呂朝鵬,楊紅春
(武漢大學生命科學學院雜交水稻國家重點實驗室,湖北 武漢 430072)
鋅指蛋白是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子,具有結(jié)合Zn2+的手指狀結(jié)構(gòu),能夠調(diào)控植物生長發(fā)育、參與脅迫應(yīng)答[1,2]。根據(jù)鋅指蛋白氨基酸序列中半胱氨酸和組氨酸殘基排列順序和數(shù)量的差異,可分為C2H2、C2HC、C3H、C2HC5、C3HC4、C4、C4HC3、C6、C8九種亞型[3]。植物中存在大量的C2H2型鋅指蛋白,水稻中至少發(fā)現(xiàn)了189個該類蛋白[4]。本文總結(jié)了近年來水稻中C2H2型鋅指蛋白在水稻生長發(fā)育、非生物脅迫中的研究進展,以期對水稻中該類蛋白的研究提供參考。
首個C2H2型鋅指蛋白TFIIIA(transcription factor IIIA)發(fā)現(xiàn)于非洲爪蟾的卵母細胞中,能夠結(jié)合并起始5SrRNA基因的轉(zhuǎn)錄[5]。植物中首個被報道的C2H2型鋅指蛋白是矮牽?;ò曛袃?yōu)勢表達的EPF1[6],隨后在大豆[7]、小麥[8]、擬南芥[9]、水稻[10]中均發(fā)現(xiàn)了C2H2型鋅指蛋白。
C2H2型鋅指蛋白含有保守的CX2-4CX3FX5LX2HX3-5H序列(C代表半胱氨酸、X代表任意氨基酸,H代表組氨酸),這段保守的序列形成1個雙鏈反向平行的β折疊和1個α螺旋,并通過結(jié)合鋅離子構(gòu)成穩(wěn)定的鋅指結(jié)構(gòu)[11]。根據(jù)α螺旋區(qū)域是否存在保守的QALGGH序列,C2H2型鋅指蛋白可分為包含該序列的Q型和不含該序列C型[11]。當Q型鋅指蛋白中該保守序列突變時,蛋白對DNA的結(jié)合能力減弱甚至喪失[12]。此外,根據(jù)鋅指數(shù)量和位置的不同又可將其分為三C2H2型、分散成對排列的C2H2型及多個毗鄰的C2H2型[13],如圖1所示。
圖1 植物C2H2型鋅指蛋白結(jié)構(gòu)圖
絕大多數(shù)C2H2型鋅指蛋白除了鋅指結(jié)構(gòu)域外,還含有核定位信號(nuclear localization signal,NLS),可能和蛋白互作相關(guān)的L-BOX結(jié)構(gòu)域,以及和轉(zhuǎn)錄活性相關(guān)的EAR結(jié)構(gòu)域(ethylene-responsive element-binding factor(ERF)-associated amphiphilic repression (EAR) domain)[14]。盡管C2H2型鋅指蛋白OsDRZ1(Oryza sativa droughtresponsive zinc finger protein 1)和ZFP179都擁有EAR結(jié)構(gòu)域,然而OsDRZ1具有轉(zhuǎn)錄抑制活性,ZFP179具有轉(zhuǎn)錄激活作用[15,16],說明C2H2型鋅指蛋白對轉(zhuǎn)錄的抑制或者激活不僅僅取決于EAR結(jié)構(gòu)域。
C2H2型鋅指蛋白調(diào)控了水稻株高、小穗發(fā)育以及開花時間等。近年來水稻中報道的該類蛋白在生長發(fā)育中的功能如表1所示。
表1 水稻C2H2型鋅指蛋白在水稻生長、發(fā)育中的功能
株高是影響水稻生物量、抗倒伏性、機械收獲效果的重要因素。赤霉素(Gibberellin, GA)是影響株高的主要激素,正向調(diào)控植物株高[17]。C2H2型鋅指蛋白ZFP207、OsDRZ1通過GA調(diào)控水稻株高。ZFP207在水稻節(jié)間高水平表達,ZFP207過表達植株表現(xiàn)出矮化、根長變短、花粉活性降低等類似GA缺乏的發(fā)育缺陷,外源施加GA3能回復過表達ZFP207引起的半矮桿表型,表明ZFP207對水稻的生長抑制和GA信號途徑相關(guān)。ZFP207結(jié)合綠色革命基因SD1/OsGA20ox2(GA20 oxidase)染色質(zhì),并抑制其表達。SD1/OsGA20ox2編碼參與GA合成的GA20氧化酶,通過調(diào)控GA的含量調(diào)控株高[18]。ZFP207通過抑制SD1/OsGA20ox2的表達阻礙具有生物活性GA的合成,從而負向調(diào)控株高[19,20]。過表達OsDRZ1可以促進水稻生長,RNA-Seq分析表明,OsDRZ1過表達植株中GA受體蛋白基因GID1L2表達上調(diào),該基因的上調(diào)可能增強GA信號,促進水稻生長[16]。
開花時間是一項重要的農(nóng)藝性狀,展示植物對季節(jié)和地域的適應(yīng)情況,影響作物產(chǎn)量。水稻Hd3a(Heading date 3a)、RFT1(RICE FLOWERING LOCUS T 1)分別在短日照、長日照條件下促進開花[21,22]。Ehd1(Early heading date 1)促進Hd3a、RFT1的表達,加速開花[23]。C2H2型鋅指蛋白SIP1(SDG723/OsTrx1/OsSET33 Interaction Protein 1) 參與Ehd1-RFT1通路調(diào)控開花[1]。在長日照條件下,SIP1突變體中Ehd1、RFT1表達下調(diào),開花延遲。研究表明SIP1能夠和組蛋白H3K4甲基轉(zhuǎn)移酶OsTrX1(Oryza sativa Trithorax1)互作,招募OsTrX1結(jié)合到Ehd1染色質(zhì)上,促進基因激活修飾H3K4me3在Ehd1染色質(zhì)上的沉積,增加Ehd1的表達促進開花。
水稻的每個小穗由1朵小花和1對護穎、1對副護穎組成,最終發(fā)育成1粒種子,其中小花由6個雄蕊、1個雌蕊、1個外稃、1個內(nèi)稃、2個漿片共同組成。C2H2型鋅指蛋白LRG1(LACKING RUDIMENTARY GLUME 1)、NSG1(NONSTOP GLUMES1)、SL1(STAMENLESS 1)通過調(diào)控花器官決定基因的表達,控制小穗發(fā)育。LRG1在小穗發(fā)育期間在花序中表達增加,突變體中,護穎變長、產(chǎn)生額外的外稃樣器官,并且和野生型外稃具有相似的維管束數(shù)量;同時花器官決定基因OsMADS1、OsMADS14、OsMADS15、DL(DROOPING LEAF)也在變長的護穎和外稃樣器官中異位表達,暗示lrg1中額外產(chǎn)生了具有部分外稃特征的器官。這表明,C2H2型鋅指蛋白LRG1抑制護穎到外稃的同源轉(zhuǎn)化,維持小穗的正常發(fā)育[24]。此外,NSG1突變體中除了含有正常數(shù)量和形狀的外稃外,部分護穎、漿片轉(zhuǎn)變?yōu)橥怙麡悠鞴?,花器官決定基因LHS1(LEAFY HULL STERILE1)、DL在護穎中異位表達,并且DL也在漿片中異位表達,暗示C2H2型鋅指蛋白NSG1抑制護穎、漿片到外稃的同源轉(zhuǎn)化,維持小穗的正常發(fā)育。LHS1啟動子區(qū)存在DBS(DST-binding sequence)元件,NSG1結(jié)合該基序,并通過和OsTPRs(TOPLESS-RELATED genes)互作招募組蛋白去乙酰化酶HDACs(histone deacetylases),從而降低LHS1染色質(zhì)上的乙?;?,抑制其表達,調(diào)控小穗發(fā)育[25]。此外,單鋅指C2H2型蛋白突變體SL1中漿片和雄蕊轉(zhuǎn)變?yōu)閮?nèi)稃、外稃樣器官,且SPW1(SUPERWOMAN1)/OsMADS16在雄蕊原基和漿片原基中的表達消失,而SPW1/OsMADS16是決定雄蕊和漿片形成的關(guān)鍵基因[26],因此,SL1可能通過促進SPW1/OsMADS16轉(zhuǎn)錄決定漿片和雄蕊的發(fā)育[27]。
水稻產(chǎn)量主要由籽粒數(shù)、千粒重決定,籽粒數(shù)由水稻穗分枝數(shù)決定,籽粒大小是影響千粒重的重要因素。水稻C2H2型鋅指蛋白DST(DROUGHT AND SALT TOLERANCE)能夠通過細胞分裂素(cytokinin, CK)途徑調(diào)控穗分枝數(shù)進而決定籽粒數(shù),影響作物產(chǎn)量[16]。DST半顯性等位突變DSTreg1中,CK在莖尖分生組織處積累導致穗分枝增加[28],籽粒數(shù)增加[29]。DST能夠激活CK氧化酶基因Gn1a/OsCKX2(Grain number 1a/Cytokinin oxidase 2)的表達從而降解具有生物活性的CK。而DSTreg1轉(zhuǎn)錄激活功能喪失,導致OsCKX2表達下降,促進CK在SAM中積累,穗分枝數(shù)目增加,最終增加籽粒數(shù)量。并且將DSTreg1引入到水稻中,水稻的小穗數(shù)目增加,籽粒數(shù)也增加,暗示了其在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的潛力。
C2H2型鋅指蛋白LRG1不僅調(diào)控花發(fā)育,也通過調(diào)控細胞周期、細胞擴展基因的表達,參與穎殼大小的調(diào)控。LRG1突變體中穎殼縱切面的內(nèi)外層表皮細胞變短,細胞數(shù)目減少,導致籽粒變短;橫截面的細胞增大,造成穎殼變寬[24]。同時LRG1突變體細胞增殖速度變慢,細胞增殖和擴展相關(guān)基因BG1(Big Grain 1)、BG2、GS3(Grain Size 3)表達增加;促進籽粒增大的基因GS2、GS5表達減少;細胞周期相關(guān)基因CDKA1(Cyclin-dependent kinase A-1)、CDKA2降低;細胞擴展相關(guān)基因EXPA1(expansin-A 1)表達明顯減少,但EXPA25表達增加。這些結(jié)果表明,C2H2型鋅指蛋白LRG1通過正向或者負向調(diào)控細胞增殖和擴展相關(guān)的基因,控制穎殼的細胞增殖和擴展,從而影響穗粒大小。
鹽、干旱、冷等非生物脅迫能夠通過滲透脅迫、氧化脅迫和離子毒害等次級作用損傷細胞,抑制植物生長。植物通過合成脯氨酸、可溶性糖、甘氨酸、甜菜堿等滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)維持細胞滲透平衡,并且利用超氧化物歧化酶(Super Oxide Dimutase,SOD)、過氧化氫酶(Catalase,CAT)、過氧化物酶(peroxidase,POD)、谷胱甘肽過氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)清除過氧化氫(H2O2)、超氧陰離子(O2-)等活性氧(reactive oxygen species,ROS),減少ROS造成的細胞損傷[30]。近年來有關(guān)水稻中C2H2型鋅指蛋白在脅迫中的功能如表2所示。
表2 水稻C2H2型鋅指蛋白在非生物脅迫中的功能
鹽脅迫是植物面臨的主要非生物脅迫之一,高鹽抑制植物生長導致糧食減產(chǎn),嚴重制約農(nóng)業(yè)生產(chǎn),威脅糧食安全。過表達C2H2型鋅指蛋白基因ZFP179、ZFP213、ZFP252能夠通過維持滲透平衡和ROS穩(wěn)態(tài),提高水稻幼苗在鹽脅迫下的存活率[31-34]。鹽處理ZFP179過表達植株幼苗時,脯氨酸合成限速酶基因OsP5CS(Pyrroline-5-carboxylate synthetase)、脯氨酸轉(zhuǎn)運蛋白基因OsProT(Proline transporter 1-like)、脅迫相關(guān)基因OsDREB2A(Dehydration-Responsive Element-Binding Protein 2A)、OsLea3(Late embryogenesis abundant protein, group 3) 表達水平提高,可溶性糖和脯氨酸含量增加[15,35],暗示ZFP179可能通過促進脯氨酸、可溶性糖合成、轉(zhuǎn)運相關(guān)基因的表達,促進細胞內(nèi)脯氨酸、可溶性糖的積累,維持滲透平衡,提高水稻在鹽脅迫下的存活率。鹽處理OsZFP213過表達植株,幼苗中OsSOD、OsAPX、OsCAT表達增加,H2O2含量減少,存活率提高[32]。而過表達AtSOD、OsAPX2能夠提高植物對鹽脅迫的耐受性[36,37],表明C2H2型鋅指蛋白OsZFP213可能通過提高ROS的清除能力,減少H2O2的積累從而提高水稻在鹽脅迫下的存活率。此外,鹽處理DST突變體,莖中Na+的積累減少,幼苗對鹽的耐受性增加。該突變體可能通過促使氣孔關(guān)閉,降低呼吸速率從而減少Na+從根到莖的轉(zhuǎn)運,減少鹽離子在水稻中的積累,提高其在鹽脅迫下的存活率[38]。
全球人口的增長造成農(nóng)業(yè)用水需求不斷增加,然而全球可用的淡水資源日益匱乏,因此干旱對全球糧食安全影響越來越大。植物受到干旱脅迫時,種子萌發(fā)、開花受精等過程受到影響,導致作物減產(chǎn)。過表達C2H2型鋅指蛋白基因ZFP252、ZFP245、OsDRZ1等能夠通過維持滲透平衡、ROS穩(wěn)態(tài),提高水稻幼苗在干旱脅迫下的存活率。和鹽處理ZFP179過表達植株類似,干旱處理ZFP252過表達植株,OsP5CS、OsProT、OsDREB1A、OsLea3表達水平提高,脯氨酸和可溶性糖含量增加,幼苗存活率提高[31]。這暗示C2H2型鋅指蛋白ZFP252可能通過促進滲透物質(zhì)的積累增強植物的抗旱性。干旱處理ZFP245、OsDRZ1過表達的植株,相比于野生型,幼苗中H2O2、O2-積累更少,POD、SOD活性增加,存活率提高[10,16]。RNA-Seq分析表明,與野生型相比,干旱處理下OsDRZ1過表達植物的抗氧化活性相關(guān)基因表達水平更高[16],暗示C2H2型鋅指蛋白OsDRZ1、ZFP245可能通過維持ROS穩(wěn)態(tài)增強植物的抗旱性。此外,C2H2型鋅指蛋白OsDRZ1、DST也能通過調(diào)控氣孔活動增強植物的抗旱性。干旱處理OsDRZ1過表達植株,氣孔關(guān)閉程度增加,幼苗相對水含量更高,相對水分丟失速率更低,耐旱性增強[16]。與此不同的是,DST突變體氣孔密度減少、關(guān)閉程度增加,水稻的抗旱性增強。DST能夠通過直接結(jié)合到Prx24(Peroxidase 24 precursor)啟動子區(qū)域的DBS元件,促進Prx24表達,分解控制水稻氣孔關(guān)閉的H2O2[39]。干旱條件下,DST表達水平降低造成Prx24表達下降和H2O2積累,從而促進氣孔關(guān)閉,增強水稻的抗旱性[38]。
在營養(yǎng)生長階段低溫脅迫造成水稻分蘗減少,在生殖生長階段導致水稻雄性不育,在灌漿期降低水稻灌漿率。C2H2型鋅指蛋白ZFP245是水稻中鑒定出的首個同脅迫應(yīng)答相關(guān)的蛋白,低溫能誘導其表達。低溫處理ZFP245過表達植株,OsP5CS表達增加,自由脯氨酸含量增加,植物存活率明顯上升[40];同時SOD、POD含量增加,水稻的抗氧化能力提高[10],這些結(jié)果暗示,C2H2型鋅指蛋白ZFP245可能通過調(diào)控滲透物質(zhì)的積累和維持ROS穩(wěn)態(tài)增強植物的耐冷性。此外,大豆中鑒定出的C2H2型鋅指蛋白SCOF(soybean cold-inducible zinc finger protein)通過和bZIP轉(zhuǎn)錄因子SGBF-1互作,促進COR(cold response protein)表達[7],而水稻中的C2H2型鋅指蛋白是否能夠以及如何調(diào)控低溫基因應(yīng)答有待進一步的研究。
鋁以Al3+離子的形式溶解在酸性土壤中,通過抑制植物根系生長,影響植物對水分、營養(yǎng)物質(zhì)的吸收,對植物產(chǎn)生毒害,限制作物產(chǎn)量[41,42]。相比于其他主要農(nóng)作物,水稻對鋁的耐受能力更強。這種耐受同C2H2型鋅指蛋白OsART1(Al resistance transcription factor 1)相關(guān)[43]。OsART1在根中組成型表達,表達水平不受鋁的影響,OsART1能夠直接結(jié)合GGNVS順式作用元件[44],激活鋁耐受相關(guān)下游基因OsNRAT1(Nramp aluminum transporter 1)、OsALS1(ALUMINUM SENSITIVE 1)的表達,增加水稻對鋁的耐受能力[43]。OsNRAT1(Nramp aluminum transporter 1)是特異性Al3+轉(zhuǎn)運蛋白,定位于除表皮細胞外的所有根尖細胞的質(zhì)膜上。敲除OsNRAT1,鋁與細胞壁結(jié)合增加,水稻對鋁的吸收減少,敏感性增強[45]。OsALS1定位于液泡膜上,負責將鋁隔離到液泡中,減輕鋁對水稻的毒害[46]。這些結(jié)果表明,C2H2型鋅指蛋白OsART1能夠通過調(diào)控鋁下游基因OsNRAT1、OsART1的表達,吸收環(huán)境中的Al3+并轉(zhuǎn)運到液泡中,增強水稻對鋁脅迫的耐受性。
脫落酸(abscisic acid,ABA)在種子成熟、萌發(fā)、氣孔運動等發(fā)育和脅迫應(yīng)答調(diào)控中扮演了重要角色[49]。鹽、干旱脅迫能夠促進ABA積累。ZFP179、ZFP182啟動子上存在ABA響應(yīng)元件ABRE(ABA-responsive element)[15,34],ABA能夠誘導ZFP179、ZFP182表達,這暗示C2H2型鋅指蛋白ZFP179、ZFP182可能通過ABA依賴途徑發(fā)揮作用。ABA處理ZFP179過表達植株,滲透壓相關(guān)基因OsP5CS、OsLea3、OsProT表達增加,暗示C2H2型鋅指蛋白ZFP179可能通過ABA依賴途徑維持脅迫條件下的滲透平衡[15],提高水稻在逆境下的存活率;ABA處理ZFP182過表達植株,OsMAPK1、OsMAPK5表達上調(diào),SOD、APX活性增強[47];ABA處理ZFP36過表達植株,OsMAPK表達增加,SOD、APX活性增強,水稻對H2O2的敏感性減弱[48]。MAPK是ABA依賴途徑中與抗氧化相關(guān)的信使分子[50]。這些結(jié)果暗示,C2H2型鋅指蛋白ZFP182、ZFP36可能通過參與ABA誘導的抗氧化防御反應(yīng)提高植物的存活率。
ABA能夠調(diào)控H2O2積累控制氣孔關(guān)閉,增強植物對干旱的耐受性[51]。DST能夠通過調(diào)控H2O2含量提高水稻對干旱的耐受性[38]。經(jīng)ABA處理后,DST的表達水平?jīng)]有明顯變化,同時野生型和突變體中氣孔開放程度也沒有明顯變化,暗示C2H2型鋅指蛋白DST能夠以不依賴于ABA的方式增強水稻對干旱的耐受。
DREB/CBF(The dehydration-responsive element binding transcription factors/C-repeat CRT binding transcription factors)能夠以非ABA依賴的方式增強植物的抗逆性[52,53]。OsDREB2A是DREB家族的成員能增強水稻對鹽和干旱的耐受[54]。ZFP179過表達植株中OsDREB2A表達增加,耐鹽性提高,然而ABA處理ZFP179過表達植株,OsDREB2A表達卻沒有增加,暗示C2H2型鋅指蛋白ZFP179也可能通過非ABA依賴的方式調(diào)控DREB2A基因的表達從而增強對逆境的耐受。
C2H2型鋅指蛋白參與了水稻株高、籽粒發(fā)育、花期調(diào)控等過程,在生長發(fā)育中發(fā)揮重要功能,同時該類蛋白也參與了對鹽、冷、干旱、鋁脅迫的應(yīng)答。雖然OsART1參與了水稻對鋁脅迫的耐受調(diào)控,但是仍然不清楚C2H2型鋅指蛋白是否參與對其他重金屬的耐受調(diào)控。目前對該類蛋白的研究主要集中在水稻形態(tài)和生理變化等方面的描述,對于逆境脅迫的信號轉(zhuǎn)導途徑和分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究仍然有待深入。此外,在水稻的生長發(fā)育過程中,C2H2型鋅指蛋白能夠通過改變?nèi)旧|(zhì)狀態(tài)調(diào)控花期,然而能否通過改變?nèi)旧|(zhì)狀態(tài)而增強抗逆能力仍然有待探究。
綜上,C2H2型鋅指蛋白在水稻的生長發(fā)育和脅迫的耐受調(diào)控中發(fā)揮重要作用,其功能和分子機制還有待進一步研究和挖掘。