張紅芳, 施偉領(lǐng), 馬靈燕, 呂文濤, 楊彩梅, 楊 華, 吳酬飛, 肖英平*
(1.湖州師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,浙江湖州 313000;2.浙江農(nóng)業(yè)科學(xué)院省部共建農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全危害因子與風(fēng)險(xiǎn)防控國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全與營養(yǎng)研究所,浙江杭州 310021;3.浙江大飛龍動(dòng)物保健品股份有限公司,浙江金華 321017;4浙江萬方生物科技有限公司,浙江湖州 313300)
腸道作為哺乳動(dòng)物最重要的器官,其腸內(nèi)含有與宿主健康相關(guān)的多種微生物(Zhaxi,2020;徐娥,2019)。這些微生物在維持宿主生長發(fā)育方面發(fā)揮著顯著作用,例如合成維生素,刺激與免疫相關(guān)的組織來抵御病原菌的入侵,提供營養(yǎng)物質(zhì)并產(chǎn)生多種代謝產(chǎn)物(李潔,2020;鄭有秀,2018)。仔豬作為豬生長發(fā)育中最重要的階段,其在斷奶期間引起的應(yīng)激會(huì)打破宿主與腸道微生物的動(dòng)態(tài)平衡,導(dǎo)致腸道結(jié)構(gòu)和黏膜屏障損毀,容易引起仔豬腹瀉、采食量降低、生長速度緩慢,甚至死亡(Xun,2015;Campbell,2013)。研究表明,在飼料中加入微生態(tài)制劑能夠有效地改善斷奶仔豬的生長性能(李慧敏,2022),主要是通過改變宿主體內(nèi)腸道微環(huán)境,促進(jìn)宿主體內(nèi)有益菌的增加,抑制有害菌的生長起到益生作用(黃其田,2017)。特別是自2020年飼料全面實(shí)施禁抗以來,尋找綠色安全,無毒害作用的微生態(tài)制劑已成為必經(jīng)之路(Ming,2021)。眾所周知,丁酸梭菌作為一種能調(diào)節(jié)動(dòng)物疾病的革蘭氏陽性厭氧芽孢桿菌,作為促進(jìn)動(dòng)物生長的飼料添加劑已被廣泛應(yīng)用。在日糧中添加丁酸梭菌可以顯著降低畜禽的腹瀉率和腸道通透性,增加營養(yǎng)物質(zhì)的消化率和腸道緊密連接蛋白的表達(dá),維持腸上皮屏障的完整性(李娜,2021;Fu,2021)。丁酸梭菌能夠使仔豬血清樣本中IgA、IgG蛋白的濃度明顯升高(李玉鵬,2020)。此外,丁酸梭菌在機(jī)體內(nèi)的代謝物SCFAs能夠?yàn)榇竽c提供必要的能量,對(duì)維持宿主的免疫穩(wěn)態(tài)起調(diào)節(jié)作用(Koh,2016),特別是在丁酸激酶和丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶作用下生成的代謝物能夠?yàn)闄C(jī)體腸道上皮細(xì)胞再生和修復(fù)等生物學(xué)過程提供必要的營養(yǎng)(楊華,2019)。然而,目前的研究大多集中在丁酸梭菌作為益生菌對(duì)仔豬生長性能、血清免疫的用途(Wang,2019a),對(duì)于丁酸梭菌對(duì)斷奶仔豬盲腸菌群及其產(chǎn)丁酸代謝的研究較少。因此,本試驗(yàn)通過研究丁酸梭菌對(duì)斷奶仔豬盲腸微生物菌群結(jié)構(gòu)的影響,旨在揭示微生物及微生物代謝產(chǎn)物(SCFAs)與宿主的關(guān)系,為丁酸梭菌替代抗生素在畜牧中的應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。
1.1 試驗(yàn)材料和設(shè)計(jì) 選取日齡為(25±1)d、重量為(6.24±0.32)kg的“杜×長×大”斷奶仔豬162頭,隨機(jī)分成3個(gè)試驗(yàn)組。處理如下:對(duì)照組(Ctrl組)給予常規(guī)飼料喂養(yǎng),試驗(yàn)組在對(duì)照組的基礎(chǔ)上加入濃度為500 mg/kg(CB500組)和2000 mg/kg(CB2000組)的丁酸梭菌。試驗(yàn)仔豬飼喂的常規(guī)飼料成分與配方參照鄭有秀(2018)的報(bào)道,飼養(yǎng)期為30 d,然后從每個(gè)組中選取4頭仔豬進(jìn)行屠宰,取盲腸內(nèi)容物于-80℃保存用于測序。
1.2 DNA提取和產(chǎn)丁酸關(guān)鍵功能基因RTPCR分析 用QIAamp DNA Stool Mini Kit(QIAGEN,CA)試劑盒從試驗(yàn)仔豬盲腸內(nèi)提取一定量的微生物DNA,參照趙廣民(2021)的引物序列(表1)對(duì)仔豬盲腸丁酸激酶和丁酰-CoA,乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其擴(kuò)增體系共10μL,分別為5.0 μL SYBRTM Green Mix,上、下游引物各0.5μL,dd H2O 4.0μL,擴(kuò)增流程為:在溫度為95℃的條件下進(jìn)行預(yù)變性2 min;95℃變性15 s;58℃退火45 s;最后在72℃延伸1 min;共三十次循環(huán)。每個(gè)樣品設(shè)置三次重復(fù),根據(jù)所測定的Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)比來計(jì)算樣本中基因的相對(duì)表達(dá)量。
表1 引物序列
1.3 短鏈脂肪酸測定 參照Xiao(2017)的方法進(jìn)行短鏈脂肪酸含量的測定,具體為稱取斷奶仔豬盲腸腸道內(nèi)容物0.5 g于15 mL的離心管中,加入5 mL超純水,緩慢搖晃至混合均勻,12000 r/min離心10 min。抽取1 mL的上清液后,向其中加入0.2 mL的巴豆酸和偏磷酸混合液,之后使用規(guī)格為0.22μm的濾膜對(duì)上述混合液進(jìn)行過濾,之后使 用毛細(xì)管 氣 相 色 譜 儀 (GC-2010 plus,Shimadzu,Japan)測定短鏈脂肪酸的濃度。
1.4 高通量測序和生物信息學(xué)分析 用341F(5'-CCTAYGGGRB-GCASCAG-3')和806R(5'-GGACTACNNGGG-TATCTAAT-3')對(duì)16S rRNA基因的高變區(qū)(V3~V4區(qū))進(jìn)行擴(kuò)增,并借助于Illumina Hiseq平臺(tái)對(duì)擴(kuò)增區(qū)域進(jìn)行測定分析。用QIIME平臺(tái)對(duì)相似度為97%的測序數(shù)據(jù)按照不同操作單元(OTU)進(jìn)行分類。用Sliva和RPD對(duì)OTU中全部典型序列進(jìn)行物種匹配。之后按照最終有效數(shù)據(jù)對(duì)其不同分類下的相對(duì)豐度進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
1.5 數(shù)據(jù)分析 qPCR、SCFA兩個(gè)試試驗(yàn)數(shù)據(jù)用SPSS 26.0軟件進(jìn)行單因素方差分析(one-way ANOVA),用Duncan's法進(jìn)行多重比較,以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤”表示,P<0.05為數(shù)據(jù)差異有意義。并用Graph Pad Prim7軟件包進(jìn)行微生物多樣性作圖。
2.1 丁酸梭菌對(duì)仔豬盲腸菌群豐度和多樣性的影響 由表2可知,相比對(duì)照組,用丁酸梭菌處理可以使仔豬盲腸內(nèi)容物中菌群α多樣性的豐度指數(shù)(chao)指數(shù)和香農(nóng)(shannon)指數(shù)有明顯的升高趨勢。且本次測序樣本覆蓋度(Goods_coverage)指數(shù)為0.996~0.997,說明本次測序樣本的覆蓋度較全面,符合測序要求。
表2 仔豬盲腸菌群alpha多樣性分析
2.2 丁酸梭菌對(duì)仔豬盲腸菌群結(jié)構(gòu)的分析 門和屬水平的盲腸內(nèi)容物中的細(xì)菌群落組成見圖1,在仔豬盲腸中相對(duì)豐度最高的三個(gè)優(yōu)勢菌門分別為厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobac-teria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)、其厚壁菌門和變形菌門的相對(duì)豐度分別為61.67%~86.95%和4.96%~24.84%,擬桿菌門為3.37%~16.71%。且與Ctrl組相比,CB2000組的變形菌門和廣古菌門(Euryarchaeota)相對(duì)豐度分別下降了1.34%和6.62%(P<0.05)。
圖1 丁酸梭菌對(duì)仔豬盲腸菌群結(jié)構(gòu)的影響
在屬水平上,其相對(duì)豐度最高的有梭菌屬(Clostridium_sensu_stricto_1)、土 孢 桿 菌 屬(Terrisporobacter)、直腸真桿菌屬([Eubacterium]_rectale_group)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、幽門螺桿菌(Helicobacter)、普雷沃氏菌屬(Prevotella_9)、布勞特氏菌屬(Blautia)、罕見小球菌屬(Subdoligranulum)、羅斯氏菌屬(Roseburia)和葡萄球菌屬(Staphylococcus)。相比對(duì)照組而言,CB500組中Terrisporobacter和Staphylococcus相對(duì)豐度分別增加了0.38%和0.14%(P<0.05)。
由圖2可知,與Ctrl組相比,CB2000組的彎曲菌屬(Campylobacter)和瘤胃菌屬(Ruminococcaceae_UCG-014)的相對(duì)豐度分別下降了5.5%和0.72%(P<0.05)。但相比于Ctrl組,CB500組的庫特氏菌屬(Kurthia)和鏈球菌屬(Streptococcus)分別增加了0.71%和0.03%(P<0.05)。
圖2 仔豬盲腸菌群結(jié)構(gòu)熱點(diǎn)圖(前35種菌屬)
2.3 不同水平丁酸梭菌對(duì)仔豬盲腸菌群結(jié)構(gòu)Beta多樣性分析 由圖3可知,基于非加權(quán)法通過對(duì)不同水平丁酸梭菌對(duì)仔豬盲腸菌群樣品間的差異進(jìn)行主坐標(biāo)分析(PCoA)發(fā)現(xiàn),當(dāng)R=0.1065時(shí),對(duì)照組和試驗(yàn)組有顯著不同的聚類,且試驗(yàn)組在不同水平下有不同的聚類,說明試驗(yàn)組和對(duì)照組仔豬盲腸微生物菌群結(jié)構(gòu)存在差異,且試驗(yàn)組在不同水平的丁酸梭菌濃度添加下其菌群結(jié)構(gòu)也存在差異。
圖3 仔豬盲腸菌群結(jié)構(gòu)主坐標(biāo)分析
2.4 丁酸梭菌對(duì)斷奶仔豬盲腸SCFA的影響由表3可知,與對(duì)照組相比,丁酸梭菌處理使斷奶仔豬盲腸中丁酸、異丁酸、戊酸、異戊酸和總短鏈脂肪酸的含量有增多趨勢,其中丁酸含量增加趨勢較為明顯(P=0.064),且CB2000組丁酸含量比對(duì)照組增加了28.0%。
表3 仔豬盲腸短鏈脂肪酸含量
2.5 丁酸梭菌仔豬盲腸產(chǎn)丁酸代謝關(guān)鍵功能基因的影響 由表4可知,與對(duì)照組相比,丁酸梭菌處理組的丁酸激酶和丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶的相對(duì)表達(dá)含量增加,尤其是丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)量增加顯著(P<0.05),且CB2000組丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)量與對(duì)照組相比增加了15%。
表4 仔豬盲腸丁酸激酶和丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶基因相對(duì)表達(dá)量
丁酸梭菌制劑作為一種活菌被廣泛應(yīng)用于豬、牛和家禽飼料中,其產(chǎn)生的芽孢能夠抵制外界環(huán)境的惡劣變化,并且在生物體內(nèi)能夠耐酸、耐熱、耐膽汁。Scalfaro(2017)研究發(fā)現(xiàn),丁酸梭菌進(jìn)入人和動(dòng)物腸道后,通過產(chǎn)生抗菌化合物如有機(jī)酸和細(xì)菌素來增強(qiáng)腸上皮屏障功能,進(jìn)而對(duì)病原體起到一定的拮抗效果,導(dǎo)致病原菌的增殖生長速率大幅下降,改善免疫狀態(tài)、腸黏膜結(jié)構(gòu)和腸道微生物的分布。Wang(2019b)用不同水平濃度的丁酸梭菌對(duì)仔豬空腸進(jìn)行處理后發(fā)現(xiàn),處理組腸道內(nèi)TLR4、MyD88、NF-κB的表達(dá)水平明顯下調(diào),這說明丁酸梭菌能夠?qū)LR4炎癥通路起到一定的調(diào)節(jié)控制作用,進(jìn)而使LPS誘導(dǎo)的機(jī)體炎性反應(yīng)明顯減緩。此外,已有研究發(fā)現(xiàn),丁酸梭菌能夠使仔豬腸道內(nèi)的優(yōu)勢菌群含量明顯增多,進(jìn)而對(duì)毒害菌群的增殖和生長產(chǎn)生一定的抑制作用,進(jìn)而使機(jī)體免疫系統(tǒng)生物學(xué)功能顯著增強(qiáng),并有效促進(jìn)機(jī)體的生長發(fā)育(趙敏孟,2018)。本研究中,在斷奶仔豬日糧中添加500 mg/kg的丁酸梭菌可以顯著增加盲腸菌群厚壁菌門的相對(duì)豐度,通過進(jìn)一步對(duì)屬水平上進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),盲腸內(nèi)容物中鏈球菌屬(Streptococcus)的相對(duì)豐度顯著增加,彎 曲 菌 屬(Campylobacter)和 瘤 胃 菌 屬(Ruminococcaceae_UCG-014)等條件致病菌的相對(duì)豐度顯著降低(P<0.05),這與Han(2020)和王遠(yuǎn)霞(2020)的研究結(jié)果一致。說明用丁酸梭菌處理可以調(diào)節(jié)腸道微生態(tài)平衡,有效的緩解仔豬腹瀉。
丁酸作為腸上皮細(xì)胞的主要能源物質(zhì),在人體結(jié)腸內(nèi)超過95%的丁酸被吸收利用,既維持了生物體內(nèi)結(jié)腸細(xì)胞的穩(wěn)定,又可以防止或抑制細(xì)胞發(fā)生病變,且一定水平的丁酸能夠通過調(diào)節(jié)腸道菌群來治療腸應(yīng)激綜合征。在動(dòng)物中,丁酸作為具有多種生物學(xué)特性的脂肪酸,能夠促進(jìn)動(dòng)物的生長性能并影響動(dòng)物產(chǎn)品品質(zhì)(黃翠翠,2021)。Elamin(2013)研究發(fā)現(xiàn),丁酸通過增加黏液層的厚度來對(duì)Caco-2細(xì)胞起保護(hù)作用。丁酸梭菌代謝產(chǎn)生的短鏈脂肪酸(SCFA)特別是丁酸等可以被后腸迅速吸收,既維持了大腸的正常功能,又降低了腸道滲透壓和pH,有利于提高動(dòng)物腸道內(nèi)消化酶的活性(林華林,2019)。本研究中丁酸梭菌處理的斷奶仔豬盲腸內(nèi)容物中丙酸、丁酸、戊酸的含量均有增加趨勢,產(chǎn)丁酸代謝關(guān)鍵酶丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶基因的相對(duì)表達(dá)量明顯升高。這表明丁酸梭菌有助于生成多種對(duì)機(jī)體有益的代謝物,例如維生素和胞外酶等,進(jìn)而改善機(jī)體對(duì)營養(yǎng)物質(zhì)的吸收和消化,更好的塑造腸道代謝環(huán)境,有益于斷奶仔豬健康。
丁酸梭菌處理能夠增加仔豬盲腸鏈球菌屬、庫特氏菌屬、土孢桿菌屬的豐度,顯著降低仔豬腸道內(nèi)彎曲菌屬和瘤胃菌屬等條件致病菌的豐度。丁酸梭菌處理能夠使腸道短鏈脂肪酸含量呈增加趨勢,且產(chǎn)丁酸的關(guān)鍵酶丁酰-CoA:乙酰-CoA轉(zhuǎn)移酶的表達(dá)水平顯著上調(diào)。