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貉源細(xì)小病毒(RDPV)HeB17株的分離鑒定及基因組序列分析

2022-11-15 02:41:00王振軍羅國良程悅寧馮二凱劉利芳于清平朱先鵬鄧旭明王建鋒
中國獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2022年10期
關(guān)鍵詞:病料細(xì)小腸炎

王振軍,羅國良,程悅寧,馮二凱,劉利芳,郭 利,于清平,朱先鵬,鄧旭明,王建鋒*

(1.吉林大學(xué) 動物醫(yī)學(xué)學(xué)院,吉林 長春 130062;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 特產(chǎn)研究所,吉林 長春 130122;3.通化縣農(nóng)業(yè)綜合行政執(zhí)法大隊(duì),吉林 通化 134100;4.柳河縣農(nóng)業(yè)綜合行政執(zhí)法大隊(duì),吉林 柳河 135300)

近年,貉源細(xì)小病毒(RDPV)在我國主要貉養(yǎng)殖地區(qū)(東北三省、河北、山東)普遍流行,尤以夏季(6-7月份)仔貉分窩時(shí)最為嚴(yán)重,病貉主要表現(xiàn) 為嚴(yán)重的腹瀉、脫水、消瘦等胃腸炎癥狀,嚴(yán)重者以死亡告終[1]。該病發(fā)病及死亡率均較高,對我國貉養(yǎng)殖業(yè)造成嚴(yán)重?fù)p失。因RDPV感染貉主要表現(xiàn)為腸炎癥狀,故稱該病為RDPV性腸炎。

RDPV性腸炎是由RDPV引起的一種急性、烈性、高度接觸性傳染病。該病1982年由NEUVONEN等[2]首次報(bào)道犬細(xì)小病毒(CPV)感染貉,此后國外和我國黑龍江地區(qū)也偶見相關(guān)報(bào)道[3-4],起初普遍認(rèn)為是CPV跨種傳播感染貉[5-7],直到1988年由夏咸柱等[8]從病貉中分離出RDPV才確認(rèn)RDPV在我國的流行。長期以來,國內(nèi)外科研人員對RDPV性腸炎的報(bào)道及相關(guān)研究相對較少,但近年來,尤其2015年之后,RDPV性腸炎有區(qū)域性集中暴發(fā)的趨勢,對我國貉養(yǎng)殖業(yè)造成嚴(yán)重?fù)p失,這引起了科研人員對RDPV的再次關(guān)注[9-10]。

RDPV為細(xì)小病毒科細(xì)小病毒屬成員,是單鏈DNA病毒[11]。其基因結(jié)構(gòu)與細(xì)小病毒屬其他成員結(jié)構(gòu)類似,與CPV、水貂細(xì)小病毒(MEV)、貓細(xì)小病毒(FPV)有較高的同源性,甚至與犬細(xì)小病毒滅活苗和水貂細(xì)小病毒滅活苗存在一定交叉保護(hù)[12]。本研究從疑似RDPV感染的貉腸道及其內(nèi)容物中成功分離1株病毒,進(jìn)一步對分離得到的病毒進(jìn)行PCR鑒定、病毒分離培養(yǎng)及形態(tài)學(xué)觀察、豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)、基于VP2基因建立的系統(tǒng)發(fā)生樹分析、同源性分析、動物回歸試驗(yàn)等方法的鑒定并對其VP2基因組進(jìn)行了克隆測序分析[13-14],以期了解河北地區(qū)RDPV性腸炎的流行趨勢,為進(jìn)一步研發(fā)RDPV性腸炎疫苗及相關(guān)診斷試劑提供資源和參考。

1 材料與方法

1.1 主要試驗(yàn)材料病料樣品取自河北某貉養(yǎng)殖場的發(fā)病貉,采集病貉的腸道及其內(nèi)容物用于RDPV的分離、培養(yǎng)和鑒定。F81貓腎細(xì)胞購自上海細(xì)胞庫,傳代后保存于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所。

M.M培養(yǎng)基購自美國Gibco公司;胎牛血清由長春西諾生物科技有限公司提供;ExTaq DNA聚合酶、dNTP、pMD18-T載體均購自寶生物工程(大連)有限公司;DNA提取試劑盒、膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購自江蘇康為世紀(jì)生物科技有限公司;DNA Marker購自北京全式金生物科技有限公司;其他化學(xué)試劑均為分析純,購自國藥化學(xué)試劑。

10只2~12月齡的健康試驗(yàn)貉,抗RDPV HI抗體效價(jià)≤1∶8,購自中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所毛皮動物試驗(yàn)基地。

1.2 病料樣品處理取腸道及內(nèi)容物加入MEM充分研磨后制成10%的懸液,研磨過程中反復(fù)凍融3次,加入等體積氯仿混勻,靜置30 min。經(jīng)10 000 r/min 4℃離心30 min取上清,通過0.22 μm的濾膜過濾。加入每毫升1 000 U雙抗4℃過夜,-70℃保存。

1.3 病料樣品PCR鑒定取處理的病料懸液用DNA提取試劑盒提取其基因組,根據(jù)康洪濤等[15]設(shè)計(jì)RDPV檢測引物進(jìn)行PCR檢測,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

1.4 病毒分離、培養(yǎng)及形態(tài)學(xué)檢驗(yàn)將處理好的病料樣品按2%的比例同步接種于生長良好的F81細(xì)胞,設(shè)立正常細(xì)胞對照,置于37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)并逐日觀察細(xì)胞生長狀態(tài),當(dāng)80%細(xì)胞出現(xiàn)CPE時(shí)收獲接毒細(xì)胞,連續(xù)培養(yǎng)3~6代,保存在-70℃以下;取第6代病毒細(xì)胞培養(yǎng)物反復(fù)凍融數(shù)次后經(jīng)4℃、10 000 r/min離心10 min,取上清液經(jīng)0.5%磷鎢酸負(fù)染后進(jìn)行電鏡觀察病毒形態(tài)。

1.5 豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)取第1~6代病毒培養(yǎng)物進(jìn)行豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)鑒定分離毒株的血凝特性。

1.6 病毒理化性質(zhì)測定選取第6代病毒培養(yǎng)物,分別對其進(jìn)行乙醚敏感性試驗(yàn)、耐酸性試驗(yàn)、耐熱性試驗(yàn)同時(shí)設(shè)立對照組,以測定其理化性質(zhì)。具體操作如下:取病毒液1.6 mL,加乙醚0.4 mL,振蕩10 min,置于2~8℃冰箱24 h。次日去除水相并使乙醚完全揮發(fā),測定乙醚處理前和處理后病毒含量變化,判定病毒對乙醚的敏感性;取病毒液2 mL,先用酸將其pH調(diào)至3.0,在37℃作用1 h后,再用碳酸氫鈉將pH調(diào)至7.2,然后測定每毫升病毒含量的變化,判定病毒對酸的耐受性;取病毒液2 mL,56℃水浴1 h,測定每毫升病毒含量的變化,判定病毒對熱的耐受性。

1.7 病毒核酸的提取及VP2基因的擴(kuò)增通過DNA提取試劑盒提取病毒DNA,根據(jù)GenBank中已登錄的RPDV序列,設(shè)計(jì)合成其VP2序列引物:RDPV-F:5′-GCCGGTGCAGGACAAGTA-3′;RDPV-R:5′-CAACCCACACCATAACAACA-3′。利用設(shè)計(jì)的引物擴(kuò)增病毒的VP2序列,預(yù)計(jì)擴(kuò)增產(chǎn)物長度為1 755 bp。

1.8 病毒VP2基因的遺傳進(jìn)化分析及同源性分析將擴(kuò)增得到的VP2基因進(jìn)行測序后獲得病毒VP2基因序列,利用生物信息學(xué)軟件DNAStar、Mega 5.0分析分離病毒以及GenBank中登錄的其他參考株序列的同源性,構(gòu)建分離病毒VP2基因及參考序列的遺傳進(jìn)化樹并分析其遺傳進(jìn)化關(guān)系。

1.9 動物回歸試驗(yàn)選取10只健康貉并對其進(jìn)行分組,試驗(yàn)組5只,對照組5只。用第6代病毒細(xì)胞培養(yǎng)物對試驗(yàn)貉進(jìn)行人工感染試驗(yàn),接種途徑為灌服,接種劑量為5 mL(HA效價(jià)210、含5×107TCID50),對照組接種相應(yīng)體積的正常細(xì)胞培養(yǎng)物,隔離飼養(yǎng),連續(xù)觀察14 d,逐日對試驗(yàn)貉的精神、食欲、體溫、糞便情況進(jìn)行記錄,同時(shí)采集試驗(yàn)貉的糞便樣品進(jìn)行豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)檢測。

2 結(jié)果

2.1 病料樣品PCR鑒定結(jié)果病料樣品經(jīng)RDPV檢測引物PCR鑒定后,結(jié)果顯示,擴(kuò)增出長度近573 bp的特異性條帶,與預(yù)期的目的片段長度一致(圖1)。結(jié)果表明,該病料樣品中含有RDPV。

2.2 病毒分離、培養(yǎng)及形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果將處理的病料按照2%的比例同步接種于生長良好的F81細(xì)胞,連續(xù)盲傳3代,傳至第3代72 h后,細(xì)胞出現(xiàn)脫落、拉網(wǎng)、聚集等明顯的CPE,而對照組細(xì)胞生長狀態(tài)正常,未見異常變化(圖2)。繼續(xù)傳至第6代后對其進(jìn)行標(biāo)記并保存在-70℃以下;對病毒進(jìn)行負(fù)染后在電鏡下觀察,可見直徑約25 nm的球狀、無囊膜、無纖突的病毒樣粒子,這與細(xì)小病毒粒子的大小相符(圖3)。結(jié)果表明,分離到的病毒株為細(xì)小病毒。

A.正常F81細(xì)胞;B.病料樣品接種F81細(xì)胞后72 h出現(xiàn)的CPE

圖3 電鏡下的病毒粒子(40 000×)

2.4 豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)結(jié)果以第1~6代病毒的細(xì)胞培養(yǎng)物進(jìn)行血凝-血凝抑制試驗(yàn),結(jié)果顯示,第1~6代病毒的血凝價(jià)分別為1∶512,1∶512,1∶1 024,1∶1 024,1∶1 024和1∶1 024(圖4)。結(jié)果表明,所分離的細(xì)小病毒具有豬紅細(xì)胞凝集特性。

1~6.第1~6代病毒的細(xì)胞培養(yǎng)物;7~8.正常細(xì)胞對照

2.5 病毒理化性質(zhì)測定結(jié)果第6代毒種培養(yǎng)物經(jīng)乙醚處理、酸處理和56℃高溫處理后,試驗(yàn)組和對照組病毒效價(jià)無明顯差異(表3)。結(jié)果表明,分離的病毒能耐受乙醚、酸和熱處理。

表1 病毒培養(yǎng)物理化特性試驗(yàn)結(jié)果 TCID50/mL

2.6 病毒分子生物學(xué)鑒定、序列分析及同源性比對結(jié)果分離株VP2基因PCR擴(kuò)增結(jié)果(圖5),顯示,在1 755 bp處有目的條帶,片段大小符合預(yù)期,進(jìn)一步證實(shí)分離株為RDPV。分離株VP2序列測序后與GenBank中具有代表性的CPV、FPV、MEV以及RDPV等20余株病毒的VP2基因進(jìn)行對比并建立進(jìn)化樹(圖6),結(jié)果顯示,分離株VP2基因序列與CPV-b2毒株VP2序列相似度較高,位于同一分支上,表明分離株VP2序列與CPV-b2毒株親緣關(guān)系最近;CPV-b2毒株VP2基因序列與RDPV-HLJ11-1、RDPV-LN-10-1、RDPV-HeB-10-1、Abashiri/MEV以及CU-4/FPV毒株VP2基因序列相似性均較高,位于同一分支且在這些序列的上游,表明以上參考株在遺傳關(guān)系上較近,提示RDPV、MEV、FPV均與CPV-b2有關(guān),但是否是由CPV適應(yīng)不同宿主后形成的新類型仍需更多數(shù)據(jù)的證實(shí)。

M.DL2000 Marker;1.VP2基因擴(kuò)增結(jié)果

圖6 RDPV-HeB17分離株VP2基因序列進(jìn)化樹

與參考毒株VP2序列進(jìn)行同源性比對,結(jié)果顯示,其同源性在98.4%~99.5%之間,其中與CU-4-FPV株同源性最低為98.4%,與CPV-b-2株同源性最高為99.5%。此外,本研究中的分離株與國內(nèi)參考序列對比發(fā)現(xiàn)其同源性要高于國外序列參考株,由此可推測,該分離株在我國可能有相同的起源。

2.7 動物回歸試驗(yàn)結(jié)果對健康試驗(yàn)貉分組后進(jìn)行人工感染試驗(yàn),結(jié)果顯示,4只試驗(yàn)組貉分別在攻毒后第5和6天開始出現(xiàn)精神不振、食欲減退、腹瀉、便血等嚴(yán)重的腸炎臨床癥狀,但是體溫并無顯著升高;隨著病情發(fā)展出現(xiàn)食欲廢絕、消瘦脫水、個(gè)別病情嚴(yán)重的病貉出現(xiàn)死亡;采集糞便樣品處理后進(jìn)行紅細(xì)胞凝集試驗(yàn),結(jié)果顯示對豬紅細(xì)胞血凝(HA)效價(jià)均>1∶128(表2)。對死亡試驗(yàn)貉剖檢可見典型的腸炎癥狀:胃表面蒼白,胃黏膜發(fā)紅,腸系膜淋巴結(jié)腫大,腸黏膜出血,腸內(nèi)有血樣內(nèi)容物,肝脾腫大(圖7),對照組試驗(yàn)貉無任何臨床癥狀。以上結(jié)果表明,所分離病毒可對試驗(yàn)貉造成再次感染,動物回歸試驗(yàn)成立。將所分離病毒株命名為RDPV-HeB17。

表2 動物回歸試驗(yàn)結(jié)果(第9天)

圖7 攻毒后照片(糞便、臟器病變)

3 討論

RDPV自20世紀(jì)80年代分離鑒定以來一直鮮有報(bào)道。但隨著我國貉養(yǎng)殖數(shù)量不斷增加,地區(qū)間頻繁引種以及貉養(yǎng)殖環(huán)境治理欠佳,RDPV近年時(shí)有暴發(fā),多位科研人員對該病均有報(bào)道,使貉養(yǎng)殖業(yè)遭受嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。針對RDPV,目前尚無有效疫苗產(chǎn)品問世,加強(qiáng)RDPV流行病學(xué)及致病機(jī)制的研究及其疫苗的研發(fā)投入對RDPV的防控至關(guān)重要。

本研究對所分離RDPV進(jìn)行PCR鑒定、病毒分離培養(yǎng)及形態(tài)學(xué)觀察、豬紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)、基于其VP2基因建立系統(tǒng)發(fā)生樹、同源性分析,并以CPV、FPV、MEV以及RDPV進(jìn)行參考,結(jié)果顯示所分離RDPV-HeB17與RDPV-HLJ、RDPV-LN親緣關(guān)系較近,調(diào)查這些毒株的來源可知,這些毒株的地緣關(guān)系也非常近(分別位于河北、黑龍江、遼寧),根據(jù)對以上地區(qū)貉養(yǎng)殖場的走訪得知,這些地區(qū)之間存在頻繁的引種,這或許對該病的流行起到了促進(jìn)作用。進(jìn)化分析還顯示該分離株與CPV、貓泛白細(xì)胞減少癥病毒(FPV)、水貂腸炎病毒(MEV)也處于同一分支,且CPV處于分支的上游,說明CPV、FPV、MEV、RDPV這些肉食獸細(xì)小病毒親緣關(guān)系較近,這也再次驗(yàn)證了RDPV極有可能是由CPV變異而來,但使用CPV疫苗免疫貉又不能使貉獲得完全保護(hù),也證實(shí)了通過長時(shí)間的自然選擇和環(huán)境壓力,已經(jīng)逐漸形成了一個(gè)新的適應(yīng)在貉體內(nèi)增長繁殖的細(xì)小病毒。

分離株VP2基因與參考毒株VP2基因序列同源性比對結(jié)果顯示,與CU-4-FPV株同源性最低為98.4%,與CPV-b-2株同源性最高為99.5%。氨基酸對比結(jié)果顯示,分離株VP2蛋白序列與RDPV-HeB10-1、RDPV-LN10-1、RDPV-HLJ11-1相比有3處突變,第27位氨基酸殘基由絲氨酸(S)突變?yōu)樘K氨酸(T),第297位氨基酸殘基由絲氨酸(S)突變?yōu)楸彼?A),第562位氨基酸殘基由纈氨酸(V)突變?yōu)榱涟彼?L)。有報(bào)道表明第562位氨基酸突變對RDPV宿主范圍有一定程度影響[10],但第27位、第297位氨基酸突變對病毒的影響還不清楚,有待進(jìn)一步研究。

本研究從發(fā)病貉腸道及內(nèi)容物中成功分離到1株病毒,并對其進(jìn)行了一系列鑒定,證實(shí)該分離株為RDPV,命名為RDPV-HeB17。該毒株的分離對RDPV的進(jìn)一步研究奠定了基礎(chǔ),也為其疫苗的研制提供了材料。

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