王 月,譚勤琴,2,劉 英,楊幸貴,2,營 夏,2,馬 青,韋小瑜,李世軍
布魯氏菌(Brucella)是一類胞內(nèi)寄生的革蘭陰性菌,主要引起人獸共患性布魯氏菌病(Brucellosis,簡稱布病)[1-2]。FAO/WHO依據(jù)布魯氏菌屬細菌的生化特性及宿主偏好性將其分為6個經(jīng)典種,19個生物型。羊種、牛種和豬種布魯氏菌是人類感染布病的主要病原體[1],貴州省布病疫情主要由羊種導致[3]。布魯氏菌病原體可通過體表粘膜、消化道、呼吸道侵入機體,而人感染布病的途徑通常與職業(yè)、飲食、生活習慣相關(guān)[1]。自2010年,“千萬只肉羊”工程在貴州省啟動,及后續(xù)“十二五規(guī)劃”提出的“著力打造一批規(guī)?;藴驶?、產(chǎn)業(yè)化的優(yōu)質(zhì)肉豬、肉羊、肉牛及地方特色畜禽生產(chǎn)基地,努力建設生態(tài)畜牧業(yè)大省”,使得我省養(yǎng)羊業(yè)獲得長足發(fā)展[4]。貴州省于2010年首次從貴州省山羊血液分離到羊種布魯氏菌[5],到2015年,貴州省布病疫情已覆蓋貴陽、 黔南、黔東南、銅仁、遵義、黔西南、六盤水、安順和畢節(jié)9個市/州及貴安新區(qū),僅部分縣未報道過布病疫情[6],防控形勢嚴峻。
布魯氏菌種間同源性高[7],表型分析無法對其進行關(guān)聯(lián)性研究,多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列分析(Multiple locus variable-number tandem repeat analysis,MLVA)技術(shù)可克服這方面的缺陷,其分型數(shù)據(jù)可在MLVA數(shù)據(jù)庫進行網(wǎng)絡數(shù)據(jù)共享和分型鑒定,具有分辨率佳、重復性好、可比性高的特點[8-10]。MLVA分型技術(shù)基于非感染性核酸材料[11],降低操作人員的感染風險,被廣泛用于分子流行病學調(diào)查及溯源分析[12-14]。本研究采用MLVA-16方法對貴州省78株羊種布魯氏菌本地株進行分子分型分析,以期發(fā)現(xiàn)貴州省羊種布魯氏菌間的關(guān)聯(lián)性,為貴州省布病疫情的科學防控提供可靠的依據(jù)。
1.1 菌株來源 貴州省疾病預防控制中心布病實驗室分離、鑒定及保存的羊種布魯氏菌菌株(2013-2021年),總計78株。
1.2 主要儀器與試劑 主要儀器有PCR擴增儀(美國Thermo)、凝膠成像儀(美國Bio-Rad)等。主要試劑有布魯氏菌瓊脂培養(yǎng)基(美國BD)、引物及配套PCR試劑(北京天一輝遠生物科技有限公司)。
1.3 細菌培養(yǎng)及DNA提取 將實驗室保存菌株嚴格按照《2019布魯氏菌病診斷標準(WS269-2019)》的操作程序接種于布魯氏菌瓊脂平板上,置37 ℃ CO2培養(yǎng)箱,根據(jù)細菌的生長情況培養(yǎng)24~48 h。挑取布魯氏菌菌落研磨制成菌懸液,經(jīng)煮沸法提取菌株核酸[3],同時提取疫苗株M5、A19、S2的核酸作試驗用陽性對照。
1.4 布魯氏菌的復判 用布魯氏菌屬特異性基因BCSP-31[15]對菌株進行鑒定,疫苗株M5、A19及S2 核酸作陽性對照,純水為陰性對照。依據(jù)文獻[16]使用的B4和B5引物序列及擴增參數(shù)進行擴增,產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.5 布魯氏菌株種型的復判 采用基于布魯氏菌屬特異性插入序列IS711[17]建立的多重PCR技術(shù)對78株分離菌進行種/型鑒定[18],疫苗株M5、A19及S2核酸作陽性對照,純水作陰性對照。依據(jù)文獻[19]使用的引物序列和擴增參數(shù)進行擴增,產(chǎn)物經(jīng)1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.6 布魯氏菌株MLVA-16分型 78株布魯氏菌株根據(jù)文獻[20]使用的16個位點引物及擴增參數(shù)擴增。MLVA-16包括panel 1、panel 2A和panel 2B,共16個位點,MLVA-8即panel 1的所有8個位點,用于布魯氏菌種的分析。Panel 1(06、08、11、12、42、43、45及55 )各位點的擴增產(chǎn)物在實驗室內(nèi)進行瓊脂凝膠電泳,挑取差異序列送北京天一輝遠生物科技有限公司進行測序。對測得序列進行整理,去除側(cè)翼序列得到該位點的串聯(lián)重復序列,通過換算,得到該序列的重復串聯(lián)數(shù)值。Panel 2包括 panel 2A(18、 19、21)和panel 2B(04、07、09、16、30),各位點采用FAM基團標記引物進行擴增,產(chǎn)物送公司進行毛細管電泳,結(jié)果參照Panel 2各位點重復單元長度及重復數(shù)目換算表得到重復數(shù)值。
1.7 MLVA基因型分析 將MLVA基因型數(shù)值輸入MLVAbank(http//mcrobes genotyping.i2bc.paris-saclay.fr/)數(shù)據(jù)庫進行比對確定其MLVA-8的基因型。用 BioNumerics (Version 8.0)軟件對78株羊種菌分離株MLVA基因型進行聚類分析,聚類方式用非加權(quán)組平均法 (UPGMA),構(gòu)建聚類分析樹狀圖和最小生成樹(Minimum spanning tree,MST)。
2.1 BCSP31-PCR的復判結(jié)果 除陰性對照外,78株菌株核酸及疫苗株核酸的的擴增產(chǎn)物均產(chǎn)生分子量約為223 bp的條帶,判為布魯氏菌屬細菌。
2.2 AMOS-PCR對布魯氏菌種/型的復判結(jié)果 78株本地分離株和M5的擴增產(chǎn)物均出現(xiàn)分子量約為731 bp和178 bp的條帶,鑒定為羊種布魯氏菌,陰性對照無特異條帶出現(xiàn)。
2.3 MLVA-8分型結(jié)果 78株羊種布魯氏菌基于MLVA-8分型被分為5種型(即42、43、45、58和1種未分類型),以42、43型為主,二者占總數(shù)91.03%,見表1。42型在全省7個市/州均有分布,分布最廣。黔西南地區(qū)分布著4種MLVA-8基因型,多樣性較高,且出現(xiàn)一種新基因型(1-5-3-12-3-1-3-2),見表2。
表1 78株羊種布魯氏菌的MLVA-8 基因型別及百分比Tab.1 MLVA-8 genotypes and percentages of 78 B. melitensis strains
表2 78株羊種布魯氏菌MLVA-8基因型的地區(qū)分布Tab.2 Regional distribution of MLVA-8 genotypes of the 78 B. melitensis strains
2.4 MLVA-16分型結(jié)果 78株羊種布魯氏菌基于MLVA-16分型數(shù)據(jù)構(gòu)建聚類分析樹狀圖,分為4個群,46種MLVA-16基因型,單基因型分離株32株,余46株構(gòu)成14種MLVA-16基因型(圖1)。 MLVA-16基因型的地區(qū)分布中,遵義市16種,黔東南州11種,該2地為貴州省MLVA-16基因型多樣性主要聚集地(表3)。78株羊種菌基于MLVA-16分型數(shù)據(jù)并以每個節(jié)點相同位點最大距離為1構(gòu)建MST,78株分離株被分為8個遺傳復合體和14個單體,遵義與黔東南、黔南及畢節(jié)地區(qū)的菌株間均存在共享基因型,同一地區(qū)年份相近的菌株基因型之間的遺傳距離也很近(圖2)。
圖1 貴州省78株羊種布魯氏菌的MLVA-16聚類分析樹狀圖Fig.1 Dendrogram based on MLVA genotyping analysis (UPGMA method), showing the correlations among 78 B. melitensis strains
表3 78株羊種布魯氏菌MLVA-16基因型的地區(qū)分布Tab.3 Regional distribution of MLVA-16 genotypes of the 78 B. melitensis strains
圖2 貴州省78株羊種布魯氏菌MLVA基因型聚類分析的MST圖Fig.2 Clustering analysis MST (minimum spanning tree) mapping based on MLVA genotype data for 78 B. melitensis strains
貴州省布病疫情的擴大蔓延,是由于近年來貴州省養(yǎng)羊業(yè)迅猛發(fā)展,大量從省外引種[21],加之養(yǎng)殖模式大多為散養(yǎng)和小規(guī)模養(yǎng)殖,散養(yǎng)戶對布病的認知及防治知識匱乏,自我保護技能欠缺,導致疫情形勢嚴峻[6]。
羊種布魯氏菌是貴州省布病疫情的主要病原體,本研究對2013-2021年間貴州省78株羊種菌進行MLVA基因分型,基于MLVA-8分型數(shù)據(jù)分為5種基因型(即42、43、45、58和1種未分類型)。42及43型占總數(shù)91.03%,屬省內(nèi)羊種布魯氏菌優(yōu)勢基因型,國內(nèi)研究者研究證明該2種基因型也是國內(nèi)布魯氏菌的優(yōu)勢基因型[22-28],證實貴州省羊種布魯氏菌流行株與國內(nèi)流行株一致。貴州省羊種布魯氏菌已鑒定的MLVA-8基因型均屬于“東地中海型”,即其地理起源可能相同。黔西南地區(qū)布魯氏菌的分離株存在4種MLVA-8基因型,基因型多樣性較高,鑒于MLVA-16的panel 1模塊位點的變異度較低,提示該地可能存在多個布魯氏菌傳染源。黔南及黔西南鄰近云南及廣西2省,廣西、云南均鑒定出布魯氏菌58型[26,28],在山西、青海均有布魯氏菌45型的分布[26-27],基因型的一致性提示疫情病原菌間存在一定關(guān)聯(lián)性,可能為與鄰省間的畜牧貿(mào)易活動相關(guān),故應加強畜牧貿(mào)易活動的監(jiān)管,同時嚴格執(zhí)行動物的檢驗檢疫。未明確分類的MLVA-8型(1-5-3-12-3-1-3-2)分離于2016年,此后未再檢出該基因型,提示布魯氏菌可能為適應不同的自然地理環(huán)境而改變了其基因型[29]。
基于MLVA-16分型數(shù)據(jù),78株羊種菌分離株聚為4個基因群(A-D),分為46種基因型,親緣關(guān)系較近(≥73.9),單基因型菌株32株,余46株構(gòu)成14種共享基因型,證實貴州省羊種布魯氏菌分離株MLVA基因型具有型別多樣性。MLVA-16基因型的地區(qū)分布中,遵義及黔東南州分布的基因型最多,提示這2地的布病疫情可能存在多個傳染源。MST圖顯示,相鄰時間段,相鄰地區(qū)流行的基因型遺傳距離較近,提示貴州省省內(nèi)布病疫情流行株的基因型未發(fā)生較大改變,遵義與黔南、黔東南、畢節(jié)等地的布魯氏菌流行株間的共享基因型,從時間維度(遵義疫情早于其他地區(qū)疫情)及基因型角度,揭示布病疫情可能存在從遵義擴散導致的省內(nèi)傳播。2015年之后,貴州南部(黔東南、黔南、黔西南)相繼出現(xiàn)聚集性布病疫情,其基因型與遵義疫情基因型間的遺傳距離較遠,而與臨省廣西、云南的MLVA-8基因型一致,提示可能為省外輸入性導致的聚集性布病疫情。
布魯氏菌的MLVA分型分析對于布病疫情判斷及防控具有重要意義,貴州省羊種布魯氏菌分離株經(jīng)MLVA分析發(fā)現(xiàn),貴州省布病疫情可能存在以遵義為中心的省內(nèi)傳播及來自省外輸入傳播的多條傳播鏈。相關(guān)部門需要做好布病疫情的外防輸入,內(nèi)防擴散,衛(wèi)生疾控部門與動物防疫部門應加強聯(lián)防聯(lián)控,對于外防輸入,須嚴格加強對跨地區(qū)動物檢疫,對于內(nèi)防擴散,加強疫情監(jiān)測是相關(guān)部門需要關(guān)注的防控重點。
利益沖突:無