應曉波,張傳領
金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)是引起皮膚和軟組織感染(skin and soft tissue infections,SSTIs)最常見的病原體,可引起膿皰病、壞死性筋膜炎等疾病[1]。金黃色葡萄球菌產(chǎn)生多種毒力因子,其中殺白細胞素(Panton-Valentine leukocidin,PVL)是一種雙組分孔隙形成毒力蛋白,與皮膚軟組織感染密切相關[2]。社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(community-associated methicillin-resistantStaphylococcusaureus,CA-MRSA)是常見的耐藥性社區(qū)群體感染病原菌。我們前期對pvl基因亞型初步研究發(fā)現(xiàn),引起SSTIs的CA-MRSA攜帶pvl基因比率較高,但不同菌株遺傳特征不明確[3]。因此,本研究檢測與分析了引起SSTIs的攜帶pvl基因CA-MRSA菌株(pvl+-CA-MRSA)的分子特征,以期更有效地預防、診斷和治療pvl+-CA-MRSA 所致SSTIs提供依據(jù)。
1.1 菌株來源 收集浙江蕭山醫(yī)院就診為SSTIs患者標本,采用VITEK-2 Compact全自動微生物鑒定系統(tǒng)進行菌種鑒定,已分離鑒定的MRSA用PCR擴增mecA基因再次確證,然后用30%甘油肉湯、-70 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩RSA ATCC 49775(陽性質控)和MRSA N315(陰性質控)為上海市第一人民醫(yī)院劉慶中博士惠贈。CA-MRSA判讀標準參照文獻[4]。
1.2 儀器和試劑 二氧化碳恒溫培養(yǎng)箱為美國Forma Scientific公司產(chǎn)品;Vitek 2 全自動微生物鑒定儀購自法國Bio-Merieux 公司并配套鑒定卡片GP和藥敏卡AST-GP67)。GeneAmp PCR System 9600為美國ABI公司產(chǎn)品,EPS-100 電泳儀為上海天能科技有限公司產(chǎn)品,UV-3B 紫外成像儀為珠海黑馬醫(yī)學儀器有限公司產(chǎn)品,CHEF-MAPPER脈沖場凝膠電泳(PFGE)儀為美國Bio-Rad公司產(chǎn)品。細菌基因組DNA提取試劑盒為美國Axygen公司產(chǎn)品,Lysostaphin、Premix Taq Version 2.0和DNA Marker購自寶生物工程(大連)有限公司(TaKaRa),PCR引物由上海生工生物工程有限公司合成。
1.3.1 藥物敏感試驗 采用VITEK-2 Compact全自動細菌檢測分析系統(tǒng)及其AST-GP67 藥敏卡檢測CA-MRSA 菌株對不同抗菌藥物的敏感性。
1.3.2 細菌基因組DNA制備 采用細菌基因組DNA提取試劑盒(美國 Axygen)按說明書提取CA-MRSA菌株基因組DNA,其中含有1 mg/mL溶葡萄球菌酶,紫外分光光度法測定DNA濃度和純度。
1.3.3pvl基因檢測與亞型確認 參照文獻報道的PCR檢測CA-MRSA菌株中pvl基因[5],擴增產(chǎn)物由上海生工生物工程有限公司測序。按Boakes等[6]介紹的PCR采用3對引物分別擴增654、718和680 bp不同亞型pvl基因片段。擴增產(chǎn)物由上海生工生物工程有限公司測序后參照O’Hara等[7]的方法判斷pvl基因亞型。
1.3.4 SCCmec分型 參照文獻采用多重PCR 檢測并確定pvl+-CA-MRSA菌株SCCmec類型(Ⅰ-Ⅴ)[8]。MRSA ATCC49775(陽性質控)、SCCmec分型質控菌株NCTC10442(Ⅰ型)、N315(Ⅱ型)、85/2082(Ⅲ型)、JCSC4744(Ⅳ型)和HS663(Ⅴ型)由上海市第一人民醫(yī)院劉慶中博士惠贈。
1.3.5 序列類型(STs)、克隆復合物(CCs)、金黃色葡萄球菌蛋白A(spa)和輔助基因調節(jié)子(agr)位點分型 根據(jù)PCR產(chǎn)物測序結果進行STs/CCs分型。參照Enright等[9]介紹的方法,采用PCR擴增arcC、aroE、glpF、gmk、pta、tpi、yqiL 7個靶基因,擴增產(chǎn)物測序,根據(jù)MLST數(shù)據(jù)庫(http://www.mlst.net)分析確定其STs,通過網(wǎng)絡(http://eburst.mlst.net/)中eBURST程序 (enhanced based upon related sequence types)進行CCs分析。參照文獻用spa分型引物PCR檢測[10],擴增產(chǎn)物測序后通過網(wǎng)站(http://www.ridom.de/spaserver/) 分析,獲得spa型別。agr分型采用文獻報道的多重PCR法[11]。
1.3.6 PFGE分型pvl+-CA-MRSA菌株DNA用限制性核酸內切酶SmaⅠ酶切和PFGE后,采用BioNemuerics 軟件對條帶模式進行聚類分析,相似度大于80%的條帶判為有密切相關性[12]。
1.3.7 統(tǒng)計學方法 獲得的數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0統(tǒng)計學軟件進行χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1pvl基因檢出率及分布特征 本研究從SSTIs患者標本中分離獲得92株CA-MRSA(頭孢西丁抑菌圈≤21 mm和mecA基因陽性),其中24株為pvl+-CA-MRSA,檢出率為26.1%(24/94),其余68株為未攜帶pvl基因CA-MRSA (pvl--CA-MRSA)。24株pvl+-CA-MRSA中,男性患者13例、女性11例,平均年齡(24.5±19.0)歲。病種以皮膚膿腫為主(50%,12/24),其次為外傷感染(45.8%,11/24)。不同年齡組患者中分離CA-MRSA的pvl陽性率差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.031,P>0.05)(表1)。
表1 不同年齡SSTIs患者中分離CA-MRSA的pvl陽性率Tab.1 pvl positivity rates of CA-MRSA isolates from patients with SSTIs by age
2.2 藥物敏感試驗結果 除對β-內酰胺類抗菌藥物(青霉素、苯唑西林和頭孢西丁)耐藥外,24株pvl+-CA-MRSA對紅霉素、克林霉素、四環(huán)素、復方新諾明、環(huán)丙沙星和慶大霉素的耐藥率分別為87.5%、62.5%、54.2%、16.7%、8.3% 和8.3%,未發(fā)現(xiàn)耐莫西沙星、利福平、利奈唑胺和萬古霉素的菌株(表2)。與68株pvl--CA-MRSA比較,pvl+-CA-MRSA菌株對四環(huán)素的耐藥率較高(χ2=6.091,P<0.05),但對其它抗菌藥物耐藥率差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
表2 CA- MRSA菌株對不同抗菌藥物的耐藥率Tab.2 Resistance rates of CA-MRSA isolates to various antibiotics
2.3pvl+-CA-MRSA分子特征 24株pvl+-CA-MRSA菌株中,H亞型23株(H1亞型3株、H2亞型20株),R亞型(R2)1株;共鑒定出8種不同的STs和7種CCs,其中以ST59(62.5%,15/24)和CC59(70.8%,17/24)為主;SCCmec型別主要為III和IVa,分別占54.2%和33.3%;agr等位基因以agrI(87.5%,21/24)最常見,其余為agrIII,共檢出8種spa型,以t437型(66.7%,16/24)最為常見。因此,pvl+-CA-MRSA的優(yōu)勢克隆為pvlH2、ST59/CC59、SCCmecIII/IVa、agrI、t437(58.3%,14/24),見表3。
表3 24株pvl+-CA-MRSA菌株分子特征Tab.3 Molecular characteristics of 24 pvl+-CA-MRSA isolates
2.4 PFGE分型結果 24株分離自SSTIs患者標本的pvl+-CA-MRSA可分為17種PFGE類型(A-Q)其中A 型(A1-A4 亞型)4株、B 型(B1-B3 亞型)3株、C 型(C1-C2 亞型)2株、D型2株和E-Q型各1株。
SSTIs是化膿性致病菌侵犯表皮、真皮和皮下組織引起的炎癥性疾病,包括毛囊炎、癤、癰、淋巴管炎、急性蜂窩織炎、燒傷創(chuàng)面感染和褥瘡等。金黃色葡萄球菌是SSTIs的主要病原體,其產(chǎn)生的毒力因子如殺白細胞素(PVL)、α-溶血素、表皮脫落毒素、酚溶性調節(jié)蛋白等均與SSTIs嚴重程度相關[13]。PVL可誘導嗜中性粒細胞浸潤,釋放炎癥因子與核因子κB,是壞死性SSTIs的重要毒力因子[14]。Meta分析結果顯示,PVL與深部SSTIs密切相關[15]。流行病學調查結果顯示,pvl+金黃色葡萄球菌感染極易形成區(qū)域性社區(qū)傳播[16]。
PVL被認為是鑒定CA-MRSA的標志之一[17]。我們從SSTIs患者標本中分離獲得的92株CA-MRSA菌株中,pvl陽性率為24.6%,低于國內外報道的63.89%[18]、71.4%[19]和40%[20],這可能與不同地區(qū)和人群差異性有關。pvl+金黃色葡萄球菌常引起蜂窩織炎和膿腫[21]。本研究中,50%pvl+-CA-MRSA菌株中分離自皮膚膿腫標本,與報道一致。
由于地域和人群不同,所流行的pvl+-CA-MRSA分子特征可存在明顯差異。例如,美國為ST8/CC8-SCCmecⅣ、亞洲主要為ST59/CC59-SCCmecⅣ/V、印度為ST22-SCCmecⅣ和ST772-SCCmecⅤ型、歐洲為ST80/CC80-SCCmecⅣ、非洲為ST88-SCCmecⅣ型、澳大利亞為ST93/CC93-SCCmecⅣ[22-24]。本研究中分離自SSTIs的24株pvl+-CA-MRSA中,共鑒定出8種STs和7種CCs,但以ST59(62.5%)和CC59(70.8%)為主,SCCmec主要為III(54.2%)和IV型(33.3%),與上述文獻報道有較大差異。agr等位基因可分為Ⅰ-Ⅳ型,本研究中分離自SSTIs標本的24株pvl+-CA-MRSA中以agrI(87.5%)最常見,其余為agrIII,未發(fā)現(xiàn)其它型別。此外,上述pvl+-CA-MRSA中共檢出8種spa型,以t437型(66.7%)最為常見。值得一提的是,pvl編碼基因易發(fā)生變異,根據(jù)第176位氨基酸種類,可將pvl分為H和R亞型[7],pvl亞型的分布數(shù)據(jù)國內外報道均較少,本研究中分離的24株pvl+-CA-MRSA以H2亞型為主(pvlH2),與國外文獻報道不同[7]。上述24株pvl+-CA-MRSA的PFGE可檢出17種類型(A-Q)共23 種帶型,顯示出明顯的多態(tài)性,說明菌株進化來源于多個克隆系,可能在進化過程中存在較大變異。
我們的藥物敏感試驗結果顯示,除對青霉素、苯唑西林、頭孢西丁等β-內酰胺類抗菌藥物耐藥外,24株pvl+-CA-MRSA對紅霉素、克林霉素、四環(huán)素、復方新諾明、環(huán)丙沙星和慶大霉素的耐藥率分別為87.5%、62.5%、54.2%、16.7%、8.3% 和8.3%,未發(fā)現(xiàn)對莫西沙星、利福平、利奈唑胺和萬古霉素有耐藥性。有文獻報道,克林霉素、利奈唑胺和夫西地酸能在體外抑制MRSA時表達pvl[25]??肆置顾睾屠芜虬肥羌毦鞍踪|合成的抑制劑,故可能抑制金黃色葡萄球菌結構蛋白和酶類的合成,即使在亞抑菌水平下,利奈唑胺也可使金黃色葡萄球菌更易被中性粒細胞吞噬[26]。然而,本研究中pvl+-CA-MRSA菌株對克林霉素有較高耐藥率(62.5%),該抗生素已不適合用于pvl+-CA-MRSA引起的SSTIs治療,但上述菌株對利奈唑胺高度敏感,可作為治療pvl+-CA-MRSA引起的SSTIs首選藥物。
利益沖突:無
引用本文格式:應曉波,張傳領.引起皮膚軟組織感染的殺白細胞素陽性社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌分子特征研究[J].中國人獸共患病學報,2022,38(9):778-783.DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2022.00.124