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天山烏魯木齊河源1號(hào)冰川表層雪微生物多樣性分析

2023-05-29 05:47:28張麗娟贠豐澤馬應(yīng)輝張新強(qiáng)阿瓦古麗圖爾蓀馬正海
干旱區(qū)研究 2023年4期
關(guān)鍵詞:古菌菌門冰川

張麗娟,杜 瀚,贠豐澤,馬應(yīng)輝,張新強(qiáng),阿瓦古麗·圖爾蓀,馬正海

(1.新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆生物資源基因工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,新疆 烏魯木齊 830046;2.中國(guó)科學(xué)院新疆天山冰川觀測(cè)試驗(yàn)站,新疆 烏魯木齊 830035)

冰川區(qū)冰雪微生物是地球化學(xué)及氣候與環(huán)境變化的指示生物,其分布、豐度和多樣性受冰川區(qū)氣候和環(huán)境變化的影響[1-2],其所含色素通過降低冰川表面反照率而加速冰川融化[3],因此,冰川區(qū)冰雪微生物的多樣性及其功能研究不僅在冰川學(xué)和生態(tài)學(xué)中具有重要的理論意義,同時(shí)也能反映氣候和環(huán)境的變化,具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。

微生物群落與氣象因子和季節(jié)周期相關(guān)的動(dòng)態(tài)變化的研究已有較多報(bào)道,劉勇勤等[4]對(duì)珠穆朗瑪峰地區(qū)東絨布冰川冰雪微生物數(shù)量和菌群結(jié)構(gòu)及其與季節(jié)變化的關(guān)系進(jìn)行了研究,結(jié)果表明微生物的數(shù)量和菌群結(jié)構(gòu)具有明顯的季節(jié)特征,可能是受珠峰地區(qū)夏季和冬季不同水汽來源的影響所致;劉曉波等[5]研究了各拉丹冬果曲冰川雪中細(xì)菌的季節(jié)變化特征,結(jié)果顯示夏季主要以α-Protobacteria和Actinobacteria 為主,冬春季主要以Cytophaga-Flavobacterium-Bacterioides(CFB)為主,反映了細(xì)菌對(duì)不同季節(jié)大氣環(huán)流的響應(yīng);王海偉[6]分析了天山1 號(hào)冰川不同季節(jié)表層雪中細(xì)菌群落與氣候環(huán)境因子的關(guān)系,結(jié)果顯示春季和夏季(4—8月)細(xì)菌種類較少,秋冬季節(jié)(9 月至次年2 月)細(xì)菌種類較多,Arthrobacter和Sphingomonas兩屬普遍存在于不同季節(jié)。

雪系統(tǒng)具有季節(jié)性溫度波動(dòng)、強(qiáng)光照、紫外輻射和好氧等環(huán)境特征,烏源1 號(hào)冰川雪層厚度隨季節(jié)變化,冬季雪層厚度變化不大,夏季雪層厚度隨溫度升高而減小,通過沉降作用,積雪可以將大氣中的不同物質(zhì)及微生物與下層土壤或冰川冰的微環(huán)境聯(lián)系起來,對(duì)冰川生態(tài)系統(tǒng)具有重要影響[7]。近年來,烏源1 號(hào)冰川的氣候隨全球變暖向暖濕化發(fā)展,冰川退縮明顯,積雪加速消融的同時(shí)由降雪和降水不斷補(bǔ)給[8];每年4—6月季風(fēng)期大量來自中亞干旱區(qū)陸地外源物質(zhì)向?yàn)踉? 號(hào)冰川輸入[9],以上氣候變化不僅會(huì)改變雪層中化學(xué)成分的原始記錄,還會(huì)導(dǎo)致冰川融水的徑流增加,進(jìn)而影響冰川下游的生態(tài)系統(tǒng)[10-11]。與此同時(shí),烏源1 號(hào)冰川規(guī)模較小,距離城鎮(zhèn)近,受周邊人類活動(dòng)的干擾較嚴(yán)重,如附近后峽鎮(zhèn)工業(yè)排放的大量污染物以及周邊城鎮(zhèn)空氣污染物可隨大氣環(huán)流進(jìn)入冰川區(qū)上空??傊瑸踉? 號(hào)冰川的生態(tài)和環(huán)境受氣候變化和人類活動(dòng)的雙重影響而變得極為脆弱,而冰川區(qū)積雪是研究冰川氣候和環(huán)境變化的重要材料,其化學(xué)組分和微生物多樣性受周圍環(huán)境和局域微環(huán)境的影響較大[12],其中的微生物則是冰川區(qū)氣候和環(huán)境變化最敏感的指示生物[13]。本研究于2021年4—6月采集烏源1號(hào)冰川表層雪,分析細(xì)菌、古菌和真菌的群落組成,探討冰川表層雪微生物多樣性和結(jié)構(gòu)受氣候和環(huán)境變化的影響。

1 材料與方法

1.1 研究區(qū)概況

烏源1號(hào)冰川(43°06′N,86°49′E)位于亞洲大陸中部,地處天山中段喀拉烏成山北坡,由東、西兩支冰川組成,呈東北走向,被沙漠和戈壁包圍,冰川距城市較近(圖1)。烏源1號(hào)冰川海拔4486 m,典型大陸性氣候,主要受西風(fēng)急流的影響,近地表局地的山谷風(fēng)于每年3—9 月盛行[14]。根據(jù)大西溝氣象站(3593 m)觀測(cè)數(shù)據(jù)顯示,1959—2017年期間烏源1號(hào)冰川年均降水量460 mm,年均氣溫-4.6 ℃[15],主要降水期在5—9 月,為夏季補(bǔ)給型冰川[16],期間由于消融加劇和融水下滲,會(huì)對(duì)下部雪層產(chǎn)生影響[17]。

圖1 研究區(qū)位置及采樣點(diǎn)示意圖Fig.1 Location of the study area and distribution of the sampling sites

1.2 樣品的采樣

表層雪樣采集于烏源1 號(hào)冰川背陽面處,分別采集了2021 年4 月4 日海拔3549 m 處雪樣(TSX1)以及6 月19 日海拔3770 m 處雪樣(TSX2)和海拔3800 m處雪樣(TSX3)。為避免人為污染,采樣工具均經(jīng)無菌處理,采樣人員穿戴一次性無菌手套、口罩和超凈服。設(shè)置3個(gè)取樣點(diǎn),樣方為2 m×2 m,取平行樣3 份,采樣時(shí)為防止雪樣污染和受強(qiáng)紫外照射,首先去除表面10 cm雪層,將10~30 cm深的雪樣收集至5 L 無菌的聚乙烯瓶。采集的雪樣保存于-20 ℃車載冰箱中運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,儲(chǔ)存于-80 ℃冰箱備用。

1.3 雪樣中細(xì)菌、古菌和真菌的收集

3份雪樣于4 ℃暗環(huán)境下融化后,各取15 L雪樣融水,分別經(jīng)0.22 μm聚醚砜濾膜過濾收集微生物,濾膜儲(chǔ)存于-80 ℃冰箱。以上濾膜置于干冰中進(jìn)行高通量測(cè)序。

1.4 總DNA提取及PCR擴(kuò)增

用ALFA-SEQ Advanced Water DNA Kit 試劑盒(Thermo,USA)提取基因組DNA,瓊脂糖凝膠電泳和Qubit 2.0熒光定量?jī)x(InvitrogenTM)對(duì)DNA的純度和濃度進(jìn)行定量。以雪樣DNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,分別用引物338F(ACTCCTACGGGAGGCAGCA)和806R(GGACTACHVGGGTWTCTAAT)[18]擴(kuò)增細(xì)菌16S rDNA V3-V4 區(qū),用引物Arch519F(CAGCCGCCGCGGTAA)和 Arch915R(GTGCTCCCCCGCCAATTCCT)[19]擴(kuò)增古菌16S rDNA V4-V5 區(qū),用引物ITS3-F(GCATCGATGAAGAACGCAGC)和ITS4-R(TCCTCCGCTTATTGATATGC)[20]擴(kuò)增真菌ITS2區(qū),以上引物均帶Barcode。PCR 反應(yīng)體系(50 μL)包括:DNA模板50 ng,正反向引物各1 μL,2×Premix Taq 25 μL,補(bǔ)Nuclease-free water 至50 μL。用無菌去離子水代替DNA 模板用作PCR 反應(yīng)的陰性對(duì)照。PCR擴(kuò)增條件為:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,52 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR 產(chǎn)物的片段長(zhǎng)度。使用GeneTools Analysis Software(V.4.03.05.0,SynGene)將細(xì)菌、古菌和真菌的PCR產(chǎn)物分別進(jìn)行濃度對(duì)比后,按照等質(zhì)量原則計(jì)算各樣品所需體積,將各PCR 產(chǎn)物進(jìn)行混合。使用E.Z.N.A.?Gel Extraction Kit(Omega,USA)凝膠回收試劑盒回收PCR產(chǎn)物,TE緩沖液洗脫回收目標(biāo)DNA片段。

1.5 文庫構(gòu)建和上機(jī)測(cè)序

按照NEBNext?UltraTMII DNA Library Prep Kit for Illumina?(New England Biolabs,USA)標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行建庫操作。使用Illumina Nova 6000 平臺(tái)對(duì)構(gòu)建的擴(kuò)增子文庫進(jìn)行PE150 測(cè)序。本研究獲得的細(xì)菌、古菌和真菌的測(cè)序數(shù)據(jù)已提交至國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI),可 查 看Bioproject accession PRJNA872833。

1.6 測(cè)序數(shù)據(jù)處理及分析

對(duì)獲得的原始序列(raw reads)進(jìn)行質(zhì)控、去除引物、overlap 小于16 bp 且拼接錯(cuò)配大于5 bp 的序列、低質(zhì)量的raw tags 和嵌合體,獲得高質(zhì)量的序列clean tags,使用UPARSE軟件[以大于97%的相似性聚類生成操作分類單元(Operational Taxonomic Unit,OTU)],用每個(gè)OTU 的代表序列與數(shù)據(jù)庫[SILVA(細(xì)菌、古菌)和Unite(真菌)]比對(duì)獲得物種注釋信息?;贠TU 豐度表,使用Usearch(V.10.0.240)計(jì)算Chao1、Shannon 和Simpson 等α多樣性指數(shù)以評(píng)價(jià)不同菌群種類的豐富度和多樣性。運(yùn)用R 包‘psych’中的Corr.Test 函數(shù)計(jì)算樣品相關(guān)性矩陣并執(zhí)行檢驗(yàn)不同菌群屬水平物種間的Spearman 相關(guān)性系數(shù),得到相關(guān)性系數(shù)矩陣和P值矩陣,確定物種間存在相互作用的閾值(|R|>0.7,P≤0.05),利用Gephi V.0.9.6 軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)互作圖的構(gòu)建。

2 結(jié)果與分析

2.1 雪樣中微生物測(cè)序數(shù)據(jù)及稀釋曲線

經(jīng)高通量測(cè)序,雪樣中細(xì)菌、古菌和真菌分別共計(jì)獲得213849 條、578 條和110952 條有效序列,OTU總數(shù)分別為804個(gè)、28個(gè)和1059個(gè)。各稀釋度曲線見圖1,細(xì)菌(圖2a)、古菌(圖2b)和真菌(圖2c)的曲線均趨于平坦,說明測(cè)序獲得了絕大多數(shù)樣本信息,能夠反映雪樣中不同微生物的多樣性。

圖2 雪樣中細(xì)菌(a)、古菌(b)和真菌(c)的OTU韋恩圖和Richness稀釋曲線Fig.2 OTU Venn and Richness rarefaction curves of bacteria(a),archaea(b)and fungi(c)in the snow samples

2.2 雪樣中細(xì)菌多樣性分析

各雪樣中細(xì)菌OTU 在228~297 個(gè)。Venn 圖顯示(圖2a),雪樣中共有的細(xì)菌OTU 數(shù)目為51個(gè),占OTU 總數(shù)的6.34%,3 個(gè)雪樣中特有的OTU 數(shù)目分別為206個(gè)、44個(gè)和81個(gè),以TSX1中特有OTU數(shù)目最多。α多樣性指數(shù)(表1)顯示,春季樣品TSX1 中細(xì)菌的多樣性高于夏季樣品TSX2 和TSX3,而夏季高海拔樣品TSX3中的細(xì)菌多樣性又高于低海拔樣品TSX2。

表1 雪樣細(xì)菌、古菌和真菌的α多樣性指數(shù)Tab.1 Alpha diversity indexes of the bacterial,archaea and fungi community in the snow samples

3 份雪樣共鑒定出19 個(gè)菌門(圖3a),TSX1、TSX2 和TSX3 分別鑒定出17 個(gè)、10 個(gè)和11 個(gè)菌門。TSX1 的優(yōu)勢(shì)菌為變形菌門(Proteobacteria,89.10%)和放線菌門(Actinobacteria,5.31%),TSX2 和TSX3的優(yōu)勢(shì)菌均為變形菌門(Proteobacteria,58.13%和63.65%)和 擬 桿 菌 門(Bacteroidetes,40.74% 和35.31%)。

圖3 雪樣細(xì)菌群落組成Fig.3 The bacteria community in the snow samples

在綱分類階元共鑒定出45個(gè)菌綱,TSX1、TSX2和TSX3 分別鑒定出40 個(gè)、16 個(gè)和17 個(gè)菌綱,相對(duì)豐度前13的菌綱如圖3b所示。在優(yōu)勢(shì)菌綱中,3份雪樣的γ變形菌綱(Gammaproteobacteria)相對(duì)豐度在32.47%~61.17%之間,TSX1 中α變形菌綱(Alphaproteobacteria)和放線菌綱(Actinobacteria)的相對(duì)豐度分別為56.56%和5.15%,TSX2 和TSX3 中的擬桿菌綱(Bacteroidia)、δ變形菌綱(Deltaproteobacteria)的相對(duì)豐度分別為35.31%和40.74%、0.96%和1.72%。

在屬分類階元共鑒定出152 個(gè)菌屬,TSX1、TSX2和TSX3分別鑒定出111個(gè)、72個(gè)和79個(gè)菌屬,TSX1 的細(xì)菌種類明顯多于TSX2 和TSX3。相對(duì)豐度前14的菌屬如圖3c所示,3份雪樣的優(yōu)勢(shì)菌屬存在差異,TSX1 的優(yōu)勢(shì)菌屬包括短波單胞菌屬(Brevundimonas,12.44%)、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas,11.90%)、鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas,9.95%)、甲基桿菌屬(Methylobacterium,8.64%)和青枯菌屬(Ralstonia,6.99%),TSX2 和TSX3 的優(yōu)勢(shì)菌屬 包 括 黃 桿 菌 屬(Flavobacterium,26.01% 和33.64%)、極地單胞菌屬(Polaromonas,21.36%和24.72%)、紅育菌屬(Rhodoferax,7.34%和11.50%)和馬賽菌屬(Massilia,7.62%和11.75%)。相對(duì)豐度不低于1%的菌屬還包括主要存在于TSX1中的異樣根瘤菌屬(Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium)和(Ralstonia)以及主要存在于TSX3中的Arcicella、Herminiimonas、假單胞菌屬(Pseudomonas)和土地桿菌屬(Pedobacter),其他未分類的菌屬占4.85%~26.73%。

2.3 雪樣中古菌多樣性的分析

各雪樣OTU 在7~11 個(gè)之間。Venn 圖顯示(圖2b),雪樣中共有的古菌OTU數(shù)目為3個(gè),占OTU總數(shù)的10.71%,3 個(gè)雪樣中特有的OTU 數(shù)目分別為4個(gè)、2 個(gè)和3 個(gè),以TSX1 中特有OTU 數(shù)目最多。雪樣古菌的α多樣性指數(shù)(表1)顯示,夏季樣品TSX2和TSX3 中古菌的多樣性高于春季樣品TSX1,而夏季低海拔樣品TSX2中的古菌多樣性又高于高海拔樣品TSX3。

3份雪樣鑒定出的古菌分屬3個(gè)門(圖4a)、4個(gè)綱(圖4b)和4個(gè)屬(圖4c)。奇古菌門(Thaumarchaeota)在3份雪樣中的相對(duì)豐度分別為38.10%、97.18%和97.55%;納古菌門(Nanoarchaeaeota)僅存在于TSX1中,相對(duì)豐度為61.90%;廣古菌門(Euryarchaeota)存在于TSX2 和TSX3 中,相對(duì)豐度分別為2.45%和2.88%。綱分類階元,Nitrososphaeria 綱存在于3 份雪樣中,相對(duì)豐度在38.10%~97.55%,Woesearchaeia綱僅存在于TSX1中,占61.90%。屬分類階元,奇古菌門的Candidatus Nitrososphaera屬存在于3 份雪樣中,相對(duì)豐度在0.79%~4.41%之間;Candidatus Nitrosoarchaeum屬僅存在于TSX1 中,相對(duì)豐度為23.02%,鹽桿菌綱的Halomarina屬僅存在于TSX2中,相對(duì)豐度為1.61%,甲烷桿菌綱的甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter)僅存在于TSX3 中,相對(duì)豐度為0.98%;雪樣中屬水平上未確定分類地位的古菌占比較高,在76.19%~95.56%之間。

圖4 雪樣古菌群落組成Fig.4 The archaea community in the snow samples

2.4 雪樣中真菌多樣性的分析

各雪樣OTU 在103~334 個(gè)之間。Venn 圖顯示(圖2c),雪樣中共有的真菌OTU 數(shù)目為82 個(gè),占OTU 總數(shù)的10.70%,3 個(gè)雪樣中特有的OTU 數(shù)目分別為45個(gè)、171個(gè)和91個(gè),以TSX2中特有OTU數(shù)目最多。雪樣真菌α多樣性指數(shù)(表1)顯示,夏季樣品TSX2 和TSX3 中真菌的多樣性高于春季樣品TSX1。

3 份雪樣各鑒定出4 個(gè)菌門,共計(jì)5 個(gè)菌門(圖5a)。其中子囊菌門(Ascomycota)為TSX1的優(yōu)勢(shì)菌門,相對(duì)豐度為88.43%,其在TSX2 和TSX3 中的相對(duì)豐度分別為10.10%和7.06%;單毛壺菌門(Monoblepharidomycota)為TSX2和TSX3的優(yōu)勢(shì)菌門,相對(duì)豐度分別為36.21%和40.78%,TSX1中未發(fā)現(xiàn)該菌;擔(dān)子菌門(Basidiomycota)和壺菌門(Chytridiomycota)在3 份雪樣中均有分布,在TSX2 和TSX3 中的相對(duì)豐度較高;腐生性真菌毛霉門(Mucoromycota)僅存在于TSX1中,相對(duì)豐度為0.09%。

圖5 雪樣真菌群落組成Fig.5 The fungi community in the snow samples

在綱分類階元共鑒定出19個(gè)菌綱,TSX1、TSX2和TSX3 分別鑒定出12 個(gè)、18 個(gè)和15 個(gè)菌綱,相對(duì)豐度前10的菌綱如圖5b所示。座囊菌綱(Dothideomycetes)在3 份雪樣中的相對(duì)豐度均較高(2.67%~3.88%);散囊菌綱(Eurotiomycetes)和Cystobasidiomycetes 綱在TSX1 中的相對(duì)豐度分別為82.11%和2.20%;單毛壺菌綱(Monoblepharidomycetes)、微球黑粉菌綱(Microbotryomycetes)在TSX2和TSX3中的相對(duì)豐度分別為36.21%和4.78%、10.62%和14.97%;相對(duì)豐度不低于1%的菌屬的菌綱還有TSX3中擔(dān)子菌門的銀耳菌綱(Tremellomycetes)。

在屬分類階元共鑒定出54個(gè)菌屬,TSX1、TSX2和TSX3 分別鑒定出20 個(gè)、50 個(gè)和52 個(gè)菌屬,相對(duì)豐度前10的菌屬如圖5c所示。曲霉屬(Aspergillus)在TSX1 中的相對(duì)豐度為81.04%;紅酵母屬(Rhodotorula)在TSX2 和TSX3 中的相對(duì)豐度分別為6.12%和7.93%;相對(duì)豐度不低于1%的菌屬還包括TSX1中的囊擔(dān)菌屬(Cystobasidium)。TSX2 和TSX3 中未分類菌屬占比較高,分別占47.56%和41.08%。

2.5 雪樣微生物共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)

基于Spearman在屬水平上的相關(guān)性構(gòu)建了3個(gè)表層雪樣細(xì)菌、古菌和真菌的互作網(wǎng)絡(luò)(圖6),結(jié)果顯示,烏源1 號(hào)冰川表層雪樣微生物互作關(guān)系主要為細(xì)菌-細(xì)菌、細(xì)菌-真菌以及真菌-真菌的相互作用。根據(jù)Spearman 相關(guān)系數(shù),得到3 個(gè)相互獨(dú)立的網(wǎng)絡(luò)互作,其中以細(xì)菌-細(xì)菌為主的網(wǎng)絡(luò)互作節(jié)點(diǎn)數(shù)和邊數(shù)最多,表明細(xì)菌之間的生態(tài)網(wǎng)絡(luò)更加復(fù)雜,物種聯(lián)系更加緊密。3 個(gè)網(wǎng)絡(luò)互作以正相關(guān)連接為主,占97.3%,負(fù)相關(guān)連接占2.7%,表明烏源1號(hào)冰川表層雪細(xì)菌、古菌和真菌間趨于協(xié)作關(guān)系而非競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系。

圖6 屬分類水平下表面雪樣中細(xì)菌、古菌和真菌的相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)分析Fig.6 Correlation network analysis of bacteria,archaea and fungi of the surface snow base on genus level

3 討論

本研究α多樣性結(jié)果表明,烏源1號(hào)冰川表層雪微生物多樣性在春夏兩季存在明顯差異。就細(xì)菌而言,TSX1的Chao1和Shannon指數(shù)較高,而其Simpson指數(shù)顯著低于另兩份雪樣,說明TSX1 中細(xì)菌的多樣性和豐富度均較高,研究中從TSX1 鑒定的細(xì)菌種類也明顯多于另兩份雪樣;而TSX2 和TSX3 的菌群種類較少且豐富度分布不均勻,優(yōu)勢(shì)菌的生態(tài)優(yōu)勢(shì)度極高,該兩份樣品中變形菌門和擬桿菌門豐度之和均接近99%,占絕對(duì)優(yōu)勢(shì)。就真菌而言,TSX2、TSX3 的Chao1 和Shannon 指 數(shù) 明 顯 高 于TSX1,而Simpson 指數(shù)明顯低于TSX1,表明TSX2和TSX3的真菌多樣性更高,其中鑒定的真菌種類也明顯多于TSX1。以上結(jié)果表明,烏源1號(hào)冰川表層雪中細(xì)菌多樣性春季較高夏季較低,而真菌多樣性春季較低夏季較高。有學(xué)者報(bào)道珠穆朗瑪峰東絨布冰川表層雪微生物多樣性隨季節(jié)變化而變化,并發(fā)現(xiàn)細(xì)菌的多樣性與溫度呈負(fù)相關(guān)[21],這與本文的研究結(jié)果一致,其可能與冰川區(qū)特定耐冷細(xì)菌群落的生長(zhǎng)特性有關(guān)。另外,受西風(fēng)急流和沙塵的影響,春季大量細(xì)菌可由大氣和沙塵攜帶輸入烏源1號(hào)冰川區(qū)并落入表層雪中,也是細(xì)菌多樣性增加的因素之一。夏季雪樣中真菌多樣性較高,主要與夏季氣溫升高和光照延長(zhǎng)等因素更適于真菌生長(zhǎng)有關(guān)[22]。古菌的多樣性變化與真菌一致,夏季較高春季較低的原因可能是門水平和屬水平相對(duì)豐度最高的古菌均來自奇古菌門,且為氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea,AOA),溫度低時(shí)AOA 生物酶催化新陳代謝的速率減慢[23],導(dǎo)致豐度降低[24],春季相較于夏季氣溫偏低,不利于古菌的生長(zhǎng)繁殖。

烏源1 號(hào)冰川雪樣的優(yōu)勢(shì)菌包括變形菌門、擬桿菌門和放線菌門,變形菌門中γ變形菌綱為主要優(yōu)勢(shì)菌,α變形菌綱和δ變形菌綱為次要優(yōu)勢(shì)菌。這些細(xì)菌在其他冰川亦有較高的相對(duì)豐度,如放線菌門、變形菌門和擬桿菌門為珠峰北坡表層雪和冰芯中的優(yōu)勢(shì)菌[25],α、δ、γ變形菌綱以及放線菌門在Svalbard冰川[26]和天山奎屯哈希勒根51號(hào)冰川[27]雪樣中的相對(duì)豐度均較高。在屬分類階元上,短波單胞菌屬、寡養(yǎng)單胞菌屬、鞘脂單胞菌屬、甲基桿菌屬、青枯菌屬、黃桿菌屬、極地單胞菌屬、紅育菌屬和馬賽菌屬在雪樣中的相對(duì)豐度較高,其中短波單胞菌屬、黃桿菌屬和鞘脂單胞菌屬等為烏源1 號(hào)冰川積雪中的優(yōu)勢(shì)菌群已見報(bào)道[28],表明這些菌屬在烏源1號(hào)冰川在空間上廣泛分布且相對(duì)豐度較為穩(wěn)定。另外,本研究結(jié)果顯示,春季與夏季優(yōu)勢(shì)菌屬存在差異,推測(cè)可能是由于春、夏兩季烏源1號(hào)冰川冰雪微生物受氣候影響不同,冰雪微生物春季主要受沙塵來源的影響,夏季受降水及氣溫升高冰雪消融的影響,本研究海拔高度雖相差不大,但亦有可能造成不同樣本間優(yōu)勢(shì)菌屬的差異。

從烏源1號(hào)冰川雪樣中注釋到的古菌包括奇古菌門、納古菌門和廣古菌門。奇古菌門為典型的氨氧化古菌,是重要的硝化菌,最早分離于深海極端環(huán)境[29],其在3份雪樣中的相對(duì)豐度均較高,研究中注釋到奇古菌門Candidatus Nitrososphaera屬在陸地生境氮循環(huán)中發(fā)揮著重要作用[30],故雪樣中高豐度的奇古菌門可參與冰川環(huán)境的氮循環(huán)。廣古菌門中鑒定到鹽桿菌綱和甲烷桿菌綱,據(jù)報(bào)道這2 個(gè)菌綱在冰川中參與甲烷的生產(chǎn)以及厭氧甲烷的氧化,在地球化學(xué)物質(zhì)循環(huán)中具有重要意義[31-32]。納古菌門僅在TSX1 中注釋到一個(gè)綱,其功能方面的報(bào)道較少。

本研究從雪樣中鑒定出5 個(gè)真菌門,其中子囊菌門和單毛壺菌門的相對(duì)豐度較高,春季雪樣TSX1中真菌群落組成及其豐度與兩份夏季雪樣存在差異。據(jù)報(bào)道子囊菌門在格陵蘭冰芯[33]和Rotmoosferner 冰川[34]中均為優(yōu)勢(shì)真菌,其普遍存在于各類冰川中,在與植物互作[35]和土壤演替成熟[36]中發(fā)揮作用,如子囊菌門的茶漬菌綱(0.08%~0.27%)在本次采集雪樣中的相對(duì)豐度較高,據(jù)報(bào)道其與地衣的形成相關(guān)[37]。單毛壺菌門在土壤環(huán)境和植物中常被報(bào)道[38],但相對(duì)豐度均較低,且具體的生態(tài)功能未知,在南極苔蘚中注釋到少量單毛壺菌門[39],其是否可以在冰川中影響植物的生長(zhǎng)還有待進(jìn)一步研究。雪樣中的優(yōu)勢(shì)真菌屬為曲霉菌屬和紅酵母屬。曲霉菌屬耐低溫[40],具有在低溫條件下降解碳?xì)浠衔锏臐摿Γ?1],其在1號(hào)冰川底部沉積層中相對(duì)豐度較高[42]。紅酵母屬是冷環(huán)境中的重要酵母[43],能產(chǎn)多種低溫酶,可承受極端氣候[44],降解木質(zhì)素和纖維素的能力較細(xì)菌更強(qiáng)[45],在冰川的碳素循環(huán)中有重要作用。

微生物相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果表明,烏源1 號(hào)冰川微生物類群共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)中大部分節(jié)點(diǎn)的菌屬為互利共生類型的互作關(guān)系,微生物之間的相互作用主要是受到養(yǎng)分的驅(qū)動(dòng),表明微生物在冰川惡劣的生態(tài)環(huán)境下,各微生物之間更趨向于合作關(guān)系,更有利于其在冰川中的生存。同時(shí),細(xì)菌在雪樣微生物群落中所占比例較大,群落結(jié)構(gòu)較穩(wěn)定,其通過與真菌和古菌直接或間接的相互作用可促進(jìn)微生物群落的恢復(fù)。

本研究從烏源1號(hào)冰川表層雪中注釋到大量冷適應(yīng)微生物。注釋到的冷適應(yīng)細(xì)菌包括變形菌門的馬賽菌屬(0.03%~11.75%)和極性單胞菌屬(0.01%~24.72%),放線菌門的冷桿菌屬(Cryobacterium)(0.01%~0.63%)、節(jié)細(xì)菌屬(Arthrobacter)(0%~0.01%)和紅球菌屬(Rhodococcus)(0%~0.10%),擬桿菌門的黃桿菌屬(2.32%~33.64%)和薄層桿菌屬(Hymenobacter)(0.01%~1.10%)以及厚壁菌門中的芽孢桿菌屬(Bacillus)(0%~0.01%)和類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)(0%~0.01%),以上菌屬存在于多種寒冷環(huán)境中[46-48]。注釋到的冷適應(yīng)真菌包括擔(dān)子菌門的隱球酵母屬(Cryptococcus)(0%~0.16%)、Dioszegia(0.08%~0.21%)、紅酵母屬(0.02%~8.02%)、擲孢酵母屬(Sporobolomyces)(0%~0.02%)、Vishniacozyma(0%~0.33%)、Cystobasidium(0.01%~2.23%),子囊菌門的青霉菌屬(0.07%~0.80%)和鏈格孢屬(0.01%~0.14%),以上真菌在烏源1 號(hào)冰川凍土[49]和格陵蘭島冰川[50]中亦有分布。高山冰川是適冷微生物的主要棲息地,其在營(yíng)養(yǎng)循環(huán)和有機(jī)物質(zhì)礦化方面發(fā)揮著重要的作用[51],并在適應(yīng)冰川環(huán)境的過程中進(jìn)化產(chǎn)生多種耐冷策略和生物特性[52],在環(huán)境、農(nóng)業(yè)和工業(yè)等方面具有巨大的應(yīng)用潛力。

4 結(jié)論

烏源1號(hào)冰川表層雪中細(xì)菌和真菌的多樣性受季節(jié)變化影響,細(xì)菌多樣性春季高夏季低,春季變形菌門占優(yōu)勢(shì),夏季擬桿菌門占優(yōu)勢(shì);真菌多樣性夏季高春季低,夏季單毛壺菌門占優(yōu)勢(shì),春季子囊菌門占優(yōu)勢(shì)。春夏兩季均鑒定到奇古菌門、廣古菌門和納古菌門等古菌。烏源1號(hào)冰川表層雪中微生物多樣性較高,雪樣中微生物群落春季受沙塵影響,夏季受消融影響,其季節(jié)變化反映了微生物對(duì)不同季節(jié)大氣環(huán)流和氣候變化的響應(yīng)。烏源1號(hào)冰川表層雪中微生物類群共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)的互作關(guān)系主要為互利共生類型,表明在惡劣的冰川環(huán)境中合作關(guān)系更有利于微生物生存。

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