為適應周圍環(huán)境,附著于生物或非生物的固體表面而形成的具有一定結(jié)構(gòu)的微生物群體,可保護細菌免于抗菌藥物的殺傷作用,與細菌耐藥性息息相關(guān)[8-9]。本研究利用試管法和微孔板法證明GlpK基因敲除菌株的生物被膜形成能力顯著降低,從生物被膜角度揭示了其影響耐藥性的作用機制。卷曲菌毛(Curli菌毛)和纖維素是沙門菌生物被膜的主要成分[10],本研究證明GlpK敲除菌株生成Curli菌毛和纖維素的能力降低,進一步揭示了該基因影響腸炎沙門菌生物被膜形成的機制。
研究顯示,調(diào)控基因qbcsgD可影響Curli菌毛的生物合成;ropS和ompR基因可激活qbcsgD基因轉(zhuǎn)錄,進而對生物被膜產(chǎn)生影響[11-12];rfbH基因可能通過影響細菌O-抗原的形成,從而影響生物被膜的形成;fimD基因編碼鞭毛蛋白,鞭毛形成和生物被膜密切相關(guān)[13-14];bcsA基因也可影響沙門菌生物被膜形成[15-16]。本研究通過熒光定量PCR方法證明GlpK基因敲除后,bcsgD、bcsA、ropS、ompR、rfbH和fimD表達量降低,研究結(jié)果從分子水平揭示了GlpK影響沙門菌生物被膜形成的機制。
綜上所述,本研究利用同源重組技術(shù)構(gòu)建了腸炎沙門菌GlpK基因敲除菌株,并進行了生物被膜和藥物敏感性檢測,同時分析了該基因影響生物被膜形成的作用機制,為防控沙門菌感染的靶向藥物研發(fā)奠定了重要基礎(chǔ)。