劉永杰,湯姜楊,朱麗麗,李洪林
(華東理工大學(xué)藥學(xué)院, 上海市新藥設(shè)計(jì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 上海 200237)
胞外5′-核苷酸酶(e5NT,又稱CD73),由NT5E基因編碼,蛋白分子量為70 kDa,被糖基磷脂酰肌醇(GPI)固定在細(xì)胞表面[1-3]。CD73 與CD39 共同參與嘌呤能信號(hào)的調(diào)控,在嘌呤能信號(hào)通路中,三磷酸腺苷(ATP)/二磷酸腺苷(ADP)被CD39 水解為單磷酸腺苷(AMP),AMP 被CD73 水解為腺苷和磷酸,AMP轉(zhuǎn)化為腺苷在細(xì)胞外不可逆[4]。在腫瘤微環(huán)境中,CD73 的過表達(dá)與腫瘤細(xì)胞的免疫逃逸有關(guān)。CD73 在腫瘤細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞(DCs)、調(diào)節(jié)性T (T reg)細(xì)胞、骨髓源性抑制細(xì)胞(MDSCs)、自然殺傷細(xì)胞(NK)和腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)的細(xì)胞表面均有表達(dá)[5]。CD73 的表達(dá)受缺氧誘導(dǎo)因子-1 (HIF-1)、TGF-β、EGFR、AKT、β-catenin等分子的調(diào)控,特別是受HIF-1[6-10]的調(diào)控尤為突出。缺氧是腫瘤微環(huán)境的一個(gè)重要特征,缺氧誘導(dǎo)HIF-1 上調(diào),進(jìn)而導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境中CD73 的廣泛表達(dá)。放化療引起的缺氧或ATP 富集會(huì)促進(jìn)CD39-CD73-腺苷信號(hào)的級(jí)聯(lián)反應(yīng),有利于增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的增殖和功能,促進(jìn)腫瘤免疫逃逸[11]。因此,CD73 被認(rèn)為是一個(gè)重要的腫瘤免疫治療潛在靶點(diǎn)。
由于CD73 與腫瘤發(fā)生、發(fā)展以及擴(kuò)散之間的關(guān)系,全球眾多醫(yī)藥企業(yè)和科研單位都在積極開發(fā)靶向CD73 的單克隆抗體和小分子抑制劑。目前,代謝穩(wěn)定的核苷酸類似物是CD73 小分子抑制劑研發(fā)的主流[12]。1970 年,核苷酸類似物AMPCP (抑制常數(shù)Ki=88.4 nmol/L)首次被報(bào)道具有強(qiáng)效的CD73 抑制活性[13]。文獻(xiàn)[14-16]報(bào)道了活性更強(qiáng)的核酸類似物PSB-12379 (Ki=2.2 nmol/L)、PSB-12489 (Ki=0.31 nmol/L),處于臨床研究中的CD73 抑制劑AB680 (Ki=5 pmol/L)也屬于核酸類似物[17]。雖然這類化合物具有強(qiáng)效的CD73 抑制活性,但是由于酸性太大,影響其成藥性。此外,一些非核苷酸類CD73抑制劑也被報(bào)道,主要包括黃酮類化合物[18]、磺胺類化合物[19]、蒽醌類化合物[20]和苯并噻嗪類化合物[21],但這些化合物表現(xiàn)出比較弱的活性或潛在的代謝問題。2020 年文獻(xiàn)[22]報(bào)道了一類新型高活性、具有選擇性的CD73非核苷酸抑制劑,這類化合物因避免了CD73 核苷類抑制劑酸度大、透膜性低等缺點(diǎn),從而性能得以提高。
本文對(duì)實(shí)驗(yàn)室保存的876 個(gè)已經(jīng)上市的藥物開展靶向CD73 的篩選,發(fā)現(xiàn)順苯磺酸阿曲庫銨(51w89)可以抑制CD73 的酶活性,為研發(fā)CD73 小分子抑制劑提供了新的苗頭化合物。
1.1.1蛋白與細(xì)胞 CD73 蛋白由本實(shí)驗(yàn)室根據(jù)文獻(xiàn)[2]純化得到,MDA-MB-231、MCF-7、Wi-38 細(xì)胞來源于ATCC 細(xì)胞庫。
1.1.2試劑 孔雀綠試劑盒購自BioAssaySystems(POMG-25H);CD73siRNA 購自廣州銳博生物科技有限公司(siG000004907A);Lipo6000轉(zhuǎn)染試劑購自Beyotime(C0526);CD73 抗體(CD73RabbitPolyclonal antibody)購自Proteintech(12231-1-AP);GAPDH 抗體(GAPDH Mouse mAb)購自Abclonal(AC002);Goat-anti-MouseSecondaryantibody 購自SAB 抗體公司(L3032);Goat-anti-RabbitSecondaryantibody 購自SAB 抗體公司(L3042);氨基偶聯(lián)試劑盒、醋酸鈉緩沖液(pH4.5)和CM5 芯片購自GEHealthcare;RIPA裂解液購自武漢塞維爾生物科技有限公司(G2002);BCA(BicinchoninicAcidAssary)試劑盒購自BioSharp(BL521A);BSA 購自源葉生物(9048-46-8);結(jié)晶紫染色液購自Beyotime(C0121);Matrigel 基質(zhì)膠購自康寧公司(354248);T 細(xì)胞擴(kuò)增培養(yǎng)基購自Sigma 公司(S1694);CD3/CD28 抗體購自Stemcell(10971);IFN-γELISA檢測(cè)試劑盒購自聯(lián)科生物(EK180-48);CD8+T 細(xì)胞磁珠分選試劑盒購自Biolegend(480011);腺苷5′-(α,β-亞甲基)二磷酸APCP(CAS號(hào):3768-14-7)、51w89(CAS 號(hào):96946-42-8)以及AMP(CAS 號(hào):130-49-4)購自Sigma 公司。
1.2.1分子水平CD73 活性測(cè)試 將重組CD73 蛋白用測(cè)活緩沖液(1mmol/LCaCl2,1mmol/LMgCl2,200mmol/L NaCl,10mmol/LKCl,100mmol/LTris-HCl,pH=8.0)稀釋至10ng/mL,在96 孔板中加入70μLCD73 蛋白稀釋液,然后加入化合物二甲基亞砜(DMSO,體積分?jǐn)?shù)控制在0.5%),吹打均勻后室溫孵育10min,加入AMP 使其終濃度為15μmol/L,然后放至37℃烘箱中孵育30min 后,加入孔雀綠試劑置于室溫顯色30min,待顏色穩(wěn)定后使用酶標(biāo)儀(美國伯騰儀器有限公司,Synergy2)檢測(cè)630nm 的吸光度值。每個(gè)實(shí)驗(yàn)條件設(shè)3 個(gè)復(fù)孔,使用GraphPadPrism7.0 軟件擬合化合物的IC50值。
1.2.251w89 與CD73 蛋白結(jié)合親和力的測(cè)定 采用表面等離子體共振(SurfacePlasmonResonance,SPR)技術(shù)測(cè)定化合物51w89 與CD73 蛋白之間的結(jié)合親和力。SPR 實(shí)驗(yàn)是在Cytiva(思拓凡)公司的BIAcore T200 儀器上進(jìn)行。首先將純化后的CD73蛋白用pH 4.5 的醋酸鈉溶液稀釋至75 μg/mL,再用偶聯(lián)試劑1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳化二亞胺(EDC)和N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)將CD73 蛋白偶聯(lián)在CM5 芯片上,流速為10 μL/min,結(jié)合時(shí)間為600 s,最后用乙醇胺封閉,最終CD73 偶聯(lián)量約為4946 RU。偶聯(lián)完成后,利用運(yùn)行緩沖液(10 mmol/L 磷酸鹽緩沖液(PBS),2.7 mmol/L KCl, 137 mmol/L NaCl 和φ=0.005%表面活性劑P20, pH 7.4)沖洗芯片表面直至基線平穩(wěn),之后將51w89 用運(yùn)行緩沖液溶解,并且成倍稀釋成一系列濃度梯度(1.563、3.125、6.250、12.500、25.000 μmol/L),以30 μL/min 的流速,結(jié)合90 s,解離120 s。實(shí)驗(yàn)結(jié)果利用BIAcore T200 Evaluation 1.0 軟件進(jìn)行穩(wěn)態(tài)擬合。
1.2.3Westernblot 檢測(cè)CD73 在腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)選取兩株人乳腺癌細(xì)胞(MDA-MB-231、MCF-7)以及一株人胚肺細(xì)胞(Wi-38)以每毫升5×104個(gè)細(xì)胞的密度鋪于6 孔板中,待密度和活力均達(dá)到90%以上時(shí),用PBS 刮取清洗細(xì)胞并于放射免疫沉淀法(RIPA)裂解液中孵育30min,離心去上清,用BCA試劑盒測(cè)定蛋白濃度。樣品與5×loading 上樣緩沖液混勻,在100℃金屬浴中煮5min,接著對(duì)其進(jìn)行10%SDS-PAGE 凝膠電泳并轉(zhuǎn)膜,將目的條帶剪下用5%BSA封閉1h 后,用CD73 抗體孵育并置于4℃過夜。用含TBST 緩沖液(Tris-HCl,NaCl,Tween 20)清洗3 遍,于室溫下孵育二抗2h,隨后用化學(xué)發(fā)光儀曝光條帶。
1.2.4細(xì)胞水平CD73 活性測(cè)試 當(dāng)MDA-MB-231 的細(xì)胞密度達(dá)到90%、細(xì)胞活力達(dá)到95%及以上時(shí),加入胰酶消化,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至15mL無菌離心管中,在1000r/min 轉(zhuǎn)速下離心3min,棄去培養(yǎng)基,加入活性測(cè)試液(2mmol/LMgCl2,125mmol/LNaCl,1mmol/L KCl,10mmol/L葡萄糖,10mmol/L4-羥乙基哌嗪乙磺酸(Hepes)緩沖液,pH7.2)重懸細(xì)胞,然后在1000r/min轉(zhuǎn)速下離心3min,重復(fù)上述操作3 次。細(xì)胞計(jì)數(shù)后,用活性測(cè)試液稀釋細(xì)胞,在96 孔板中每孔加入70μL(約2500 個(gè)細(xì)胞)細(xì)胞懸液,然后加入化合物吹打均勻(DMSO 的體積分?jǐn)?shù)控制在0.5%),置于37℃烘箱中孵育10min,加入底物AMP 使其終濃度為15μmol/L,然后加入孔雀綠試劑室溫顯色30min,待顏色穩(wěn)定后使用BioTek 酶標(biāo)儀檢測(cè)630nm 處的吸光度值。每個(gè)實(shí)驗(yàn)條件下設(shè)3 個(gè)復(fù)孔,使用GraphPadPrism7.0軟件擬合化合物的IC50值。
1.2.5siRNA 干擾腫瘤細(xì)胞CD73 表達(dá) 將生長狀態(tài)良好的MDA-MB-231 消化后重懸,以每孔1×105個(gè)的細(xì)胞密度均勻鋪于6 孔板中,待6 孔板中的細(xì)胞生長融匯達(dá)50%以后,將CD73 siRNA 通過Lipo6000轉(zhuǎn)染到MDA-MB-231 細(xì)胞中,繼續(xù)培養(yǎng)3 d 后,通過Western blot 檢測(cè)CD73 表達(dá)情況。
1.2.6Transwell 實(shí)驗(yàn) 設(shè)置空白組、陰性對(duì)照組(CD73-siRNA 組,敲除了CD73 的MDA-MB-231 細(xì)胞)以及加藥組(10μmol/L51w89),在Transwell 上室加入100μL 與上述對(duì)應(yīng)的細(xì)胞及化合物,細(xì)胞密度為每毫升5×104個(gè)細(xì)胞,同時(shí)在下室加入φ=10%的胎牛血清培養(yǎng)基600μL。孵育24h 后,丟棄上室細(xì)胞,通過膜向下表面遷移的細(xì)胞用甲醇室溫固定15min,結(jié)晶紫染色15min,然后用PBS 清洗上室3遍。將小室放在載玻片上,選取至少3 個(gè)不同的視野,在顯微鏡(德國Leica 公司,LeicaDMil 型)下觀察并拍照。
1.2.7細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn) 將生長狀態(tài)良好的細(xì)胞MDAMB-231 正常消化后重懸,以每孔5×105個(gè)的細(xì)胞密度均勻鋪于6 孔板中,設(shè)置對(duì)照組、51w89 組(51w89濃度分別為5、10、50μmol/L),然后將細(xì)胞轉(zhuǎn)移到培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)。待6 孔板中的細(xì)胞生長融匯達(dá)到95%后,用10μL 的移液器吸頭垂直于底部劃痕,然后棄去原來的培養(yǎng)基,用PBS 漂洗3 次,洗去漂浮的細(xì)胞碎片。用無血清RMPI-1640 培養(yǎng)基將51w89依次稀釋為50、10、5μmol/L,并加入到相應(yīng)的孔中,對(duì)照孔中只加入無血清的RMPI-1640 培養(yǎng)基。劃痕0、12、24、36h 后,選取至少3 個(gè)不同的視野,在顯微鏡下觀察并拍照。
1.2.8ELISA 法檢測(cè)T 細(xì)胞中IFN-γ的分泌水平收集健康志愿者的外周血,用磁珠分選試劑盒分出CD8+T 細(xì)胞,將CD8+T 細(xì)胞在完全生長培養(yǎng)基(1 mmol/L 谷氨酰胺,30 IU/mL IL-2 和25 μL/mL的CD3/CD28T 細(xì)胞激活劑)中培養(yǎng)24h,然后收集細(xì)胞,重懸在不含T 細(xì)胞激活劑的細(xì)胞擴(kuò)增培養(yǎng)基中。將細(xì)胞以每孔8×104個(gè)細(xì)胞(90 μL)接種于96 孔板上,加入待測(cè)化合物,以1 μmol/L 腺苷5'-(α,β-亞甲基)二磷酸(APCP)作為對(duì)照,于37 ℃孵育15 min 后,除了空白對(duì)照組外均加入終濃度為25 μmol/L的 AMP,在37 ℃,φ=5% CO2條件下孵育96 h。每個(gè)實(shí)驗(yàn)條件設(shè)3 個(gè)復(fù)孔。將96 孔板于300g條件下離心10 min,取上清,用ELISA 法檢測(cè)細(xì)胞因子含量。
以100 μmol/L 的化合物濃度對(duì)本課題組的老藥庫(包含876 個(gè)已經(jīng)上市的藥物)進(jìn)行初篩,可得到100 μmol/L 51w89 對(duì)重組蛋白CD73 的抑制率為93.30% (圖1(a)中紅色球),然后設(shè)置不同濃度的51w89 測(cè)試其對(duì)CD73 的抑制活性,測(cè)得其分子水平的IC50為(13.30±0.34) μmol/L(圖1(b))。
圖1 51w89 抑制重組蛋白CD73 的酶活性Fig.1 Inhibition activity of 51w89 against recombinant CD73
為了進(jìn)一步驗(yàn)證51w89 靶向結(jié)合CD73,采用SPR 技術(shù)評(píng)價(jià)51w89 與重組蛋白CD73 的結(jié)合親和力,得到其結(jié)合親和力系數(shù)(KD)為20.45 μmol/L(圖2)。
圖2 51w89 與重組CD73 蛋白結(jié)合的SPR 結(jié)果Fig.2 SPR results for the binding affinity between 51w89 and CD73
51w89 對(duì)人乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231 的細(xì)胞毒性?。↖C50= (71.43±1.19)μmol/L),且高表達(dá)CD73(圖3(a)),因此本文選擇MDA-MB-231 細(xì)胞用于后續(xù)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)。用孔雀綠試劑盒測(cè)試在MDA-MB-231 細(xì)胞中51w89 對(duì)CD73 的酶抑制活性,得到IC50為(17.70±0.98)μmol/L(圖3(b))。
將CD73 siRNA 轉(zhuǎn)染到MDA-MB-231 細(xì)胞(即CD73-SiRNA 中后,通過Western blot 分析CD73 表達(dá)情況(圖4(a)),結(jié)果表明轉(zhuǎn)染CD73 siRNA 后,CD73 的表達(dá)量明顯降低。Transwell 實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,加入51w89 或siRNA下調(diào)CD73 表達(dá)后,穿膜細(xì)胞數(shù)少于對(duì)照組,即抑制了MDA-MB-231 細(xì)胞的遷移(圖4(b))。
圖4 51w89 或CD73-siRNA 對(duì)MDA-MB-231 細(xì)胞遷移能力的抑制效果Fig.4 Inhibitory effects of 51w89 or CD73-siRNA on the migration of MDA-MB-231 cells
劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖5 所示,在沒有添加51w89的情況下(控制組),從0~36 h,劃痕隨著時(shí)間在逐漸修復(fù),說明MDA-MB-231 細(xì)胞進(jìn)行了遷移;而添加51w89的處理組,細(xì)胞的愈合能力較對(duì)照組減弱,而且隨著51w89濃度的增加,劃痕的愈合面積隨之減小,說明MDA-MB-231 細(xì)胞的遷移能力也逐漸受到抑制。該實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明51w89 抑制MDA-MB-231細(xì)胞的遷移活性。
圖5 51w89 抑制MDA-MB-231 細(xì)胞遷移的劃痕實(shí)驗(yàn)Fig.5 Inhibitory effects of 51w89 on the migration of MDA-MB-231 cells by scratch tests
腺苷信號(hào)傳導(dǎo)與免疫調(diào)節(jié)息息相關(guān),腺苷濃度過高時(shí)會(huì)產(chǎn)生免疫抑制。AMP 可被CD73 水解為腺苷和磷酸,因此CD73 是腺苷產(chǎn)生過程中的限速分子。加入25 μmol/L 的 AMP 后,CD8+T 細(xì)胞分泌的炎癥細(xì)胞因子IFN-γ水平降低,而CD73 抑制劑APCP或51w89 可在一定程度上逆轉(zhuǎn)AMP 對(duì)CD8+T 細(xì)胞分泌IFN-γ的抑制作用(圖6)。
圖6 ELISA 法測(cè)定CD8+T 細(xì)胞分泌IFN-γ 的水平Fig.6 Measurements of IFN-γ secretion in CD8+T cells by ELISA
在腫瘤微環(huán)境中,腺苷是ATP 的代謝產(chǎn)物,是一種有效的免疫調(diào)節(jié)因子。CD73 在腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞上的過表達(dá)導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境中腺苷的濃度升高,高濃度的腺苷抑制抗腫瘤免疫反應(yīng),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移和血管生成。CD73 是腺苷生成過程中的限速分子,因此,抗CD73 治療有望成為一種新的腫瘤免疫治療方法。
本文篩選發(fā)現(xiàn)51w89 對(duì)CD73 具有酶抑制活性,通過表面等離子體共振實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證51w89 可靶向結(jié)合CD73。通過劃痕實(shí)驗(yàn)、Transwell 實(shí)驗(yàn)和siRNA實(shí)驗(yàn)證明CD73 在腫瘤細(xì)胞遷移過程中的作用,表明51w89 可抑制MDA-MB-231 細(xì)胞的遷移能力。另外,證實(shí)51w89 可逆轉(zhuǎn)AMP 對(duì)CD8+T 細(xì)胞的抑制作用。因此,51w89 可被作為CD73 抑制劑苗頭化合物并用于后續(xù)的結(jié)構(gòu)優(yōu)化以及抗腫瘤研究。