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斯萬(wàn)特·帕博:非典型“諾二代”

2022-11-17 02:06何承波
南風(fēng)窗 2022年21期
關(guān)鍵詞:索瓦人尼安德特人

何承波

今年的諾貝爾自然科學(xué)獎(jiǎng)“生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)”有些冷門,給了人類進(jìn)化遺傳學(xué)。

獲獎(jiǎng)?wù)咧挥幸晃唬鸬溥M(jìn)化遺傳學(xué)家斯萬(wàn)特·帕博,古遺傳學(xué)的創(chuàng)始人之一—也意味著,折合人民幣640多萬(wàn)元的獎(jiǎng)金,由他一人獨(dú)享,也是該獎(jiǎng)項(xiàng)近年少見的情況。

同時(shí),這也是進(jìn)化遺傳學(xué)在該獎(jiǎng)項(xiàng)上的首次問鼎。

學(xué)科雖然冷門,但斯萬(wàn)特·帕博卻是一個(gè)明星級(jí)的學(xué)者。他上過《花花公子》,寫過暢銷書,還參與電視節(jié)目。學(xué)術(shù)成就上,他對(duì)古人類基因和人類進(jìn)化的研究,也確實(shí)是開創(chuàng)性的,刷新了我們對(duì)人類起源的認(rèn)知。

帕博的研究,看上去就是“不可能任務(wù)”。他對(duì) 3萬(wàn)年前的尼安德特人進(jìn)行基因測(cè)序,這多少有點(diǎn)瘋狂了。畢竟,1856年尼安德特人被發(fā)現(xiàn)以來(lái),他們到底是獨(dú)立物種,還是我們祖先智人的亞種?100多年來(lái),這些謎團(tuán)只能依靠化石去拼湊,以至懸而未決。

但帕博研究表明,尼安德特人其實(shí)是現(xiàn)代人類的親戚。

當(dāng)然,帕博也并未止步于此。一如諾獎(jiǎng)委員會(huì)的評(píng)價(jià),通過帕博的開創(chuàng)性工作,我們確認(rèn)了智人和已滅絕親屬之間的基因差異,如今密集的研究,正在解釋是什么使我們成為獨(dú)特的人類。

我們的祖先,是否真的是野蠻殘暴的侵略者,橫掃了整個(gè)星球?如果不是,他們又如何與其他物種互動(dòng),他們交配嗎?我們的糖尿病、抑郁癥、煙癮、皮膚病,這些基因又從何處繼承?

換句話說(shuō),與其他物種的互動(dòng),如何造就了人類自身的進(jìn)化優(yōu)勢(shì)與劣勢(shì)?

但對(duì)于帕博來(lái)說(shuō),酷,才是一切的標(biāo)準(zhǔn)。在他進(jìn)入學(xué)術(shù)界的早期,用基因技術(shù)研究古人類,是一項(xiàng)不務(wù)正業(yè)的妄想,但這些謎團(tuán)勾引著他的好奇心,逐漸形成一個(gè)瘋狂的夢(mèng)想。

這項(xiàng)工作極具挑戰(zhàn),如同在巨型垃圾填埋場(chǎng)里,尋找碎紙機(jī)處理過的紙屑,并把它們重新拼接成一本書。而帕博面對(duì)的,是橫跨數(shù)萬(wàn)年的混亂時(shí)空。

瘋狂的計(jì)劃

2006年7月,斯萬(wàn)特·帕博公布了一項(xiàng)空前的計(jì)劃:對(duì)整個(gè)尼安德特人的基因組進(jìn)行測(cè)序。

他是馬克斯·普朗克進(jìn)化人類學(xué)研究所的遺傳學(xué)負(fù)責(zé)人,他計(jì)劃跟美國(guó)454生命科學(xué)公司合作,開發(fā)一種高通量的測(cè)序機(jī)—一次可以復(fù)制數(shù)萬(wàn)個(gè)DNA片段。

帕博專注尼安德特人DNA研究十多年了。過去測(cè)序技術(shù)不發(fā)達(dá),每次只能測(cè)出百來(lái)個(gè)樣本,可讀取的核苷酸序列嚴(yán)重受限。要知道,人類基因組擁有32億對(duì)堿基,要測(cè)完整何其困難。

進(jìn)入新世紀(jì),人類、黑猩猩、大小鼠等生物的完整基因組序列已經(jīng)公布。此時(shí)正值尼安德特人被發(fā)現(xiàn)150周年,帕博雄心勃勃,勢(shì)必在2年內(nèi)拿下。

《經(jīng)濟(jì)學(xué)人》對(duì)此評(píng)價(jià):“很有膽量的研究?!?/p>

問題是,尼安德特人滅絕起碼3萬(wàn)年了。要找到足夠的DNA,成了最大的挑戰(zhàn)。在他拿到的基因信息中,遠(yuǎn)不足以重組整個(gè)基因組。

后來(lái),他找到了一組來(lái)自克羅地亞的骨頭,它們屬于三位尼安德特女性,這帶來(lái)了希望。

2006年底,他報(bào)告說(shuō),他們成功完成了100萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)的測(cè)序。尼安德特人完整的基因組由30億個(gè)堿基對(duì)組成,以此推斷,機(jī)器運(yùn)行6000次,兩年時(shí)間,可如期完成。

但隨后發(fā)現(xiàn),這100萬(wàn)堿基對(duì)被人類DNA污染了,而且骨頭中80%的DNA屬于各種微生物,這基本宣告了計(jì)劃的無(wú)效。這讓他們感到絕望。

污染,是古DNA測(cè)序最頭疼的問題。早在1990年,帕博就意識(shí)到污染的嚴(yán)重性。在慕尼黑大學(xué)開啟科研生涯之初,他就以偏執(zhí)的態(tài)度,堅(jiān)持先建世界上第一間潔凈室。他還制定嚴(yán)苛的行為準(zhǔn)則,避免環(huán)境中的DNA片段與古DNA混淆。

盡管馬克斯·普朗克研究所也配備了高規(guī)格的潔凈室,但眼下,類似問題還是無(wú)法避免,以致項(xiàng)目停擺了一年多。

帕博覺得這一點(diǎn)很酷,尼安德特人并未滅絕,而是在我們身上“活”了一部分。

又過了兩年,帕博擁有了足夠的DNA序列,但新的問題又產(chǎn)生了。篩查測(cè)序機(jī)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)—一長(zhǎng)串A、T、G、X列表時(shí),團(tuán)隊(duì)成員發(fā)現(xiàn)了怪異的現(xiàn)象:尼安德特人的序列,與現(xiàn)代歐洲人序列非常相似,而且這個(gè)相似度要遠(yuǎn)高于其他種族的人類。歐洲人、亞洲人與尼安德特人共享的DNA,比非洲人多。

常規(guī)的認(rèn)知是,這是似乎不可能的;“又一起污染事件”,團(tuán)隊(duì)成員如此懷疑,他們?cè)噲D消除這個(gè)“錯(cuò)誤”結(jié)果。

過去20多年,“走出非洲”是一種絕對(duì)主導(dǎo)的理論。學(xué)術(shù)界也提出單一起源的假說(shuō),認(rèn)為現(xiàn)代人是20萬(wàn)年前某支非洲智人群體的后裔。在大約距今12.5萬(wàn)年到6萬(wàn)年間,他們離開非洲大陸。6萬(wàn)年前,他們進(jìn)入東亞,距今5萬(wàn)年前,他們來(lái)到南亞,距今4萬(wàn)年前,他們遷到澳大利亞,擴(kuò)張到早期直立人從未到達(dá)的領(lǐng)域。

一段時(shí)間后,這些智人一步步取代了本土的早期人類群體,不僅包括歐洲的尼安德特人,還有亞洲的直立人,乃至北京猿人的后代,均被這一支智人替代或滅絕。 他們呈現(xiàn)出強(qiáng)烈侵略擴(kuò)張的意愿,與其他并存的古人類是一種直線關(guān)系—取代與被取代。這種戲劇性的說(shuō)法,在大眾媒體上極具魅惑力。

基于此,科學(xué)家也相信,當(dāng)尼安德特人出現(xiàn)與人類相似的基因序列時(shí),這種可能是某種實(shí)驗(yàn)事故,而非一種“真相”。帕博沒有氣餒,他重新投入反反復(fù)復(fù)的測(cè)試,數(shù)據(jù)量越來(lái)越大,一種具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)論,成立了。

非洲以外的人,都帶有1%~4%的尼安德特人的基因。智人祖先在“取代”尼安德特人前,曾與他們“同床共枕”,發(fā)生了性關(guān)系。他們不僅交配了,還將某些遺傳信息保留了下來(lái),融入現(xiàn)代人類社會(huì)。他們的孩子,遍布了歐洲、亞洲和各種新大陸。

盡管現(xiàn)代人類已經(jīng)同化了許多祖先的基因,但尼安德特人的基因所發(fā)揮的作用,依然不可忽視。研究表明,現(xiàn)代人泛濫成災(zāi)的抑郁癥、尼古丁成癮,皮膚疾病、膽固醇和維生素D的水平,乃至膚色和頭發(fā)變化,都與尼安德特人的基因相關(guān)。尼安德特人用以抵御饑餓的基因,也成了增加我們糖尿病的易感性。當(dāng)然,事情也不全是壞的,尼安德特人留下的某些基因,也有助于免疫系統(tǒng)抵御疾病。

只是,取代尼安德特人的,值得重新商榷。

帕博覺得這一點(diǎn)很酷,尼安德特人并未滅絕,而是在我們身上“活”了一部分。

非典型諾二代

“酷”是帕博的口頭禪。

在媒體訪問中,他不止一次地說(shuō),最酷的事情,莫過于探究尼安德特人與我們之間的關(guān)系。

帕博很小就展現(xiàn)出他對(duì)古老事物的迷戀。

1955年,他出生在瑞典斯德哥爾摩。母親是化學(xué)家,是一位來(lái)自愛沙尼亞的難民。很小的時(shí)候,他就喜歡去樹林里找古老的陶瓷碎片,把房間擺得滿滿的。十來(lái)歲時(shí),他隨母親參觀埃及金字塔,對(duì)木乃伊產(chǎn)生了迷戀。他立志成為一名埃及學(xué)家,就像后來(lái)電影里出現(xiàn)的印第安納·瓊斯那樣。

上了大學(xué),課程無(wú)非是解析象形文字,他覺得沒什么挑戰(zhàn),無(wú)聊。受父親的啟發(fā),他改學(xué)醫(yī)學(xué),后來(lái),又轉(zhuǎn)學(xué)細(xì)胞生物學(xué)。

父親在帕博的人生中,是一個(gè)特殊的存在。

母親曾在生物化學(xué)家蘇恩·貝格斯特倫的實(shí)驗(yàn)室短暫工作過。帕博則是那段關(guān)系的產(chǎn)物。但貝格斯特倫已有家室,還有個(gè)跟帕博同年的兒子魯里克。

有趣的是,因?qū)η傲邢偎氐难芯?,父親1982年獲得了諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。準(zhǔn)確來(lái)說(shuō),帕博是個(gè)諾二代了。

他在自傳《尼安德特人》中披露,母親從未結(jié)婚,帕博作為“私生子”,每周六才能見一次貝格斯特倫,他們?nèi)淞稚⒉?,或者躲在不被人發(fā)現(xiàn)的地方。這種秘密關(guān)系持續(xù)了近60年,直到2004年貝格斯特倫去世,魯里克才知道自己還有個(gè)同父異母的兄弟。

80年代初,帕博正忙于與病毒相關(guān)的博士論文,這期間,他又開始幻想他心心念念的木乃伊—竟然沒人想過從木乃伊中提取DNA?如果可能,那歷史就有一種全新的打開方式了。

為了證明可行性,他買了一塊肝臟,把它放在實(shí)驗(yàn)室的烤箱里,加熱到50攝氏度,持續(xù)數(shù)天,模擬成功。他就設(shè)法從東柏林的埃及博物館搞到了木乃伊樣本。害怕導(dǎo)師罵他太傻,他只好晚上偷偷琢磨。

1984年,他在名不見經(jīng)傳的東德雜志上發(fā)表了成果,在死了2000年的木乃伊兒童的細(xì)胞中,他成功檢測(cè)到了DNA。在他看來(lái),這可以探究一些深層的問題,比如,是什么導(dǎo)致了法老王朝的變革。

至少,這也可以解答法老圖坦卡蒙身世之謎—后來(lái)還真有人做了,2010年的古DNA研究證實(shí),其父母乃親兄妹。

回歸正題。

論文效果不佳,他沒放棄,準(zhǔn)備投給英文期刊。1985年,《自然》雜志給了他的木乃伊研究一個(gè)封面的待遇,媒體評(píng)價(jià)不錯(cuò),說(shuō)是生物分子學(xué)領(lǐng)域最引人注目的成就。但瑞典的同事們不太看好,叫他趕緊忘了那些干尸,把病毒研究做好。

80年代初,帕博正忙于與病毒相關(guān)的博士論文,這期間,他又開始幻想他心心念念的木乃伊—竟然沒人想過從木乃伊中提取DNA?

每個(gè)人都告訴他,離開如此重要的領(lǐng)域,去做一件看起來(lái)像愛好的事情,真的很愚蠢。但他不做理會(huì),跑到美國(guó)加州去,為當(dāng)時(shí)爭(zhēng)議極大的生物學(xué)家艾倫·威爾遜做事。威爾遜算得上是分子進(jìn)化學(xué)的先驅(qū),提出“分子鐘”概念,試圖利用基因組數(shù)據(jù)來(lái)理解進(jìn)化事件。

威爾遜的博士生瑪麗·金回憶道,帕博和威爾遜的共同點(diǎn),遠(yuǎn)不止對(duì)古代DNA的興趣。

90年代初,帕博轉(zhuǎn)向了一個(gè)雄心勃勃的項(xiàng)目—尼安德特人的DNA。但問題來(lái)了,面對(duì)一個(gè)極其冷門的學(xué)科,很少有博物館館長(zhǎng)愿意奉獻(xiàn)一點(diǎn)自家珍藏的骨頭,尤其是這么一個(gè)年輕的遺傳學(xué)家,一心只想把價(jià)值連城的文物鋸成塊。

交涉了好幾年,他總算搞到了人生中第一塊尼安德特骨頭。那是骨架中的一塊臂骨,他提取了3.5克的樣本,并從線粒體中分離出幾個(gè)DNA序列。這一成果再一次為他拿下了重磅封面。馬克斯·普朗克研究所也拋來(lái)了橄欖枝,稱要斥資2000萬(wàn)英鎊,在德國(guó)萊比錫打造世界級(jí)的人類學(xué)研究中心。

帕博便一直工作于此。直到2010年,他關(guān)于尼安德特人的基因組測(cè)序才完成,發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上,徹底把這門冷僻的學(xué)科推到聚光燈下。他的研究,也改寫了人類的進(jìn)化樹,此后古基因領(lǐng)域的研究層出不窮。

他成了學(xué)術(shù)明星,登上了《花花公子》雜志。他打趣說(shuō),這可能是這輩子唯一一個(gè)上《花花公子》的機(jī)會(huì),不能錯(cuò)過。同時(shí),他也遭到了很多保守宗教力量的批評(píng)。

他的風(fēng)趣,在自傳中也有展現(xiàn)。比如,談及自己的性取向,他一直堅(jiān)信自己是同性戀,直到遇到了現(xiàn)在的妻子,相當(dāng)“男孩子氣”的科學(xué)家琳達(dá)·維吉倫特。兩人婚后育有一兒一女。

重繪演化樹

帕博和人類進(jìn)化的故事,還沒有講完?!罢J(rèn)親”尼安德特人,只是一個(gè)起點(diǎn)。

時(shí)間回到2008年。

某天,帕博接到同事的電話,對(duì)方說(shuō):“結(jié)果出來(lái)了,你最好坐下來(lái),這根手指不是人類的?!毖韵轮猓赡苁莵?lái)自某種未知人類物種。

指骨來(lái)自丹尼索瓦,一個(gè)位于西伯利亞山脈的僻靜洞穴。2008年,一隊(duì)考古學(xué)家在此發(fā)現(xiàn)了一個(gè)小指頭的化石碎片。其歷史,可以追溯到3.5萬(wàn)年前。很快,它被送到了帕博的實(shí)驗(yàn)室。

常規(guī)遺傳分析結(jié)果表明,指骨的主人,與同時(shí)期當(dāng)?shù)氐闹侨擞忻黠@區(qū)別,于是被命名為丹尼索瓦人。最終,一番折騰后,帕博和同事們分離出了它的基因組和污染過的病菌DNA,經(jīng)過測(cè)序,得到一個(gè)完整的遺傳圖譜。

他們確認(rèn),丹尼索瓦人,是一個(gè)全新的物種。

后來(lái),甘肅夏河縣發(fā)現(xiàn)了一份下頜骨化石,經(jīng)測(cè)定為丹尼索瓦人,距今已有16萬(wàn)年。這說(shuō)明,青藏高原范圍內(nèi),很早就有丹尼索瓦人的活動(dòng)蹤跡。丹尼索瓦人現(xiàn)身后,中國(guó)境內(nèi)發(fā)現(xiàn)的大荔人、金牛山人等,也一度被懷疑是丹尼索瓦人的東亞代表。

帕博團(tuán)隊(duì)的基因研究揭示,大多數(shù)亞洲人都有丹尼索瓦人的DNA。美拉尼西亞人中,丹尼索瓦人的基因比例甚至高達(dá)6%。同時(shí)也有證據(jù)顯示,他們與現(xiàn)代人的祖先共同生活了幾千年??梢哉f(shuō),丹尼索瓦人跟現(xiàn)代人類的血緣關(guān)系,比尼安德特人更親近。

單地起源的人類演化史,已經(jīng)不再具有說(shuō)服力了,必須得到更新和修正。

到這里,事情變得有趣起來(lái)了。

先做個(gè)假設(shè),尼安德特人,生活在歐亞大陸西部,丹尼索瓦人,則居住在該大陸的東部地區(qū),大陸兩端的人類種群,會(huì)產(chǎn)生怎樣的交集?

2015年,牛津大學(xué)進(jìn)化遺傳學(xué)家Katerina Douka和Tom Higham拿到了幾塊丹尼索瓦人的骨骼碎片,測(cè)年和同位素分析顯示,骨骼迄今已有5萬(wàn)年歷史,來(lái)自一位女性的手臂和腿部,其主人被命名為丹妮。遠(yuǎn)在德國(guó)的帕博,則負(fù)責(zé)了丹妮的基因測(cè)序,他得出的結(jié)論是:丹妮是一個(gè)混血兒。

丹妮的每對(duì)染色體中,一條來(lái)自丹尼索瓦人,另一條對(duì)應(yīng)尼安德特人。也就是說(shuō),丹妮的母親是尼安德特人,父親是丹尼索瓦人。這種案例相當(dāng)罕見,但卻揭示了一個(gè)事實(shí):智人與其他古人類之間的繁衍關(guān)系,比任何人的想象都更復(fù)雜。

現(xiàn)在可以肯定的是,智人走出非洲前,丹尼索瓦所代表的支系、尼安德特人等不同的人種,已經(jīng)在亞歐大陸上獨(dú)立演化了數(shù)十萬(wàn)年,他們跟智人共同組成了現(xiàn)代人類的祖先。更多的人類近親,也在DNA技術(shù)的幫助下,得以“相認(rèn)”。

單地起源的人類演化史,已經(jīng)不再具有說(shuō)服力了,必須得到更新和修正。人類的進(jìn)化,并不是一枝一葉,而是相互交織的、密集的叢林。

這一切,似乎都來(lái)自當(dāng)年那個(gè)少年不切實(shí)際的天真幻想。

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