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LncRNA FOXD3-AS1 在惡性腫瘤中的表達(dá)、功能及作用機(jī)制

2022-11-26 23:48陶碧君劉建德王玉洲
醫(yī)學(xué)信息 2022年10期
關(guān)鍵詞:黑色素瘤鼻咽癌膠質(zhì)瘤

陶碧君,劉建德,王玉洲

(1.廣東醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,廣東 湛江 524000;2.暨南大學(xué)附屬?gòu)V州紅十字會(huì)醫(yī)院內(nèi)分泌科,廣東 廣州 510000;3.廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤科,廣東 湛江 524000)

惡性腫瘤(malignant tumor)是全球第2 大死亡原因,其發(fā)病率和死亡率呈現(xiàn)著逐年上升的趨勢(shì),加強(qiáng)惡性腫瘤的預(yù)防和控制的任務(wù)迫在眉睫[1]。靶向治療是治療惡性腫瘤的方法之一,是指在細(xì)胞分子水平上,針對(duì)已經(jīng)明確的致病位點(diǎn)的一種治療方式[2,3]。該位點(diǎn)可以是腫瘤細(xì)胞內(nèi)部的一個(gè)蛋白分子,也可以是一個(gè)基因片段。尋找生物標(biāo)志物[4]可以為疾病的治療帶來(lái)新的方向。近年來(lái),關(guān)于LncRNA FOXD3-AS1 的研究證實(shí)了其在多種疾病中的表達(dá)存在異常[5],包括惡性腫瘤、腦及心肌缺血/再灌注損傷、高氧/活性氧(ROS)誘導(dǎo)的肺損傷、變應(yīng)性鼻炎[6]等,并且通過(guò)不同的作用機(jī)制促進(jìn)或抑制疾病的發(fā)生、發(fā)展。因此,LncRNA FOXD3-AS1 可以為疾病的治療提供新的特異性靶點(diǎn),同時(shí)可作為生物標(biāo)志物來(lái)預(yù)測(cè)疾病的預(yù)后。在此,本文就LncRNA FOXD3-AS1 在惡性腫瘤中的表達(dá)、功能及其作用機(jī)制作一簡(jiǎn)要綜述,進(jìn)而為指導(dǎo)疾病的治療提供依據(jù)。

1 LncRNA FOXD3-AS1 的簡(jiǎn)介

LncRNA FOXD3-AS1 由4 個(gè)外顯子組成,位于FOXD3 啟動(dòng)子上游染色體1p31.3 處,為蛋白質(zhì)編碼基因FOXD3 的反義轉(zhuǎn)錄物。此外,chip-seq 數(shù)據(jù)顯示FOXD3-AS1 位于FOXD3 上游啟動(dòng)子區(qū)域,可能與FOXD3 mRNA 發(fā)生作用,稱為啟動(dòng)子上游的轉(zhuǎn)錄物[7]。FOXD3-AS1 廣泛存在于哺乳動(dòng)物中,在不同的疾病中其表達(dá)或高或低。研究證實(shí),在惡性黑色素瘤、乳腺癌、結(jié)直腸癌、肝細(xì)胞癌、宮頸癌、惡性神經(jīng)膠質(zhì)瘤、甲狀腺癌等惡性腫瘤中,F(xiàn)OXD3-AS1的表達(dá)明顯上調(diào),并起著促進(jìn)疾病發(fā)生發(fā)展的作用,是預(yù)后不良的生物標(biāo)志物。與此不同的是,在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中,F(xiàn)OXD3-AS1 的表達(dá)較低,卻起著與前述疾病相似的促進(jìn)疾病發(fā)生發(fā)展的作用,是預(yù)后良好的生物標(biāo)志物。在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中的研究仍存在爭(zhēng)議。Ji T 等[8]的研究顯示FOXD3-AS1 為低表達(dá);而在Zeng ZL 等[9]的研究顯示FOXD3-AS1 在NSCLC 組織和細(xì)胞中的表達(dá)明顯上調(diào),但兩者均起著促進(jìn)NSCLC 發(fā)展的作用,其機(jī)制有待進(jìn)一步的研究。除了惡性腫瘤,F(xiàn)OXD3-AS1 在其他疾病中也發(fā)揮著作用。例如Zheng J 等[10]在探討FOXD3-AS1 對(duì)缺氧誘導(dǎo)的AC16 心肌損傷的影響及其相關(guān)分子機(jī)制時(shí)得出,低氧暴露導(dǎo)致AC16 細(xì)胞中FOXD3-AS1的上調(diào)和miR-150-5p 的下調(diào),敲低FOXD3-AS1減弱了AC16 細(xì)胞中缺氧誘導(dǎo)的細(xì)胞存活率降低的結(jié)果。上述研究可知,F(xiàn)OXD3-AS1 是很多疾病的一種潛在生物標(biāo)志物,能為治療提供新的靶點(diǎn)。

2 LncRNA FOXD3-AS1 的作用機(jī)制

研究證明,F(xiàn)OXD3-AS1 在疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,但其具體的作用機(jī)制尚不明確。FOXD3-AS1 可能通過(guò)多種不同的機(jī)制調(diào)控疾病:作為內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)RNA(competingendogenous RNAs,ceRNA)參與基因表達(dá)的調(diào)控、調(diào)控PARP1和CTCF、調(diào)節(jié)FOXD3 mRNA 及蛋白質(zhì)水平[11]、調(diào)節(jié)信號(hào)通路等。

2.1 作為ceRNA 參與基因表達(dá)的調(diào)控 已知miRNA可以通過(guò)結(jié)合mRNA 導(dǎo)致基因沉默,而ceRNA 可以通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合miRNA 來(lái)調(diào)節(jié)基因表達(dá)。多項(xiàng)研究證明FOXD3-AS1 可作為ceRNA 參與基因表達(dá)的調(diào)控,進(jìn)而影響疾病的發(fā)展[12,13]。Chen X 等[14]研究發(fā)現(xiàn)LncRNA FOXD3-AS1 可充當(dāng)miR-325 的海綿體,通過(guò)調(diào)節(jié)miR-325/MAP3K2 軸促進(jìn)皮膚惡性黑色素瘤的增殖、侵襲和遷移。而Wan N 等[15]在探索黑色素瘤的機(jī)理中證明,miR-127-3p 可以與FOXD3-AS1 結(jié)合,并且在黑素瘤中它的表達(dá)受到FOXD3-AS1 的負(fù)調(diào)控。此外,miR-127-3p 的過(guò)表達(dá)抑制了黑色素瘤的進(jìn)展。Wu Q 等[16]通過(guò)實(shí)驗(yàn)證明了FOXD3-AS1 通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)miR-135a-5p 作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA 來(lái)上調(diào)SIRT1 從而促進(jìn)結(jié)腸腺癌細(xì)胞的增殖和遷移。Chen Y 等[17]研究表明,miR-296 -5p 是 lncRNA FOXD3-AS1 的靶標(biāo),而FOXD3-AS1 的過(guò)表達(dá)通過(guò)下調(diào)miR-296-5p 來(lái)發(fā)揮促進(jìn)甲狀腺癌的作用。Ma WG 等[18]在宮頸癌的研究中發(fā)現(xiàn)FOXD3-AS1 通過(guò)直接結(jié)合miR-296-5p充當(dāng)內(nèi)源性海綿,從而抑制了miR-296-5p 而發(fā)揮促癌作用??梢?,F(xiàn)OXD3-AS1 可通過(guò)充當(dāng)多種miRNA 的海綿體來(lái)發(fā)揮其調(diào)控基因表達(dá)的作用,進(jìn)而影響惡性腫瘤的發(fā)展。

2.2 調(diào)控PARP1 和CTCF 作為PARP 家族的主要成員,PARP1 能夠催化PAR 部分共價(jià)結(jié)合在來(lái)自供體煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)分子的靶核蛋白上,并在調(diào)節(jié)DNA 修復(fù),基因組完整性和基因轉(zhuǎn)錄中起關(guān)鍵作用[19]。PARP1 被激活并促進(jìn)了DNA 堿基損傷和單鏈斷裂修復(fù)[20]。PARP1 的高水平和活性與癌癥進(jìn)展相關(guān)。在Zhao X 等[21]對(duì)神經(jīng)母細(xì)胞瘤的研究中顯示FOXD3-AS1 的表達(dá)降低,并通過(guò)敲低FOXD3-AS1 促進(jìn)了神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞中PARP1 和CTCF 之間的直接物理相互作用,導(dǎo)致其下游的抑癌基因表達(dá)下降而促進(jìn)神經(jīng)母細(xì)胞瘤的發(fā)展。

2.3 調(diào)節(jié)FOXD3 mRNA 及蛋白質(zhì)水平 FOXD3-AS1 位于FOXD3 上游啟動(dòng)子區(qū)域,F(xiàn)OXD3-AS1 可與在基因序列中與其位置相近的FOXD3 發(fā)生作用。陳振華在對(duì)FOXD3-AS1 在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及功能研究中發(fā)現(xiàn)[22],F(xiàn)OXD3-AS1 與FOXD3 在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)呈正相關(guān),在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中抑制FOXD3-AS1 可以降低FOXD3 的表達(dá)水平從而抑制膠質(zhì)瘤的進(jìn)展。

2.4 調(diào)節(jié)信號(hào)通路 研究發(fā)現(xiàn)[17],甲狀腺癌中FOXD3-AS1 通過(guò)激活TGF-β1/Smads 信號(hào)通路進(jìn)而減少TNF-α 的表達(dá)來(lái)促進(jìn)甲狀腺癌的惡性腫瘤生物學(xué)行為。此外,在肝細(xì)胞癌中[23],F(xiàn)OXD3-AS1 可充當(dāng)miR-335 的海綿,而RICTOR 是miR-335 的直接靶基因。FOXD3-AS1 可通過(guò)使miR-335 海綿化而提高RICTOR 的水平,從而通過(guò)激活A(yù)KT 信號(hào)通路促進(jìn)肝癌細(xì)胞的生長(zhǎng)、增值與遷移。

3 LncRNA FOXD3-AS1 的表達(dá)及其與癌癥的關(guān)系

3.1 乳腺癌 乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一,2018 年全球新發(fā)210 萬(wàn)例,其發(fā)病率和死亡率均位于女性癌癥之首。但在我國(guó),乳腺癌為女性癌癥發(fā)病第1 位,死亡第5 位[24],已經(jīng)成為婦女健康的最大威脅。因此尋求有效的生物標(biāo)志物對(duì)于乳腺癌的防治是十分必要的。Guan Y 等[25]證明了與正常組織相比,LncRNA FOXD3-AS1 在乳腺癌細(xì)胞系(BT549,MDA-MB-231)中具有顯著高表達(dá),沉默F(xiàn)OXD3-AS1 后會(huì)抑制乳腺癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力。這說(shuō)明FOXD3-AS1 可能是乳腺癌的潛在生物標(biāo)志物及治療乳腺癌的新靶點(diǎn)[26]。

3.2 NSCLC 肺癌是全球年齡標(biāo)化發(fā)病率(ASIR)和年齡標(biāo)化死亡率(ASMR)最高的惡性腫瘤[1]。肺癌早期可無(wú)明顯癥狀,即使是有癥狀的患者,也容易因其臨床表現(xiàn)的非特異性而與原來(lái)就存在的一些臨床表現(xiàn)相混淆,從而導(dǎo)致診斷的不及時(shí)。因此,需要對(duì)高危人群進(jìn)行篩查及尋求特異性的生物標(biāo)志物來(lái)協(xié)助肺癌的診斷與治療。Ji T 等[8]通過(guò)qRT-PCR 檢測(cè)FOXD3-AS1、miR-150 和SRC 激酶信號(hào)抑制劑1(SRCIN1)的mRNA 在NSCLC 組織中的表達(dá),并分析了NSCLC 患者的病理特征與FOXD3-AS1 表達(dá)水平的關(guān)系。并以人NSCLC 細(xì)胞系H1299 和A549為細(xì)胞模型,采用CCK-8 和BrdU 測(cè)定法檢測(cè)癌細(xì)胞的增殖能力,并采用Transwell 測(cè)定法檢測(cè)細(xì)胞侵襲能力。得出了在NSCLC 組織中FOXD3-AS1 的低表達(dá)與陽(yáng)性淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和相對(duì)較高的腫瘤分級(jí)密切相關(guān)的結(jié)論。相反地,Zeng ZL 等[9]通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR 測(cè)定FOXD3-AS1 的基因表達(dá)水平,通過(guò)體外功能實(shí)驗(yàn)測(cè)定NSCLC 細(xì)胞的增殖和侵襲能力,結(jié)果顯示FOXD3-AS1 在肺癌組織中的表達(dá)明顯上調(diào),F(xiàn)OXD3-AS1 的過(guò)表達(dá)促進(jìn)了NSCLC 細(xì)胞的增殖和侵襲,而FOXD3-AS1 的敲低對(duì)NSCLC 細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為產(chǎn)生了抑制作用。因此,F(xiàn)OXD3-AS1 可能是NSCLC 預(yù)后評(píng)估的潛在標(biāo)志物。Zeng ZL 等[27]研究發(fā)現(xiàn),LncRNAFOXD3-AS1通過(guò)直接作用于miR-127-3p/MDM2 軸而增加了NSCLC 細(xì)胞對(duì)順鉑的耐藥性,這為NSCLC 的治療提供了新的觀點(diǎn)。

3.3 消化系統(tǒng)腫瘤 根據(jù)2015 年中國(guó)惡性腫瘤報(bào)告,我國(guó)最常見的癌癥依次為肺癌、胃癌、結(jié)直腸癌、肝癌、乳腺癌和食管癌,消化道癌癥較多見,這可能與文化、飲食模式、攝入食物營(yíng)養(yǎng)素低及食品污染有關(guān)。張心武等[28]研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)XOD3-AS1 在進(jìn)展期遠(yuǎn)端胃癌組織中高表達(dá)(P=0.018),其高表達(dá)與進(jìn)展期遠(yuǎn)端胃癌患者原位癌(P=0.001)、臨床分期(P=0.004)、有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P=0.006)和有無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(P=0.016)相關(guān),并且能夠縮短進(jìn)展期遠(yuǎn)端胃癌患者的生存期(P=0.032)。同樣地,Liu C 等[23]通過(guò)實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)評(píng)估肝癌組織和細(xì)胞株中FOXD3-AS1 的表達(dá),通過(guò)CCK-8、BrdU 細(xì)胞增殖測(cè)定,Transwell 侵襲實(shí)驗(yàn)和劃痕實(shí)驗(yàn)來(lái)檢測(cè)FOXD3-AS1對(duì)HCC 細(xì)胞(Huh6)的作用,結(jié)果顯示FOXD3-AS1在肝癌組織中的表達(dá)明顯高于癌旁組織,且FOXD3-AS1 水平高的HCC 患者預(yù)后較差。Wu Q等[16]通過(guò)同樣的方法發(fā)現(xiàn)了結(jié)腸腺癌組織和細(xì)胞中FOXD3-AS1 的高表達(dá),且用Kaplan-Meier 分析證明了FOXD3-AS1 對(duì)結(jié)腸腺癌患者的預(yù)后價(jià)值。綜上所述,F(xiàn)OXD3-AS1 可能在消化系統(tǒng)腫瘤中發(fā)揮著癌基因效應(yīng)。

3.4 甲狀腺癌 甲狀腺癌是甲狀腺最常見的惡性腫瘤,約占全身惡性腫瘤的1%。除未分化型甲狀腺癌,手術(shù)是其余各型的基本治療方法。對(duì)甲狀腺癌相關(guān)靶標(biāo)的研究是甲狀腺癌診斷和新藥開發(fā)的基礎(chǔ)。Chen Y 等[17]通過(guò)qRT-PCR 檢測(cè)lncRNA FOXD3-AS1,發(fā)現(xiàn)其在甲狀腺癌細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),LncRNA FOXD3-AS1 敲低能有效抑制體外細(xì)胞增殖和侵襲。LncRNA FOXD3-AS1 有望成為甲狀腺癌診斷和新藥開發(fā)的有效指標(biāo)。

3.5 宮頸癌 子宮頸癌是全球婦女中第3 大常見的惡性腫瘤。2018 年宮頸癌新發(fā)病例57 萬(wàn),死亡病例31.1 萬(wàn),居女性發(fā)病和死亡癌癥原因第4 位。Ma WG等[18]的研究小組首先報(bào)道了子宮頸癌組織和細(xì)胞系中FOXD3-AS1 的水平明顯升高。FOXD3-AS1 的明顯上調(diào)與淋巴管浸潤(rùn),遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移以及國(guó)際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(FIGO)的分期有關(guān),也預(yù)示了患者的臨床效果較差。FOXD3-AS1 可能會(huì)成為子宮頸癌的新型標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)。

3.6 神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤 Chen ZH 等[29]通過(guò)對(duì)患者標(biāo)本和臨床數(shù)據(jù)的系統(tǒng)分析,得出了與低級(jí)神經(jīng)膠質(zhì)瘤(WHOⅠ~Ⅱ級(jí))和正常腦組織相比,高級(jí)膠質(zhì)瘤組織(WHO Ⅲ~Ⅳ級(jí))中的FOXD3-AS1 明顯上調(diào)(均P<0.01),且FOXD3-AS1 表達(dá)低的患者生存率更高。多因素回歸分析表明,F(xiàn)OXD3-AS1 表達(dá)增加是膠質(zhì)瘤患者預(yù)后不良的重要獨(dú)立指標(biāo)(P=0.034)。Zhao X 等[21]通過(guò)研究證實(shí)了FOXD3-AS1 在神經(jīng)母細(xì)胞瘤組織和細(xì)胞系中下調(diào),并且FOXD3-AS1 的異位表達(dá)誘導(dǎo)神經(jīng)元分化并降低細(xì)胞在體內(nèi)和體外的侵襲性。FOXD3-AS1 為神經(jīng)母細(xì)胞瘤患者預(yù)后良好的獨(dú)立預(yù)后指標(biāo)。

3.7 惡性黑色素瘤 黑色素瘤是一種由異常黑色素細(xì)胞過(guò)度增生引發(fā)的惡性腫瘤,預(yù)后多數(shù)較差。我國(guó)黑色瘤發(fā)病率相對(duì)較低,但增長(zhǎng)較快。Wan N 等[15]通過(guò)RT-qPCR 檢測(cè)到黑色素瘤細(xì)胞中FOXD3-AS1的表達(dá)上調(diào),通過(guò)功能喪失試驗(yàn)驗(yàn)證了FOXD3-AS1缺乏抑制細(xì)胞增殖和遷移,通過(guò)敲低FOXD3-AS1發(fā)現(xiàn)其可促進(jìn)了腫瘤細(xì)胞的凋亡。

3.8 鼻咽癌 鼻咽癌的特點(diǎn)是地理分布獨(dú)特,在東亞和東南亞尤為普遍。過(guò)去10 年的流行病學(xué)趨勢(shì)表明,其發(fā)病率逐漸下降,死亡率大大降低。靶向治療為鼻咽癌的治療提供了新的機(jī)遇。Zhang E 等[30]的研究證實(shí)了在鼻咽癌細(xì)胞系中FOXD3-AS1 明顯上調(diào),而miR-135a-5p 明顯下調(diào),并通過(guò)雙熒光素酶報(bào)告基因分析證實(shí)了miR-135a-5 為FOXD3-AS1的靶基因。通過(guò)上調(diào)miR-135a-5p 的表達(dá),抑制了鼻咽癌細(xì)胞的生長(zhǎng),增強(qiáng)細(xì)胞凋亡,促進(jìn)Caspase3活性,增加裂解的Caspase3 并降低pro-Caspase3 水平。該研究顯示FOXD3-AS1 敲低通過(guò)改變miR-135a-5p 表達(dá)來(lái)調(diào)節(jié)鼻咽癌細(xì)胞的生長(zhǎng)和凋亡,這表明FOXD3-AS1 可能是鼻咽癌診斷和治療的治療靶點(diǎn)。

4 總結(jié)

LncRNA FOXD3-AS1 在惡性腫瘤中呈現(xiàn)出異常表達(dá),并對(duì)其發(fā)生發(fā)展發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,與惡性腫瘤的增殖、遷移、侵襲等惡性生物學(xué)行為密切相關(guān),及與腫瘤的早期診斷、治療、預(yù)后密切相關(guān),這為尋找新型的生物標(biāo)志物奠定基礎(chǔ)及為惡性腫瘤的靶向治療提供依據(jù)。目前的研究證實(shí),在大多數(shù)的惡性腫瘤中,高表達(dá)的LncRNA FOXD3-AS1 預(yù)示著高度惡性和不良預(yù)后,運(yùn)用靶向干擾RNA 技術(shù),可以靶向抑制LncRNA FOXD3-AS1 的表達(dá),有望抑制惡性腫瘤的進(jìn)展。LncRNA FOXD3-AS1 可通過(guò)作為ceRNA 調(diào)控基因表達(dá)、調(diào)控PARP1 和CTCF、調(diào)節(jié)FOXD3 mRNA 及蛋白質(zhì)水平、調(diào)節(jié)多種信號(hào)通路等機(jī)制發(fā)揮其作用,但具體作用機(jī)制尚不太明確,仍有待進(jìn)一步研究。因此,LncRNA FOXD3-AS1可能為惡性腫瘤的診斷、治療及預(yù)后提供新方向、新思路。

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