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長鏈非編碼RNA5(CARLo-5)在食管癌中的表達(dá)及臨床意義

2022-09-09 05:49耿錦楠張雅青張煦陸濱
甘肅醫(yī)藥 2022年8期
關(guān)鍵詞:食管癌淋巴結(jié)基因

耿錦楠張雅青張煦 陸濱

1.蘭州大學(xué)第一醫(yī)院,甘肅 蘭州 730000;2.西北民族大學(xué),甘肅 蘭州 730030;3.蘭州大學(xué),甘肅 蘭州 730000;4.蘭州市第二人民醫(yī)院,甘肅 蘭州 730000

食管癌(esophageal carcinoma,EC)是全球范圍內(nèi)常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率在惡性腫瘤中居第九位,病死率居第六位[1-2],嚴(yán)重威脅人類生命安全。中國是EC高發(fā)國家,全球每年約50%的新發(fā)EC病例在我國,其中食管鱗癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)是其最常見的病理亞型[3],約占EC的90%[3,4]。進(jìn)行性咽下困難是ESCC的典型臨床癥狀,但該病早期進(jìn)展緩慢,偶有不適感或癥狀輕重不一,因而發(fā)病早期通常無法及時(shí)察覺,確診時(shí)多數(shù)患者已處于中晚期,腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移造成死亡率較高,給患者及其家庭帶來沉重負(fù)擔(dān)。因此,有必要探尋一種可用于食管癌早期診斷、靶向治療、復(fù)發(fā)監(jiān)測及預(yù)后判斷的高效能手段。

近年來,高通量測序技術(shù)的發(fā)展速度很快,非編碼RNA的應(yīng)用逐漸受到關(guān)注。長鏈非編碼RNA(LncRNA)普遍存在于細(xì)胞質(zhì)與細(xì)胞核,它是一類長度>200個核苷酸的RNA,且無法編碼蛋白質(zhì)[5]。有證據(jù)表明LncRNA具有廣泛的生物學(xué)作用,其異常表達(dá)可能與多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[6],但現(xiàn)階段人們對LncRNA的具體機(jī)制及相關(guān)功能所知甚少。癌癥相關(guān)區(qū)域長鏈非編碼RNA5(CARLo-5)最初發(fā)現(xiàn)于結(jié)腸癌中,后陸續(xù)發(fā)現(xiàn)其高表達(dá)于肝癌、肺癌等惡性腫瘤[7],但其在EC組織中表達(dá)及臨床意義的研究報(bào)道較少。本研究采用Realtime-PCR法檢測患者癌組織及對應(yīng)癌旁組織標(biāo)本CARLo-5表達(dá)水平,分析CARLo-5在EC組織中的表達(dá)情況及其與EC患者臨床病理特征和預(yù)后的關(guān)系。

1 資料與方法

1.1 一般資料 選取2015年3月至2016年10月行食管癌根治術(shù)的食管癌患者58例,每例患者均取癌組織及非癌組織(距癌組織>5cm)標(biāo)本,上述標(biāo)本均有詳細(xì)完整的臨床資料及組織病理診斷。采集標(biāo)本后存于離心管中(無RNA酶),置-80℃冰箱保存。58例患者中男性41例,女性17例,年齡42~78歲,平均(59.87±8.76)歲。參照2017年國際抗癌聯(lián)盟(union for interna tional cancer control,UICC)和美國癌癥聯(lián)合會(American joint committee on cancer,AJCC)發(fā)布的食管癌TNM分期標(biāo)準(zhǔn)(第8版)進(jìn)行分期,依據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)病理分級標(biāo)準(zhǔn)[8]確定分化程度(1級:高度分化;2級:中度分化;3級:低度分化)。

1.2 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn)。①術(shù)后病理證實(shí)為食管鱗癌,均行根治性切除術(shù);②均為原發(fā)性食管鱗癌,術(shù)前未行放化療;③本研究經(jīng)蘭州大學(xué)第一醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn);④標(biāo)本采集獲得患者及家屬同意,均簽署知情同意書。

1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn)。①心、肝、腎等重要臟器功能不全者;②合并自身免疫疾病或精神疾病者;③食管腺癌(EAC)或并發(fā)其他惡性腫瘤者。

1.3 主要儀器及試劑 光學(xué)顯微鏡(日本OLYMPUS公司,BX41型)、倒置相差顯微鏡(日本Niko公司,TS100型)、生物安全柜(山東濟(jì)南鑫貝西公司,BSC-1500ⅡA型)、PCR儀(美國ABI公司,ABI5700型)、Realtime-PCR(Applied Biosystems公司,7500型)、高速低溫離心機(jī)(TTICH-400型)、無菌培養(yǎng)瓶(美國Costar公司)、TRIzolR試劑(美國Invitrogen Life Technologies公司)、SYBR Real-Time PCR試劑盒(美國Thermo公司)、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(美國Invitrogen公司)、細(xì)胞裂解液(北京索萊寶科技有限公司)、PCR引物(上海生工技術(shù)有限公司)等。

1.4 檢測方法 ①總RNA提取及鑒定:a.實(shí)驗(yàn)前制冰,以離心機(jī)預(yù)冷20min;固體組織置于培養(yǎng)皿,以手術(shù)剪剪成小塊(約3mm×3mm)后置于研磨器中,加入TRIzol裂解液,充分研磨后將組織勻漿液移至1.5mLEP管;加200μL氯仿至EP管,手動震蕩12s,后冰上靜置10min,4℃下12000rpm離心30min;吸取無色液相置入新EP管(取上層,500μL即可),后加異丙醇500μL,混勻后冰上靜置10min,4℃下離心30min;棄上清見RNA沉入管底,加75%乙醇1mL至EP管中后溫和震蕩,使RNA再度懸浮,4℃下離心5min;棄上清,以槍頭吸取剩余乙醇,室溫下晾干;RNA沉淀與焦碳酸二乙酯(DEPC)水相溶后,-80℃下保存待用。b.RNA檢測:以0.1%DEPC水調(diào)零檢測儀,取1μL RNA稀釋液測定濃度、純度,A260/A280介于1.8~2.0時(shí)視為純度合格,無污染。即刻讀取濃度,其濃度介于500~1000ng/μL間最為適宜,酌加0.1%DEPC水調(diào)整。②Realtime-PCR法檢測CARLo-5表達(dá)水平:a.反轉(zhuǎn)錄合成cDNA:采用反轉(zhuǎn)錄試劑盒完成RNA至cDNA制備,于-20℃下保存?zhèn)溆茫籦.PCR擴(kuò)增:PCR引物:設(shè)計(jì)合成后引物呈粉末狀,以離心機(jī)高速離心,參照摩爾數(shù)適量添加DEPC水,配制儲存液(濃度為100mmol/L)后保存,工作液濃度10mmol/L,引物序列見表1;PCR反應(yīng)條件:CARLo-5/GAPDH:95℃預(yù)變性5min,設(shè)定循環(huán)參數(shù)(95℃15s、60℃30s、72℃30s,共40次),72℃延伸5min。c.目的基因鑒定:取DNAladder、目的基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物各5μL,以GAPDH基因?yàn)閮?nèi)參照,分析灰度值比或以2-ΔΔCT表示各目的基因相對表達(dá)量。根據(jù)EC組織中CARLo-5相對表達(dá)倍數(shù)(癌/癌旁組織)之中位數(shù)分化低表達(dá)組(癌/癌旁組織<2.80,24例)和高表達(dá)組(癌/癌旁組織>2.80,34例)。以EC組織中CARLo-5相對表達(dá)量平均數(shù)4.25為分界點(diǎn),分為CARLo-5高表達(dá)組和低表達(dá)組。

表1 引物序列及擴(kuò)增條件

1.5 隨訪 以門診和電話隨訪等方式開展術(shù)后隨訪,隨訪截止日期為2019年11月10日。以手術(shù)開始至死亡或末次隨訪時(shí)間定義總生存期(overall survival,OS),分析其術(shù)后生存情況。

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS20.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析數(shù)據(jù)。計(jì)量資料采用(±s)表示,以獨(dú)立樣本t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以%表示,予χ2檢驗(yàn);以COX分析法分析影響EC患者生存情況的相關(guān)因素,以Kaplan-Meier曲線分析生存情況,組間行Log-Rank檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 EC組織及癌旁組織中CARLo-5表達(dá)水平比較Realtime-PCR檢測結(jié)果顯示,EC組織中CARLo-5相對表達(dá)量上調(diào)(4.25±9.02)明顯高于配對癌旁組織(1.09±0.95),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.653,P<0.05)。見圖1,2。

圖1 LncRNA CARLo-5在食管癌和癌旁組織中的表達(dá)水平

2.2 CARLo-5與EC患者臨床病理特征的關(guān)系 食管癌組織中CARLo-5表達(dá)與患者年齡、性別、腫瘤分化程度、位置和大小無關(guān)(P>0.05),與腫瘤TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況有關(guān)(P<0.05)。見表2。

表2 CARLo-5與EC患者臨床病理特征的關(guān)系(例)

2.3 EC患者CARLo-5表達(dá)與生存情況的關(guān)系CARLo-5高表達(dá)組生存率顯著低于CARLo-5低表達(dá)組(χ2=6.941,P<0.05,高表達(dá)組平均生存期為(24.39±1.68)月,低表達(dá)組平均生存期為(31.42±1.48)月,高表達(dá)組生存期顯著短于低表達(dá)組(t=2.653,P<0.05)。見圖2。

圖2 EC患者CARLo-5表達(dá)與生存情況的關(guān)系

2.4 EC患者OS影響因素的Cox分析 單因素分析顯示TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、CARLo-5表達(dá)水平為影響EC患者OS的危險(xiǎn)因素(P<0.05)。見表3。COX多因素回歸分析顯示淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、CARLo-5表達(dá)水平是影響OS的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(P<0.05)。見表4。

表3 影響EC患者OS的單因素分析

表4 影響EC患者OS的Cox多因素回歸分析

3 討論

EC主要有ESCC和EAC兩種組織學(xué)形式,前者多因食管鱗狀上皮細(xì)胞不典型增生演變發(fā)展而來,后者則由食管下段復(fù)層上皮緩慢演變或腸上皮細(xì)胞化生而來,近年來其發(fā)生率呈不斷升高態(tài)勢。我國北方地區(qū)是EC高發(fā)地區(qū),其中主要為ESCC。據(jù)報(bào)道[9-10],與EC死亡相關(guān)病例約50%以上發(fā)生于中國,防治形勢十分嚴(yán)峻。

近年來,轉(zhuǎn)錄組學(xué)及高通量測序技術(shù)的研究獲得較大進(jìn)展,人們發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)基因被轉(zhuǎn)錄成ncRNA,且上述基因在漫長的生物進(jìn)化過程中得以保留,這對傳統(tǒng)基因表達(dá)及調(diào)控模式提出了新的挑戰(zhàn)?,F(xiàn)有研究證實(shí)轉(zhuǎn)錄成LncRNA的ncRNA占76%[11-12],且具備組織特異性,能在表觀遺傳調(diào)控中發(fā)揮關(guān)鍵性作用[13]。隨著臨床研究的進(jìn)一步深入,越來越多的學(xué)者發(fā)現(xiàn)LncRNA異常表達(dá)于多種惡性腫瘤,可同時(shí)作為癌基因或抑癌基因,并參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程,被認(rèn)為是相關(guān)腫瘤潛在的診斷、預(yù)后判斷標(biāo)志物乃至治療靶點(diǎn)[14]。EC的發(fā)病機(jī)制目前仍未完全闡明,其發(fā)展過程同時(shí)也是一種復(fù)雜的生物學(xué)過程,遺傳及表觀遺傳學(xué)被認(rèn)為參與了該病的發(fā)生發(fā)展。現(xiàn)有研究證實(shí)LncRNA與EC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),其中HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA被證實(shí)在絕大多數(shù)ESCC中呈異常表達(dá),是癌細(xì)胞侵襲及轉(zhuǎn)移能力得以增強(qiáng)的重要驅(qū)動因素,同時(shí)也是影響患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素[15]。

CARLo-5是一種近年來研究較多的LncRNA,相繼被學(xué)者發(fā)現(xiàn)在結(jié)直腸癌、肝癌、肝內(nèi)膽管癌、肺癌等多種惡性腫瘤中呈高表達(dá)。管群等[16]指出,CARLo-5在子宮內(nèi)膜癌組織中表達(dá)水平異常升高,與腫瘤分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和患者預(yù)后密切相關(guān)。Dou C等[17]經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),CARLo-5可作為肝癌治療的新靶點(diǎn),該基因敲除能明顯抑制腫瘤生長。本研究采用Realtime-PCR檢測58例EC組織及癌旁組織CARLo-5情況,結(jié)果顯示EC組織中CARLo-5表達(dá)水平明顯高于癌旁組織,提示EC組織中CARLo-5表達(dá)上調(diào)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)CARLo-5表達(dá)與TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),其高表達(dá)多見于TNM分期Ⅲ、Ⅳ期患者和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者中,推測其可能在該病發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用,隨著EC患者病情進(jìn)展CARLo-5表達(dá)量亦隨之升高,這與管群等[16]關(guān)于CARLo-5在子宮內(nèi)膜癌中表達(dá)情況的相關(guān)研究結(jié)論一致。但EC組織中CARLo-5表達(dá)上調(diào)的具體機(jī)制及生物學(xué)功能尚不明確,可能與CARLo-5能抑制細(xì)胞凋亡、誘導(dǎo)EC細(xì)胞增殖有關(guān)。研究認(rèn)為[18],癌癥的易感性增加與CARLo-5的表達(dá)水平有關(guān),推測其可能在腫瘤發(fā)生及進(jìn)展中起一定作用。此外,本研究經(jīng)隨訪發(fā)現(xiàn)CARLo-5高表達(dá)組患者的生存率及生存期均較低表達(dá)組差,提示CARLo-5高表達(dá)可能與EC患者預(yù)后相關(guān),可能在預(yù)后評估中有重要價(jià)值。同時(shí),本研究發(fā)現(xiàn)單因素及Cox多因素回歸分析結(jié)果顯示淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、CARLo-5表達(dá)水平是影響OS的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,這進(jìn)一步揭示CARLo-5表達(dá)可能在EC患者預(yù)后評估中有一定價(jià)值。

綜上所述,CARLo-5在食管癌組織中較癌旁組織顯著上調(diào),其表達(dá)與TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等臨床特征有關(guān);淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、CARLo-5表達(dá)水平是影響食管癌患者生存的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,其中CARLo-5表達(dá)水平可能與食管癌發(fā)生發(fā)展有一定關(guān)系,并可能成為該病預(yù)后評估的重要生物標(biāo)志物。本研究主要存在以下不足:①僅納入58例EC患者,樣本量較少,后期需擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步證實(shí)CARLo-5在EC患者中的臨床價(jià)值;②癌組織中CARLo-5表達(dá)上調(diào)的具體機(jī)制仍有待進(jìn)一步研究。目前對于LncRNA的功能人們?nèi)运邢蓿蚪M研究發(fā)現(xiàn)LncRNA是一種具備復(fù)雜調(diào)控機(jī)制的分子,其可能延伸范圍目前尚不確定。盡管LncRNA無法編碼蛋白質(zhì),但可向下游傳遞相關(guān)信息,并在調(diào)控基因表達(dá)方面發(fā)揮重要作用,因而作為一種信息傳導(dǎo)分子其在疾病診治方面可能較傳統(tǒng)意義上的蛋白質(zhì)更具特異性和敏感性。目前LncRNA及CARLo-5的研究尚處于初始階段,相信隨著相關(guān)研究的進(jìn)一步深入,人們會逐步揭示CARLo-5等LncRNA與食管癌以及其他惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,并逐漸加深理解和認(rèn)識,最終在食管癌等惡性腫瘤的診斷和治療中發(fā)揮其作用。

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