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多光譜法研究鈣黃綠素-U(VI)配合物與鯡魚精DNA的作用機(jī)理

2023-04-29 07:51劉德春楊文彬肖嘯楊懿謝紅威李威顏奧琦

劉德春 楊文彬 肖嘯 楊懿 謝紅威 李威 顏奧琦

摘要:結(jié)合UV-Vis吸收光譜、熒光光譜和黏度測(cè)試法,系統(tǒng)研究了Tris-HCl(pH=7.25)緩沖溶液中U(VI)-鈣黃綠素(CA)配合物與鯡魚精DNA(hsDNA)的相互作用機(jī)理。通過摩爾比率法確定U(VI)-CA-hsDNA體系的結(jié)合比nU(VI)∶nCA∶nhsDNA=1∶2∶1。以雙倒數(shù)法計(jì)算出此體系在不同反應(yīng)溫度下的結(jié)合常數(shù),熱力學(xué)計(jì)算表明U(VI)-CA-hsDNA的反應(yīng)是疏水力驅(qū)動(dòng)進(jìn)行的自發(fā)行為。結(jié)合熒光分析、Scatchard法分析和溶液黏度變化分析,證明U(VI)-CA配合物對(duì)hsDNA的熒光猝滅為動(dòng)態(tài)和靜態(tài)混合猝滅過程,作用方式為嵌插和非嵌插的混合結(jié)合模式。實(shí)驗(yàn)表明U(VI)-CA配合物嚴(yán)重影響hsDNA的生物功能。

關(guān)鍵詞:鯡魚精DNA放射性U(VI)鈣黃綠素?zé)晒忖?/p>

中圖分類號(hào):O657.61文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):1671-8755(2023)01-0022-09

Abstract:ViathemeasurementapproachesofUV-Visabsorptionspectrum,fluorescencespectrumandviscosity,theinteractionmechanismbetweenU(VI)-calcein(CA)complexandherringspermDNA(hsDNA)intheTris-HClbuffersolution(pH=7.25)wassystematicallyinvestigated.BindingratioofU(VI)-CA-hsDNAwasdeterminedasnU(VI)∶nCA∶nhsDNA=1∶2∶1bymolarratiomethod.BindingconstantsofU(VI)-CA-hsDNAcomplexatdifferenttemperatureswereobtainedbydoublereciprocalmethod,andtheevaluatedthermodynamicdataindicatedthattheformationofU(VI)-CA-hsDNAcomplexwasspontaneousanddrivenbyhydrophobicforce.Combinedwiththefluorescenceanalysis,scatchardmethodanalysisandsolutionviscositychangeanalysis,thefluorescencequenchingmodeofhsDNAbyU(VI)-CAcomplexwasprovedtobeamixeddynamic-staticquenchingprocess,andtheactionmodewasamixedcombinationmodeofintercalationandnonintercalation.TheexperimentalresultsshowthattheU(VI)-CAcomplexseriouslyaffectsthebiologicalfunctionofhsDNA.

Keywords:HerringspermDNA;RadioactiveU(VI);Calcein;Fluorescencequenching

鈾在工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和科技領(lǐng)域有著廣泛應(yīng)用。作為重要的放射性核素之一,即使在低濃度下也具有嚴(yán)重的毒性[1],其不當(dāng)?shù)暮筇幚砘蚺欧艜?huì)對(duì)地面和含水層造成嚴(yán)重的環(huán)境威脅,因此,鈾及其各種衍生物的分析監(jiān)測(cè)受到廣泛關(guān)注[2]。含鈾廢物在水中易溶解、輸運(yùn)和沉淀,若處理不當(dāng)而排入水體中,在微生物作用下將產(chǎn)生更多有毒金屬有機(jī)物,通過食物鏈富集進(jìn)入人體,從而對(duì)人體健康造成嚴(yán)重影響[3]。因此,探索放射性鈾及其有機(jī)小分子活性配合物與生物大分子的作用方式,對(duì)了解放射性核素危害人體健康的致病機(jī)理具有重要意義。

生物體細(xì)胞核中的重要遺傳物質(zhì)DNA大分子由糖磷酸骨架和4個(gè)核堿基組成[4],它控制著蛋白質(zhì)的合成和儲(chǔ)存遺傳信息[5],在基因轉(zhuǎn)錄、基因表達(dá)、癌變和突變中起著至關(guān)重要的作用。因此,DNA常作為研究各種抗腫瘤和抗癌藥物的生物活性靶分子[6]。研究各種小分子及其金屬離子的配合物與DNA的相互作用機(jī)理,對(duì)于設(shè)計(jì)能夠識(shí)別特定DNA位點(diǎn)的新型高效藥物具有重要意義[7]。近年來,有學(xué)者開展了小分子及其各種金屬離子配合物與DNA結(jié)合的研究[8]。然而,放射性U(VI)及其各種有機(jī)小分子活性配合物與DNA的相互作用機(jī)理卻鮮有報(bào)道。研究鈾及其有機(jī)小分子活性配合物與DNA的結(jié)合方式,可以從分子水平上了解鈾及其小分子活性配合物對(duì)人體健康的影響,準(zhǔn)確推進(jìn)針對(duì)靶向癌細(xì)胞和正常細(xì)胞的無毒高效藥物的作用機(jī)理研究和開發(fā)[9]。UV-Vis吸收和熒光光譜具有測(cè)量簡(jiǎn)單、快速且靈敏的特點(diǎn),是研究小分子與生物大分子之間作用機(jī)理的最有效方法[10]。因此,本實(shí)驗(yàn)在生理pH值條件下利用多光譜法研究了U(VI)-鈣黃綠素活性配合物與鯡魚精DNA的相互作用機(jī)理,為放射性鈾在環(huán)境科學(xué)、生物醫(yī)學(xué)和毒理學(xué)領(lǐng)域的毒性預(yù)防、評(píng)價(jià)及相關(guān)藥物的開發(fā)提供理論依據(jù)。

1實(shí)驗(yàn)

1.1試劑

鯡魚精DNA(BR級(jí),純度>99.0%,分子量為17736g·mol-1),上海源葉生物科技有限公司;三羥甲基氨基甲烷(BR級(jí))、NaOH(AR級(jí))、HCl(AR級(jí))、茜素紅(AR級(jí))、鈣黃綠素(AR級(jí)),成都市科隆化學(xué)品有限公司;硝酸鈾(AR級(jí)),北京化工廠。所有實(shí)驗(yàn)溶液均使用生物反應(yīng)最優(yōu)pH值的Tris-HCl緩沖溶液制備。

1.2實(shí)驗(yàn)方法

1.2.1UV-Vis吸收光譜測(cè)定

UV-Vis吸收光譜測(cè)量在UV-3150分光光度計(jì)(日本京都島津公司)和1.0cm石英比色皿上進(jìn)行。吸收光譜的測(cè)定分3步進(jìn)行,首先在系列10mL比色管中用Tris-HCl緩沖溶液配制固定濃度的U(VI),CA和hsDNA溶液(cCA=1×10-3mol·L-1,cU(VI)=1×10-3mol·L-1和chsDNA=1×10-5mol·L-1),以相應(yīng)pH值的緩沖溶液為空白參比溶液,掃描三者之間在20℃下相互作用的吸收光譜以確定最佳反應(yīng)pH值。其次,配制最佳反應(yīng)pH值下的U(VI),CA和hsDNA溶液(濃度同上一步),在石英比色皿中加入3.5mL相關(guān)溶液,采用滴定法測(cè)定U(VI)與CA相互作用的吸收光譜。最后,以摩爾比法得到U(VI)與CA反應(yīng)的結(jié)合比,配制此結(jié)合比下的一定濃度的U(VI)-CA配合物溶液,采用滴定法測(cè)定其與hsDNA在不同溫度下相互作用的吸收光譜。每次掃描光譜前均將比色皿中的樣品溶液充分混合并恒溫5min,體積效應(yīng)忽略不計(jì),下同。

1.2.2熒光光譜測(cè)定

熒光光譜測(cè)量在F-4600熒光分光光度計(jì)(日本日立高科技公司,1.0cm石英比色皿)上進(jìn)行。測(cè)量過程分為3個(gè)步驟:首先,不同反應(yīng)溫度下U(VI)-CA-hsDNA三相作用體系熒光猝滅光譜的測(cè)定采用1×10-3mol·L-1濃度的U(VI)-CA配合物溶液滴定1×10-5mol·L-1濃度的hsDNA溶液。其次,以3×10-4mol·L-1茜素紅作為熒光探針,固定hsDNA濃度為1×10-6mol·L-1,在室溫25℃下測(cè)定hsDNA和U(VI)-CA配合物不同混合摩爾比(0,0.2,0.4,0.6,0.8和1.0)的熒光光譜。最后,通過測(cè)量U(VI)-CA-hsDNA溶液從30℃升溫至90℃的最大特征熒光峰(掃描步長(zhǎng)為10℃)的變化來確定U(VI)-CA-hsDNA配合物的熔點(diǎn)溫度(Tm),這里固定U(VI)-CA-hsDNA配合物的濃度為1×10-3mol·L-1。所有熒光光譜測(cè)定條件設(shè)置為中等速度,狹縫寬度5nm,幅度為2,波長(zhǎng)310nm。

1.2.3U(VI)-CA-hsDNA反應(yīng)體系黏度的測(cè)定

使用烏氏黏度計(jì)(0.6mm)在25℃水浴中進(jìn)行反應(yīng)體系溶液的黏度變化測(cè)量。hsDNA和U(VI)-CA配合物溶液的濃度均固定在1×10-4mol·L-1。加入2mLhsDNA溶液于10mL比色管中,分別加入不同量(0~8mL)的U(VI)-CA溶液,以Tris-HCl緩沖溶液稀釋制備系列不同濃度的U(VI)-CA-hsDNA三相體系溶液。分別在黏度計(jì)中加入不同濃度的U(VI)-CA-hsDNA溶液,重復(fù)3次測(cè)定各樣品的流動(dòng)時(shí)間t。溶液比黏度η0和η值由η=(t-t0)/t0進(jìn)行計(jì)算[11],其中t和t0分別代表在添加不同濃度U(VI)-CA配合物和單獨(dú)緩沖溶液存在下hsDNA的流出時(shí)間;η和η0分別代表添加和沒有添加U(VI)-CA配合物的hsDNA溶液的比黏度。

2結(jié)果及分析

2.1溶液pH值對(duì)U(VI)-CA-hsDNA配合物形成的影響

CA在不同的溶液pH值條件下與放射性U(VI)離子或hsDNA反應(yīng)時(shí),其UV-Vis吸收光譜特征峰的吸光度值和位置會(huì)發(fā)生明顯變化,從而可確定體系反應(yīng)的最佳pH值。如圖1所示,CA溶液在323nm和493nm出現(xiàn)兩個(gè)特征吸收峰。將各反應(yīng)體系在493nm處的特征吸收峰的吸光度變化值和紅移值列于表1中,結(jié)果發(fā)現(xiàn)U(VI)-CA和U(VI)-CA-hsDNA系統(tǒng)在pH值7.25時(shí)存在最大的吸光度降低值和紅移值,表明此pH值為U(VI)-CA-hsDNA配合物形成的最佳值,它接近人體生理pH值,符合hsDNA大分子的生物學(xué)條件。因此,后續(xù)實(shí)驗(yàn)均在pH=7.25下進(jìn)行。

2.2U(VI)-CA-hsDNA配合物形成的UV-Vis吸收光譜分析

CA與U(VI)的結(jié)合率可以通過分光光度滴定法的UV-Vis吸收光譜計(jì)算得到[12]。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)U(VI)-CA配合物在493nm特征峰處的吸光度值隨U(VI)量的增加而顯著降低,并產(chǎn)生一定程度的紅移(圖2(a),每滴10μL,0-13對(duì)應(yīng)0~130μL)。通過摩爾比法可求得此特征峰處U(VI)-CA配合物的結(jié)合比nU(VI)∶nCA=1∶2(圖2(b))[13]。采用相同的方法,在λ=492nm處可確定U(VI)-CA-hsDNA三相體系的結(jié)合比nU(VI)∶nCA∶nhsDNA=1∶2∶1(圖2(c)和圖2(d),cU(VI)-CA=5.0×10-5mol·L-1,chsDNA=1.0×10-6mol·L-1,每滴10μL,0-30對(duì)應(yīng)0~300μL)。根據(jù)朗伯-比爾定律(吸光度A=εbc,b=1cm),U(VI)-CA和U(VI)-CA-hsDNA配合物在20℃下的表觀摩爾吸光度(ε)分別為5.11×104L·mol-1·cm-1和7.33×104L·mol-1·cm-1。

2.4U(VI)-CA配合物對(duì)hsDNA的熒光猝滅機(jī)理

圖5為不同溫度下滴加U(VI)-CA配合物的hsDNA溶液的熒光光譜(λex=310nm,λem=391nm,pH=7.25)。從圖5可見,hsDNA溶液的熒光強(qiáng)度隨著U(VI)-CA量的增加而顯著降低,但最大發(fā)射波長(zhǎng)隨溫度的升高而產(chǎn)生明顯的紅移現(xiàn)象,表明hsDNA的構(gòu)象產(chǎn)生了改變(圖5(a)、圖5(b)和圖5(c))。同時(shí),在475nm附近出現(xiàn)了一個(gè)等熒光強(qiáng)度點(diǎn),表明U(VI)-CA配合物對(duì)hsDNA產(chǎn)生了嵌插作用[17]。由于hsDNA蛋白隨溫度升高而變性,導(dǎo)致U(VI)-CA-hsDNA溶液的熒光強(qiáng)度隨溫度升高而降低[18]?;谀柋确?,計(jì)算出U(VI)-CA-hsDNA配合物在不同溫度下的結(jié)合比nhsDNA∶nU(VI)-CA=1∶1(圖5(d)),與UV-Vis吸收光譜的分析結(jié)果相同。

為了進(jìn)一步探索U(VI)-CA對(duì)hsDNA的猝滅機(jī)理,假設(shè)熒光猝滅是動(dòng)態(tài)猝滅過程,因此可用Stern-Volmer方程來描述[19]:

2.5U(VI)-CA配合物與hsDNA之間的結(jié)合模式分析

由于茜素紅(AR)分子可以嵌入DNA鏈雙螺旋的堿基對(duì)中,從而增加其熒光強(qiáng)度。因此,AR可用作熒光探針來研究U(VI)-CA配合物與hsDNA之間的相互作用。AR對(duì)U(VI)-CA-hsDNA體系的影響可通過熒光Scatchard方程進(jìn)行分析[24]:

式中:r是指每個(gè)核苷酸結(jié)合配合物的量;c是游離配合物的濃度;n是r的最大值;K是單個(gè)位點(diǎn)固有的結(jié)合常數(shù)。根據(jù)r的定義,可得:

U(VI)-CA是否嵌插入hsDNA的螺旋雙鏈中,可以通過測(cè)定U(VI)-CA-hsDNA不同溫度下的變性溫度(Tm)來確定。因?yàn)镈NA的變性溫度一般在70℃左右,如果嵌入劑嵌入DNA的雙鏈堿基對(duì)中,則可以提高DNA螺旋雙鏈的穩(wěn)定性和Tm值;反之,非嵌入結(jié)合會(huì)導(dǎo)致Tm值增加不明顯[27]。測(cè)定U(VI)-CA-hsDNA配合物在不同加熱溫度下的系列熒光光譜,以最大特征峰處的熒光值比Ft/F0為縱坐標(biāo)、加熱溫度為橫坐標(biāo)繪制U(VI)-CA-hsDNA配合物的熱變性曲線如圖8所示。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在U(VI)-CA配合物存在下,hsDNA的Tm為80℃,表明U(VI)-CA配合物已嵌入hsDNA的雙螺旋堿基對(duì)中[28]。

雖然光學(xué)探針可以提供必要但不充分的線索來探索二者的結(jié)合模式,但流體動(dòng)力學(xué)測(cè)量對(duì)溶液中結(jié)合模式的長(zhǎng)度變化卻很敏感[29]。即,hsDNA與U(VI)-CA配合物的結(jié)合模式可以通過黏度測(cè)量進(jìn)一步驗(yàn)證。當(dāng)嵌入劑嵌入DNA后會(huì)增長(zhǎng)DNA的雙螺旋鏈,導(dǎo)致DNA溶液的黏度顯著增加。反之,小分子配合物部分或非嵌入DNA的雙螺旋鏈中卻會(huì)降低DNA溶液的黏度,這是因?yàn)榉乔度虢Y(jié)合不會(huì)明顯增加DNA溶液的黏度[30]。如圖9所示,hsDNA溶液的相對(duì)黏度值隨著U(VI)-CA配合物的增加量而降低,并最后趨于平衡。進(jìn)一步證明U(VI)-CA與hsDNA的相互作用模式確實(shí)為嵌入和非嵌入結(jié)合模式。

3結(jié)論

本文結(jié)合UV-Vis吸收光譜、熒光光譜、熱變性和黏度測(cè)量法研究了U(VI)與鈣黃綠素和U(VI)-CA配合物與hsDNA之間的相互作用,獲得了U(VI)-CA-hsDNA的結(jié)合比(摩爾比1∶2∶1)、結(jié)合作用力和結(jié)合方式等信息和數(shù)據(jù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明U(VI)-CA配合物和hsDNA的結(jié)合是受焓驅(qū)動(dòng)的自發(fā)作用,前者對(duì)hsDNA的猝滅過程是由動(dòng)態(tài)和靜態(tài)猝滅相結(jié)合引發(fā)的,二者之間的作用方式為采用嵌插和非嵌插混合的結(jié)合模式。本文結(jié)果為了解放射性核素對(duì)人體的致病機(jī)理和尋找新的能夠識(shí)別特定DNA位點(diǎn)的新型抗腫瘤藥物提供了理論和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

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