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美國(guó)《Emerging Infectious Diseases》2022年第5期有關(guān)人獸共患病論文摘譯

2022-08-11 08:56:12江典偉
關(guān)鍵詞:變體估計(jì)值青霉

P915 英國(guó)2018-2019年與家庭醫(yī)療相關(guān)的侵襲性A組鏈球菌疫情//Laura E. Nabarro, Colin S. Brown, Sooria Balasegaram,等

疫情日益與醫(yī)療保健等服務(wù)相關(guān),但emm分型和全基因組測(cè)序可以幫助確定病例群。醫(yī)療保健相關(guān)侵襲性A組鏈球菌(iGAS)疫情在世界范圍內(nèi)普遍存在,但只有英國(guó)報(bào)道了與家庭健康護(hù)理(HHC)相關(guān)的疫情。2018-2019年英國(guó)發(fā)生10次疫情,累計(jì)96例iGAS病例(2~39例/次),28例死亡(病死率29%)。疫情暴發(fā)持續(xù)時(shí)間3~517 d;病例間隔中位數(shù)20.5 d(1~225 d)。疫情甄別較為困難,但emm分型和全基因組測(cè)序提高了鑒別能力。網(wǎng)絡(luò)分析表明此類疫情存在多條潛在的傳播途徑。篩查9起疫情中的366名HHC工人,發(fā)現(xiàn)僅1名工人攜帶A組鏈球菌??刂拼祟愐咔楸┌l(fā)需要多種干預(yù)措施,包括感染預(yù)防的改進(jìn)、設(shè)備消殺和人員抗菌等。iGAS疫情未得到充分認(rèn)識(shí),尚不明確有效的干預(yù)措施和傳播途徑。公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)應(yīng)關(guān)注HHC相關(guān)iGAS疫情,保障患者健康并減少死亡。

P924 2015-2017年全球產(chǎn)碳青霉烯酶腸桿菌基因組流行病學(xué)//Gisele Peirano, Liang Chen, Diego Nobrega,等

具有不同地理分布大腸桿菌種群具有不同的主要基因序列類型,提示需進(jìn)行持續(xù)的基因組監(jiān)測(cè)。2015-2017年對(duì)36個(gè)國(guó)家229株產(chǎn)碳青霉烯酶大腸桿菌進(jìn)行全球分子流行病學(xué)描述。常見碳青霉烯酶有苯唑西林酶(OXA)181(23%)、新德里金屬β-內(nèi)酰胺酶(NDM)5(20%)、OXA-48(17%)、肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶2(15%)和NDM-1(10%)。已確定5種顯性序列類型(STs);4個(gè)是全球性的(ST410、ST131、ST167和ST405),1個(gè)(ST1284)僅限于土耳其。OXA-181在約旦(因ST410-B4/H24RxC子代碼)和土耳其(因ST1284子代碼)較常見。在12個(gè)國(guó)家的11個(gè)STs中發(fā)現(xiàn)了幾乎相同的IncX3-blaOXA-181質(zhì)粒。NDM-5在埃及、泰國(guó)(與ST410-B4/H24RxC和ST167-B子代碼相關(guān))和越南(因ST448子代碼)頻繁出現(xiàn)。OXA-48在土耳其較常見(與ST11260子代碼相關(guān))。全球肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶與ST131 C1/H30亞型相關(guān),NDM-1與各種STs相關(guān)。具有不同特征和不同地理分布的不同STs序列類型決定全球碳青霉烯酶大腸桿菌種群,提示需進(jìn)行持續(xù)的基因組監(jiān)測(cè)。

P940 美國(guó)2個(gè)大城市污水處理廠污水監(jiān)測(cè)估算2種SARS-CoV-2變體的相對(duì)豐度//Alexander T. Yu,1 Bridgette Hughes,1 Marlene K. Wolfe,等

監(jiān)測(cè)急性重癥呼吸綜合征冠狀病毒2型(SARS-CoV-2)變異毒株(VOCs)對(duì)于冠狀病毒病的公共衛(wèi)生管理意義重大?;驕y(cè)序具集約和不典型性特征,并非所有的分離株都能進(jìn)行基因測(cè)序。廢水SARS-CoV-2 RNA濃度與棚屋區(qū)冠狀病毒病的發(fā)病率相關(guān),因此監(jiān)測(cè)廢水中的VOCs較有價(jià)值。開發(fā)反轉(zhuǎn)錄PCR檢測(cè)廢水沉淀物中α和δVOC變體的豐度,將其應(yīng)用于美國(guó)兩個(gè)大型城市棚屋區(qū)2020年7月至2021年8月的樣本,并與病例分離的VOC豐度值進(jìn)行估計(jì)比較。廢水測(cè)量值與病例分離的VOC豐度估計(jì)值密切相關(guān)(α,rp 0.82-0.88;δ,rp 0.97)。即使在SARS-CoV-2總RNA水平<5%的廢水和病例隔離前可分離到的樣本的1~3周中也可檢測(cè)到突變。重癥急性呼吸綜合征的比較見圖1。廢水中SARS-CoV-2變體監(jiān)測(cè)策略有助于完善病例分離測(cè)序。

2021年2月1日至7月31日,美國(guó)加利福尼亞州圣何塞和薩克拉門托,與冠狀病毒病病例分離株相關(guān)的廢水固體中值得關(guān)注的冠狀病毒2變異(A、 B)根據(jù)圣何塞(A)和薩克拉門托(B)污水廠過去14 d收集和測(cè)序的病例分離物測(cè)序數(shù)據(jù)估計(jì),循環(huán)嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2型異毒株中歸因于α和δ變體的比例。(C、 D)在圣何塞(C)和薩克拉門托(D)通過廢水中的N基因濃度標(biāo)準(zhǔn)化,α(HV69-70)和δ(Del156-157/R158G)變異病毒中發(fā)現(xiàn)的突變濃度,過去14 d的平均值。未顯示前14 d內(nèi)未進(jìn)行測(cè)量的日期的數(shù)據(jù)。N:核蛋白圖1 重癥急性呼吸綜合征的比較

P948 以色列BNT162b2疫苗增強(qiáng)劑對(duì)SARS-CoV-2感染和突破病例并發(fā)癥的有效性研究//Aharona Glatman-Freedman, Michal Bromberg, Yael Hershkovitz,等

在以色列,對(duì)年齡大于16歲且病程持續(xù)時(shí)間小于20周的突破病例進(jìn)行疫苗BNT162b2(輝瑞生物技術(shù)公司,https://www.pfizer.com) 增強(qiáng)劑后并發(fā)癥(住院、重癥和死亡)效果評(píng)估。第3周,16~59歲人群的VE估計(jì)值達(dá)到96.8%(95%CI: 96.0%~97.5%)保持抗體水平8周,60歲以上人群的VE估計(jì)值達(dá)到93.1%(95%CI: 91.8%~94.2%)保持抗體水平11周。隨后緩慢下降,最后2~3周下降明顯。最后一周的評(píng)估顯示16~59歲和60歲以上人群的VE估計(jì)值分別為77.6%(95%CI: 68.4%~84.2%)和61.3%(52.5%~68.4%)。VE估計(jì)值下降明顯的同時(shí),Omicron變異體活性同時(shí)迅速增加。整個(gè)評(píng)估過程中突破病例并發(fā)癥的減少率保持在中等至較高水平。

P957 美國(guó)紐約市住宅區(qū)蜱蟲控制干預(yù)措施對(duì)蜱蟲數(shù)量、人類接觸蜱蟲和蜱媒疾病發(fā)病率的影響//Felicia Keesing,1 Stacy Mowry, William Bremer,等

萊姆病等蜱傳疾病(TBD)導(dǎo)致美國(guó)每年約50萬(wàn)病例。各種能在較小空間上減少蜱蟲數(shù)量的方法措施能否降低TBD的發(fā)病率尚不清楚。為測(cè)試2種環(huán)境無(wú)害干預(yù)措施進(jìn)行了一項(xiàng)隨機(jī)、重復(fù)、完全交叉、安慰劑對(duì)照、雙盲試驗(yàn),即蜱蟲控制系統(tǒng)(TCS)和Met52真菌噴霧劑,兩者單獨(dú)或聯(lián)合使用,在24個(gè)居民區(qū)進(jìn)行人及寵物的TBD風(fēng)險(xiǎn)和發(fā)病率試驗(yàn)。所有參與的社區(qū)人員及物業(yè)同等對(duì)待。TCS與更少的蜱蟲和更少的寄生嚙齒動(dòng)物蜱有關(guān)。干預(yù)措施未形成人群TBDs發(fā)病率的顯著差異,但顯著降低了寵物TBDs的發(fā)病率。與之前的研究證據(jù)相同,減少居住區(qū)蜱蟲數(shù)量可能不會(huì)減少人群TBD的發(fā)生。

P977 測(cè)試將現(xiàn)有人群免疫力作為豬流感大流行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的一部分//Jonathan Tin Lai Cheung, Tim K. Tsang, Hui-ling Yen,等

人獸共患流感不斷地威脅著人類健康。防范大流行則需要對(duì)動(dòng)物病毒進(jìn)行持續(xù)監(jiān)測(cè)和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,而群體免疫是風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的一個(gè)重要組成部分。我們測(cè)定了在中國(guó)香港和廣州流行的按年齡分層的5種豬流感病毒的血凝素抑制抗體血清陽(yáng)性率。使用血凝素抑制抗體血清陽(yáng)性率及滴度,我們模擬了如果每種病毒在人類中傳播,人群免疫對(duì)基本繁殖數(shù)(R0)的影響。在353份人血清樣本中,我們報(bào)告3組重組H1N2和歐亞禽類H1N1流感病毒的血清陽(yáng)性率均較低,這使R0僅降低18%~20%。引起大流行所需的最小R0為1.22~1.24,這意味著現(xiàn)有的人群免疫力不足以阻止這些H1N1或H1N2變體的傳播。對(duì)于起源于人類的H3N2,現(xiàn)有的群體免疫可將R0抑制到47%,從而降低大流行風(fēng)險(xiǎn)。

P986 美國(guó)5-11歲兒童首劑2019冠狀病毒疫苗接種率差異//Neil Chandra Murthy, Elizabeth Zell, Hannah E. Fast,等

分析了美國(guó)2021年11-12月5-11歲兒童首劑冠狀病毒疫苗的接種率。兒童疫苗接種率因轄區(qū)司法、年齡組和種族/族裔影響而存在差異,結(jié)果顯示在疫苗推出的前兩個(gè)月,5~11歲兒童首劑冠狀病毒疫苗的接種率顯著落后于12~15歲青少年的疫苗接種率。

P998 感染SARS-CoV-2 Omicron變異體的疫苗接種者脫落病毒持續(xù)時(shí)間//Kenichiro Takahashi, Masahiro Ishikane, Mugen Ujiie,等

為了確定病毒脫落的持續(xù)時(shí)間,檢查日本2021年 11月29日-12月18日感染嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2 Omicron變體的患者上呼吸道采集的臨床樣本。輕度或無(wú)癥狀感染的疫苗接種者在發(fā)病或診斷后,甚至在癥狀緩解后病毒脫落仍會(huì)持續(xù)6~9 d。

蜱媒腦炎病毒(TBEV)主要通過蜱蟲叮咬傳播,但人類可因食用未經(jīng)高溫消毒的受染動(dòng)物奶而感染。尚未證實(shí)或排除母乳喂養(yǎng)傳播TBEV的可能性。一例可能通過母乳喂養(yǎng)從未接種疫苗的母親傳播給嬰兒的TBEV病例報(bào)告。

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